Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
Армеев Григорий Алексеевич
пользователь
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
,
Кафедра биоинженерии
, ведущий научный сотрудник, с 17 мая 2021
кандидат физико-математических наук с 2018 года
Прежние места работы
(Нажмите для отображения)
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
,
Кафедра биоинженерии
, аспирант, 30 сентября 2014 - 1 октября 2018
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
,
Кафедра биоинженерии
, старший научный сотрудник, 1 января 2019 - 16 мая 2021
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
,
Кафедра биоинженерии
, младший научный сотрудник, 30 апреля 2015 - 31 декабря 2018, по совместительству
Соавторы:
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Кирпичников М.П.
,
Князева А.С.
,
Студитский В.М.
,
Грибкова А.К.
,
Panchenko A.R.
,
Глухов Г.С.
,
Феофанов А.В.
,
Герасимова Н.С.
,
Комарова Г.А.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Landsman D.
показать полностью...
,
Волох О.И.
,
Соколова О.С.
,
Чертков О.В.
,
Zhurkin V.B.
,
Багров Д.В.
,
Валиева М.Е.
,
Горковец Т.К.
,
Дудник А.О.
,
Качер Ю.Г.
,
Кудрявцев А.В.
,
Новиков Р.В.
,
Поспелова Ю.
,
Трофимчук Е.С.
,
Басс М.В.
,
Зайцев П.А.
,
Кобельков Г.М.
,
Ложников М.А.
,
Любителев А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Мулкиджанян А.Я.
,
Пугачева Т.Т.
,
Carl W.
,
Hua X.
,
Mosslehy W.
,
VOSKOBOYNIKOVA N.
,
Блинов В.Н.
,
Волынский А.Л.
,
Ефимов А.В.
,
Котова Е.Ю.
,
Кудряшова К.С.
,
Николаев А.Ю.
,
Никонорова Н.И.
,
Попеленский Ф.Ю.
,
Синицын Д.О.
,
Султанов Д.Ч.
,
Трифонова Е.С.
,
Шаряфетдинова А.С.
,
Яминский И.В.
,
Astashkin R.
,
Bamberg E.
,
Bratanov D.
,
Büldt G.
,
Chang H.
,
Chizhov I.
,
David L.
,
Erendjenova A.A.
,
Eria-Oliveira A.
,
Feofanov V.
,
Formosa T.
,
Gaykalova D.A.
,
Goncearenco A.
,
Hsieh F.
,
Mager T.
,
McCullough L.L.
,
Moser T.
,
Offenhäusser A.
,
Pestov N.A.
,
Podolyak E.
,
Rankovic V.
,
Rosselli R.
,
Savelyeva E.
,
Soloviov D.
,
Steinhoff H.
,
Steinhoff H.J.
,
Vaganova S.
,
Valera F.R.
,
Vivaudou M.
,
Volkov D.
,
Willbold D.
,
Yutin N.
,
Zabelskii D.
,
Албакова З.М.
,
Андреева Е.А.
,
Антипов В.А.
,
Антоненко Ю.Н.
,
Боздаганян М.Е.
,
Васильев В.А.
,
Васюченко Е.П.
,
Вердиян Е.Э.
,
Воскобойникова Н.Е.
,
Георгиев П.Г.
,
Горделий В.И.
,
Грум-Гржимайло А.Н.
,
Грызлова Е.В.
,
Ефимова Д.А.
,
Клячко Н.Л.
,
Косарим Н.А.
,
Котова Е.Ю.
,
Котова Е.Ю.
,
Крупянский Ю.Ф.
,
Кудрявцев А.В.
,
Кудряшова К.С.
,
Кулаева О.И.
,
Кунин Е.В.
,
Легоцкий С.А.
,
Лунин В.Ю.
,
Лунина Н.Л.
,
Мирошников К.А.
,
Мосслеи В.
,
Огурцов С.В.
,
Орехов Ф.С.
,
Петрова Т.Е.
,
Рокицкая Т.И.
,
Рухля Е.Г.
,
Сапожников А.М.
,
Степанов А.С.
,
Суханова Ю.А.
,
Сыкилинда Н.Н.
,
Тарасов К.А.
,
Терешкина К.Б.
,
УПОРОВ И.В.
,
Упоров И.В.
,
Х-Ю Ш.
66 статей
,
66 докладов на конференциях
,
29 тезисов докладов
,
27 НИР
,
2 свидетельства о регистрации прав на ПО
,
1 членство в программном комитете
,
1 диссертация
,
6 дипломных работ
,
5 учебных курсов
,
4 выступление в СМИ
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 223, Scopus: 229
IstinaResearcherID (IRID): 9571655
Деятельность
Статьи в журналах
2023
Structure and Dynamics of Compact Dinucleosomes: Analysis by Electron Microscopy and spFRET
Stefanova Maria E.,
Volokh Olesya I.
,
Chertkov Oleg V.
,
Armeev Grigory A.
,
Shaytan Alexey K.
,
Feofanov Alexey V.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Sokolova Olga S.
