Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
отправить сообщение
Пенин Алексей Александрович
пользователь
кандидат биологических наук с 2003 года
Прежние места работы
(Нажмите для отображения)
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
,
Кафедра генетики
, старший научный сотрудник, 15 января 2004 - 5 июля 2019
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Факультет биоинженерии и биоинформатики
, старший научный сотрудник, 1 февраля 2011 - 1 декабря 2014, по совместительству
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
, старший научный сотрудник, 1 декабря 2014 - 30 ноября 2017, по совместительству
Соавторы:
Логачёва М.Д.
,
Кондрашов А.С.
,
Клепикова А.В.
,
Щелкунов М.И.
,
Kasianov A.
,
Базыкин Г.А.
,
Герасимов Е.С.
,
Ежова Т.А.
,
Неретина Т.В.
,
Алёшин В.В.
,
Вахрушева О.А.
,
Лазаревич Н.Л.
,
Михайлов К.В.
показать полностью...
,
Нуралиев М.С.
,
Панчин Ю.В.
,
Самигуллин Т.Х.
,
Чуб В.В.
,
Штратникова В.Ю.
,
GALIMOV Y.R.
,
Vinogradov D.
,
Мнацаканова Е.А.
,
Разин С.В.
,
Ульянов С.В.
,
Шестаков С.В.
,
Nabieva E.R.
,
Sutormin R.
,
Алексеев Д.В.
,
Вальехо-Роман К.М.
,
Демиденко Н.В.
,
Елисеева И.А.
,
Кривцова О.М.
,
Леушкин Е.В.
,
Мюге Н.С.
,
Науменко С.А.
,
Никитин М.А.
,
Николаева О.В.
,
Fesenko A.N.
,
Khrustaleva A.M.
,
Markevich G.N.
,
Patyutko Y.I.
,
Selosse M.A.
,
Антонов А.С.
,
Васецкий Е.С.
,
Гельфанд М.С.
,
Горюнов Д.В.
,
Гущанская Е.С.
,
Дмитриев С.Е.
,
Жарикова А.А.
,
Женавчук О.Ф.
,
Карбышева Е.А.
,
Кудашкин Н.Е.
,
Макарова А.С.
,
Мещерякова П.В.
,
Миронов А.А.
,
Михеева Л.Е.
,
Мунтян М.С.
,
Носов М.В.
,
Поташникова Д.М.
,
Ремизова М.В.
,
Сеплярский В.Б.
,
Скрябин К.Г.
,
Соколов Д.Д.
,
Федотова А.В.
,
Чесноков М.С.
,
Шавочкина Д.А.
,
Шеваль Е.В.
,
Шубина Е.А.
,
Шульга О.А.
,
Archibald J.
,
Arkhipova I.R.
,
Baranova M.A.
,
Besedina E.G.
,
Cornette R.
,
Demin A.V.
,
Dhingra A.
,
Etingova A.E.
,
Evgen’ev M.B.
,
Fesenko I.N.
,
Gavrilov A.
,
Gelfand M.
,
Gusev O.V.
,
Herrera-Ibata D.
,
Hiroyuki K.
,
James T.Y.
,
Jennifer W.
,
Kanapin A.A.
,
Karpov S.A.
,
Khrameeva E.
,
Kikawada T.
,
Kirov I.V.
,
Kondrashov F.A.
,
Kotelnikova E.A.
,
Kremenetskaya O.S.
,
Kulakovskiy I.V.
,
Lando A.S.
,
Lee P.A.
,
Letcher P.M.
,
Lukes J.
,
Makeev V.
,
Manabu F.
,
Marthaler D.
,
Mazin P.
,
Mitsuyasu H.
,
Miyata Y.
,
Nepoklonov E.
,
Nori S.
,
Novakovsky G.E.
,
Onodera N.
,
Paleeva A.G.
,
Potapenko E.V.
,
Pozdnyakov I.
,
Pyatnitskiy M.A.
,
Richard C.
,
Rie H.
,
Rodriguez F.
,
Rudall P.J.
,
Ryo K.
,
Sachiko S.
,
Safonova Y.Y.
,
Shagimardanova E.I.
,
Sherbakov D.Y.
,
Shingo K.
,
Shnayder E.D.
,
Shuji S.
,
Sogame Y.
,
Takashi M.
,
Takashi O.
,
Takeshi K.
,
Tanifuji G.
,
Tomoaki N.
,
Trilisenko L.V.
,
Veronika G.
,
Volf P.
,
Votypka J.
,
Yoshitaka S.
,
Young N.
,
Yuichi K.
,
Yushenova I.
,
Акопов С.Б.
,
Андреев Д.Е.
,
Анисимова А.
,
Арифулин Е.А.
,
Артемов А.В.
,
Артемов А.В.
,
Безменова А.В.
,
Богомазова А.Н.
,
Валяева А.А.
,
Воробьев И.А.
,
Высоких М.Ю.
,
Гаврилов А.А.
,
Галицына А.А.
,
Гараева А.А.
,
Глаголева Е.С.
,
Голышев С.А.
,
Евстафьева А.Г.
,
Егоров А.А.
,
Ефейкин Б.Д.
,
Ефимов С.В.
,
Залевский А.О.
,
Занегина О.Н.
,
Зверков О.А.
,
Звягина Е.А.
,
Исаев С.В.
,
Качалова А.И.
,
Кедрова О.С.
,
Кнорре Д.А.
,
Ковалева И.Е.
,
Ковина А.П.
,
Козлов В.Н.
,
Кос П.И.
,
Котельникова Е.А.
,
Кудрявцев В.Б.
,
Кудрявцева О.А.
,
Кулаковский И.В.
,
Кустова И.Ф.
,
Локк И.Э.
,
Любецкий В.А.
,
Макаренко М.С.
,
Макеева Д.С.
,
Максименко О.Г.
,
Мороз Л.Л.
,
Москаленко В.Н.
,
Мусинова Я.Р.
,
Нестеренко М.А.
,
Николаев Л.Г.
,
Огаркова О.А.
,
Озерова С.Г.
,
Омельченко Д.О.
,
Панчин А.Ю.
,
Петров Н.Б.
,
Прудковский П.А.
,
Русин Л.Ю.
,
Рязанский С.С.
,
Саидова А.А.
,
Сафина К.Р.
,
Свердлов Е.Д.
,
Синицын П.Г.
,
Снигирева Г.П.
,
Солдатова О.П.
,
Спиридонов С.Э.
,
Степанова В.В.
,
Теренин И.М.
,
Тереханова Н.В.
,
Тихомирова М.А.
,
Хесина П.А.
,
Хуторненко А.А.
,
Чертович А.В.
,
Чумаков П.М.
,
Шатский И.Н.
,
Шмакова А.А.
,
Ямпольский Л.Ю.
,
Яровая О.В.
70 статей
,
1 книга
,
2 доклада на конференциях
,
13 тезисов докладов
,
19 НИР
,
1 награда
,
1 диссертация
,
4 дипломные работы
,
2 учебных курса
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 1273, Scopus: 1380
IstinaResearcherID (IRID): 380419
ResearcherID:
A-5477-2011
Scopus Author ID:
24177968100
Деятельность
Статьи в журналах
2022
Ectopic expression of HIV-1 Tat modifies gene expression in cultured B cells: Implications for the development of B-cell lymphomas in HIV-1-infected patients
Valyaeva A.A.
,
Tikhomirova M.A.
,
Potashnikova D.M.
,
Bogomazova A.N.
,
Snigiryova G.P.
,
Penin A.A.
,
Logacheva M.D.
,
Arifulin E.A.
,
Shmakova A.
, Germini D.,
Kachalova A.I.
,
Saidova A.A.
,
Zharikova A.A.
,
Musinova Y.R.
,
Mironov A.A.
,
Vassetzky Y.S.
,
Sheval E.V.
в журнале
PeerJ
, издательство
PeerJ
(San Francisco)
, том 10
DOI
2022
Genomic analysis reveals cryptic diversity in aphelids and sheds light on the emergence of Fungi
Mikhailov Kirill V.
,
Karpov Sergey A.
,
Letcher Peter M.
,
Lee Philip A.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
,
Nesterenko Maksim A.
,
Pozdnyakov Igor R.
,
Potapenko Evgenii V.
,
Sherbakov Dmitry Y.
,
Panchin Yuri V.
,
Aleoshin Vladimir V.
