Шенкарев Захар Олегович
доктор физико-математических наук
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук», ведущий научный сотрудник, руководитель группы структурной биологии ионных каналов
Количество цитирований статей в журналах по данным
Web of Science: 208,
Scopus: 108
IstinaResearcherID (IRID): 5843805
Деятельность
Статьи в журналах
2019
Cell-Free Expression of Sodium Channel Domains for Pharmacology Studies. Noncanonical Spider Toxin Binding Site in the Second Voltage-Sensing Domain of Human Nav1.4 Channel
Myshkin Mikhail Yu ,
Männikkö Roope,
Krumkacheva Olesya A. ,
Kulbatskii Dmitrii S. ,
Chugunov Anton O. ,
Berkut Antonina A. ,
Paramonov Alexander S. ,
Shulepko Mikhail A. ,
Fedin Matvey V. ,
Hanna Michael G. ,
Kullmann Dimitri M. ,
Bagryanskaya Elena G. ,
Arseniev Alexander S. ,
Kirpichnikov Mikhail P. ,
Lyukmanova Ekaterina N. ,
Vassilevski Alexander A. ,
Shenkarev Zakhar O.
в журнале Frontiers in pharmacology , издательство Frontiers Media] ([Lausanne, Switzerland) , № eCollection 2019
DOI
2019
Cryoelectron microscopy study of water-soluble extracellular domain of α7 nicotinic acetylcholine receptor
Tsarev Andrey V. ,
Kamyshinskii Roman A. ,
Mikirtumov Vasiliy I. ,
Kulbatskii Dmitriy S. ,
Yablokov Eugene O. ,
Shenkarev Zakhar O. ,
Sokolova Olga S. ,
Lyukmanova Ekaterina N.
в журнале International Journal of Biomedicine , том 9, № S19, с. 20
DOI
2019
Recombinant Production and Structure–Function Study of the Ts1 Toxin from the Brazilian Scorpion Tityus serrulatus
Shenkarev Z.O. ,
Shulepko M.A. ,
Peigneur S. ,
Myshkin M.Yu ,
Berkut A.A. ,
Vassilevski A.A. ,
Tytgat J. ,
Lyukmanova E.N. ,
Kirpichnikov M.P.
в журнале Doklady Biochemistry and Biophysics , издательство M A I K Nauka - Interperiodica (Russian Federation) , том 484, № 1, с. 9-12
DOI
2018
Crystallomycin revisited after 60 years: aspartocins B and C
Tyurin Anton P. ,
Alferova Vera A. ,
Paramonov Alexander S. ,
Shuvalov Maxim V. ,
Malanicheva Irina A. ,
Grammatikova Natalia E. ,
Solyev Pavel N. ,
Liu Shaowei ,
Sun Chenghang ,
Prokhorenko Igor A. ,
Efimenko Tatyana A.,
Terekhova Larisa P. ,
Efremenkova Olga V. ,
Shenkarev Zakhar O. ,
Korshun Vladimir A.
в журнале MedChemComm , издательство Royal Society of Chemistry (United Kingdom) , том 9, № 4, с. 667-675
DOI
2018
Human secreted proteins SLURP-1 and SLURP-2 control the growth of epithelial cancer cells via interactions with nicotinic acetylcholine receptors
Lyukmanova E.N. ,
Bychkov M.L.,
Sharonov G.V.,
Efremenko A.V.,
Shulepko M.A.,
Kulbatskii D.S. ,
Shenkarev Z.O. ,
Feofanov A.V. ,
Dolgikh D.A. ,
Kirpichnikov M.P.
в журнале British Journal of Pharmacology , издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) , том 175, № 11, с. 1973-1986
DOI
2018
Recombinant Production, Reconstruction in Lipid–Protein Nanodiscs, and Electron Microscopy of Full-Length Alpha-Subunit of Human Potassium Channel Kv7.1
Shenkarev Z.O. ,
Karlova M.G. ,
Kulbatskii D.S. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Lyukmanova E.N. ,
Sokolova O.S.
