ИСТИНА

Nikolaeva A.

Соавторы: Попов В.О., Bezsudnova E.Y., Бойко К.М., Boiko K.M., Rakitina T.V., Бойко К.М., Korzhenevskiy D., Stekhanova T.N., Алексеева А.А., Савин С.С., Тишков В.И., Атрошенко Д.Л., Бончук А.Н. показать полностью..., Власкина А.В., Ивашкина О.И., Субач О.М., Субач Ф.В., Popov V.O., Анохин К.В., Липкин А.В., Марданов А.В., Тимофеев В.И., Dorovatovskiy P.V., Littlechild J., Pozmogova G.E., Ravin N.V., Stroylov V.S., Zubanova S.A., Барыкина Н.В., Варижук А.М., Груздева А.М., Дороватовский П.В., Каргов И.С., Качалова Г.С., Петкевич К., Плюснин В.В., Ракитина Т.В., Сотсков В.П., Юрченко Т.С., Agapova Y.K., Bolden D.S., Boyko and Popov K.M., Georgiev P., James P., Lazarenko V.A., Ma R., Mavletova D.A., Mayer C., Petrenko D.E., Petrova T.E., Podgornyi O.V., Portugues R.F., Rudakova N.L., Schmidt M., Schoenheit P., Smirnova T.A., Sykilinda N., Tashkeev A., You K., Zeifman Y.S., Алексеева М.Г., Гайворонский Ф.А., Груздев Е.В., Диброва Д.В., Клячко Н.Л., Корженевский Д.А., Корженевский Д.А., Мирошников К.А., Попинако А.В., Случанко Н.Н., Суплатов Д.А., Тимофеев И.А., Тугаева К.В., Хренова М.Г., Чефанова Е.С., Шилова С.А., Шнейдер М.М.