в журнале
Current Biology
, издательство
Cell Press
(United States)
, том 32
DOI
2021
High-Resolution Transcriptome Atlas and Improved Genome Assembly of Common Buckwheat, Fagopyrum esculentum
Penin Aleksey A.
,
Kasianov Artem S.
,
Klepikova Anna V.
,
Kirov Ilya V.
,
Gerasimov Evgeny S.
,
Fesenko Aleksey N.
,
Logacheva Maria D.
в журнале
Frontiers in plant science
, издательство
Frontiers Research Foundation
(Switzerland)
, том 12
DOI
2021
lepidium-like, a naturally occurring mutant of Capsella bursa-pastoris and its implications for the evolution of petal loss in Cruciferae
Klepikova Anna
,
Shnayder Elina D.
,
Kasianov Artem
,
Remizowa Margarita V.
,
Sokoloff Dmitry D.
,
Penin Aleksey
в журнале
Frontiers in plant science
, издательство
Frontiers Research Foundation
(Switzerland)
, том 12
DOI
2020
Assembly and Analysis of the Complete Mitochondrial Genome of Capsella bursa-pastoris
Omelchenko Denis O.
,
Makarenko Maxim S.
,
Kasianov Artem S.
,
Schelkunov Mikhail I.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
в журнале
Plants
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 9, № 4, с. 469
DOI
2020
Genomic signatures of recombination in a natural population of the bdelloid rotifer Adineta vaga
Vakhrusheva Olga A.
,
Mnatsakanova Elena A.
,
Galimov Yan R.
,
Neretina Tatiana V.
,
Gerasimov Evgeny S.
,
Naumenko Sergey A.
,
Ozerova Svetlana G.
,
Zalevsky Arthur O.
,
Yushenova Irina A.
,
Rodriguez Fernando
,
Arkhipova Irina R.
,
Penin Aleksey A.
,
Logacheva Maria D.
,
Bazykin Georgii A.
,
Kondrashov Alexey S.
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, том 11, № 1, с. 6421
DOI
2020
Mitochondrial genome of the nonphotosynthetic mycoheterotrophic plant Hypopitys monotropa, its structure, gene expression and RNA editing
Shtratnikova V.Yu
,
Schelkunov M.I.
,
Penin A.
,
Logacheva M.D.
в журнале
PeerJ
, издательство
PeerJ
(San Francisco)
, том 8, с. e9309
DOI
2020
Rapid accumulation of mutations in growing mycelia of a hypervariable fungus Schizophyllum commune
Bezmenova Aleksandra V.
,
Zvyagina Elena A.
,
Fedotova Anna V.
,
Kasianov Artem S.
,
Neretina Tatiana V.
,
Penin Aleksey A.
,
Bazykin Georgii A.
,
Kondrashov Alexey S.
в журнале
Molecular Biology and Evolution
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 37, № 8, с. 2279-2286
DOI
2019
Coding palindromes in mitochondrial genes of Nematomorpha
Mikhailov Kirill V.
,
Efeykin Boris D.
,
Panchin Alexander Y.
,
Knorre Dmitry A.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
,
Muntyan Maria S.
,
Nikitin Mikhail A.
,
Popova Olga V.
,
Zanegina Olga N.
,
Vyssokikh Mikhail Y.
,
Spiridonov Sergei E.
,
Aleoshin Vladimir V.
,
Panchin Yuri V.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 47, № 13, с. 6858-6870
DOI
2019
Comparative Analysis of Developmental Transcriptome Maps of Arabidopsis thaliana and Solanum lycopersicum
Penin Aleksey
,
Klepikova Anna
, Kasianov Artem,
Gerasimov Evgeny
,
Logacheva Maria
в журнале
Genes
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 10, № 1
DOI
2019
Dicyemida and Orthonectida: Two stories of body plan simplification
Zverkov O.A.
,
Mikhailov K.V.
,
Isaev S.V.
,
Rusin L.Y.
,
Popova O.V.
,
Logacheva M.D.
,
Penin A.A.
,
Moroz L.L.
,
Panchin Y.V.
,
Lyubetsky V.A.
,
Aleoshin V.V.
в журнале
Frontiers in genetics
, издательство
Frontiers Research Foundation.
(Lausanne, Switzerland)
, том 10, № 443
DOI
2019
Genetics of Adaptation of the Ascomycetous Fungus Podospora anserina to Submerged Cultivation
Kudryavtseva Olga A.
,
Safina Ksenia R.
,
Vakhrusheva Olga A.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
,
Neretina Tatiana V.
,
Moskalenko Viktoria N.
,
Glagoleva Elena S.
,
Bazykin Georgii A.
,
Kondrashov Alexey S.
в журнале
Genome biology and evolution
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 11, № 10, с. 2807-2817
DOI
2019
The Reduced Level of Inorganic Polyphosphate Mobilizes Antioxidant and Manganese-Resistance Systems in Saccharomyces cerevisiae
Trilisenko Ludmila
, Zvonarev Anton, Valiakhmetov Airat,
Penin Alexey A.
,
Eliseeva Irina A.
, Ostroumov Vladimir,
Kulakovskiy Ivan V.
, Kulakovskaya Tatiana
в журнале
Cells
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 8, № 5, с. 461
DOI
2019
Translatome and transcriptome analysis of TMA20 (MCT-1) and TMA64 (eIF2D) knockout yeast strains
Makeeva Desislava S.
,
Lando Andrey S.
,
Anisimova Aleksandra
,
Egorov Artyom A.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Alexey A.
,
Andreev Dmitry E.
,
Sinitcyn Pavel G.
,
Terenin Ilya M.
,
Shatsky Ivan N.
,
Kulakovskiy Ivan V.
,
Dmitriev Sergey E.
в журнале
Data in Brief
, издательство
Elsevier Inc.
(США)
, том 23, с. 103701
DOI
2018
Cooption of heat shock regulatory system for anhydrobiosis in the sleeping chironomid Polypedilum vanderplanki
Mazin PV
,
Shagimardanova E.
, Kozlova O., Cherkasov A.,
Sutormin R.
,
Stepanova VV
, Stupnikov A.,
Logacheva M.
,
Penin A.
,
Sogame Y.
,
Cornette R.
, Tokumoto S.,
Miyata Y.
,
Kikawada T.
,
Gelfand MS
,
Gusev O.
в журнале
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
, издательство
National Academy of Sciences
(United States)
, том 115, № 10, с. E2477-E2486
DOI
2018
FACS isolation of viable cells in different cell cycle stages from asynchronous culture for RNA sequencing
Potashnikova DM
,
Golyshev SA
,
Penin AA
,
Logacheva MD
,
Klepikova AV
,
Zharikova AA
,
Mironov AA
,
Sheval EV
,
Vorobjev IA
в журнале
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
, издательство
Humana Press, Inc.
(United States)
, том 1745, с. 315-335
DOI
2018
Genome Characterization of a Pathogenic Porcine Rotavirus B Strain Identified in Buryat Republic, Russia in 2015
Alekseev KP,
Penin AA
, Mukhin AN, Khametova KM, Grebennikova TV, Yuzhakov AG, Moskvina AS, Musienko MI, Raev SA, Mishin AM, Kotelnikov AP, Verkhovsky OA, Aliper TI,
Nepoklonov EA
,
Herrera-Ibata DM
, Shepherd FK,
Marthaler DG
в журнале
PATHOGENS
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 7, № 2, с. 1-12
DOI
2018
RNA-seq highlights parallel and contrasting patterns in the evolution of the nuclear genome of fully mycoheterotrophic plants
Schelkunov Mikhail
,
Penin Aleksey
,
Logacheva Maria
в журнале
BMC Genomics
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 19, № 602, с. 1-16
DOI
2017
Effect of method of deduplication on estimation of differential gene expression using RNA-seq
Klepikova Anna V.
,
Kasianov Artem S.
,
Chesnokov Mikhail S.
,
Lazarevich Natalia L.
,
Penin Aleksey A.
,
Logacheva Maria
в журнале
PeerJ
, издательство
PeerJ
(San Francisco)
, том 5, с. e3091
DOI
2017
Evolution of the genome 3D organization: comparison of fused and segregated globin gene clusters
Kovina AP
, Petrova NV, Gushchanskaya ES, Dolgushin KV,
Gerasimov ES
,
Galitsyna AA
,
Penin AA
, Flyamer IM, Ioudinkova ES, Gavrilov AA,
Vassetzky YS
,
Ulianov SV
, Iarovaia OV,
Razin S.V.