,
Studitsky Vasily M.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 24, № 15, с. 12127-12127
DOI
2022
Analysis of Ion Atmosphere Around Nucleosomes Using Supercomputer MD Simulations
Косарим Н.А.
,
Армеев Г.А.
,
Кирпичников М.П.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Supercomputing Frontiers and Innovations
, том 9, № 2, с. 56-67
DOI
2022
Bulk automated analysis of variability of nucleosome structures and their complexes
Armeev Grigoriy
,
Gribkova Anna
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Biophysical Journal
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 121, № 3, с. 361a-362a
DOI
2022
H2A-H2B Histone Dimer Plasticity and Its Functional Implications
Kniazeva Anastasiia S.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Cells
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 11, № 18, с. 1-20
DOI
2022
N-Terminal Tails of Histones H2A and H2B Differentially Affect Transcription by RNA Polymerase II In Vitro
Chang Han-Wen
,
Feofanov Alexey V.
,
Lyubitelev Alexander V.
,
Armeev Grigory A.
,
Kotova Elena Y.
,
Hsieh Fu-Kai
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Shaytan Alexey K.
,
Studitsky Vasily M.
в журнале
Cells
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 11, № 16
DOI
2022
Nucleosomes and their complexes in the cryoEM era: Trends and limitations
Armeev Grigoriy A.
,
Gribkova Anna K.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Frontiers in Molecular Biosciences
, издательство
Frontiers Media S.A.
(Lausanne, Switzerland)
, том 9
DOI
2022
Structure of an Intranucleosomal DNA Loop That Senses DNA Damage during Transcription
Gerasimova Nadezhda S.
,
Volokh Olesya I.
,
Pestov Nikolay A.
,
Armeev Grigory A.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Shaytan Alexey K.
,
Sokolova Olga S.
,
Studitsky Vasily M.
в журнале
Cells
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 11, № 17, с. 2678
DOI
2022
Портативная ячейка для качественной оценки паропроницаемости пленочных материалов
Роенко А.О.
,
Армеев Г.А.
,
Трофимчук Е.С.
,
Яминский И.В.
в журнале
Наноиндустрия
, издательство
АО "Рекламно-издательский центр "Техносфера"
(Москва)
, том 15, № 5, с. 308-318
DOI
2022
Применение нейронных сетей для распознавания конформационных изменений в структуре белка по рентгеновским дифрактограммам его одиночных молекул на примере фотоцикла бактериородопсина
Армеев Г.А.
,
Кирпичников М.П.
,
Кобельков Г.М.
,
Кудрявцев А.В.
,
Ложников М.А.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
в журнале
Интеллектуальные системы. Теория и приложения (ранее: Интеллектуальные системы по 2014, № 2, ISSN 2075-9460)
, издательство
[б.и.]
(М.)
, том 26, № 1, с. 24-34
2021
CPE-DB: An Open Database of Chemical Penetration Enhancers
Vasyuchenko Ekaterina P.
,
Orekhov Philipp S.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Bozdaganyan Marine E.
в журнале
Pharmaceutics
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 13, № 1, с. 66
DOI
2021
Design of Nucleic Acid Biosensors Based on CRISPR/Cas Systems and Reporter Split Proteins
Novikov R.V.
,
Gribkova A.K.
,
Kacher J.G.
,
Zaytsev P.A.
,
Armeev G.A.
,
Gluhov G.S.
,
Shaytan A.K.
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 76, № 2, с. 52-58
DOI
2021
Histone dynamics mediate DNA unwrapping and sliding in nucleosomes
Armeev Grigoriy A.
,
Kniazeva Anastasiia S.
,
Komarova Galina A.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, том 12, № 1, с. 1-15
DOI
2021
Histone dynamics mediate DNA unwrapping and sliding in nucleosomes: insights from multi-microsecond molecular dynamics simulations
Armeev Grigoriy A.
,
Kniazeva Anastasia S.
,
Komarova Galina A.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
bioRxiv (The preprint server for biology)
, с. 1-29
DOI
2021
Memory Effect in Porous Polyethylene Films Preliminarily Deformed in the Medium of Supercritical CO2
Roenko A.O.
,
Trofimchuk E.S.
,
Efimov A.V.
,
Armeev G.A.
,
Nikonorova N.I.
,
Nikolaev A.Yu
,
Volynskii A.L.
в журнале
Polymer Science, Series A
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 62, № 5, с. 471-484
DOI
2021
Modeling of tandem dCas9 complexes bound to DNA for nucleic acids detection
Novikov Roman
,
Kacher Julia
,
Gribkova Anna
,
Zaytsev Petr
,
Armeev Grigoriy
,
Gluhov Grigoriy
,
Shaytan Alexey
в журнале
Microscopy and Microanalysis
, издательство
Cambridge University Press
(United Kingdom)
, том 27, № S1, с. 1696-1698
DOI
2021
Дизайн биосенсоров нуклеиновых кислот на основе систем CRISPR/Cas и репортерных сплит-белков
Новиков Роман вячеславович
,
Грибкова А.К.
,
Качер Ю.Г.
,
Зайцев П.А.
