–
Статьи в журналах
-
- 2021 Enhanced C/EBP binding to G·T mismatches facilitates fixation of CpG mutations in cancer and adult stem cells
- Ershova A.S., Eliseeva I.A., Nikonov O.S., Fedorova A.D., Vorontsov I.E., Papatsenko D., Kulakovskiy I.V.
- в журнале Cell reports, издательство Cell Press (United States), том 35, № 10 DOI
-
- 2019 ВЫЯВЛЕНИЕ ИММУНОГЕННЫХ МУТАНТНЫХ НЕОАНТИГЕНОВ В ГЕНОМЕ МЕЛАНОМЫ МЫШЕЙ
- Косоруков В.С., Барышникова М.А., Кособокова Е.Н., Яковишина Д.Ю., Ершова А.С., Пеков Ю.А.
- в журнале Российский биотерапевтический журнал, издательство Изд. группа РОНЦ (М.), том 18, № 3, с. 23-30 DOI
-
- 2019 Identification of immunogenic mutant neoantigens in the genome of murine melanoma
- Kosorukov V.S., Baryshnikova M.A., Kosobokova E.N., Yakovishina D.Yu, Ershova A.S., Pekov Yu A.
- в журнале Российский биотерапевтический журнал, издательство Изд. группа РОНЦ (М.), том 18, № 3, с. 23-30 DOI
-
- 2018 Avoidance of recognition sites of restriction-modification systems is a widespread but not universal anti-restriction strategy of prokaryotic viruses
- Rusinov I.S., Ershova A.S., Karyagina A.S., Spirin S.A., Alexeevski A.V.
- в журнале BMC Genomics, издательство BioMed Central (London), том 19, № 1, с. 885 DOI
-
- 2018 Сравнение методов обнаружения исключительных последовательностей в геномах прокариот
- Русинов И.С., Ершова А.С., Карягина А.С., Спирин С.А., Алексеевский А.В.
- в журнале Биохимия, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), том 83, № 2, с. 225-237
-
- 2018 Comparison of methods of detection of exceptional sequences in prokaryotic genomes
- Rusinov I.S., Ershova A.S., Karyagina A.S., Spirin S.A., Alexeevski A.V.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 83, № 2, с. 225-237 DOI
-
- 2016 Роль систем рестрикции-модификации в эволюции и экологии прокариот
- Ершова А.С., Русинов И.С., Спирин С.А., Карягина А.С., Алексеевский А.В.
- в журнале Биохимия, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), том 81, № 1, с. 18-34
-
- 2016 Recombinant domains III of Tick-Borne Encephalitis Virus envelope protein in combination with dextran and CpGs induce immune response and partial protectiveness against TBE virus infection in mice
- Ershova Anna S., Gra Olga A., Lyaschuk Alexander M., Grunina Tatyana M., Tkachuk Artem P., Bartov Mikhail S., Savina Darya M., Sergienko Olga V., Galushkina Zoya M., Gudov Vladimir P., Kozlovskaya Liubov I., Kholodilov Ivan S., Gmyl Larissa V., Karganova Galina G., Lunin Vladimir G., Karyagina Anna S., Gintsburg Alexander L.
- в журнале BMC Infectious Diseases, издательство BioMed Central (London), том 16, с. 544 DOI
-
- 2016 Restriction-Modification systems interplay causes avoidance of GATC site in prokaryotic genomes
- Anna Ershova, Ivan Rusinov, Mikhail Vasiliev, Sergey Spirin, Anna Karyagina
- в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 14, с. 1641003-1641003 DOI
-
- 2015 Lifespan of restriction-modification systems critically affects avoidance of their recognition sites in host genomes
- Rusinov I., Ershova A., Karyagina A., Spirin S., Alexeevski A.
- в журнале BMC Genomics, издательство BioMed Central (London), том 16, № 1084, с. 1-15 DOI
-
- 2015 Role of Restriction–Modification Systems in Prokaryotic Evolution and Ecology
- Ershova A.S., Rusinov I.S., Spirin S.A., Karyagina A.S., Alexeevski A.V.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 80, № 10, с. 1373-1386 DOI
-
- 2012 Solitary restriction endonucleases in prokaryotic genomes
- Ershova Anna S., Karyagina Anna S., Vasiliev Mikhail O., Lyashchuk Alexander M., Lunin Vladimir G., Spirin Sergey A., Alexeevski Andrei V.
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 40, № 20, с. 10107-10115 DOI
-
- 2010 Probe-Level Universal Search (PLUS) algorithm for gender differentiation in affymetrix datasets
- Karyagyna AS, Vassiliev MO, Ershova AS, Nurtdinov RN, Lossev IS
- в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 8, № 3, с. 553-577
-
- 2010 [Production of the recombinant human bone morphogenetic protein-2 in Escherichia coli and testing of its biological activity in vitro and in vivo]
- Sharapova N.E., Kotnova A.P., Galushkina Z.M., Lavrova N.V., Poletaeva N.N., Tukhvatulin A.E., Tukhvatullin A.E., Semikhin A.S., Gromov A.V., Soboleva L.A., Ershova A.S., Za?tsev V.V., Sergienko O.V., Lunin V.G., Kariagina A.S.