в журнале
Molecular Biology and Evolution
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2017
High quality genome assembly of Capsella bursa-pastoris reveals asymmetry of regulatory elements at early stages of polyploid genome evolution
Kasianov Artem S.
,
Klepikova Anna V.
, Kulakovskiy Ivan V.,
Gerasimov Evgeny S.
,
Fedotova Anna V.
,
Besedina Elizaveta G.
,
Kondrashov Alexey S.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
в журнале
Plant Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, с. n/a-n/a
DOI
2017
Transcriptome profile of yeast reveals essential role of PMA2 and uncharacterized gene YBR056W-A (MNC1) in adaptation to toxic manganese concentration
Andreeva Nadezhda, Kulakovskaya Ekaterina, Zvonarev Anton,
Penin Aleksey
,
Eliseeva Irina
, Teterina Anastasia, Lando Andrey, Kulakovskiy Ivan, Kulakovskaya Tatiana
в журнале
Metallomics : integrated biometal science
, издательство
RSC Publishing
(Cambridge, England)
DOI
2017
Transcriptome-based phylogeny of endemic Lake Baikal amphipod species flock: fast speciation accompanied by frequent episodes of positive selection
Naumenko S.A.
,
Logacheva M.D.
, Popova N.V.,
Klepikova A.V.
,
Penin A.A.
,
Bazykin G.A.
,
Etingova A.E.
,
Mugue N.S.
,
Kondrashov A.S.
,
Yampolsky L.Y.
в журнале
Molecular Ecology
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
DOI
2016
A High Resolution Map of the Arabidopsis thaliana Developmental Transcriptome Based on RNA-seq Profiling
Klepikova Anna V.
,
Kasianov Artem S.
,
Gerasimov Evgeny S.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
в журнале
Plant Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, с. n/a-n/a
DOI
2016
Active chromatin and transcription play a key role in chromosome partitioning into topologically associating domains
Ulianov SV
,
Khrameeva EE
, Gavrilov AA, Flyamer IM,
Kos P.
, Mikhaleva EA,
Penin AA
,
Logacheva MD
, Imakaev MV,
Chertovich A.
,
Gelfand MS
, Shevelyov YY,
Razin SV
в журнале
Genome Research
, издательство
Cold Spring Harbor Laboratory Press
(United States)
, том 26, с. 70-84
DOI
2016
Architectural proteins Pita, Zw5, and ZIPIC contain homodimerization domain and support specific long-range interactions in Drosophila
Zolotarev Nikolay, Fedotova Anna, Kyrchanova Olga, Bonchuk Artem,
Penin Aleksey A.
, Lando Andrey S.,
Eliseeva Irina A.
, Kulakovskiy Ivan V.,
Maksimenko Oksana
, Georgiev Pavel
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, с. 1-40
DOI
2016
Comparative analysis of plastid genomes of non-photosynthetic Ericaceae and their photosynthetic relatives
Logacheva Maria D.
,
Schelkunov Mikhail I.
,
Shtratnikova Victoria Y.
, Matveeva Maria V.,
Penin Aleksey A.
в журнале
Scientific reports
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 6, с. 30042
DOI
2016
Complete Plastid Genome of the Recent Holoparasite Lathraea squamaria Reveals Earliest Stages of Plastome Reduction in Orobanchaceae
Samigullin TH
,
Logacheva MD
,
Penin AA
,
Vallejo-Roman CM
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 11, № 3, с. 0150718
DOI
2016
Interplay between RNA interference and heat shock response systems in Drosophila melanogaster
Funikov S.Yu,
Ryazansky S.S.
,
Kanapin A.A.
,
Logacheva M.D.
,
Penin A.A.
, Snezhkina A.V., Shilova V.Yu, Garbuz D.G.,
Evgen’ev M.B.
, Zatsepina O.G.
в журнале
Open biology
, издательство
Royal Society Pub.
(London, England)
, том 6, № 10, с. 1-13
DOI
2016
Mitochondrial Genomes of Kinorhyncha: trnM Duplication and New Gene Orders within Animals
Popova O.V.
,
Mikhailov K.V.
,
Nikitin M.A.
,
Logacheva M.D.
,
Penin A.A.
,
Muntyan M.S.
,
Kedrova O.S.
,
Petrov N.B.
,
Panchin Yu V.
,
Aleoshin V.V.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 11, № 10, с. e0165072
DOI
2016
The genome of Intoshia linei affirms orthonectids as highly simplified spiralians
Mikhailov K.V.
, Slyusarev G.S.,
Nikitin M.A.
,
Logacheva M.D.
,
Penin A.A.
,
Aleoshin V.V.
,
Panchin Y.V.
в журнале
Current Biology
, издательство
Cell Press
(United States)
, том 26, № 13, с. 1768-1774
DOI
2016
Transcriptome-based identification of PDGFA as a candidate secreted biomarker for hepatocellular carcinoma
Chesnokov M.S.
,
Krivtsova O.M.
,
Skovorodnikova P.A.
,
Makarova A.S.
,
Kustova I.F.
,
Logacheva M.D.
,
Penin A.A.
,
Klepikova A.V.
,
Shavochkina D.A.
,
Kudashkin N.E.
, Moroz E.A.,
Patyutko Y.I.
,
Kotelnikova E.A.
,
Lazarevich N.L.
в журнале
Biopolymers and Cell
, издательство
Naukova Dumka
(Ukraine)
, том 32, № 6, с. 418-432
DOI
2016
Whole transcriptome profiling of adult and infective stages of the trematode Opisthorchis felineus
Pomaznoy Mikhail,
Logacheva Maria
,
Young Neil
,
Penin Aleksey
, Ershov Nikita, Katokhin Alexey, Mordvinov Viatcheslav
в журнале
Parasitology International
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 65, № 1, с. 12-19
DOI
2015
Comparative genome analysis of Pseudogymnoascus spp. reveals primarily clonal evolution with small genome fragments exchanged between lineages
Leushkin Evgeny V.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
,
Sutormin Roman A.
,
Gerasimov Evgeny S.
, Kochkina Galina A., Ivanushkina Natalia E., Vasilenko Oleg V.,
Kondrashov Alexey S.
, Ozerskaya Svetlana M.
в журнале
BMC Genomics
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 16, № 400, с. 1-15
DOI
2015
Exploring the Limits for Reduction of Plastid Genomes: a Case Study of the Mycoheterotrophic Orchids Epipogium aphyllum and Epipogium roseum
Schelkunov M.I.
,
Shtratnikova V.
,
Nuraliev M.S.
,
Selosse M.A.
,
Penin A.A.
,
Logacheva M.D.
в журнале
Genome biology and evolution
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 7, № 4, с. 1179-1191
DOI
2015
Extraordinary genetic diversity in a wood decay mushroom
Baranova Maria A.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
,
Seplyarskiy Vladimir B.
,
Safonova Yana Y.
,
Naumenko Sergey A.
,
Klepikova Anna V.
,
Gerasimov Evgeniy S.
,
Bazykin Georgii A.
,
James Timothy Y.
,
Kondrashov Alexey S.
в журнале
Molecular Biology and Evolution
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 32, № 10, с. 2775-2783
DOI
2015
NGS-based identification of druggable alterations and signaling pathways - hepatocellular carcinoma case report
Kotelnikova E.A.
,
Logacheva M.D.
,
Nabieva E.R.
,
Pyatnitskiy M.A.
,
Vinogradov D.V.
,
Makarova A.S.
,
Demin A.V.
,
Paleeva A.G.
,
Kremenetskaya O.S.
,
Penin A.A.
,
Klepikova A.V.
,
Kasianov A.S.
,
Shavochkina D.A.
,
Kudashkin N.E.
,
Patyutko Yu I.
,
Mugue N.S.
,
Kondrashov A.S.
,
Lazarevich N.L.
в журнале
Biopolymers and Cell
, издательство
Naukova Dumka
(Ukraine)
, том 31, № 6, с. 436-445
DOI
2015
RNA-seq analysis of an apical meristem time series reveals a critical point in Arabidopsis thaliana flower initiation
Klepikova Anna V.
,
Logacheva Maria D.
,
Dmitriev Sergey E.
,
Penin Aleksey A.
в журнале
BMC Genomics
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 16, № 466, с. 1-15
DOI
2014
A sustained deficiency of mitochondrial respiratory complex III induces an apoptotic cell death through the p53-mediated inhibition of pro-survival activities of the Activating Transcription Factor 4
Evstafieva A.G.
,
Garaeva A.A.
,
Khutornenko A.A.