,
Армеев Г.А.
,
Глухов Г.С.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, том 76, № 2, с. 67-75
2021
Эффект “памяти” в пористых пленках полиэтилена, предварительно деформированных в среде сверхкритического co2
Роенко А.О.
,
Трофимчук Е.С.
,
Ефимов А.В.
,
Армеев Г.А.
,
Никонорова Н.И.
,
Николаев А.Ю.
,
Волынский А.Л.
в журнале
Высокомолекулярные соединения. Серия А
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 62, № 5, с. 307-321
DOI
2020
Analyzing nucleosome plasticity via atomistic MD simulations
Anastasiia Kniazeva
,
Grigorii Armeev
,
Iunona Pospelova
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Biophysical Journal
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 118, № 3
DOI
2020
Detecting Cas9-sgRNA Complex Interactions with DNA via Fluorescent Microscopy: Computer Simulations of Experimental Designs
Novikov Roman
,
Armeev Grigoriy
,
Gribkova Anna
,
Kacher Julia
,
Gluhov Grigory
,
Shaytan Alexey
в журнале
Microscopy and Microanalysis
, издательство
Cambridge University Press
(United Kingdom)
, с. 1-3
DOI
2020
HSP70 Multi-Functionality in Cancer
Zarema Albakova
,
Armeev Grigoriy A.
, Kanevskiy Leonid M., Kovalenko Elena I.,
Sapozhnikov Alexander M.
в журнале
Cells
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 9, № 3 Special Issue Molecular Chaperones: Cancer and Cell Death
DOI
2020
Integrative Modeling of Nucleosomes and Supranucleosomal Structures
Grigoriy Armeev
,
Anna Panchenko
,
Alexey Feofanov
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Biophysical Journal
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 118, № 3
DOI
2020
Investigation of the Effect of a Single-Stranded Break on the Mechanical Parameters of DNA by Molecular Dynamics Method
Volokh O.I.
,
Armeev G.A.
,
Trifonova E.S.
,
Sokolova O.S.
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 75, № 3, с. 136-141
DOI
2020
The Effect of the Viscosity of the Medium on the Molecular Dynamics of the Formation of Secondary Structure of (AlaGly)25 and (AlaGly)75 Polypeptides
Erendjenova A.A.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
в журнале
Biophysics
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 65, № 5, с. 731-735
DOI
2020
Viral rhodopsins 1 are unique family of light-gated cation channels
Zabelskii Dmitrii
, Alekseev Alexey, Kovalev Kirill,
Rankovic Vladan
, Balandin Taras,
Soloviov Dmytro
,
Bratanov Dmitry
,
Savelyeva Ekaterina
,
Podolyak Elizaveta
,
Volkov Dmytro
,
Vaganova Svetlana
,
Astashkin Roman
,
Chizhov Igor
,
Yutin Natalia
, Rulev Maksim, Popov Alexander,
Eria-Oliveira Ana-Sofia
,
Rokitskaya Tatiana
,
Mager Thomas
,
Antonenko Yuri
,
Rosselli Riccardo
,
Armeev Grigoriy
,
Shaitan Konstantin
,
Vivaudou Michel
,
Büldt Georg
, Rogachev Andrey,
Valera Francisco Rodriguez
,
Kirpichnikov Mikhail
,
Moser Tobias
,
Offenhäusser Andreas
,
Willbold Dieter
,
Koonin Eugene
,
Bamberg Ernst
,
Gordeliy Valentin
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, № 11, с. 1-16
DOI
2020
Исследование влияния однонитевого разрыва на механические параметры ДНК методом молекулярной динамики
Волох О.И.
,
Армеев Г.А.
,
Трифонова Е.С.
,
Соколова О.С.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, том 75, № 3, с. 164-169
2019
Abstract OR-19: Integrative Approach on Nucleosome Complexes Modeling
Armeev Grigoriy A.
,
Panchenko Anna
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
International Journal of Biomedicine
, том 9, № S1, с. 13-14
2019
Abstract P-20: Linker Histone H1: The Interplay between Chromatosome Stability, Oncomutations and Post-Translational Modifications
Bass Mikhail V.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
International Journal of Biomedicine
, том 9, № S1, с. 25-25
2019
Analyzing nucleosome plasticity using molecular dynamics simulations
Армеев Г.А.
,
Поспелова Юнона
,
Князева А.
,
Комарова г.а.
,
Шайтан А.К.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 9, № sup1, с. 19-19
DOI
2019
Construction and Analysis of Amino Acid Substitution Matrices for Optimal Alignment of Microbial Rhodopsin Sequences
Novoseletsky V.N.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 74, № 1, с. 21-25
DOI
2019
Linking chromatin composition and structural dynamics at the nucleosome level
Armeev Grigoriy A.
,
Gribkova Anna K.
,
Pospelova Iunona
,
Komarova Galina A.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Current Opinion in Structural Biology
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 56, с. 46-55
DOI
2019
Python toolkit for DNA geometry analysis and modeling
Armeev G.A.
,
Sukhanova I.A.
