ИСТИНА

Зименков Д.В.

Соавторы: Машко С.В., Скороходова А.Ю., Biriukova I.V., Doroshenko V.G., Гулевич А.Ю., Каташкина Ж.И., Бирюкова И.В., Гавриков А.В., Gryadunov D.A., Katashkina J.I., Krylova L.Y., Noskova E.Y., Антонова О.В. показать полностью..., Кулагина Е.В., Минаева Н.И., Akhverdyan V.Z., Kivero A., Minaeva N., Skorokhodova A., Беспятых Ю.А., Холина М.С., Шитиков Е.А., Debabov V., Gak E.R., Gulevich A.A., Kozlov Y., Krylov A., Michurina T.A., Minaeva N., Peretokina I.V., Savrasova E.A., Беневоленский М.С., Богородская Е.М., Дебабов В.Г., Ермишев В.Ю., Заседателев А.С., Ильина Е.Н., Исакова А.А., Крылов А.А., Литвинов В.И., Михайлович В.М., Полонская З.М., Сафонов С.А., Смирнов С.В., Суржиков С.А., Хахалина К.И., Шульгина М.В.

19 статей, 2 тезисов докладов, 7 патентов, 1 дипломная работа

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 63, Scopus: 103

IstinaResearcherID (IRID): 41139245

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • 2020 Reduced susceptibility and resistance to bedaquiline in clinical M. tuberculosis isolates
    • Krylova L.Y., Antonova O.V., Kholina M.S., Kulagina E.V., Nosova E.Y., Safonova S.G., Borisov S.E., Zimenkov D.V.
    • в журнале Journal of Infection, издательство W. B. Saunders Co., Ltd. (United Kingdom), том 23 DOI
  • • 2018 ADVANCES IN THE STUDY OF MOLECULAR BASIS OF RESISTANCE TO NEW ANTI-TB DRUGS
    • Peretokina I.V., Krylova L.Y., Antonova O.V., Kholina M.S., Gryadunov D.A., Nosova E.Y., Zimenkov D.V.
    • в журнале Russian Journal of Infection and Immunity, том 4, № 8, с. 577 DOI
  • • 2016 A Comparison of the Sensititre MycoTB Plate, the Bactec MGIT 960, and a Microarray-Based Molecular Assay for the Detection of Drug Resistance in Clinical Mycobacterium tuberculosis Isolates in Moscow, Russia
    • Nosova EY, Zimenkov DV, Khakhalina AA, Isakova AI, Krylova LY, Makarova MV, Galkina KY, Krasnova MA, Safonova SG, Litvinov VI, Gryadunov DA, Bogorodskaya EM
    • в журнале PLoS ONE, издательство Public Library of Science (United States), том 30, № 11, с. e0167093
  • 
    • 2014 Анализ генетических детерминант множественной и широкой лекарственной устойчивости возбудителя туберкулеза с использованием олигонуклеотидного микрочипа
    • Зименков Д.В., Кулагина Е.В., Антонова О.В., Суржиков С.А., Беспятых Ю.А., Шитиков Е.А., Ильина Е.Н., Михайлович В.М., Заседателев А.С., Грядунов Д.А.
    • в журнале Молекулярная биология, том 48, с. 251-264
  • • 2013 Определение лекарственной устойчивости и генотипирование клинических штаммов Mycobacte-rium tuberculosis при помощи экспериментального набора "ТБтест"
    • Беспятых Ю.А., Шитиков Е.А., Зименков Д.В., Кулагина Е.В., Шульгина М.В., и др.
    • в журнале Пульмонология, № 4, с. 77-81
  • 
    • 2009 Новый метод конструирования оперонов с трансляционно-сопряженными генами в бактериальной хромосоме». Молекулярная биология 43
    • Гулевич А.Ю., Скороходова А.Ю., Ермишев В.Ю., Крылов А.А., Минаева Н.И., Полонская З.М., Зименков Д.В., Бирюкова И.В., Машко С.В.
    • в журнале Молекулярная биология, том 43, с. 547-556
  • 
    • 2008 Dual-In/Out strategy for genes integration into bacterial chromosome: a novel approach to step-by-step construction of plasmid-less marker-less recombinant E. coli strains with predesigned genome structure