,
Klepikova A.V.
,
Logacheva M.D.
,
Penin A.A.
,
Novakovsky G.E.
,
Kovaleva I.E.
,
Chumakov P.M.
в журнале
Cell death & disease
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, том 5
DOI
2014
Comparative genome sequencing reveals genomic signature of extreme desiccation tolerance in the anhydrobiotic midge
Oleg Gusev,
Yoshitaka Suetsugu
,
Richard Cornette
,
Takeshi Kawashima
,
Logacheva Maria D.
,
Kondrashov Alexey S.
,
Penin Aleksey A.
,
Rie Hatanaka
,
Shingo Kikuta
,
Sachiko Shimura
,
Hiroyuki Kanamori
,
Yuichi Katayose
,
Takashi Matsumoto
, Elena Shagimardanova, Dmitry Alexeev, Vadim Govorun,
Jennifer Wisecaver
, Alexander Mikheyev,
Ryo Koyanagi
,
Manabu Fujie
,
Tomoaki Nishiyama
,
Shuji Shigenobu
, Shibata Tomoko F.,
Veronika Golygina
,
Mitsuyasu Hasebe
,
Takashi Okuda
,
Nori Satoh
, Takahiro Kikawada
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, том 5, № 4784
DOI
2014
Crossing-over in a hypervariable species preferentially occurs in regions of high local similarity
Seplyarskiy Vladimir B.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
, Baranova Maria A.,
Leushkin Evgeny V.
,
Demidenko Natalia V.
,
Klepikova Anna V.
,
Kondrashov Fyodor A.
,
Kondrashov Alexey S.
, James Timothy Y.
в журнале
Molecular Biology and Evolution
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2014
Fast Evolution from Precast Bricks: Genomics of Young Freshwater Populations of Threespine Stickleback Gasterosteus aculeatus
Terekhanova Nadezhda V.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
,
Neretina Tatiana V.
, Barmintseva Anna E.,
Bazykin Georgii A.
,
Kondrashov Alexey S.
,
Mugue Nikolai S.
в журнале
PLoS Genetics
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 10, № 10, с. e1004696
DOI
2014
The clustering of CpG islands may constitute an important determinant of the 3D organization of interphase chromosomes
Gushchanskaya ES
,
Artemov AV
,
Ulyanov SV
,
Logacheva MD
,
Penin AA
, Kotova ES,
Akopov SB
,
Nikolaev LG
,
Iarovaia OV
,
Sverdlov ED
,
Gavrilov AA
,
Razin SV
в журнале
Epigenetics : official journal of the DNA Methylation Society
, издательство
Landes Bioscience
(United States)
, том 9, № 7, с. 951-963
DOI
2014
The plastid genome of mycoheterotrophic monocot Petrosavia stellaris exhibits both gene losses and multiple rearrangements
Logacheva Maria D.
,
Schelkunov Mikhail I.
,
Nuraliev Maxim S.
,
Samigullin Tagir H.
,
Penin Aleksey A.
в журнале
Genome biology and evolution
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 6, № 1, с. 238-246
DOI
2014
Пространственная организация генов домашнего хозяйства в интерфазных ядрах
Гущанская Е.С.
,
Артемов А.А.
,
Ульянов С.В.
,
Пенин А.А.
,
Логачева М.Д.
,
Разин С.В.
,
Гаврилов А.А.
в журнале
Молекулярная биология
, том 48, с. 1008-1018
2013
Paratrypanosoma is a novel early-branching trypanosomatid
Flegontov P.,
Votypka J.
, Skalicky T.,
Logacheva MD
,
Penin AA
,
Tanifuji G.
,
Onodera NT
,
Kondrashov AS
,
Volf P.
,
Archibald JM
,
Lukes J.
в журнале
Current Biology
, издательство
Cell Press
(United States)
, том 23, № 18, с. 1787-1793
2013
The miniature genome of a carnivorous plant Genlisea aurea contains a low number of genes and short non-coding sequences
Leushkin Evgeny V.
,
Sutormin Roman A.
, Nabieva Elena R.,
Penin Aleksey A.
,
Kondrashov Alexey S.
,
Logacheva Maria D.
в журнале
BMC Genomics
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 14, № 476
DOI
2012
Comparative Analysis of Gene Expression Level by Quantitative Real-Time PCR Has Limited Application in Objects with Different Morphology
Demidenko NV
,
Penin AA
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 7, № 5, с. 38161
DOI
2011
Correlation between number and position of floral organs in Arabidopsis
Penin A.A.
,
Logacheva M.D.
в журнале
Annals of Botany
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 108, № 1, с. 123-131
DOI
2011
De novo sequencing and characterization of floral transcriptome in two species of buckwheat (Fagopyrum)
Logacheva M.
,
Kasianov A.
,
Vinogradov D.
,
Samigullin T.
,
Gelfand M.
,
Makeev V.
,
Penin A.
в журнале
BMC Genomics
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 12, № 1, с. 30-30
DOI
2011
Selection and Validation of Reference Genes for Quantitative Real-Time PCR in Buckwheat (Fagopyrum esculentum) Based on Transcriptome Sequence Data
Demidenko N.V.
,
Logacheva M.D.
,
Penin A.A.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 6, № 5
DOI
2011
Sequencing and Analysis of Plastid Genome in Mycoheterotrophic Orchid Neottia nidus-avis
Logacheva M.D.
,
Schelkunov M.I.
,
Penin A.A.
в журнале
Genome biology and evolution
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 3, с. 1296-1303
DOI
2009
Some characteristics of genetic control of Fagopyrum esculentum flower development
Penin A.A.
, Fesenko A.N., Fesenko I.N.,
Logacheva M.D.
в журнале
Wulfenia
, издательство
Botanischer Garten des Landes Karnten
(Austria)
, том 16, с. 117-127
2009
Структура и эволюция границ инвертированного повтора и малой уникальной области хлоропластного генома гречишных и родственных семейств Caryophyllales, Polygonineae
Логачева М.Д.
,
Пенин А.А.
,
Вальехо-Роман К.М.
,
Антонов А.С.
в журнале
Молекулярная биология
, том 43, № 5, с. 818-827
2008
Bract reduction in Cruciferae: possible genetic mechanisms and evolution
Penin A.A.
в журнале
Wulfenia
, издательство
Botanischer Garten des Landes Karnten
(Austria)
, том 15
2008
Comparative chloroplast genomics and phylogenetics of Fagopyrum esculentum ssp. ancestrale–A wild ancestor of cultivated buckwheat
Logacheva M.D.
,
Samigullin T.H.
,
Dhingra A.
,
Penin A.A.
в журнале
BMC Plant Biology
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 8, № 1, с. 59
DOI
2008
Genetic and morphological analysis of floral homeotic mutants tepal-like bract and fagopyrum apetala of Fagopyrum esculentum
Logacheva M.D.
,
Fesenko I.N.
,
Fesenko A.N.
,
Penin A.A.
в журнале
Botany
, издательство
National Research Council Canada
(Canada)
, том 86, № 4, с. 367-375
2007
Взаимодействие гена BRACTEA с генами, TERMINAL FLOWER1, LEAFY и APETALA1 при формировании соцветия и цветка у Arabidopsis thaliana
Пенин А.А.
, Будаев Р.А.,
Ежова Т.А.
в журнале
Генетика
, издательство
Наука
(М.)
, том 43, № 3, с. 287-293
DOI
2007
Ген LEPIDIUM-LIKE определяет активность стволовых клеток при формировании лепестков и тычинок у Arabidopsis thaliana
Пенин А.А.
,
Логачева М.Д.
в журнале
Доклады Академии наук
, издательство
Наука
(М.)
, том 412, № 4, с. 56-58
2007
Нетипичные чередования органов цветка у Paeonia: структура и возможный механизм формирования
Логачева М.Д.
,
Прудковский П.А.
,
Ефимов С.В.
,
Пенин А.А.
в журнале
Онтогенез
, том 38, № 6, с. 463-470
2007
Филогения цветковых растений по последовательностям хлоропластного генома: в поисках «счастливого гена»
Логачева М.Д.
,
Пенин А.А.
,
Самигуллин Т.Х.
,
Вальехо-Роман К.М.
,
Антонов А.С.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 72, № 12, с. 1639-1646
2006
Определение типа и положения органов цветка: динамическая модель развития
Скрябин К.Г.,
Алексеев Д.В.
,
Ежова Т.А.
, Козлов В.Н., Кудрявцев В.Б., Носов М.В.,
Пенин А.А.
, Чуб В.В.,
Шестаков С.В.
, Шульга О.А.
в журнале
Известия Российской академии наук. Серия биологическая
, издательство
Наука
(М.)
, том 33, № 6, с. 523-535
DOI
2005
Влияние гена ABRUPTUS/PINOID Arabidopsis thaliana на экспрессию гена LEAFY
Лебедева О.В., Ондар У.Н.,
Пенин А.А.
,
Ежова Т.А.
в журнале
Генетика
, издательство
Наука
(М.)
, том 41, № 4, с. 559-565
DOI
2005
Закономерности разметки органов цветка Arabidopsis thaliana. Математическое моделирование
Алексеев Д.В.
,
Ежова Т.А.
, Козлов В.Н., Кудрявцев В.Б.,
Носов М.В.
,
Пенин А.А.
,
Скрябин К.Г.
,
Чуб В.В.
,
Шульга О.А.
,
Шестаков С.В.
в журнале
Доклады Академии наук
, издательство
Наука
(М.)
, том 401, № 4, с. 570-573
DOI
2005
Правила формирования терминального цветка
Пенин А.А.
,
Чуб В.В.
,
Ежова Т.А.
в журнале
Онтогенез
, том 36, № 2, с. 90-95
DOI
2005
Участие гена TEPAL-LIKE BRACT (TLB) в определении границы между брактеями и околоцветником у Fagopyrum esculentum Moench
Фесенко А.Н., Фесенко И.Н.,
Логачева М.Д.
,
Пенин А.А.
в журнале
Генетика
, издательство
Наука
(М.)
, том 41, № 12, с. 1367-1365
2004
Математическое моделирование генетического контроля определения типа органа цветка у Arabidopsis thaliana
Скрябин К.Г.
,
Алексеев Д.В.
,
Ежова Т.А.
,
Козлов В.Н.
,
Кудрявцев В.Б.
,
Носов М.В.
,
Пенин А.А.
,
Чуб В.В.
,
Шульга О.А.
,
Шестаков С.В.
в журнале
Известия АН
, № 4, с. 346-353
DOI
2004
Структура цветка Arabidopsis thaliana (L.) Heynh: разметка положения органов
Чуб В.В.
,
Пенин А.А.
в журнале
Онтогенез
, том 35, № 4, с. 280-284
2002
Принципы формализации данных для построения генетико-морфологической модели развития побега цветковых растений
Пенин А.А.
,
Ежова Т.А.
,
Чуб В.В.
в журнале
Онтогенез
, том 33, № 6, с. 421-428
DOI
2001
Новый ген BRACTEA (BRA) Arabidopsis thaliana (L.) Heynh., отвечающий за формирование открытого эбрактеозного соцветия. Генетика
Ежова Т.А.
,
Пенин А.А.
в журнале
Генетика
, издательство
Наука
(М.)
, том 37, № 7, с. 935-938
DOI
Книги
2003
Arabidopsis thaliana - модельный объект генетики растений (учебное пособие, под ред. Академика РАСХН Скрябина К.Г., профессора Пирузян Э.С.)
Ежова Т.А.
, Лебедева О.В.,
Огаркова О.А.
,
Пенин А.А.
,
Солдатова О.П.
,
Шестаков С.В.
место издания
МаксПресс Москва
, ISBN 5-317-00872-7, 219 с.
Доклады на конференциях
2017
Влияние длительного космического полета на экспрессию генов в сердечной мышце мышей
(Стендовый)
Авторы:
Валяева Анна
,
Жарикова Анастасия
,
Пенин Алексей
,
Логачева Мария
,
Клепикова Анна
,
Миронов Андрей
,
Гусев Олег
ИТиС'17
, Уфа, Россия, 14-18 сентября 2017
2016
Геномика растений в эпоху NGS
(Приглашенный)
Автор:
Пенин АА
Всероссийская конференция с международным участием «50 лет ВОГиС: успехи и перспективы»
, Москва, Россия, 8-10 ноября 2016
Тезисы докладов
2018
Sequencing of the polyploid transcriptomes of freshwater and migratory forms of Far East salmon Oncorhynchus nerka
Shubina E.A.
,
Markevitch G.N.
,
Penin A.A.
,
Logacheva M.D.
,
Goryunov D.V.
,
Khrustaleva A.M.
в сборнике
Contributions to the 5th Moscow International Conference "Molecular Phylogenetics and Biodiversity Biobanking"(MolPhy-5)
, серия
Moleclar Phylogenetics
, место издания
TORUS PRESS Moscow
, тезисы, с. 111-112
DOI
2018
Sequencing of the polyploid transcriptomes of freshwater and migratory forms of Far East salmon Oncorhynchus nerka, 2018
Shubina E.A.
,
Markevitch G.N.
,
Penin A.A.
,
Logacheva M.D.
,
Goryunov D.V.
,
Khrustaleva A.M.
в сборнике
Contributions to the 5th Moscow International Conference "Molecular Phylogenetics and Biodiversity Biobanking"(MolPhy-5)
, серия
серия Moleclar Phylogenetics
, место издания
TORUS PRESS Moscow
, тезисы, с. 111-112
2018
The evaluation of different types of genomic reorganization according to whole genome analysis of several closely related strains of cyanobacterium Trichormus variabilis
Meshcheryakova P.V.
,
Karbysheva E.A.
,
Mikheeva L.E.
,
Penin A.A.
,
Zhenavchuk O.F.
в сборнике
Contributions to the 5th Moscow International Conference "Molecular Phylogenetics and Biodiversity Biobanking"(MolPhy-5)
, серия
Moleclar Phylogenetics
, место издания
TORUS PRESS Moscow
, тезисы, с. 95-95
2018
Widespread diversity vs cosmopolitism of certain cyanobacterial strains of Nostocaceae family
Lidia Mikheeva
,
Elena Karbysheva
,
Aleksey Penin
,
Oxana Zhenavchuk
,
Polina Meshcheryakova
в сборнике
XXXVII ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN CULTURE COLLECTIONS’ ORGANISATION ECCO 2018
, серия
13-15 сентября 2018
, место издания
ООО "МАКС Пресс" Москва, Россия
, тезисы, с. 66-67
DOI
2017
The signatures of recombination and gene conversion in the bdelloid rotifer Adineta vaga
Vakhrusheva OA
,
Mnatsakanova EA
,
Galimov Y.
,
Neretina TV
,
Penin AA
,
Logacheva MD
,
Bazykin GA
,
Kondrashov AS
в сборнике
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB-2017
, место издания
Moscow
, тезисы, с. 27-30
2017
The signatures of recombination in the bdelloid rotifer Adineta vaga
Vakhrusheva OA
,
Mnatsakanova EA
,
Galimov Y.
,
Neretina TV
,
Penin AA
,
Logacheva MD
,
Bazykin GA
,
Kondrashov AS
в сборнике
Информационные технологии и системы (ИТиС’17)
, тезисы, с. http://itas2017.iitp.ru/papers/-http://itas2017.iitp.ru/papers/
2017
Transcriptome-based analysis of allele-specific gene expression in hepatocellular carcinoma
Krivtsova O.
,
Vinogradov D.
,
Nabieva E.
,
Logacheva M.
,
Penin A.
,
Lazarevich N.
в сборнике
Acta Naturae
, серия
Спецвыпуск No1 (Тезисы II Всероссийской конференции с международным участием «Высокопроизводительное секвенирование в геномике»)
, место издания
ООО «Парк-медиа» г. Москва
, том 9, тезисы, с. 94-94
2017
Whole-Genome Analysis of Polymorphism in a Bdelloid Rotifer Adineta vaga
Vakhrusheva OA
,
Galimov Y.
,
Mnatsakanova EA
,
Gerasimov E.
,
Neretina TV
,
Penin AA
,
Logacheva MD
,
Bazykin GA
,
Kondrashov AS
в сборнике
Society for molecular biology and evolution
, тезисы, с. SMBE-Abstract-Book-22-June-SMBE-Abstract-Book-22-June
2016
Integrated whole exome and transcriptome analysis of allele-specific expression in hepatocellular carcinoma
Krivtsova O.M.
,
Logacheva M.D.
,
Penin A.A.
,
Vinogradov D.V.
,
Nabieva E.R.
,
Lazarevich N.L.
в сборнике
Abstracts of papers presented at the EMBO Conference: From functional genomics to systems biology, 12 - 15 November 2016
, место издания
EMBL Heidelberg, Germany
, тезисы, с. 201-201
2016
Transcriptome sequencing of Epipogium (Orchidaceae) and Monotropa (Ericaceae) reveals parallel gene losses in nuclear genomes of non-photosynthetic plants
Schelkunov M.I.
,
Shtratnikova V.Y.
,
Nuraliev M.S.
,
Penin A.A.
,
Logacheva M.D.
в сборнике
Plant & Animal Genome Conference: PAG XIV, Abstracts
, место издания
San Diego
, тезисы
2015
Highly reduced plastid genomes of nonphotosynthetic orchids Epipogium aphyllum and Epipogium roseum
Schelkunov M.I.
,
Shtratnikova V.Y.
,
Nuraliev M.S.
,
Selosse M.A.
,
Penin A.A.
,
Logacheva M.D.
в сборнике
Plant & Animal Genome Conference: PAG XIII, Abstracts
, место издания
San Diego
, тезисы
2015
Nuclear genome changes accompanying a loss of photosynthesis in orchids of genus Epipogium
Schelkunov M.I.
,
Nuraliev M.S.
,
Penin A.A.
,
Logacheva M.D.
в сборнике
Сборник трудов 39-й междисциплинарной школы-конференции ИППИ РАН «Информационные технологии и системы 2015»
, тезисы, с. 248-248
2012
Patterns of terminal flower formation in mutants of arabidopsis and in natural populations of some basal monocots
Lock I.E.
,
Penin A.A.
,
Rudall P.J.
,
Remizowa M.V.
,
Sokoloff D.D.
в сборнике
Euro Evo Devo Conference: abstract book
, место издания
Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa Lisbon
, тезисы, с. 200-200
НИРы
2 марта 2020 - 16 декабря 2022
Изучение природы несогласованности филогенетического сигнала, выявляемого при анализе ядерных и пластидных нуклеотидных последовательностей
Лаборатория геносистематики растений
Руководитель:
Самигуллин Т.Х.
Ответственные исполнители:
Вальехо-Роман К.М.
,
Логачёва М.Д.
,
Пенин А.А.
Участники НИР:
Дегтярева Г.В.
,
Пименов М.Г.
,
Терентьева Е.И.
1 января 2019 - 31 декабря 2021
Изучение морфологических и генетических основ реверсий у цветковых растений на примере изменения типа листа в роде Curio
Кафедра высших растений
Руководитель:
Тимонин А.К.
Ответственный исполнитель:
Пенин А.А.
Участники НИР:
Клепикова А.В.
,
Ремизова М.В.
,
Федотов А.П.
,
Чукавин Н.Н.
4 октября 2018 - 1 марта 2022
Создание интегрированной системы для межвидового сравнения экспрессии генов у цветковых растений.
Кафедра генетики
Руководитель:
Пенин А.А.
Участники НИР:
Герасимов Е.С.
,
Касьянов А.С.
,
Клепикова А.В.
,
Логачёва М.Д.
,
Федотова А.В.
,
Шнайдер Э.Д.
,
Щелкунов М.И.
1 января 2017 - 31 декабря 2019
Сравнительный эколого-физизиологический и геномный анализ новых штаммов-изолятов азотфиксирующих цианобактерий порядка Nostocales, выделенных из природных биоценозов в различных регионах мира.
Кафедра генетики
Руководитель:
Михеева Л.Е.
Ответственные исполнители:
Женавчук О.Ф.
,
Карбышева Е.А.
Участники НИР:
Мещерякова П.В.
,
Пенин А.А.
,
Радюкина Н.Л.
1 декабря 2016 - 28 декабря 2016
"Количественное определение содержания геном-эквивалентов "
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
Руководитель:
Логачёва М.Д.
Ответственный исполнитель:
Пенин А.А.
11 апреля 2016 - 1 декабря 2016
Высокопроизводительное секвенирование с использованием технологии Illumina для разработки системы персонального генетического скрининга людей"
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
Руководитель:
Логачёва М.Д.
Ответственный исполнитель:
Пенин А.А.
1 января 2016 - 31 декабря 2020
Изучение генетической организации генома растений
Кафедра генетики
Руководитель:
Ежова Т.А.
Участники НИР:
Волкова М.А.
,
Горячева И.А.
,
Демиденко Н.В.
,
Куприянова Е.В.
,
Меньшекова И.Ю.
,
Монахова М.А.
,
Новокрещёнова М.Г.
,
Пенин А.А.
,
Сарбашева Н.П.
,
Синюшин А.А.
,
Солдатова О.П.
,
Хартина Г.А.
3 декабря 2015 - 30 декабря 2015
Разработка научно-методических основ создания программно-аппаратного комплекса индикации и идентификации генно-инженерных конструкций в составе патогенных биологических агентов
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
Руководитель:
Макаров В.В.
Участники НИР:
Калинина Н.О.
,
Касьянов А.С.
,
Логачёва М.Д.
,
Махотенко А.В.
,
Пенин А.А.
,
Сидорова Н.Н.
,
Хромов А.В.
16 октября 2015 - 31 декабря 2015
Анализ микробного разнообразия путем высокопроизводительного секвенирования фрагментов гена 16S рибосомной РНК
Отдел эволюционной биохимии
Руководитель:
Логачёва М.Д.
Участник НИР:
Пенин А.А.
1 января 2015 - 31 декабря 2018
Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем
Ректорат
Руководитель:
Садовничий В.А.
Ответственный исполнитель:
Каменский П.А.
Участники НИР:
Cоина В.С.
,
Абрамов С.М.
,
Аверина О.А.
,
Агеева Л.В.
,
Адельянов А.М.
,
Азовский А.И.
,
Акопян Ж.А.
,
Аксенова А.А.
,
Аксенова В.А.
,
Аксянов Е.А.
,
Аласания К.Ю.
,
Алдобаева И.И.
,
Александров В.В.
,
Александрова А.В.
,
Александрушкина Н.И.
,
Александрушкина Н.А.
,
Алексеевский А.В.
,
Аляутдинов А.Р.
,
Алёшин В.В.
,
Андреева Т.В.
,
Антал Т.К.
,
Антоновская А.А.
,
Антохина О.Г.
,
Арифулин Е.А.
,
Армеев Г.А.
,
Артюшин И.В.
,
Арушанян И.О.
,
Ахметжанова А.А.
,
Ашапкин В.В.
,
Бабенко В.А.
,
Бакеева Л.Е.
,
Балацкий А.В.
,
Банникова А.А.
,
Баринова Н.Н.
,
Баулина О.И.
,
Бацевич В.А.
,
Бедарева И.В.
,
Белевич Т.А.
,
Беме И.Р.
,
Бенедиктов А.А.
,
Березина Н.Я.
,
Биланенко Е.Н.
,
Бисерова Н.М.
,
Благовещенская Е.Ю.
,
Боброва В.К.
,
Бондарева Э.А.
,
Бондаренко Г.Н.
,
Борисанова А.О.
,
Брагина Е.Е.
,
Брызгалина Е.В.
,
Бубнова Е.Н.
,
Бугров Д.И.
,
Бушуев А.В.
,
Бызов Б.А.
,
Бычков А.Ю.
,
Бычкова Е.Ю.
,
Вайпан Д.В.
,
Вайс В.Б.
,
Вальехо-Роман К.М.
,
Вангели И.М.
,
Ванюшин Б.Ф.
,
Варлыгина Т.И.
,
Вархотов Т.А.
,
Васильев А.Н.
,
Васильева Е.Д.
,
Васильева С.Г.
,
Вилкул Е.А.
,
Виноградова Е.Н.
,
Виноградская М.И.
,
Владыченская И.П.
,
Водопьянов С.С.
,
Волкова О.А.
,
Волкова О.С.
,
Волцит О.В.
,
Воробьева Е.А.
,
Воронина Е.Ю.
,
Воронко О.В.
,
Ворцепнева Е.В.
,
Высоких М.Ю.
,
Гавриленко С.М.
,
Галинская Т.В.
,
Галкин И.И.
,
Галоян Э.А.
,
Ганчарова О.С.
,
Гаранина А.С.
,
Георгиев А.А.
,
Герасимов Е.С.
,
Глаголева Е.С.
,
Глушакова А.М.
,
Гмошинский В.И.
,
Гоголева С.С.
,
Година Е.З.
,
Головин А.В.
,
Гололобова М.А.
,
Гомыранов И.А.
,
Горелова О.А.
,
Горшкова Е.А.
,
Горюнов Д.В.
,
Гофман Д.К.
