Кулаковский Иван Владимирович
Количество цитирований статей в журналах по данным
Web of Science: 38,
Scopus: 35
IstinaResearcherID (IRID): 39521762
Деятельность
-
Статьи в журналах
-
-
2022
Ribosomal leaky scanning through a translated uORF requires eIF4G2
-
Smirnova Victoria V.,
Shestakova Ekaterina D.,
Nogina Daria S.,
Mishchenko Polina A.,
Prikazchikova Tatiana A.,
Zatsepin Timofei S.,
Kulakovskiy Ivan V.,
Shatsky Ivan N.,
Terenin Ilya M.
-
в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 50, № 2, с. 1111-1127
DOI
-
-
2021
A standard knockout procedure alters expression of adjacent loci at the translational level
-
Egorov Artyom A.,
Alexandrov Alexander I.,
Urakov Valery N.,
Makeeva Desislava S.,
Edakin Roman O.,
Kushchenko Artem S.,
Gladyshev Vadim N.,
Kulakovskiy Ivan V.,
Dmitriev Sergey E.
-
в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 49, № 19, с. 11134-11144
DOI
-
-
-
-
2021
Ribo-Seq and RNA-Seq of TMA46 (DFRP1) and GIR2 (DFRP2) knockout yeast strains
-
Egorov Artyom A.,
Makeeva Desislava S.,
Makarova Nadezhda E.,
Bykov Dmitri A.,
Hrytseniuk Yanislav S.,
Mitkevich Olga V.,
Urakov Valery N.,
Alexandrov Alexander I.,
Kulakovskiy Ivan V.,
Dmitriev Sergey E.
-
в журнале F1000Research, том 10, с. 1162
DOI
-
-
-
2020
Insights gained from a comprehensive all-against-all transcription factor binding motif benchmarking study
-
Ambrosini Giovanna,
Vorontsov Ilya,
Penzar Dmitry,
Groux Romain,
Fornes Oriol,
Nikolaeva Daria D.,
Ballester Benoit,
Grau Jan,
Grosse Ivo,
Makeev Vsevolod,
Kulakovskiy Ivan,
Bucher Philipp
-
в журнале Genome Biology, издательство BioMed Central (London), том 21, № 1
DOI
-
-
2020
Landscape of allele-specific transcription factor binding in the human genome
-
Abramov Sergey,
Boytsov Alexandr,
Bykova Dariia,
Penzar Dmitry D.,
Yevshin Ivan,
Kolmykov Semyon K.,
Fridman Marina V.,
Favorov Alexander V.,
Vorontsov Ilya E.,
Baulin Eugene,
Kolpakov Fedor,
Makeev Vsevolod J.,
Kulakovskiy Ivan V.
-
в журнале bioRxiv (The preprint server for biology)
DOI
-
-
-
2019
CpG traffic lights are markers of regulatory regions in human genome
-
Lioznova Anna V.,
Khamis Abdullah M.,
Artemov Artem V.,
Besedina Elizaveta,
Ramensky Vasily,
Bajic Vladimir B.,
Kulakovskiy Ivan V.,
Medvedeva Yulia A.
-
в журнале BMC Genomics, издательство BioMed Central (London), том 20, № 1
-
-
2019
Integration of Multiple Epigenomic Marks Improves Prediction of Variant Impact in Saturation Mutagenesis Reporter Assay
-
Shigaki Dustin,
Adato Orit,
Adhikar Aashish N.,
Dong Shengcheng,
Hawkins-Hooker Alex,
Inoue Fumitaka,
Juven-Gershon Tamar,
Kenlay Henry,
Martin Beth,
Patra Ayoti,
Penzar Dmitry P.,
Schubach Max,
Xiong Chenling,
Yan Zhongxia,
Boyle Alan P.,
Kreimer Anat,
Kulakovskiy Ivan V.,
Reid John,
Unger Ron,
Yosef Nir,
Shendure Jay,
Ahituv Nadav,
Kircher Martin,
Beer Michael A.