28 статей, 1 доклад на конференции, 1 тезисы доклада

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 83, Scopus: 88

IstinaResearcherID (IRID): 11517782

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • 2022 The mRubyFT Protein, Genetically Encoded Blue-to-RedFluorescent Timer
    • Subach O.M., Tashkeev A., Vlaskina A.V., Petrenko D.E., Gaivoronskii F.A., Nikolaeva A.Y., Ivashkina O.I., Anokhin K.V., Popov V.O., Boyko K.M., Subach F.V.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 23, № 6 DOI
  • 
    • 2021 LSSmScarlet, dCyRFP2s, dCyOFP2s and CRISPRed2s, Genetically Encoded Red Fluorescent Proteins with a Large Stokes Shift
    • Subach Oksana M., Vlaskina Anna V., Agapova Yuliya K., Dorovatovskii Pavel V., Nikolaeva Alena Y., Ivashkina Olga I., Popov Vladimir O., Piatkevich Kiryl D., Khrenova Maria G., Smirnova Tatiana A., Boyko Konstantin M., Subach Fedor V.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 22, № 23 DOI
  • 
    • 2021 Mechanisms of CP190 interaction with architectural proteins in Drosophila melanogaster
    • Sabirov M., Popovich A., Boyko K., Nikolaeva A., Kyrchanova O., Maksimenko O., Popov V., Georgiev P., Bonchuk A.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 22, с. 12400 DOI
  • 
    • 2021 Preparation of Recombinant Formate Dehydrogenase from Thermotolerant Yeast Ogataea parapolymorpha and Crystallization of Its Apo- and Holo- Forms
    • Pometun A.A., Boyko K.M., Zubanova S.A., Nikolaeva A.Yu, Atroshenko D.L., Savin S.S., Tishkov V.I.
    • в журнале Moscow University Chemistry Bulletin, издательство Allerton Press Inc. (United States), том 76, № 1, с. 49-55 DOI
  • 
    • 2021 Probing the role of the residues in the active site of the transaminase from Thermobaculum terrenum
    • Bezsudnova E.Yu, Nikolaeva A.Yu, Bakunova A.K., Rakitina T.V., Suplatov D.A., Popov V.O., Boyko K.M.
    • в журнале PLoS ONE, издательство Public Library of Science (United States), том 16, № 7, с. 0255098 DOI
  • 
    • 2021 Structural basis of diversity and homodimerization specificity of zinc-finger-associated domains in Drosophila
    • Bonchuk A., Boyko K., Fedotova A., Nikolaeva A., Lushchekina S., Khrustaleva A., Popov V., Georgiev P.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 49, № 4, с. 2375-2389 DOI
  • 
    • 2021 Получение рекомбинантной формиатдегидрогеназы из термотолерантных дрожжей Ogataea parapolymorpha DL-1 и кристаллизация апо- и холо- форм фермента
    • Пометун А.А., Бойко К.М., Зубанова С.А., Николаева А.Ю., Атрошенко Д.Л., Савин С.С., Тишков В.И.
    • в журнале Вестник Московского университета. Серия 2: Химия, издательство Издательский дом МГУ (Москва), том 62, № 2, с. 130-138
  • • 2021 Пространственная структура термостабильной трансаминазы D-аминокислот из археи Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661
    • Бойко К.М., Николаева А.Ю., Бакунова А.К., Стеханова Т.Н., Ракитина Т.В., Попов В.О., Безсуднова Е.Ю.
    • в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 66, № 5, с. 776-781 DOI
  • 
    • 2020 Counterbalance of Stability and Activity Observed for Thermostable Transaminase from Thermobaculum terrenum in the Presence of Organic Solvents
    • Bezsudnova Ekaterina Y., Nikolaeva Alena Y., Kleymenov Sergey Y., Petrova Tatiana E., Zavialova Sofia A., Tugaeva Kristina V., Sluchanko Nikolai N., Popov Vladimir O.
    • в журнале Catalysts, том 10, № 9, с. 1024-1036 DOI
  • 
    • 2020 FGCaMP7, an Improved Version of Fungi-Based Ratiometric Calcium Indicator for In Vivo Visualization of Neuronal Activity
    • Barykina Natalia V., Sotskov Vladimir P., Gruzdeva Anna M., Kure Wu You, Portugues Ruben, Subach Oksana M., Chefanova Elizaveta S., Plusnin Viktor V., Ivashkina Olga I., Anokhin Konstantin V., Vlaskina Anna V., Korzhenevskiy Dmitry A., Nikolaeva Alena Y., Boyko Konstantin M., Rakitina Tatiana V., Varizhuk Anna M., Pozmogova Galina E., Subach Fedor V.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 21, № 8, с. 3012
  • 
    • 2020 Highly-Active Recombinant Formate Dehydrogenase from Pathogenic Bacterium Staphylococcus aureus: Preparation and Crystallization
    • Pometun A.A., Boyko K.M., Yurchenko T.S., Nikolaeva A.Yu, Atroshenko D.L., Savin S.S., Popov V.O., Tishkov V.I.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 85, № 6, с. 689-696 DOI
  • 
    • 2020 Novel Genetically Encoded Bright Positive Calcium Indicator NCaMP7 Based on the mNeonGreen Fluorescent Protein
    • Subach Oksana M., Sotskov Vladimir P., Plusnin Viktor V., Gruzdeva Anna M., Barykina Natalia V., Ivashkina Olga I., Anokhin Konstantin V., Nikolaeva Alena Y., Korzhenevskiy Dmitry A., Vlaskina Anna V., Lazarenko Vladimir A., Boyko Konstantin M., Rakitina Tatiana V., Varizhuk Anna M., Pozmogova Galina E., Podgorny Oleg V., Piatkevich Kiryl D., Boyden Edward S., Subach Fedor V.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 21, № 5, с. 1644 DOI
  • • 2020 Высокоактивная рекомбинантная формиатдегидрогеназа патогенных бактерий Staphylococcus aureus: получение и кристаллизация
    • Пометун А.А., Бойко К.М., Юрченко Т.С., Николаева А.Ю., Каргов И.С., Атрошенко Д.Л., Савин С.С., Попов В.О., Тишков В.И.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 85, № 6, с. 807-818 DOI
  • • 2020 Кристаллизация и предварительное рентгенострукткрное исследование ZAD-домена белка Serendipity -d из Drosophila melanogaster
    • Бойко К.М., Николаева А.Ю., Бончук А.Н., Георгиев П.Г., Попов В.О.
    • в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 65, № 4, с. 605-607 DOI
  • • 2020 Пространственная структура трансаминазы разветвленных аминкислот из Thermoproteus uzoniensis в комплексе с L-Норвалином
    • Бойко К.М., Николаева А.Ю., Тимофеев В.И., Попов В.О., Безсуднова Е.Ю.