,
Григорьев Ф.В.
,
Григорьева А.А.
,
Григорьева О.А.
,
Грицышин В.А.
,
Груздева М.А.
,
Грум-Гржимайло О.А.
,
Гусев Ф.Е.
,
Данилович И.Л.
,
Дегтярева Г.В.
,
Диброва Д.В.
,
Добров Б.В.
,
Добровольская Т.Г.
,
Дроздова О.Ю.
,
Дуброва М.С.
,
Дудов С.В.
,
Дудова К.В.
,
Дыйканов Д.Т.
,
Дьяков М.Ю.
,
Евтеев А.А.
,
Ежова О.В.
,
Екимова И.А.
,
Еланский С.Н.
,
Елумеева Т.Г.
,
Емельянова Л.Г.
,
Еремичев Р.Ю.
,
Ерохина М.В.
,
Ефименко А.Ю.
,
Ефимов С.В.
,
Жадан А.Э.
,
Жирков И.А.
,
Зайцева А.А.
,
Захаров К.В.
,
Землемерова Е.Д.
,
Зернов А.С.
,
Зубкова Е.Н.
,
Иваненко В.Н.
,
Иваницкая О.Н.
,
Иваницкий В.В.
,
Иванов А.О.
,
Иванова А.Е.
,
Игнатов М.С.
,
Игнатова Е.А.
,
Ильина И.Ю.
,
Ильинская О.П.
,
Калякин М.В.
,
Камалов А.А.
,
Карапетян М.К.
,
Касумян А.О.
,
Каткова Е.В.
,
Качалкин А.В.
,
Квятковский А.Л.
,
Квятковский А.Я.
,
Керимов А.Б.
,
Климович П.С.
,
Климчук О.И.
,
Клёнова А.В.
,
Кнорре Д.А.
,
Князева А.А.
,
Кобельков Г.М.
,
Кобельков С.Г.
,
Кокаева Л.Ю.
,
Колбасов Г.А.
,
Колбасова Г.Д.
,
Колесниченко К.А.
,
Кондакова О.А.
,
Коновалова О.П.
,
Конюхов И.В.
,
Копылов-Гуськов Ю.О.
,
Королев Д.Е.
,
Королева А.Т.
,
Корсуновская О.С.
,
Коршунова Г.А.
,
Коршунова Т.А.
,
Кочкин Д.В.
,
Кошелева Н.В.
,
Крайнов В.Н.
,
Крамина Т.Е.
,
Кремнёв С.В.
,
Криницына А.А.
,
Крупицкий А.В.
,
Крускоп С.В.
,
Кручинин П.А.
,
Кручинина А.П.
,
Кузищин К.В.
,
Кузнецов А.Г.
,
Кулебякин К.Ю.
,
Кулебякина М.А.
,
Куприянова Е.В.
,
Кураков А.В.
,
Кутов Д.К.
,
Кутуева Л.И.
,
Кутузова И.А.
,
Кушунина М.А.
,
Лазарев Е.Н.
,
Лапашина А.С.
,
Лапыгина Е.В.
,
Лебедев В.С.
,
Левик Л.Ю.
,
Лемак С.С.
,
Леонтьева О.А.
,
Лисенкова А.А.
,
Лисовский А.А.
,
Лобакова Е.С.
,
Логачёва М.Д.
,
Лопатина Ю.В.
,
Лубнина Н.В.
,
Лукашевич Н.В.
,
Лукьянов А.А.
,
Лысак Л.В.
,
Лысков Д.Ф.
,
Мазей Ю.А.
,
Макарова Н.Е.
,
Максимова И.А.
,
Малахов В.В.
,
Малютина А.М.
,
Манахов А.Д.
,
Манских В.Н.
,
Манучарова Н.А.
,
Маркина М.М.
,
Маркова О.В.
,
Марова-Кляйнбуб И.М.
,
Мартынов А.В.
,
Марфенина О.Е.
,
Маслакова А.А.
,
Мелихова Е.В.
,
Мельникова М.Н.
,
Милютина И.А.
,
Михайлов К.В.
,
Михайлов К.Г.
,
Морковин А.А.
,
Москаленко В.Н.
,
Мохова Е.Н.
,
Мулкиджанян А.Я.
,
Мунтян М.С.
,
Мурашев В.В.
,
Мурашев И.А.
,
Нагаев Б.Э.
,
Назаров П.А.
,
Назаров Р.А.
,
Нанова О.Г.
,
Недоспасов С.А.
,
Неретин Н.Ю.
,
Неретина Т.В.
,
Нестеренко А.М.
,
Нетрусов А.И.
,
Никитин М.А.
,
Николаева О.В.
,
Нилова М.В.
,
Нимирицкий П.П.
,
Новаковский Г.Э.
,
Новаковский Г.Э.
,
Новоселецкая Е.С.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Носов А.М.
,
Оболенская Е.В.
,
Овченков Е.А.
,
Огурцов С.В.
,
Озеров А.Л.
,
Озрина Р.Д.
,
Олейникова О.В.
,
Олейникова О.В.
,
Онипченко В.Г.
,
Онищенко Г.Е.
,
Орлов Д.С.
,
Орловский И.В.
,
Павлинов И.Я.
,
Павлов Д.С.
,
Павлов С.Д.
,
Павлова Н.С.
,
Панина О.Б.
,
Панютина А.А.
,
Парфёнова Е.В.
,
Пенин А.А.
,
Перехватов В.В.
,
Петракова О.С.
,
Петров Н.Б.
,
Петров П.Н.
,
Петушкова Ю.А.
,
Пивоваров Е.А.
,
Плетюшкина О.Ю.
,
Плеханова О.С.
,
Погосян С.И.
,
Поздняков Л.А.
,
Полевова С.В.
,
Полилов А.А.
,
Поляков М.П.
,
Полянская Л.М.
,
Попеленский Ф.Ю.
,
Попкова Е.Г.
,
Попов В.С.
,
Попова Е.Н.
,
Попова С.С.
,
Поярков Н.А.
,
Просвиров А.С.
,
Птушенко В.В.
,
Пугачева Т.Т.
,
Рамонова А.А.
,
Распопова А.А.
,
Ревина Д.Б.
,
Редькин Я.А.
,
Решетников Р.В.
,
Римская-Корсакова Н.Н.
,
Рогаев Е.И.
,
Романов А.А.
,
Романова Е.С.
,
Романова Е.С.
,
Рубина К.А.
,
Румянцев В.Ю.
,
Русин Л.Ю.
,
Русинов И.С.
,
Рыжов А.Л.
,
Рысенкова К.Д.
,
Савилова З.Д.
,
Савицкая М.А.
,
Савицкий В.Ю.
,
Савкин И.А.
,
Савченко А.С.
,
Самигуллин Т.Х.
,
Самойлов К.Ю.
,
Самоходская Л.М.
,
Самсонов Т.Е.
,
Северова Е.Э.
,
Селях И.О.
,
Семенова А.В.
,
Семенова Л.Р.
,
Семенова М.Л.
,
Семин В.Н.
,
Семина Е.В.
,
Сенченков Е.П.
,
Сенчукова А.Л.
,
Серегин А.П.
,
Сидоренко Г.Ю.
,
Симоненко Е.Ю.
,
Симонян Р.А.
,
Синев А.Ю.
,
Скулачев В.П.
,
Скулачев К.В.
,
Слободкина Е.А.
,
Смирнова Е.А.
,
Соловченко А.Е.
,
Соловьева Е.Н.
,
Сорокин М.И.
,
Сото Э.
,
Спасская Н.Н.
,
Сперанская А.С.
,
Спирин С.А.
,
Стамбольский Д.В.
,
Старостина Е.Е.
,
Степанов А.Л.
,
Сулимов А.В.
,
Сулимов В.Б.
,
Сумбатян Н.В.
,
Суханова Е.С.
,
Сухоруков А.П.
,
Сысоева В.Ю.
,
Тарнопольская М.Е.
,
Тащилова А.С.
,
Твердислов В.А.
,
Темерева Е.Н.
,
Терентьева Е.И.
,
Терехова В.А.
,
Тимошенко В.Ю.
,
Титова М.В.
,
Тихонов В.В.
,
Тишечкин Д.Ю.
,
Токарчук А.В.
,
Томкович П.С.
,
Троицкий А.В.
,
Тужилин А.А.
,
Тузов К.А.
,
Федоров А.В.
,
Федоров В.В.
,
Федорова А.В.
,
Федосеева (Бандолина) Е.В.