,
Shaytan A.K.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 9, № sup1, с. 150
DOI
2019
The Effect of Oncomutations and Posttranslational Modifications of Histone H1 on Chromatosome Structure and Stability
Bass M.V.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
,
Shaytan A.K.
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 74, № 3, с. 121-126
DOI
2019
ВЛИЯНИЕ ОНКОМУТАЦИЙ И ПОСТТРАНСЛЯЦИОННЫХ МОДИФИКАЦИЙ ГИСТОНА Н1 НА СТРУКТУРУ И СТАБИЛЬНОСТЬ ХРОМАТОСОМЫ
Басс М.В.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, том 74, № 3, с. 154-160
2019
Флуоресцентная микроскопия одиночных нуклеосом в структурных исследованиях ДНК-белковых комплексов
Феофанов А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Валиева М.Е.
,
Герасимова Н.С.
,
Любителев А.В.
,
Армеев Г.А.
,
Чертков О.В.
,
Шайтан А.К.
,
Котова Е.Ю.
,
Студитский В.М.
,
Кирпичников М.П.
в журнале
Acta Naturae (русскоязычная версия)
, издательство
Парк-медиа
(М.)
, том 2, с. 56-56
2018
Bacteriorhodopsin electronic structure and its modification during all-trans → 13-cis photoisomerisation
Kudriavtsev A.V.
,
Novoseletsky V.N.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
,
Kirpichnikov M.P.
в журнале
Journal of Bioenergetics and Biomembranes
, издательство
Springer/Plenum Publishers
(New York, USA)
, том 50, № 6
DOI
2018
Comparison of various substitution matrices for amino acid alignment and homology search of microbial rhodopsins
Novoseletsky V.N.
,
Kudriavtsev A.V.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
,
Kirpichnikov M.P.
в журнале
Journal of Bioenergetics and Biomembranes
, издательство
Springer/Plenum Publishers
(New York, USA)
, том 50, № 6
DOI
2018
Joint Effect of Histone H1 Amino Acid Sequence and DNA Nucleotide Sequence on the Structure of Chromatosomes: Analysis by Molecular Modeling Methods
Gorkovets T.K.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
,
Shaytan A.K.
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 73, № 2, с. 82-87
DOI
2018
Mutual influence of linker histone H1 amino acid sequence and DNA nucleotide sequence on the linker histone H1 position in chromatosome
Горковец Т.К.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 8, № Supplement S1, с. 346-346
DOI
2018
Structural interpretation of DNA-protein hydroxyl-radical footprinting experiments with high resolution using HYDROID
Шайтан А.К.
,
Xiao H.
,
Армеев Г.А.
,
Gaykalova D.A.
,
Комарова Г.А.
,
Carl Wu
,
Студитский В.М.
,
Landsman D.
,
Panchenko A.R.
в журнале
Nature Protocols
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 13, № 1, с. 2535-2556
DOI
2018
Structure of SMA 3000-stabilized lipodisks: a computer modelling study
Tarasov K.A.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
в журнале
Journal of Bioenergetics and Biomembranes
, издательство
Springer/Plenum Publishers
(New York, USA)
, том 50, № 6
DOI
2018
spFRET Microscopy Analysis of Distances Between DNA Linkers in Mononucleosomes
Armeev Grigoriy A.
,
Lubitelev Alexander V.
,
Studitsky Vasily M.
,
Feofanov Alexey V.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
в журнале
Microscopy and Microanalysis
, издательство
Cambridge University Press
(United Kingdom)
, том 24, № S1, с. 1394-1395
DOI
2018
Совместное влияние аминокислотной последовательности гистона H1 и нуклеотидной последовательности днк на структуру хроматосомы: анализ методами молекулярного моделирования
Горковец Т.К.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, том 73, № 2, с. 99-105
2017
Conformational Motion Correlations in the Formation of Polypeptide Secondary Structure in a Viscous Medium
Shaitan K.V.
,
Popelenskii F.Yu
,
Armeev G.A.
в журнале
Biophysics
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 62, № 3, с. 348-355
DOI
2017
Hydroxyl-radical footprinting combined with molecular modeling identifies unique features of DNA conformation and nucleosome positioning
Shaytan Alexey K.
,
Xiao Hua
,
Armeev Grigoriy A.
,
Carl Wu
,
Landsman David
,
Panchenko Anna R.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2017
Microsecond molecular dynamics simulations of nucleosomes:implications for nucleosome function
Shaytan AK
,
Armeev GA
,
Goncearenco A.
,
Zhurkin VB
,
Landsman D.
,
Panchenko AR
в журнале
Biochemistry and Cell Biology
, издательство
NRC Research Press
(Canada)
, том 95, № 2, с. 183
DOI
2017
Второй активный центр в эндолитической трансгликозилазе gp144 бактериофага phiKZ
Чертков О.В.
,
Армеев Г.А.
,
Упоров И.В.
, Легоцкий С.А., Сыкилинда Н.Н.,
Шайтан А.К.
,
Клячко Н.Л.
, Мирошников К.А.
в журнале
Acta Naturae (русскоязычная версия)
, издательство
Парк-медиа
(М.)
, том 9, № 1, с. 87-94
2017
Дублирующий активный центр в структуре эндолитической трансгликозилазы gp144 бактериофага phiKZ
Чертков О.В.
,
Легоцкий С.А.
,
Сыкилинда Н.Н.
,
Упоров И.В.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
, Клячко Н.Л.,
Мирошников К.А.
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 9, № 1, с. 87-94
2017
ИССЛЕДОВАНИЕ ЭНЕРГЕТИЧЕСКОГО ПРОФИЛЯ ПРОЦЕССА ОТВОРАЧИВАНИЯ ДНК ОТ ГИСТОНОВОГО ЯДРА НУКЛЕОСОМЫ МЕТОДАМИ МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ
Грибкова А.К.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, том 72, № 3, с. 164-168
2017
КОPPЕЛЯЦИЯ КОНФОPМАЦИОННЫX ДВИЖЕНИЙ ПPИ ФОPМИPОВАНИИ ВТОPИЧНОЙ CТPУКТУPЫ ПОЛИПЕПТИДОВ В ВЯЗКОЙ CPЕДЕ
Шайтан К.В.
,
Попеленский Ф.Ю.
,
Армеев Г.А.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 62, № 3, с. 443-451
2017
О возможности определения структуры белков в экспериментах с использованием рентгеновских лазеров на свободных электронах в режиме нестационарного рассеяния
Синицын Д.О.
,
Армеев Г.А.
в журнале
Химическая физика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 36, № 1, с. 16-26
DOI
2016
Characterization of lipodisc nanoparticles containing sensory rhodopsin II and its cognate transducer from Natronomonas pharaonis
Bagrov D.V.
,
Voskoboynikova N.
,
Armeev G.A.
,
Mosslehy W.
,
Gluhov G.S.
,
Ismagulova T.T.
,
Mulkidjanian A.Y.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Steinhoff H.J.
,
Shaitan K.V.
в журнале
Biophysics
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 61, № 6, с. 942-949
DOI
2016
Coupling between Histone Conformations and DNA Geometry in Nucleosomes on a Microsecond Timescale: Atomistic Insights into Nucleosome Functions
Shaytan Alexey K.
,
Armeev Grigoriy A.
, Goncearenco Alexander,
Zhurkin Victor B.
,
Landsman David
,
Panchenko Anna R.
в журнале
Journal of Molecular Biology
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 428, № 1, с. 221-237
DOI
2016
Large-Scale ATP-Independent Nucleosome Unfolding by a Histone Chaperone
Valieva M.E.
,
Armeev G.A.
,
Kudryashova K.S.
,
Gerasimova N.S.
,
Shaytan A.K.
,
Kulaeva O.I.
,
McCullough L.L.
,
Formosa T.
,
Georgiev P.G.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Studitsky V.M.
,
Feofanov A.V.
в журнале
Nature Structural and Molecular Biology
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 23, № 12, с. 1111-1116
DOI
2016
The Dynamics of Irreversible Evaporation of a Water–Protein Droplet and the Problem of Structural and Dynamic Experiments with Single Molecules
Shaitan K.V.
,
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
в журнале
Biophysics
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 61, № 2, с. 177-184
DOI
2016
Trajectories of microsecond molecular dynamics simulations of nucleosomes and nucleosome core particles
Shaytan Alexey K.
,
Armeev Grigoriy A.
, Goncearenco Alexander,
Zhurkin Victor B.
,
Landsman David
,
Panchenko Anna R.
в журнале
Data in Brief
, издательство
Elsevier Inc.
(США)
, том 7, с. 1678-1681
DOI
2016
Динамика необратимого испарения водно-белковой капли и проблема структурно-динамических экспериментов с единичными молекулами
Шайтан К.В.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 61, № 2, с. 213-221
2016
Иccледование липодиcков, cодеpжащиx комплекc cенcоpного pодопcина II c pодcтвенным белком-тpанcдьюcеpом из Natronomonas pharaonis
Багров Д.В.
,
Воскобойникова Н.
,
Армеев Г.А.
,
Мосслеи В.
,
Глухов Г.С.
,
Исмагулова Т.Т.
,
Мулкиджанян А.Я.
,
Кирпичников М.П.
,
Х-Ю Штайнхофф
,
Шайтан К.В.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 61, № 6, с. 1139-1148
2016
МОДЕЛИРОВАНИЕ СТРУКТУРЫ ДНК-БЕЛКОВЫХ КОМПЛЕКСОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ ДАННЫХ ПО РЕЗОНАНСНОМУ ПЕРЕНОСУ ЭНЕРГИИ И ПЕРЕКИСНОМУ ОКИСЛЕНИЮ
Армеев Г.А.
,
Горковец Т.К.
,
Ефимова Д.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, № 1, с. 35-40
2016
Релаксация структуры нуклеосомы при отворачивании ДНК: исследование методом молекулярной динамики
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, № 3, с. 34-37
2015
6 Combined influence of linker DNA and histone tails on nucleosome dynamics as revealed by microsecond molecular dynamics simulations
Shaytan Alexey K.