- в журнале Молекулярная биология, том 44, № 6, с. 1036-1044
-
- 2010 PLANdbAffy: probe-level annotation database for Affymetrix expression microarrays
- Nurtdinov R.N., Vasiliev M.O., Ershova A.S., Lossev I.S., Karyagina A.S.
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 38, № Database issue, с. 726 DOI
-
- 2006 Разработка модификации метода selex для определения нуклеотидных последовательностей, узнаваемых гомеодоменом antennapedia
- Ершова А.С., Лаврова Н.В., Тихонова Т.В., Кузнецова А.Ю., Мостовенко Е.В., Алексеевский А.В., Лунин В.Г., Карягина А.С.
- в журнале Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук, издательство [б.и.] (М.), № 5, с. 5-9
-
- 2006 Analysis of conserved hydrophobic cores in proteins and supramolecular complexes
- Karyagina A., Ershova A., Titov M., Olovnikov I., Aksianov E., Ryazanova A., Kubareva E., Spirin S., Alexeevski A.
- в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 4, № 2, с. 357-372 DOI
Статьи в сборниках
-
- 2022 Diversity and distribution of restriction-modification systems in natural microbial multi-species community of Antarctic Deep Lake
- Karyagina A., Rusinov I., Ershova A., Alexeevski A., Spirin S.
- в сборнике Bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology (BGRS/SB-2022): The Thirteenth International Multiconference (04–08 July, 2022, Novosibirsk, Russia); Abstracts, место издания ICG SB RAS Novosibirsk, с. 576-577 DOI
Тезисы докладов
-
- 2017 Lateral transfer of restriction-modification systems and their components
- Bezsudnova O., Guseva E., Rusinov I., Ershova A., Alexeevski A.
- в сборнике Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB-2017, место издания Moscow, тезисы
-
- 2015 Estimation of selection pressure on degenerate sequences in genomes: choice of method
- Ivan Rusinov, Anna Ershova, Anna Karyagina, Sergey Spirin, Andrey Alexeevski
- в сборнике Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB-2015. Седьмая Московская международная конференция по вычислительной молекулярной биологии МССМВ'15 Москва, 16-19 июля 2015 Сборник трудов, место издания Москва, тезисы
-
- 2015 GATC avoidance in bacteria with DpnI/DpnII complementary R-M systems
- Ershova A.S., Rusinov I.S., Karyagina A.S., Spirin S.A., Alexeevski A.V.
- в сборнике Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB-2015. Седьмая Московская международная конференция по вычислительной молекулярной биологии МССМВ'15 Москва, 16-19 июля 2015 Сборник трудов, место издания Москва, тезисы
-
- 2014 Исследование иммуногенности генно-инженерного препарата на основе домена III белка E вируса клещевого энцефалита на мышиной модели
- Ершова А.С., Гра О.А., Лящук А.М., Грунина Т.М., Громов А.В., Бартов М.С., Савина Д.М., Манухина М.С., Семихин А.С., Галушкина З.М., Козловская Л.И., Холодилов И., Карганова Г.Г., Лунин В.Г., Карягина А.С.
- в сборнике СБОРНИК ТРУДОВ IV МЕЖДУНАРОДНОЙ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКОЙ КОНФЕРЕНЦИИ Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине, место издания Казань, Россия, тезисы, с. 192-192
-
- 2014 Restriction Sites Avoidance is Trace of Lost Restriction Modification Systems
- Rusinov I.S., Ershova A.S., Karyagina A.S., Spirin S.A., Alexeevski A.V.
- в сборнике The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014, Novosibirsk, June 23-28, место издания Publishing House of the Siberian Branch Russian Academy of Sciences Novosibirsk, тезисы, с. 140-140
-
- 2014 Underrepresented Words in Prokaryotic Genome Shed Light on Lifespan of Restriction-Modification Systems in Genome
- Anna Ershova, Ivan Rusinov, Anna Karyagina, Sergei Spirin, Andrei Alexeevski
- в сборнике Материалы конференции "European Conference on Computational Biology, ECCB 2014", место издания Страсбург, Франция, тезисы, с. A26
Диссертации
-
- 2016 Анализ систем рестрикции-модификации в полногеномном контексте
- Кандидатская диссертация по специальности 03.01.09 - Математическая биология, биоинформатика (биол. науки)
- Автор: Ершова Анна Степановна, к.б.н.
- Научный руководитель: Алексеевский Андрей Владимирович, к.ф.-м.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
- Защищена в совете Д 002.077.04 при Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук (ИППИ РАН)
- Организация, в которой выполнялась работа: Московский Государственный Университет им. М.В. Ломоносова
- Ведущая организация: ФГБУН Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН