Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
Галицына Александра Алексеевна
Соавторы:
Разин С.В.
,
Ульянов С.В.
,
Khrameeva E.
,
Гельфанд М.С.
,
Кос П.И.
,
Логачёва М.Д.
,
Чертович А.В.
,
Шевелёв Ю.Я.
,
Mikhaleva E.
,
Doronin S.A.
,
Flyamer I.M.
,
Васецкий Е.С.
,
Гаврилов А.А.
показать полностью...
,
Половников К.Е.
,
Golov A.K.
,
Magnitov M.
,
Starchikov S.S.
,
Алексеевский А.В.
,
Жарикова А.А.
,
Ильин А.А.
,
Карягина-Жулина А.С.
,
Лужин А.О.
,
Миронов А.А.
,
Ненашева В.В.
,
Нечаев С.К.
,
Попов Я.В.
,
Спирин С.А.
,
Захарова В.В.
,
Abdennur N.A.
,
Abramov Y.A.
,
Evko G.S.
,
Gavrilov A.
,
Germini D.
,
Gorsky A.
,
Imakaev M.V.
,
Kobets V.A.
,
Kochetkova T.V.
,
Luzhin A.
,
Merkel A.Y.
,
Olenkina O.M.
,
Tsoy O.L.
,
Tyakht A.V.
,
Zakharova V.S.
,
Виндюрин А.С.
,
Герасимов Е.С.
,
Горлова А.В.
,
Дашинимаев Э.Б.
,
Кантидзе О.Л.
,
Ковина А.П.
,
Кононова А.А.
,
Котов А.А.
,
Лактионов П.П.
,
Максимов Д.А.
,
Нечаев С.К.
,
Пенин А.А.
,
Шлом В.
14 статей
,
14 докладов на конференциях
,
4 тезисов докладов
,
1 НИР
,
1 учебный курс
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 68, Scopus: 39
IstinaResearcherID (IRID): 8399315
Деятельность
Статьи в журналах
2023
HiConfidence: a novel approach uncovering the biological signal in Hi-C data affected by technical biases
Kobets Victoria A.
,
Ulianov Sergey V.
,
Galitsyna Aleksandra A.
,
Doronin Semen A.
,
Mikhaleva Elena A.
,
Gelfand Mikhail S.
,
Shevelyov Yuri Y.
,
Razin Sergey V.
,
Khrameeva Ekaterina E.
в журнале
Briefings in Bioinformatics
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2023
RNA-DNA interactomes of three prokaryotes uncovered by proximity ligation
Gavrilov Alexey A.
,
Evko Grigory S.
,
Galitsyna Aleksandra A.
,
Ulianov Sergey V.
,
Kochetkova Tatiana V.
,
Merkel Alexander Y.
,
Tyakht Alexander V.
,
Razin Sergey V.
в журнале
Communications Biology
, издательство
Springer Nature
(Switzerland)
, том 6, № 473
DOI
2022
Comparison of genome architecture at two stages of male germline cell differentiation in Drosophila
Ilyin Artem A.
,
Kononkova Anna D.
,
Golova Anastasia V.
,
Shloma Viktor V.
,
Olenkina Oxana M.
,
Nenasheva Valentina V.
,
Abramov Yuri A.
,
Kotov Alexei A.
,
Maksimov Daniil A.
,
Laktionov Petr P.
,
Pindyurin Alexey V.
,
Galitsyna Aleksandra A.
,
Ulianov Sergey V.
,
Khrameeva Ekaterina E.
,
Gelfand Mikhail S.
, Belyakin Stepan N.,
Razin Sergey V.
,
Shevelyov Yuri Y.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 50, № 6, с. 3203-3225
DOI
2022
RedChIP identifies noncoding RNAs associated with genomic sites occupied by Polycomb and CTCF proteins
Gavrilov A.A.
, Sultanov R.I.,
Magnitov M.D.
,
Galitsyna A.A.
,
Dashinimaev E.B.
, Lieberman Aiden E.,
Razin S.V.
в журнале
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
, издательство
National Academy of Sciences
(United States)
, том 119, № 1
DOI
2021
Order and stochasticity in the folding of individual Drosophila genomes
Ulianov Sergey V.
,
Zakharova Vlada V.
,
Galitsyna Aleksandra A.
,
Kos Pavel I.
,
Polovnikov Kirill E.
,
Flyamer Ilya M.
,
Mikhaleva Elena A.
,
Khrameeva Ekaterina E.
,
Germini Diego
,
Logacheva Mariya D.
, Gavrilov Alexey A.,
Gorsky Alexander S.
,
Nechaev Sergey K.
,
Gelfand Mikhail S.
,
Vassetzky Yegor S.
,
Chertovich Alexander V.
, Shevelyov Yuri Y.,
Razin Sergey V.
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, том 12, № 1
DOI
2021
Perspectives for the reconstruction of 3D chromatin conformation using single cell Hi-C data
Kos PI
,
Galitsyna AA
,
Ulianov SV
,
Gelfand MS
,
Razin SV
,
Chertovich AV
в журнале
PLoS Computational Biology
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 17, № 11, с. e1009546
DOI
2020
Studying RNA-DNA interactome by Red-C identifies noncoding RNAs associated with various chromatin types and reveals transcription dynamics
Gavrilov AA,
Zharikova AA
,
Galitsyna AA
,
Luzhin AV
, Rubanova NM,
Golov AK
, Petrova NV,
Logacheva MD
,
Kantidze OL
,
Ulianov SV
,
Magnitov MD
,
Mironov AA
,
Razin SV
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 48, № 12, с. 6699-6714
DOI
2019
Nuclear lamina integrity is required for proper spatial organization of chromatin in Drosophila
Ulianov Sergey V.
,
Doronin Semen A.
,
Khrameeva Ekaterina E.
,
Kos Pavel I.
,
Luzhin Artem V.
,
Starikov Sergei S.
,
Galitsyna Aleksandra A.
,
Nenasheva Valentina V.
,
Ilyin Artem A.
,
Flyamer Ilya M.
,
Mikhaleva Elena A.
,
Logacheva Mariya D.
,
Gelfand Mikhail S.
,
Chertovich Alexander V.
,
Gavrilov Alexey A.
,
Razin Sergey V.
,
Shevelyov Yuri Y.
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, № 1176, с. 1-11
DOI
2018
A whole-genome map of chromatin-bound RNAs
Gavrilov A.,
Zharikova A.
,
Galitsyna A.
,
Razin S.
,
Mironov A.A.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 8, № Suppl 1, с. 137-137
2018
Single-cell Hi-C discloses general principles of the individual genome folding in Drosophila
Zakharova VS,
Galitsyna AA
,
Polovnikov KE
,
Khrameeva EE
,
Logacheva MD
, Mikhaleva EA, Vassetzky ES, Gavrilov AA, Shevelev YY,
Nechaev SK
,
Ulianov SV
,
Razin SV
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 8, № Suppl 1, с. 65-66
2017
Activation of the alpha-globin gene expression correlates with dramatic upregulation of nearby non-globin genes and changes in local and large-scale chromatin spatial structure
Ulianov Sergey V.
,
Galitsyna Aleksandra A.
,
Flyamer Ilya M.
,
Golov Arkadiy K.
,
Khrameeva Ekaterina E.
,
Imakaev Maxim V.
,
Abdennur Nezar A.
,
Gelfand Mikhail S.
,
Gavrilov Alexey A.
,
Razin Sergey V.
в журнале
Epigenetics and Chromatin
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 10, № 1, с. 35
DOI
2017
Evolution of the genome 3D organization: comparison of fused and segregated globin gene clusters
Kovina AP
, Petrova NV, Gushchanskaya ES, Dolgushin KV,
Gerasimov ES
,
Galitsyna AA
,
Penin AA
, Flyamer IM, Ioudinkova ES, Gavrilov AA,
Vassetzky YS
,
Ulianov SV
, Iarovaia OV,
Razin S.V.
в журнале
Molecular Biology and Evolution
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2015
StructAlign – ПРОГРАММА ДЛЯ ВЫРАВНИВАНИЯ СТРУКТУР ДНК БЕЛКОВЫХ КОМПЛЕКСОВ
Попов Я.В.
,
Галицына А.А.
,
Алексеевский А.В.
,
Карягина А.С.
,
Спирин С.А.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 80, № 11, с. 1683-1687
2015
StructAlign, a Program for Alignment of Structures of DNA–Protein Complexes
Popov Ya V.
,
Galitsyna A.A.
,
Alexeevski A.V.
,
Karyagina A.S.
,
Spirin S.A.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 80, № 11, с. 1465-1468
DOI
Доклады на конференциях
2019
Исследование пространственной организации хроматина Dictyostelium discoideum
(Устный)
Авторы:
Ульянов С.В.
,
Цой О.
,
Храмеева Е.Е.
,
Лужин А.Н.
,
Галицина А.
,
Стариков С.С.
,
Гельфанд М.С.
,
Разин С.В.
II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды»
, Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
2019
Chromatin 3D conformation from single cell Hi-C data
(Стендовый)
Авторы:
Кос П.И.
,
Галицына А.А.
,
Чертович А.В.
,
Гельфанд М.С.
,
Разин С.В.
,
Ульянов Сергей Владимирович
EMBO Workshop: Chromatin and epigenetics
, Хайдельберг, Германия, 1-4 мая 2019
2018
Reconstruction of the chromatin 3D conformation from single cell Hi-C data
(Устный)
Авторы:
Кос П.И.
,
Галицына А.А.
,
Чертович А.В.
,
Гельфанд М.С.
,
Разин С.В.
,
Ульянов С.В.
IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)
, Мадрид, Испания, 3-6 декабря 2018
2018
АНАЛИЗ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ГЕНОМА В ИНДИВИДУАЛЬНЫХ КЛЕТКАХ
(Пленарный)
Авторы:
Захарова В.С.
,
Галицина А.А.
,
Половников К.Е.
,
Ульянов С.В.
,
Храмеева Е.Е.
,
Логачева М.Д.
,
Михалева Е.А.
,
Васецкий Е.С.
,
Гаврилов А.А.
,
Нечаев С.К.
,
Шевелев Ю.Я.
,
Разин С.В.
V МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ “ПОСТГЕНОМ’2018”
, Казань, Россия, 29 октября - 2 ноября 2018
2018
Исследование свойств РНК-ДНК контактов в хроматине
(Стендовый)
Авторы:
Жарикова Анастасия А.
,
Галицына Александра А.
,
Гаврилов Алексей A.
,
Логачева Мария Д.
,
Разин Сергей В.
,
Андрей А.Миронов
Информационные технологии и системы (ИТиС'18)
, Казань, Россия, 25-29 сентября 2018
2018
Сравнение алгоритмов поиска ТАДов в данных Hi-C
(Стендовый)
Авторы:
Галицына А.А.
,
Мыларщиков Д.Е.
междисциплинарная школа-конференция ИТиС 2018
, Казань, Россия, 25-30 сентября 2018
2018
SELF-ORGANIZATION OF DROSOPHILA CHROMATIN INTO TOPOLOGICALLY- ASSOCIATING DOMAINS
(Приглашенный)
Авторы:
Ulianov S.V.
,
Khrameeva E.E.
,
Zakharova V.S.
,
Galitsyna A.A.
,
Polovnikov K.E.
,
Logacheva M.D.
,
Mikhaleva E.A.
,
Vassetzky E.S.
,
Gavrilov A.A.
,
Kos P.
,
Chertovich A.
,
Gelfand M.S.
,
Shevelev Y.Y.
,
Razin S.V.
ХРОМОСОМА 2018
, Новосибирский Академгородок, Россия, 20-24 августа 2018
2018
Single-cell Hi-C discloses general principles of the individual genome folding in Drosophila
(Приглашенный)
Авторы:
Zakharova V.S.
,
Galitsyna A.A.
,
Polovnikov K.E.
,
Khrameeva E.E.
,
Logacheva M.D.
,
Razin S.V.
,
Vassetzky E.S.
,
Gavrilov A.A.
,
Shevelev Y.Y.
,
Nechaev S.K.
,
Ulianov S.V.
,
Mikhaleva E.A.
The 43th FEBS Congress
, Прага, Чехия, 7-12 июля 2018
2017
Исследование свойств РНК-ДНК контактов в хроматине
(Устный)
Авторы:
Жарикова А.А.
,
Галицына А.А.
,
Миронов А.А.
,
Логачеа М.Д.
,
Разин С.В.
,
Гаврилов А.А.
ИТиС'17
, Уфа, Россия, 14-18 сентября 2017
2017
Исследование свойств РНК-ДНК контактов в хроматине
(Устный)
Авторы:
Гаврилов А.А.
,
Логачеа М.Д.
,
Миронов А.А.
,
Галицына А.А.
,
Разин С.В.
,
Жарикова А.А.
ИТиС'17
, Уфа, Россия, 14-18 сентября 2017
2017
Adult and larval subloci of the zebrafish major alpha/beta-globin gene cluster possess different epigenetic state and spatial chromatin structure.
(Стендовый)
Авторы:
Gerasimov E.S.
,
Kovina A.P.
,
Petrova N.V.
,
Razin S.V.
,
Ulianov S.V.
,
Iarovaia O.V.
,
Galitsina A.A.
42nd FEBS Congress "From molecules to cells and back"
, Иерусалим, Израиль, 10-14 сентября 2017
2017
GENOME WIDE MAPPING OF RNA-CHROMATIN INTERACTOME IN VIVO
(Устный)
Авторы:
Gavrilov A.
,
Galitsyna A.
,
Mironov A.
,
Razin S.
,
Zharikova A.
25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus
, Нижний Новгород, Россия, 19-22 июня 2017
2017
ORGANIZATION AND EVOLUTION OF VERTEBRATE ALPHA-GLOBIN GENE DOMAINS
(Устный)
Авторы:
Kovina A.P.
,
Petrova N.V.
,
Guschanskaya E.S.
,
Galitsina A.A.
,
Flyamer I.M.
,
Gerasimov E.S.
,
Vasetzky E.S.
,
Ulianov S.V.
,
Iarovaia O.V.
,
Razin S.V.
25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus
, Нижний Новгород, Россия, 19-22 июня 2017
2016
Cell-type specific and transcription-related organization of TADs in and around the chicken alpha-globin gene domain
(Стендовый)
Авторы:
Ulianov Sergey V.
,
Galitsyna Alexandra A.
,
Flyamer Ilya M.
,
Khrameeva Ekaterina E.
,
Imakaev Maxim V.
,
Abdennur Nezar A.
,
Gelfand Mikhail S.
,
Gavrilov Alexey A.
,
Razin Sergey V.
Gordon Research Conference "Chromatin Structure and Function 2016"
, Les Diablerets, Швейцария, 22-27 мая 2016
Тезисы докладов
2018
Nuclear lamina maintains global spatial organization of chromatin in Drosophila cultured cells
Ulianov Sergey V.
,
Doronin Semen A.
,
Khrameeva Ekaterina E.
,
Kos Pavel I.
,
Starikov Sergey S.
,
Galitsyna Aleksandra A.
,
Artem Luzhin
,
Gelfand Mikhail S.
,
Chertovich Alexander V.
,
Razin Sergey V.
,
Shevelyov Yuri Y.
в сборнике
2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)
, тезисы, с. 2493-2493
DOI
2018
Reconstruction of the chromatin 3D conformation from single cell Hi-C data
Kos Pavel I.
,
Galitsyna Aleksandra A.
,
Ulianov Sergey V.
,
Gelfand Mikhail S.
,
Razin Sergey V.
,
Chertovich Alexander V.
в сборнике
2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)
, тезисы, с. 2476-2476
DOI
2018
Single-cell Hi-C demonstrates that TADs are stable units of Drosophila genome folding that persist in individual cells
Zakharova Vlada S.
,
Galitsyna Aleksandra A.
,
Polovnikov Kirill E.
,
Khrameeva Ekaterina E.
,
Logacheva Mariya D.
,
Mikhaleva Elena A.
,
Vassetzky Egor S.
, Gavrilov Aleksey A.,
Shevelev Yuri Y.
,
Nechaev Sergey K.
,
Ulianov Sergey V.
,
Razin Sergey V.
в сборнике
2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)
, тезисы, с. 2494-2494
DOI
2018
The chromatin structure of Dictyostelium discoideum
Olga Tsoy
,
Aleksandra Galitsyna
,
Ekaterina Khrameeva
,
Sergey Ulianov
,
Mikhail Gelfand
,
Sergey Razin
в сборнике
2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)
, тезисы, с. 2492-2492
DOI
НИРы
5 марта 2014 - 31 декабря 2016
Разработка алгоритмов манипуляций с блоками выравниваний и их применение для аннотации и реаннотации геномов
Отдел математических методов в биологии
Руководитель:
Алексеевский А.В.
Участники НИР:
Алексеевский Д.А.
,
Алешина Ю.А.
,
Галицына А.А.
,
Карягина-Жулина А.С.
,
Мошенский Д.М.
,
Муравьева А.В.
,
Нагаев Б.Э.
,
Николаев М.Ю.
,
Пеков Ю.А.
,
Попов Я.В.
,
Спирин С.А.
Авторство учебных курсов
2017
Информатика (Введение в Python)
Авторы:
Червонцева З.
,
Пензар Д.
,
Кудрин Р.
,
Галицына А.