,
Armeev Grigoriy A.
, Goncearenco Alexander,
Zhurkin Victor B.
,
Landsman David
,
Panchenko Anna R.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 33, № sup1, с. 3-3
DOI
2015
Conformational Flexibility of Nucleosomes: A Molecular Dynamics Study
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
,
Shaytan and A.K
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 70, № 3, с. 147-151
DOI
2015
Исследование ионного окружения и электрических характеристик нуклеосом методом молекулярной динамики
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, № 4, с. 24-28
2015
Конформационная подвижность нуклеосомы: исследование методом молекулярной динамики
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, № 3, с. 49-54
2013
Моделирование нуклеосом методами атомистического суперкомпьютерного моделирования
Армеев Г.А.
,
Блинов В.Н.
, Севенюк А.А.,
Студитский В.М.
,
Шайтан А.К.
в журнале
International Journal of Qafqaz University (PHYSICA)
, том 1, № 2, с. 91-99
Статьи в сборниках
2019
Распознавание дифракционных изображений единичных частиц в экспериментах на рентгеновских лазерах
Армеев Г.А.
,
Кобельков Г.М.
,
Кудрявцев А.В.
,
Ложников М.А.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
в сборнике
Современные проблемы математики и механики. Материалы международной конференции, посвященной 80-летию академика В. А. Садовничего
, издательство
ООО "МАКС Пресс"
(Москва)
, том 2, с. 441-443
2018
Effects of Histone Chaperones FACT and PARP1 on Nucleosome Structure and Transcription
Sultanov D.C.
,
Valieva M.E.
,
Maluchenko N.V.
,
Kotova E.
,
Gerasimova N.S.
,
Armeev G.A.
, Hsieh F.K.,
Kudryashova Ksenia S.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Shaytan A.K.
,
Feofanov A.V.
,
Studitsky V.M.
в сборнике
Abstracts of Cold Spring Harbor Laboratory international meeting on “THE PARP FAMILY & ADP-RIBOSYLATION” 2018
, место издания
США
, с. 76
Доклады на конференциях
2023
Разработка подходов к моделированию скольжения ДНК в нуклеосоме методом полноатомной МД
(Стендовый)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
VII Съезд биофизиков России
, Краснодар, Россия, 17-23 апреля 2023
2023
Изучение посттрансляционных модификаций гистонов методом молекулярного моделирования
(Стендовый)
Авторы:
Шаряфетдинова А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Князева А.С.
XXXV ЗИМНЯЯ МОЛОДЁЖНАЯ НАУЧНАЯ ШКОЛА "ПЕРСПЕКТИВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И БИОТЕХНОЛОГИИ
, г. москва, Россия, 7-10 февраля 2023
2023
Collection of Nucleosome Structures: Current State and Perspective
(Стендовый)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Грибкова А.К.
,
Шайтан А.К.
International Symposium on Chromatin Architecture: Structure and Function 2023
, Онлайн, Япония, 24-25 января 2023
2023
Intranucleosomal DNA Loops Senses DNA Damage during Transcription
(Стендовый)
Авторы:
Gerasimova Nadezhda S.
,
Pestov Nikolay A.
,
Volokh Olesya I.
,
Armeev Grigory A.
,
Shaytan Alexey K.
,
Sokolova Olga S.
,
Studitsky Vasily M.
International Symposium on Chromatin Architecture: Structure and Function 2023
, Онлайн, Япония, 24-25 января 2023
2023
Изучение посттрансляционных модификаций гистонов методом молекулярного моделирования
(Стендовый)
Авторы:
Шаряфетдинова А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Князева А.С.
XXX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2023
, on-line, Россия, 23-27 января 2023
2023
Исследование пластичности димера гистонов Н2А-Н2В методом молекулярной динамики
(Устный)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2023
, on-line, Россия, 23-27 января 2023
2023
Разработка программной библиотеки для расчета геометрических параметров ДНК на языке Python
(Стендовый)
Авторы:
Васильев В.А.
,
Армеев Г.А.
XXX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2023
, on-line, Россия, 23-27 января 2023
2022
BULK AUTOMATED ANALYSIS OF VARIABILITY OF NUCLEOSOME STRUCTURES AND THEIR COMPLEXES
(Стендовый)
Авторы:
Armeev Grigoriy
,
Gribkova Anna
,
Shaytan Alexey K.
66th Biophysical Society Annual Meeting
, Сан Франциско, США, 19-23 февраля 2022
2022
Histone tails conformation switching analyzed by all-atom MD simulations of nucleosomes
(Стендовый)
Авторы:
Kniazeva Anastasiia S.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Shaytan Alexey K.
Biophysical Society 66th Annual Meeting
, San Francisco, California, США, 19-23 февраля 2022
2022
Исследование скольжения ДНК в нуклеосоме методом молекулярного моделирования.
(Стендовый)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXIX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2022
, on-line, Россия, 24-28 января 2022
2022
Single Particle X-Ray Imaging of Tick-Borne Encephalitis Virus at the European XFEL (SPB/SFX experiment 2671)
(Стендовый)
Авторы:
Osolodkin D.I.
