Анализ траектории образования промежуточного гликозилфермента в механизме действия нейраминидазы вируса гриппа А методами молекулярного моделированиястатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 21 октября 2020 г.
Аннотация:Комплексное использование методов классической молекулярной динамики, симуляции титрования
ионизируемых остатков, метадинамики, а также комбинированного метода квантовой механики/молеку-
лярной механики позволило выявить альтернативный путь образования промежуточного гликозилфермен-
та в механизме действия нейраминидазы вируса гриппа А H5N1. Ключевую роль в механизме обеспечивает
остаток Asp151, расположенный на подвижной петле и позволяющий реализовать каталитическую функ-
цию фермента в широком интервале pH окружающей среды благодаря формированию сети взаимодействий
с молекулами воды. Так как размножение гриппа у птиц проходит в условиях пищеварительной системы
при низких значениях pH, а у человека – в дыхательных путях в условиях близких к нейтральным, сущест-
вование альтернативных путей протекания реакции при разной кислотности среды может опосредовать
двойной тропизм вируса и циркуляцию специфических штаммов вируса H5N1, склонных к передаче от
птиц к человеку.