    • Minaeva NI, Gak ER, Zimenkov DV, Skorokhodova AY, Biryukova IV, Mashko SV
    • в журнале BMC Biotechnology, издательство BioMed Central (London), том 8, № 63, с. 1-11 DOI
  • • 2006 «Введение симметричного Olac-ideal в область между «-35» и «-10» гибридного промотора Ptrc/Olac значительно увеличивает эффективность его репрессии белком LacI
    • Скороходова А.Ю., Зименков Д.В., Гулевич А.Ю., Минаева Н.И., Бирюкова И.В., Машко С.В.
    • в журнале Биотехнология, издательство ГосНИИгенетика (М.), № 3, с. 6-16
  • • 2006 Замена редко встречающихся в Escherichia coli «эукариотических» аминокислотных кодонов на синонимические «прокариотические» увеличивает эффективность накопления рекомбинантных интерферона-F и интерлейкина-1 человека
    • Зименков Д.В., Гавриков А.В., Машко С.В.
    • в журнале Биотехнология, издательство ГосНИИгенетика (М.), № 3, с. 17-32
  • 
    • 2005 Escherichia coli ORF ybhE is pgl gene encoding 6-phosphogluconolactonase (EC 3.1.1.31) that has no homology with known 6PGLs from other organisms
    • Zimenkov D., Gulevich A., Skorokhodova A., Biriukova I., Kozlov Y., Mashko S.
    • в журнале FEMS Microbiology Letters, издательство Blackwell (United Kingdom), том 244, с. 275-280 DOI
  • • 2005 Введение тандема терминаторов транскрипции повышает эффективность накопления рекомбинантных белков в клетках Escherichia coli при использовании системы экспрессии на основе РНК полимеразы фага Т7
    • Гавриков А.В., Зименков Д.В., Машко С.В.
    • в журнале Биотехнология, издательство ГосНИИгенетика (М.), № 2, с. 18-25
  • 
    • 2005 Направленное изменение уровня экспрессии генов в бактериальной хромосоме
    • Каташкина Ж.И., Скороходова А.Ю., Зименков Д.В., Гулевич А.Ю., Минаева Н.А., Дорошенко В.Г., Бирюкова И.В., Машко С.В.
    • в журнале Молекулярная биология, том 39, с. 823-831
  • • 2004 Области хромосомы E. coli, предпочтительные для встраивания генов при использовании системы интеграции на основе фага Mu
    • Зименков Д.В., Скороходова А.Ю., Каташкина Ж.И., Минаева Н.И., Саврасова Е.А., Бирюкова И.В., Дорошенко В.Г., Ахвердян В.З., Машко С.В.
    • в журнале Биотехнология, издательство ГосНИИгенетика (М.), № 6, с. 3-18
  • • 2004 Создание и исследование свойств авторегулируемого и плавнорегулируемого генетического элемента O3/PlacUV5/Olac  lacI
    • Скороходова А.Ю., Каташкина Ж.И., Зименков Д.В., Смирнов С.В., Гулевич А.Ю., Бирюкова И.В., Машко С.В.
    • в журнале Биотехнология, издательство ГосНИИгенетика (М.), № 5, с. 3-21
  • • 2002 Использование метаболической регуляции для оптимизации экспрессии генов в бактериальных клетках – новое направление биотехнологии XXI-века
    • Машко С.В., Скороходова А.Ю., Зименков Д.В., Мичурина Т.А., Гавриков А.В., Беневоленский М.С., Киверо А.Д., Каташкина Ж.И., Дорошенко В.Г., Бирюкова И.В., Дебабов В.Г.
    • в журнале Биотехнология, издательство ГосНИИгенетика (М.), № 4, с. 3-14
  • • 2001 Новые «сильные» и эффективно регулируемые прокариотические промоторы, созданные на основе гибридных регуляторных элементов Ptrp-PlacUV5/Olac введением в их состав идеально симметричного Olac-ideal в качестве дополнительного оператора
    • Машко С.В., Каташкина Ж.И., Скороходова А.Ю., Зименков Д.В., Беневоленский М.С., Бирюкова И.В., Дебабов В.Г.
    • в журнале Биотехнология, издательство ГосНИИгенетика (М.), № 5, с. 3-20