,
Vorovich M.F.
,
Round E.
,
Bean R.
,
Bielecki J.
,
Khvatov E.V.
,
Ivanova A.L.
,
Uvarova V.I.
,
Assalauova D.
,
Ignatenko A.
,
Bobkov S.
,
Kurta R.
,
Armeev G.
,
Tesluyk A.
,
Sobolev E.
,
Moiseenko A.V.
,
Sokolova O.S.
,
Bagrov D.V.
,
Ilyin V.A.
,
Rychev M.
,
Vartanyants I.A.
,
Mancuso A.P.
,
Egorov A.M.
,
Ishmukhametov A.A.
European XFEL Users' Meeting 2022/DESY Photon Science Users' Meeting 2022
, Hamburg (online), Германия, 21-28 января 2022
2021
Modeling of tandem dCas9 complexes bound to DNA for nucleic acids detection
(Стендовый)
Авторы:
Новиков Роман Вячеславович
,
Качер Юлия Германовна
,
Грибкова Анна Кирилловна
,
Зайцев Пётр Андреевич
,
Армеев Григорий Алексеевич
,
Глухов Григорий Сергеевич
,
Шайтан Алексей Константинович
Microscopy and Microanalysis 2021
, Online, США, 1 августа - 5 октября 2021
2021
Neural Network Approaches to Classify 3D Protein Structures from the Data of X-ray Laser Radiation Diffraction from Single Particles
(Стендовый)
Авторы:
Novoseletsky Valery
,
Lozhnikov Mikhail
,
Armeev Grigoriy
,
Kudriavtsev Aleksandr
,
Shaytan Alexey
,
Kobelkov Georgiy
,
Shaitan Konstantin
Криоэлектронная микроскопия 2021: достижения и перспективы (RUSSIAN INTERNATIONAL СONFERENCE ON CRYOELECTRON MICROSCOPY 2021; RICCEM2021)
, Москва, Россия, 30 мая - 2 июня 2021
2021
Молекулярная динамика нуклеосом на временах до 15 микросекунд
(Устный)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
Ломоносовские чтения 2021
, МГУ им.М.В. Ломоносова, Россия, 21 апреля 2021
2021
Numerical experiments using neural network algorithms to determine 3D protein structures from the data of X-ray laser radiation diffraction from single particles
(Стендовый)
Авторы:
Shaitan K.V.
,
Lozhnikov M.A.
,
Novoseletsky V.N.
,
Armeev G.A.
,
Kudryavtsev A.V.
,
Kobelkov G.M.
,
Shaitan A.K.
,
Kirpichnikov M.P.
European XFEL Users' Meeting 2021
, Гамбург, Германия, 25-29 января 2021
2020
Биоинформатический подход для дизайна гидовых РНК для набора детектирующих CRISPR/Cas-систем
(Устный)
Авторы:
Грибкова Анна Кирилловна
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
ШКОЛА-КОНФЕРЕНЦИЯ: Генетические технологии в фундаментальных и прикладных исследованиях
, онлайн, Россия, 2-4 декабря 2020
2020
Detecting Cas9-sgRNA Complex Interactions with DNA via Fluorescent Microscopy: Computer Simulations of Experimental Designs
(Стендовый)
Авторы:
Novikov R.
,
Armeev G.
,
Gribkova A.
,
Kacher J.
,
Gluhov G.
,
Shaytan A.
Microscopy and Microanalysis 2020
, virtual, США, 1-6 августа 2020
2021
Использование пары флуоресцентно-меченных CRISPR/Cas для детекции целевого участка ДНК, исследование методами молекулярного моделирования
(Устный)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Новиков Р.В.
,
Шайтан А.К.
XXVIII-ая Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (25 - 30 января 2021)
, Россия, 25 февраля 2020 - 30 января 2021
2021
Компьютерное моделирование эксперимента по изучению взаимодействия между комплексом Cas9-sgRNA с ДНК с использованием флуоресцентной микроскопии
(Устный)
Авторы:
Новиков Р.В.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXVIII-ая Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (25 - 30 января 2021)
, Россия, 25 февраля 2020 - 30 января 2021
2020
Analyzing nucleosome plasticity via atomistic MD simulations
(Приглашенный)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Поспелова Ю.
,
Шайтан А.К.
64th Biophysical Society Annual Meeting
, Сан-Диего, США, 15-19 февраля 2020
2020
Analyzing nucleosome plasticity via atomistic MD simulations
(Приглашенный)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Поспелова Ю.
,
Шайтан А.К.
64th Biophysical Society Annual Meeting
, Сан-Диего, США, 15-19 февраля 2020
2020
Сравнительная динамика канонических нуклеосом и нуклеосом с вариантной формой гистона Н2А
(Стендовый)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
II межвузовская студенческая конференция «Студенческий биохимический форум — 2020»
, Кафедра биохимии Биологического факультета Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова, Россия, 9-10 февраля 2020
2020
Динамические особенности нуклеосом с каноническим гистоном Н2А и его вариантной формой Н2А.Z
(Устный)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXVII Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование».