в журнале Biochemistry (Moscow) , издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom) , том 83, № 5, с. 562-573
DOI
2017
Human proteins SLURP-1 and SLURP-2 suppress proliferation of epithelial cells by interaction with nicotinic acetylcholine receptors
Kulbatskii D. ,
Bychkov M.,
Efremenko A. ,
Sharonov G. ,
Shulepko M. ,
Shenkarev Z. ,
Feofanov A. ,
Kirpichnikov M. ,
Dolgikh D. ,
Lyukmanova E.
в журнале FEBS Journal , издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom) , том 284, № Suppl. 1, с. 352
DOI
2017
Three-Finger Proteins from the Ly6/uPAR Family: Functional Diversity within One Structural Motif
Vasilyeva N.A. ,
Loktyushov E.V.,
Bychkov M.L.,
Shenkarev Z.O. ,
Lyukmanova E.N.
в журнале Biochemistry (Moscow) , издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom) , том 82, № 13, с. 1702-1715
DOI
2016
Secreted Isoform of Human Lynx1 (SLURP-2): Spatial Structure and Pharmacology of Interactions with Different Types of Acetylcholine Receptors
Lyukmanova E.N. ,
Shulepko M.A. ,
Shenkarev Z.O. ,
Bychkov M.L.,
Paramonov A.S. ,
Chugunov A.O. ,
Kulbatskii D.S. ,
Arvaniti M. ,
Dolejsi Eva ,
Schaer T.
в журнале Scientific reports , издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) , том 6, с. 30698
2015
Structure of membrane-active toxin from crab spider Heriaeus melloteei suggests parallel evolution of sodium channel gating modifiers in Araneomorphae and Mygalomorphae
Berkut Antonina A. ,
Peigneur Steve ,
Myshkin Mikhail Yu ,
Paramonov Alexander S. ,
Lyukmanova Ekaterina N. ,
Arseniev Alexander S. ,
Grishin Eugene V. ,
Tytgat Jan ,
Shenkarev Zakhar O. ,
Vassilevski Alexander A.
в журнале Journal of Biological Chemistry , издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States) , том 290, № 1, с. 492-504
DOI
2014
Липид-белковые нанодиски: новые возможности для структурно-функциональных исследований водорастворимых мембраноактивных пептидов
Шенкарев З.О. ,
Люкманова Е.Н. ,
Парамонов А.С. ,
Пантелеев П.В. ,
Баландин С.В. ,
Шулепко М.А. ,
Минеев К.С. ,
Овчинникова Т.В. ,
Кирпичников М.П. ,
Арсеньев А.С.
в журнале Acta Naturae (англоязычная версия) , издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)) , том 6, с. 68-78
2012
Lipid-protein nanodiscs for cell-free production of integral membrane proteins in a soluble and folded state: comparison with detergent micelles, bicelles and liposomes
Lyukmanova E.N. ,
Shenkarev Z.O. ,
Khabibullina N.F. ,
Kopeina G.S. ,
Shulepko M.A. ,
Paramonov A.S. ,
Mineev K.S. ,
Tikhonov R.V. ,
Shingarova L.N. ,
Petrovskaya L.E. ,
Dolgikh D.A. ,
Arseniev A.S. ,
Kirpichnikov M.P.
в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes , издательство Elsevier BV (Netherlands) , том 1818, № 3, с. 349-358
DOI
2012
N-концевые партнеры для эффективной продукции рецепторов сопряженных с G-белками в бактериальных бесклеточных системах
Люкманова Е.Н.,
Шенкарев З.О. ,
Хабибуллина Д.С.,
Кульбацкий Д.С. ,
Шулепко М.А.,
Петровская Л.Е. ,
Арсеньев А.С. ,
Долгих Д.А. ,
Кирпичников М.П.
в журнале Acta Naturae (англоязычная версия) , издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)) , том 4, № 15, с. 59-66
2010
NMR Structural and Dynamical Investigation of the Isolated Voltage-Sensing Domain of the potassium channel KvAP: Implications for Voltage-Gating
Shenkarev Z.O. ,
Paramonov A.S.,
Lyukmanova E.N. ,
Shingarova L.N. ,
Yakimov S.A. ,
Dubinnyi M.A. ,
Chupin V.V. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Blommers M.J. ,
Arseniev A.S.