• Статьи в сборниках

  • • 2006 Improvement of the performances of aromatic amino acids producing E. coli strains could be achieved due to enhancement of PckA and/or Pgl activity
    • Gulevich A., Zimenkov D., Skorokhodova A., Minaeva N., Krylov A., Ivanov D., Doroshenko V., Biryukova I., Mashko S.
    • в сборнике In: Abstr. "10th International Sympos. On the Genetics of Industrial Microorganisms", Prague, Chech Republic, June 24-28, 2006, издательство Galen Prague (Praha, Czech Republic), с. 387-387
  • • 2002 The phage Mu-driven integration system provides the non-random distribution of the points of the integrated genes insertion along the circular map of the E.coli genome
    • Zimenkov D.V., Skorochodova A.Yu, Kakashkina J.I., Biryukova I.V., Doroshenko V.G., Akhverdyan V.Z., Mashko S.V.
    • в сборнике In: Abstr. “The 2002 Molecular genetics of Bacteria and Phages Meeting”, Cold Spring Harbor Laboratory, August 20-25, (2002), издательство Cold Spring Harbor Laboratory (Cold Spring Harbor, NY, United States), с. 130-130
  • • 2002 Оптимизация экспрессии генов в бактериальных клетках в биотехнологических исследованиях XXI-века
    • Скороходова А.Ю., Зименков Д.В., Гавриков А.В., Киверо А.Д., Каташкина Ж.И., Дорошенко В.Г., Машко С.В.
    • в сборнике Радиационная безопасность человека и окружающей среды, место издания МИФИ М, с. 125-139

• Тезисы докладов

  • • 2003 Optimization of the expression level of the gene located in E.coli chromosome due to Lambda-Red-driven introducing of the randomized promoter in the upstream region
    • Kakashkina J.I., Skorokhodova A.Yu, Zimenkov D.V., Gulevich A.Yu, Michurina T.A., Doroshenko V.G., Biryukova I.V., Mashko S.V.
    • в сборнике In: Abstr. “The 2003 Molecular Genetics of Bacteria and Phages Meeting”, Univ. of Wisconsin-Madison, USA, August 5-10, (2003), место издания Univ. of Wisconsin-Madison, USA, тезисы, с. 118-118
  • • 2001 Novel LacI-regulated E.coli promoters created on the basis of the Ptrp-PlacUV5/Olac due to insertion of the symmetrical Olac-ideal as the auxiliary operator
    • Kakashkina J.I., Skorochodova A.Yu, Zimenkov D.V., Biryukova I.V., Mashko S.V.
    • в сборнике In: Abstr. “The 2001 Molecular Genetics of Bacteria and Phages Meeting”, July 31-August 5, (2001), место издания Univ. of Wisconsin-Madison, USA, том 31, тезисы, с. 114-114

• Патенты

  • • 2013 Method for constructing an operon containing translationally coupled genes
    • Авторы: Gulevich A.Y., Skorokhodova A.Y., Ermishev V.Y., Minaeva N.I., Zimenkov D.V., Krylov A.A., Biryukova I.V., Mashko S.V.
    • #US 8,394,610 B2, 20 марта
  • • 2011 Устройство для одновременного автоматизированного выделения нуклеиновых кислот из нескольких биологических образцов
    • Авторы: Ходаков Д.А., Мамаев Д.Д., Дементьева Е.И., Грядунов Д.А., Михайлович В.М., Юрасов Д.А., Шаскольский Б.Л., Зименков Д.В., Заседателев А.С.
    • #Патент РФ №110746, 27 ноября
  • • 2011 Expression control sequence
    • Авторы: Mashko S.V., Zimenkov D.V.
    • #US 7,989,611 B2, 2 августа
  • • 2005 Method for producing L-amino acids
    • Авторы: Zimenkov D., Gulevich A., Skorokhodova A., Katashkina J., Kivero A., Biryukova I., Doroshenko V., Mashko S.
    • #US 20050191684 A1, 1 сентября
  • • 2005 6-Фосфоглюконолактоназа из Escherichia coli, фрагмент ДНК, бактерия, принадлежащая к роду Esherichia, - продуцент L-аминокислоты, и способ получения L-аминокислоты
    • Авторы: Зименков Д.В., Гулевич А.Ю., Скороходова А.Ю., Каташкина Ж.И., Киверо А.Д., Бирюкова И.В., Машко С.В.
    • #RU 2004105179;RU 2005101700, 26 января
  • • 2003 Способ получения L-аминокислот с использованием бактерий, обладающих повышенной экспрессией гена pckA
    • Авторы: Гулевич А.Ю., Бирюкова И.В., Зименков Д.В., Скороходова А.Ю., Киверо А.Д., Беларева А.В., Машко С.В.
    • #RU 2003109477, 7 апреля
  • • 2001 Нуклеотидная последовательность для контроля экспрессии
    • Авторы: Машко С.В., Зименков Д.В.
    • #RU2001104817, US20030049736A1, EP1234883A1, JP2002320495A2, BR0200509A, 22 февраля

• Руководство дипломными работами

  • • 2022 Изучение детерминант устойчивости к новейшим противотуберкулёзным препаратам в геноме Mycobacterium tuberculosis
    • Научные руководители: Баурина М.М., Зименков Д.В.
    • Автор: Уштанит Анастасия Игоревна (Бакалавр)