-
в журнале Human Mutation, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), № ja
DOI
-
-
2019
Minor C allele of the SNP rs7873784 associated with rheumatoid arthritis and type-2 diabetes mellitus binds PU.1 and enhances TLR4 expression
-
Korneev Kirill V.,
Sviriaeva Ekaterina N.,
Mitkin Nikita A.,
Gorbacheva Alisa M.,
Uvarova Aksinya N.,
Ustiugova Alina S.,
Polanovsky Oleg L.,
Kulakovskiy Ivan V.,
Afanasyeva Marina A.,
Schwartz Anton M.,
Kuprash Dmitry V.
-
в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Basis of Disease, издательство Elsevier BV (Netherlands)
DOI
-
-
2019
The Reduced Level of Inorganic Polyphosphate Mobilizes Antioxidant and Manganese-Resistance Systems in Saccharomyces cerevisiae
-
Trilisenko Ludmila,
Zvonarev Anton,
Valiakhmetov Airat,
Penin Alexey A.,
Eliseeva Irina A.,
Ostroumov Vladimir,
Kulakovskiy Ivan V.,
Kulakovskaya Tatiana
-
в журнале Cells, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 8, № 5, с. 461
DOI
-
-
2019
What Do Neighbors Tell About You: The Local Context of Cis-Regulatory Modules Complicates Prediction of Regulatory Variants
-
Penzar Dmitry D.,
Zinkevich Arsenii O.,
Vorontsov Ilya E.,
Sitnik Vasily V.,
Favorov Alexander V.,
Makeev Vsevolod J.,
Kulakovskiy Ivan V.
-
в журнале Frontiers in genetics, издательство Frontiers Research Foundation. (Lausanne, Switzerland), том 10, с. 1078
DOI
-
-
2017
The single nucleotide variant rs12722489 determines differential estrogen receptor binding and enhancer properties of an IL2RA intronic region
-
Afanasyeva Marina A.,
Putlyaeva Lidia V.,
Demin Denis E.,
Kulakovskiy Ivan V.,
Vorontsov Ilya E.,
Fridman Marina V.,
Makeev Vsevolod J.,
Kuprash Dmitry V.,
Schwartz Anton M.
-
в журнале PLoS ONE, издательство Public Library of Science (United States), том 12, № 2, с. 0172681
DOI
-
Статьи в сборниках
-
-
2021
Assessing Ribosome Distribution Along Transcripts with Polarity Scores and Regression Slope Estimates
-
Vorontsov Ilya E.,
Egorov Artyom A.,
Anisimova Aleksandra S.,
Eliseeva Irina A.,
Makeev Vsevolod J.,
Gladyshev Vadim N.,
Dmitriev Sergey E.,
Kulakovskiy Ivan V.
-
в сборнике Methods in Molecular Biology, издательство Springer US (New York, United States), том 2248, с. 269-294
DOI
-
Доклады на конференциях
-
-
2021
Ribosome profiling reveals transcriptional and translational changes induces by lifespan-extending interventions in mice
(Стендовый)
-
Авторы:
Makarova Nadezhda E.,
Gerashchenko Maxim V.,
Anisimova Aleksandra S.,
Egorov Artyom A.,
Tyshkovskiy Alexander E.,
Kulakovskiy Ivan V.,
Miller Richard A.,
Gladyshev Vadim N.,
Dmitriev Sergey E.
-
EMBL – Protein Synthesis and Translational Control, Онлайн, Германия, 7-10 сентября 2021
-
-
2021
Protein-coding potential of the human repetitive elements
(Стендовый)
-
Авторы:
Egorov Artyom A.,
Buyan Andrey I.,
Gladyshev Vadim N.,
Kulakovskiy Ivan V.,
Dmitriev Sergey E.