в журнале Journal of the American Chemical Society , издательство American Chemical Society (United States) , том 132, № 16, с. 5630-5637
2009
Липид-белковые нанодиски: возможность применения для ЯМР-исследований мембранных белков и мембраноактивных пептидов
Шенкарев З.О. ,
Люкманова Е.Н.,
Соложенкин О.И.,
Гагнидзе И.Э. ,
Некрасова О.В. ,
Чупин В.В. ,
Тагаев А.А. ,
Якименко З.А. ,
Овчинникова Т.В. ,
Кирпичников М.П. ,
Арсеньев А.С.
в журнале Биохимия , издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва) , том 74, с. 933-945
Доклады на конференциях
2018
Cristallomycin: structure revision and antibacterial action
(Устный)
Авторы:
Alferova V.A. ,
Paramonov A.S. ,
Tyurin A.P. ,
Shuvalov M.V. ,
Malanicheva I.A. ,
Grammatikova N.E. ,
Shenkarev Z.O. ,
Korshun V.A.
British Council Researcher Links Workshop "Macrocycles in Medicine" , University of East Anglia, Norwich, Великобритания, 17-20 декабря 2018
2016
Action of the human Lynx1 on nicotinic acetylcholine receptors in the brain
(Стендовый)
Авторы:
Vasilyeva N.A. ,
Shulepko M.A. ,
Kulbatskii D.S. ,
Shenkarev Z.O. ,
Thomsen M.S. ,
Dolgikh D.A. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Lyukmanova E.N.
XVth International Symposium on Cholinergic Mechanisms , Марсель, Франция, 16-20 октября 2016
2016
Action of the human Lynx1 on nicotinic acetylcholine receptors in the brain
(Устный)
Авторы:
Vasilyeva N.A. ,
Shulepko M.A. ,
Kulbatskii D.S. ,
Lyukmanova E.N. ,
Thomsen M.S. ,
Dolgikh D.A. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Shenkarev Z.O.
XVth International Symposium on Cholinergic Mechanisms , Марсель, Франция, 16-20 октября 2016
2016
ИССЛЕДОВАНИЕ АНТИБИОТИЧЕСКОГО КОМПЛЕКСА ИНА-5812
(Стендовый)
Авторы:
Топольян А.П. ,
Алфёрова В.А. ,
Куляева В.В. ,
Рогожин Е.А. ,
Прохоренко И.А. ,
Брылёв В.А. ,
Шенкарёв З.О. ,
Кудан П.В. ,
Шувалов М.В. ,
Слюндина М.С. ,
Королёв А.М. ,
Катруха Г.С. ,
Гладких Е.Г. ,
Лапчинская О.А. ,
Тюрин А.П.
Химическая биология. Международная конференция посвященная 90-летию академика Д.Г.Кнорре. , Новосибирск, Россия, 24-28 июля 2016
2011
Структурная биология мембранных белков
Авторы:
Арсеньев А.С. ,
Бочаров Э.В. ,
Шенкарев З.О. ,
Минеев К.С. ,
Кирпичников М.П. ,
Надеждин К.Д. ,
Бочарова О.В.,
Люкманова Е.Н. ,
Парамонов А.С.
V Российский симпозиум «Белки и пептиды» , Петрозаводск, 2011
2009
Бактериальная и бесклеточная продукция внеклеточного домена никотинового ацетилхолинового рецептора.
(Стендовый)
Авторы:
Копеина Г.С. ,
Люкманова Е.Н. ,
Шулепко М.А. ,
Кирпичников М.П. ,
Кашеверов И.Е. ,
Цетлин В.И. ,
Долгих Д.А. ,
Шенкарев З.О.
Международная научная конференция «Современные проблемы органической и биологической химии, молекулярной биологии и биотехнологии» , Москва, Россия, 26 ноября 2009
2008
Продукция в бесклеточной системе внеклеточного домена никотинового ацетилхолинового рецептора.
(Устный)
Авторы:
Копеина Г.С. ,
Люкманова Е.Н. ,
Кирпичников М.П. ,
Шенкарев З.О. ,
Долгих Д.А. ,
Шулепко М.А.