    • в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 65, № 5, с. 770-773 DOI
  • 
    • 2019 Functional characterization of PLP fols type IV transaminase with a mixed type of activity from Haliagium ochraceum
    • Zeifman Y.S., Boyko K.M., Nikolaeva A.Y., TimofeevV I., Rakitina T.V., Popov V.O., Bezsudnova E.Y.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 18676, с. 575-585 DOI
  • 
    • 2019 Identification functional and structural characterization of novel aminoglycoside phosphotransferase APH(3//)-Id from Streptomyces rimosus subsp.rimosus ATCC 10970
    • Alekseeva M.G., Boyko K.M., Nikolaeva A.Y., Mavletova D.A., Rudakova N.N., Zakharevich N.V., Korzhenevskiy D.A., Ziganshin R.H., Popov V.O., Danilenko V.N.
    • в журнале Archives of Biochemistry and Biophysics, издательство Academic Press (United States), том 671, с. 111-122 DOI
  • • 2019 Thermophilic archaeal branched-chain amino acid transaminases from Geoglobus acetivorans and Archaeoglobus fulgidus:biochemical and structural characterization
    • Isupov M.N., Boyko K.M., Sutter J.M., James P., Sayer C., Schmidt M., Schoenheit P., Nikolaeva A.Y., Stekhanova T.N., Mardanov A.V., Ravin N.V., Bezsudnova E.Y., Popov V.O., Littlechild J.
    • в журнале Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, издательство Frontiers Media S.A. (Lausanne, Switzerland), том 7 DOI
  • 
    • 2018 Diaminopelargonic acid transaminase from Psychrobacter cryohalolentis is active towards (S)-(-)-1-phenylethylamine, aldehydes and α-diketones
    • Bezsudnova E.Yu, Stekhanova T.N., Nikolaeva A.Yu, Rakitina T.V., Popinako A.V., Boyko and Popov K.M.O.V.O
    • в журнале Applied Microbiology and Biotechnology, издательство Springer Verlag (Germany), том 102, с. 9621-9633 DOI
  • 
    • 2018 Identification of branched-chain amino acid aminotransferases active towards (R)-(+)-1-phenylethylamine among PLP fold type IV transaminases
    • Bezsudnova E.Yu, Dibrova D.V., Nikolaeva A.Yu, Rakitinaa T.V., Popov V.O.
    • в журнале Journal of Biotechnology, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 271, с. 26-28 DOI
  • 
    • 2018 Structural characterization of geranylgeranyl pyrophosphate synthase GACE1337 from the hyperthermophilic archaeon Geoglobus acetivorans
    • Petrova T.E., Boyko K.M., Nikolaeva A.Y., Stekhanova T.N., Gruzdev E.V., Mardanov A.V., Stroilov V.S., Littlechild J.A., Popov V.O., Bezsudnova E.Y.
    • в журнале Extremophiles, издательство Springer Verlag (Germany), том 22, с. 877-888 DOI
  • 
    • 2018 Structure of an Acinetobacter broad-range prophage endolysin reveals a C-terminal α-helix with the proposed role in activity against live bacterial cells
    • Sykilinda N.N., Nikolaeva A.Y., Shneider M.M., Mishkin D.V., Patutin A.A., Popov V.O., Boyko K.M., Klyachko N.L., Miroshnikov K.A.
    • в журнале Viruses, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 10, № 6, с. 309-322 DOI
  • 
    • 2018 Structure-function studies of formate dehydrohenase from pathogenic bacterium Staphylococcus aureus
    • Tishkov V.I., Boiko K.M., Pometun A.A., Nikolaeva A.Y., Korgenevskiy D.A., Kargov I.S., Savin S.S.
    • в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 8, № S1, с. 440-440 DOI
  • • 2017 Очистка, выделение, кристаллизация и предварительное рентгеноструктурное исследование ВТВ-домена белка Сentrosomal protein 190 из Drosophila melanogasters
    • Бойко К.М., Николаева А.Ю., Качалова Г.С., Бончук А.Н., Попов В.О.
    • в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 62, № 6, с. 923-925 DOI
  • • 2017 Предварительные исследования ВТВ-домена белка Lola из Drosophila melanogasters методами малоуглового рентгеновского рассеяния и рентгеноструктурного анализа
    • Бойко К.М., Николаева А.Ю., Качалова Г.С., Бончук А.Н., Дороватовский П.В., Попов В.О.
    • в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 62, № 6, с. 926-929 DOI
  • 
    • 2016 First structure of archaeal branched-chain transaminase from Thermoproteus uzoniensis with specificity to L-amino acids and R-amines
    • Boyko K., Stekhanova T., Nikolaeva A., Mardanov A., Rakitin A., Ravin N., Bezsudnova E., Popov V.
    • в журнале Extremophiles, издательство Springer Verlag (Germany), том 20, с. 215-225 DOI
  • 
    • 2015 Isolation, Purification, Crystallization, and Preliminary X-ray Diffraction Study of the Crystals of HU Protein from M. gallisepticum
    • Nikolaeva A.Yu, Timofeev V.I., Boiko K.M., Korzhenevskii D.A., Rakitinaa T.V., Dorovatovskii P.V., Lipkin A.V.
    • в журнале Crystallography Reports, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 60, № 6, с. 880-883 DOI
  • • 2015 ВЫДЕЛЕНИЕ, ОЧИСТКА, КРИСТАЛЛИЗАЦИЯ И ПРЕДВАРИТЕЛЬНОЕ РЕНТГЕНОВСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ КРИСТАЛЛОВ HU-БЕЛКА ИЗ
    • Николаева А.Ю., Тимофеев В.И., Бойко К.М., Корженевский Д.А., Ракитина Т.В., Дороватовский П.В., Липкин А.В.
    • в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 60, с. 922-925

• Доклады на конференциях

  • • 2018 Structure-function studies of formate dehydrohenase from pathogenic bacterium Staphylococcus aureus (Стендовый)
    • Авторы: Tishkov V.I., Boiko K.M., Pometun A.A., Savin S.S., Korgenevskiy D.A., Kargov I.S., Nikolaeva A.Y.
    • 43rd FEBS Congress, Biochemistry Forever, Prague, Czech Republic, July 7‐12, 2018, Прага, Чехия, 7-12 июля 2018

• Тезисы докладов

  • 
    • 2015 Development of new antibacterial drugs based on inhibitors of histone-like HU-proteins
    • Boyko K., Nikolaeva A., Rakitina T., Korgenevsky D., Stroylov V., Timofeev V., Lipkin A., Popov V.
    • в сборнике FEBS Journal, серия Special Issue: 40th FEBS Congress, The Biochemical Basis of Life, том 281, тезисы, с. 388-388