,
Федосов В.Э.
,
Фенюк Б.А.
,
Фетисова Е.К.
,
Флегонтов П.Н.
,
Фырнин Д.М.
,
Хайлова Л.С.
,
Храмова Ю.В.
,
Цетлин А.Б.
,
Чеканов К.А.
,
Челомбитько М.А.
,
Черепанов Д.А.
,
Чернов И.Ю.
,
Черняк Б.В.
,
Чертополохов В.А.
,
Чертопруд Е.С.
,
Чесунов А.В.
,
Чивкунова О.Б.
,
Чотчаева Ф.Р.
,
Чубатова Н.В.
,
Чудаев Д.А.
,
Чурикова О.А.
,
Шагиева Г.С.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Шалаева Д.Н.
,
Шаранова Н.Э.
,
Шаталкин А.И.
,
Шаталова Н.Н.
,
Шафеи Р.А.
,
Шахпаронов В.В.
,
Шведчикова Н.К.
,
Шестаков А.И.
,
Шилов Е.С.
,
Шиловский Г.А.
,
Шнырева А.В.
,
Штратникова В.Ю.
,
Шубина Е.А.
,
Шуленина Н.Э.
,
Щелкунов М.И.
,
Щербаков П.Н.
,
Эльдаров Ч.М.
,
Юрцева О.В.
,
Яворская М.И.
,
Яковенко С.А.
,
Якушев А.В.
,
Якушев А.Г.
,
Яровая Е.Б.
25 августа 2014 - 31 декабря 2016
Выявление перспективных молекулярных мишеней для терапии гепатоцеллюлярной карциномы на основе системно-биологического анализа транскриптомных данных, полученных методом NGS.
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
Руководитель:
Кондрашов А.С.
Участники НИР:
Базыкин Г.А.
,
Герасимов Е.С.
,
Клепикова А.В.
,
Лазаревич Н.Л.
,
Логачёва М.Д.
,
Мюге Н.С.
,
Пенин А.А.
30 июня 2014 - 31 декабря 2016
Некодирующая РНК: функции и эволюция
Факультет биоинженерии и биоинформатики
Руководитель:
Миронов А.А.
Участники НИР:
Виноградова С.В.
,
Пенин А.А.
,
Солдатов Р.А.
,
Ставровская Е.Д.
,
Шеваль Е.В.
1 января 2014 - 31 декабря 2016
Разработка подходов к анализу сетчатой эволюции у растений с использованием данных высокопроизводительного параллельного секвенирования
Отдел эволюционной биохимии
Руководитель:
Вальехо-Роман К.М.
Участники НИР:
Дегтярева Г.В.
,
Ефимов С.В.
,
Логачёва М.Д.
,
Лысков Д.Ф.
,
Пенин А.А.
,
Самигуллин Т.Х.
,
Соколов Д.Д.
,
Терентьева Е.И.
1 февраля 2012 - 29 ноября 2013
Структурно-функциональный анализ геномов растений и цианобактерий
Кафедра генетики
Руководитель:
Шестаков С.В.
Участники НИР:
Бабыкин М.М.
,
Демиденко Н.В.
,
Ежова Т.А.
,
Женавчук О.Ф.
,
Зинченко В.В.
,
Карбышева Е.А.
,
Куприянова Е.В.
,
Михеева Л.Е.
,
Новокрещёнова М.Г.
,
Пенин А.А.
,
Синюшин А.А.
,
Солдатова О.П.
1 марта 2011 - 31 декабря 2012
ИДЕНТИФИКАЦИЯ ГЕНОВ ГРЕЧИХИ ОПРЕДЕЛЯЮЩИХ ХОЗЯЙСТВЕННО-ЦЕННЫЕ ПРИЗНАКИ НА ОСНОВЕ АНАЛИЗА ГЕНОМНЫХ ДАННЫХ
Кафедра генетики
Руководитель:
Пенин А.А.
Участники НИР:
Демиденко Н.В.
,
Куприянова Е.В.
,
Логачёва М.Д.
9 июня 2010 - 30 ноября 2011
Структурно-функциональный анализ геномов и генных сетей у растений и цианобактерий
Кафедра генетики
Руководитель:
Шестаков С.В.
Участники НИР:
Альберт Е.В.
,
Гостимский С.А.
,
Демиденко Н.В.
,
Карбышева Е.А.
,
Клепикова А.В.
,
Коробан Н.В.
,
Куприянова Е.В.
,
Курбидаева А.С.
,
Пенин А.А.
,
Синюшин А.А.
7 мая 2010 - 25 ноября 2012
Синтез сравнительно-морфологических и молекулярно-генетических данных как источников изучения путей и механизмов эволюционных преобразований в модельных группах покрытосеменных растений
Биологический факультет
Руководитель:
Соколов Д.Д.
Участники НИР:
Беэр А.С.
,
Беэр С.С.
,
Вислобоков Н.А.
,
Дегтярева Г.В.
,
Крамина Т.Е.
,
Куприянова Е.В.
,
Локк И.Э.
,
Нуралиев М.С.
,
Пенин А.А.
,
Ремизова М.В.
3 мая 2010 - 31 декабря 2012
Генетическая регуляция стволовости клеток растений
Кафедра генетики
Руководитель:
Ежова Т.А.
Участники НИР:
Альберт Е.В.
,
Кавай-оол У.Н.
,
Куприянова Е.В.
,
Курбидаева А.С.
,
Пенин А.А.
,
Солдатова О.П.
1 января 2001 - 31 декабря 2015
Изучение генетической организации генома растений
Кафедра генетики
Руководитель:
Ежова Т.А.
Участники НИР:
Волкова М.А.
,
Горячева И.А.
,
Демиденко Н.В.
,
Куприянова Е.В.
,
Могилевский С.Л.
,
Монахова М.А.
,
Новокрещёнова М.Г.
,
Пенин А.А.
,
Синюшин А.А.
,
Солдатова О.П.
,
Хартина Г.А.
Награды и премии
2020
Академическая премия
Лауреаты:
Mikhailov Kirill V.
,
Efeykin Boris D.
,
Panchin Alexander Y.
,
Knorre Dmitry A.
,
Logacheva Maria D.
,
Penin Aleksey A.
,
Muntyan Maria S.
,
Nikitin Mikhail A.
,
Popova Olga V.
,
Zanegina Olga N.
,
Vyssokikh Mikhail Y.
,
Spiridonov Sergei E.
,
Aleoshin Vladimir V.
,
Panchin Yuri V.
НИИ физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского, Россия
Диссертация
2003
Анализ генетического контроля и моделирование развития соцветия у Arabidopsis thaliana (L.) Heynh
Кандидатская диссертация по специальности 03.00.15 (биол. науки)
Автор:
Пенин Алексей Александрович
, к.б.н.
Научный руководитель:
Ежова Т.А.
, д.б.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 002.214.01
при Институт общей генетики РАН
Руководство дипломными работами
2022
СРАВНЕНИЕ ТРАНСКРИПТОМОВ СЕМЯПОЧЕК И ПЫЛЬНИКОВ НЕКОТОРЫХ БАЗАЛЬНЫХ ПОКРЫТОСЕМЕННЫХ
Научные руководители:
Ремизова М.В.
,
Пенин А.А.
Автор: Зубарев Василий Максимович (Бакалавр)
2015
Влияние качества РНК на количественный анализ экспрессии генов с использованием методов высокопроизводительного секвенирования
Научный руководитель:
Пенин А.А.
Автор: Близнина А.И., (Бакалавр)
2014
Анализ роли гена CHB3/BRA, кодирующего элемент комплекса ремоделирования хроматина SWI/SNF, в регуляции развития Arabidopsis thaliana
Научный руководитель:
Пенин А.А.
Автор: Коровкина А.В. (Специалист)
2011
«Анализ экспрессии генов, контролирующих развитие соцветия и цветка, у растений дикого типа и мутантов гречихи посевной (Fagopyrum esculentum Moench)».
Научный руководитель:
Пенин АА
Автор: Демиденко Н.В., (Специалист)
Авторство учебных курсов
2005
Компьютерные методы в генетике
Автор:
Пенин А.А.
2000
Большой практикум по генетике растений
Авторы:
Солдатова О.П.
,
Ежова Т.А.
,
Пенин А.А.
Преподавание учебных курсов
с 8 февраля 2005
Компьютерные методы в генетике
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
,
Кафедра генетики
обязательная, по выбору (спецкурс), лекции, 48 часов