Международная конференция и дискуссионный научный клуб «Новые информационные технологии в медицине, биологии, фармакологии и экологии». Украина, Крым, Ялта-Гурзуф, с 31 мая по 9 июня 2008 года. , Крым, Ялта-Гурзуф, Украина, 31 мая - 9 июня 2008
Тезисы докладов
2017
Action of the human Lynx1 on nicotinic acetylcholine receptors in the brain
Vasilyeva N.A. ,
Shulepko M.A. ,
Kulbatskii D.S. ,
Shenkarev Z.O. ,
Thomsen M.S. ,
Dolgikh D.A. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Lyukmanova E.N. ,
Lyukmanova E.N.
в сборнике Journal of Neurochemistry, Special issue on Cholinergic Mechanisms , место издания Blackwell Publishing Inc United Kingdom , том 142, тезисы, с. 223-223
DOI
2016
Action of the human Lynx1 on nicotinic acetylcholine receptors in the brain
Vasilyeva N.A. ,
Shulepko M.A. ,
Kulbatskii D.S. ,
Shenkarev Z.O. ,
Thomsen M.S. ,
Dolgikh D.A. ,
Kirpichnikov M.P. ,
Lyukmanova E.N.
в сборнике XVth International Symposium on Cholinergic Mechanisms, 16-20 October 2016, Marseille, France [Abstract book] , тезисы, с. 112-112
2016
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ БЕЛКОВ ЧЕЛОВЕКА LYNX1 И SLURP-1 С ВОДОРАСТВОРИМЫМ ДОМЕНОМ НИКОТИНОВОГО АЦЕТИЛХОЛИНОВОГО РЕЦЕПТОРА. V СЪЕЗД БИОХИМИКОВ РОССИИ Сочи-Дагомыс, 2016. Acta Naturae, спецвыпуск, том 1, стр. 82
Люкманова Е.Н. ,
Шулепко М.А. ,
Кульбацкий Д.С. ,
Шенкарев З.О. ,
Долгих Д.А.
в сборнике ACTA NATURAE , серия СПЕЦВЫПУСК , том 1, тезисы, с. 82
2016
ИЗУЧЕНИЕ БЕЛКОВ ЗАЩИТНОЙ СИСТЕМЫ РАСТЕНИЙ НА ПРИМЕРЕ НОВОГО ЛИПИД-ТРАНСПОРТИРУЮЩЕГО БЕЛКА ГОРОХА ПОСЕВНОГО PISUM SATIVUM
Богданов И.В. ,
Мельникова Д.Н. ,
Финкина Е.И. ,
Шенкарев З.О. ,
Румынский Е.И. ,
Арсеньев А.С. ,
Овчинникова Т.В.
в сборнике Биотехнологии в комплексном развитии регионов (15-17 марта 2016) , место издания ЗАО «Экспо-биохим-технологии», РХТУ им. Д.И. Менделеева Москва , тезисы, с. 47-48
2016
ИССЛЕДОВАНИЕ НОВОГО ЛИПИД-ТРАНСПОРТИРУЮЩЕГО БЕЛКА ГОРОХА ПОСЕВНОГО PISUM SATIVUM
Богданов И.В. ,
Шенкарев З.О. ,
Финкина Е.И. ,
Мельникова Д.Н. ,
Румынский Е.И. ,
Арсеньев А.С. ,
Овчинникова Т.В.
в сборнике Тезисы XXVIII зимней молодежной научной школы "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии" , место издания Полиграфический участок ИБХ РАН Москва , том 1, тезисы, с. 6-6
2016
Подбор условий для исследования структуры и динамики потенциалчувствительного домена канала Kv2.1 человека методом ЯМР-спектроскопии
Румынский Е.И. ,
Мышкин М.Ю.,
Люкманова Е.Н. ,
Парамонов А.С.,
Кульбацкий Д.С. ,
Шенкарев З.О. ,
Арсеньев А.С.