-
Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB), Москва, Россия, 30 июля - 2 августа 2021, Skolkovo Insitute of Science and Technology, Moscow, Россия, 30 июля - 2 августа 2021
-
-
-
-
2021
Анализ данных рибосомного профайлинга выявил проблему общеупотребимой коллекции нокаутных штаммов дрожжей
(Устный)
-
Авторы:
Дмитриев С.Е.,
Егоров А.А.,
Макеева Д.С.,
Кулаковский И.В.,
Едакин Р.О.,
Макарова Н.Е.,
Кущенко А.С.,
Волынкина И.А.
-
Отчётная конференция по гранту РФФИ_Наставник, НТУ "Сириус", Сочи, Россия, 29 апреля 2021
-
-
2020
A standard knockout procedure affects expression of neighboring genes through translational mechanism
(Стендовый)
-
Авторы:
Egorov Artyom A.,
Alexandrov Alexander I.,
Urakov Valeriy N.,
Kushenko Artyom S.,
Edakin Roman O.,
Makeeva Desislava S.,
Gladyshev Vadim N.,
Kulakovskiy Ivan V.,
Dmitriev Sergey E.
-
Translational Control 2020, Cold Spring Harbor Laboratory, США, 1-4 сентября 2020
-
-
2020
Alterations of protein biosynthesis in mice subjected to longevity interventions
(Устный)
-
Авторы:
Makarova Nadezhda E.,
Gerashchenko Maxim V.,
Anisimova Aleksandra S.,
Egorov Artyom A.,
Tyshkovskiy Alexander E.,
Kulakovskiy Ivan V.,
Dmitriev Sergey E.,
Gladyshev Vadim N.
-
Translational Control 2020, Cold Spring Harbor Laboratory, США, 1-4 сентября 2020
-
-
-
2020
AD ASTRA: the database of Allelic Dosage-corrected Allele-Specific TRAnscription factor binding suggests causal regulatory sequence variants of pathologies
(Устный)
-
Авторы:
Abramov S.,
Boytsov A.,
Bykova D.,
Baulin E.,
Yevshin I.,
Kolpakov F.,
Makeev V.J.,
Kulakovskiy I.V.
-
BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”, Новосибирск, РФ, Россия, 6-10 июля 2020
-
-
-
2018
An allelic variant of the SNP rs7873784 associated with autoimmune pathologies binds PU.1 and enhances TLR4 expression.
(Стендовый)
-
Авторы:
Kuprash D.,
Korneev K.,
Sviriaeva E.,
Mitkin N.,
Afanasyeva M.,
Muratova A.,
Ustiugova A.,
Uvarova A.,
Kulakovskiy I.,
Schwartz A.
-
FEBS 2018, Прага, Чехия, 7-12 июля 2018
-
НИРы
-
-
-
1 января 2017 - 31 декабря 2019
Белковый синтез в старении и контроле продолжительности жизни
-
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
-
Руководитель:
Гладышев В.Н.
Ответственный исполнитель:
Дмитриев С.Е.
Участники НИР:
Александров А.И.,
Анисимова А.,
Буян А.И.,
Быков Д.,
Волынкина И.А.,
Гусев Ф.О.,
Дементьева М.А.,
Донцова О.А.,
Егоров А.А.,
Едакин Р.О.,
Кармушаков А.Ф.,
Кинзина Э.Д.,
Кулаковский И.В.,
Кущенко А.С.,
Лашкевич К.А.,
Макарова Н.Е.,
Макеева Д.С.,
Марина В.И.,
Меерсон М.Б.,
Меерсон М.Б.,
Остерман И.А.,
Савельев Н.В.,
Сергиев П.В.,
Тихонов С.А.,
Тышковский А.Э.,
Шафиков Р.Р.,
Шиндяпина А.В.,
Шубин С.Н.,
Шубин С.Н.,
Шубин С.Н.
-
Руководство дипломными работами
-
Руководство курсовыми работами