в сборнике Материалы XXVIII Зимней молодежной научной школы «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии», 8-11 февраля 2016, Москва , место издания Москва , тезисы, с. 68
2016
СТРУКТУРНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ПОТЕНЦИАЛОЧУВСТВИТЕЛЬНЫХ ДОМЕНОВ КАТИОННЫХ КАНАЛОВ: ОТ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С ЛИГАНДАМИ ДО ТЕРМОДИНАМИКИ ФОЛДИНГА МЕМБРАННЫХ БЕЛКОВ IN VITRO
Шенкарев З.О. ,
Парамонов А.С.,
Мышкин М.Ю.,
Люкманова Е.Н. ,
Кульбацкий Д.С. ,
Шулепко М.А. ,
Шингарова Л.Н.,
Арсеньев А.С.
в сборнике ACTA NATURAE , серия СПЕЦВЫПУСК , том 1, тезисы, с. 79
2016
ТРЕХПЕТЕЛЬНЫЕ БЕЛКИ СЕМЕЙСТВА LY-6/UPAR: ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ МНОГООБРАЗИЕ В РАМКАХ ОДНОГО СТРУКТУРНОГО МОТИВА
Люкманова Е.Н. ,
Шулепко М.А. ,
Кульбацкий Д.C. ,
Бычков М.Л.,
Васильева Н.А.,
Локтюшов Е.В.,
Бойко А.А.,
Феофанов А.В. ,
Шенкарев З.О. ,
Долгих Д.А. ,
Кирпичников М.П.
в сборнике Сборник тезисов V молодежной конференции по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН , тезисы, с. 38
НИРы
4 июня 2019 - 1 мая 2020
Современные методы изучения структуры и функций ионных каналов
ООО "Товарищество научных изданий КМК"
Руководитель:
Соколова О.С.
Ответственные исполнители:
Кирпичников М.П. ,
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Антонов М.Ю. ,
Волынцева А.Д. ,
Глухов Г.С. ,
Горделий В.И. ,
Деркачева Н.И. ,
Карлова М.Г. ,
Кузьмичёв П.К. ,
Люкманова Е.Н. ,
Моисеенко А.В. ,
Мышкин М.Ю. ,
Некрасова О.В. ,
Новоселецкий В.Н. ,
Охрименко И.С. ,
Парамонов А.С. ,
Попинако А.В. ,
Станишнева-Коновалова Т.Б. ,
Трифонова Е.С. ,
Феофанов А.В. ,
Чупин В.В. ,
Шевцов М.Б. ,
Шенкарев З.О.
24 июня 2014 - 31 декабря 2016
Молекулярные механизмы действия эндогенных нейропептидов семейства Ly6/uPAR, модулирующих работу никотинового ацетилхолинового рецептора
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Долгих Д.А.
Участники НИР:
Бычков М.Л. ,
Гапизов С.Ш. ,
Гончарук М.В. ,
Гончарук С.А. ,
Кульбацкий Д.С. ,
Люкманова Е.Н. ,
Парамонов А.С. ,
Ростанец Д.В. ,
Чугунов А.О. ,
Шенкарев З.О. ,
Шулепко М.А.
Патенты
2011
Пептидный антибиотик бактериального происхождения ЛАТЕРОЦИН, подавляющий развитие микроскопических водорослей
Авторы:
Азизбекян Р.Р. ,
Овчинникова Т.В. ,
Арсеньев А.С. ,
Рубин А.Б. ,
Кузнецова Н.И. ,
Тагаев А.А. ,
Шенкарев З.О. ,
Погосян С.И. ,
Кузин А.И. ,
Трунов К.И. ,
Якименко З.А.
#2430966, 10 октября
2010
Рекомбинантная плазмидная ДНК pET22b(+)/вд-Линкс1, кодирующая белок со свойствами Линкс1, и штамм бактерий Escherichia coli BL21(DE3)/pET22b(+)/вд-Линкс1-продуцент белка со свойсвами Линкс1 человека
Авторы:
Люкманова Е.Н. ,
Шулепко М.А. ,
Тихонов Р.В. ,
Кашеверов И.Е. ,
Цетлин В.И. ,
Шенкарев З.О. ,
Долгих Д.А. ,
Кирпичников М.П.
#2404246, 20 ноября
Диссертация