, г. Дубна, Россия, 28 января - 1 февраля 2020
2019
Флуоресцентная микроскопия одиночных нуклеосом в структурных исследованиях ДНК-белковых комплексов
(Устный)
Авторы:
Феофанов А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Валиева М.Е.
,
Герасимова Н.С.
,
Любителев А.В.
,
Армеев Г.А.
,
Чертков О.В.
,
Шайтан А.К.
,
Котова Е.Ю.
,
Студитский В.М.
,
Кирпичников М.П.
II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды»
, Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
2019
Analyzing nucleosome plasticity using molecular dynamics simulations
(Устный)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Поспелова Юнона
,
Князева А.
,
Комарова г.а.
,
Шайтан А.К.
The 44th FEBS Congress, Krakow, Poland, July 6-11.
, Краков, Польша, 6-11 июля 2019
2019
Abstract P-47: Recognition of single particle’s diffraction images generated in x-ray free electron laser experiments
(Устный)
Авторы:
Lozhnikov Mikhail A.
,
Lozhnikov Mikhail A.
,
Kobelkov Georgiy M.
,
Kobelkov Georgiy M.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Kudriavtsev Aleksandr V.
,
Kudriavtsev Aleksandr V.
,
Novoseletsky Valery N.
,
Novoseletsky Valery N.
,
Shaytan Alexey K.
,
Shaytan Alexey K.
,
Shaitan Konstantin V.
,
Shaitan Konstantin V.
Russian International Conference on Cryo-Electron Microscopy 2019 (RICCEM-2019, Moscow, June 02-05)
, Moscow, Россия, 2-5 июня 2019
2019
Abstract P-47: Recognition of single particle’s diffraction images generated in x-ray free electron laser experiments
(Устный)
Авторы:
Lozhnikov Mikhail A.
,
Lozhnikov Mikhail A.
,
Kobelkov Georgiy M.
,
Kobelkov Georgiy M.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Kudriavtsev Aleksandr V.
,
Kudriavtsev Aleksandr V.
,
Novoseletsky Valery N.
,
Novoseletsky Valery N.
,
Shaytan Alexey K.
,
Shaytan Alexey K.
,
Shaitan Konstantin V.
,
Shaitan Konstantin V.
Russian International Conference on Cryo-Electron Microscopy 2019 (RICCEM-2019, Moscow, June 02-05)
, Moscow, Россия, 2-5 июня 2019
2019
Распознавание дифракционных изображений единичных частиц в экспериментах на рентгеновских лазерах
(Устный)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Кобельков Г.М.
,
Кудрявцев А.В.
,
Шайтан А.К.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Шайтан К.В.
,
Ложников М.А.
Международная научная конференция «Современные проблемы математики и механики», посвященная 80-летию академика В. А. Садовничего
, МГУ им. М.В. Ломоносова, Россия, 13-15 мая 2019
2019
Моделирование дифракционных экспериментов с единичными частицами с использованием рентгеновских лазеров на свободных электронах
(Устный)
Авторы:
Ложников М.А.
,
Кудрявцев А.В.
,
Кобельков Г.М.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Шайтан К.В.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
«Ломоносовские чтения - 2019». Секция «Биология»
, Москва, МГУ, Россия, 15-25 апреля 2019
2019
NUCLEOSOME MODELING AT ATOMISTIC DETAIL HELPS TO INTERPRET BIOPHYSICAL EXPERIMENTS
(Стендовый)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
,
Panchenko A.R.
Multiscale Modeling of Chromatin: Bridging Experiment with Theory
, Les Houches, Франция, 31 марта - 5 апреля 2019
2019
GROMACS force field parameters and molecule topology editing
(Стендовый)
Авторы:
Андреева Е.А.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2019
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПЛАСТИЧНОСТИ ДИМЕРОВ ГИСТОНОВ H3-H4
(Стендовый)
Авторы:
Поспелова Ю.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2019
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПЛАСТИЧНОСТИ ДИМЕРОВ ГИСТОНОВ H3-H4
(Устный)
Авторы:
Поспелова Ю.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2019
Оценка изменения свободной энергии депротонирования аминокислот, участвующих в переносе протона, в ходе фотоцикла бактериородопсина
(Стендовый)
Авторы:
Князева А.С.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Армеев Г.А.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2019
РЕДАКТИРОВАНИЕ ПАРАМЕТРОВ СИЛОВЫХ ПОЛЕЙ И ТОПОЛОГИЙ МОЛЕКУЛ ДЛЯ ПРОГРАММЫ GROMACS
(Устный)
Авторы:
Андреева Е.А.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2019
Создание молекулярных моделей нуклеосом и их комплексов по разнородным экспериментальным данным
(Устный)
Авторы:
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2018
Исследование процесса переноса протона в ходе фотоцикла бактериородопсина
(Стендовый)
Авторы:
Князева А.С.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Армеев Г.А.
Студенческий биохимический форум
, Биологический факультет МГУ, Москва, Россия, 10-17 декабря 2018
2018
Bacteriorhodopsin electronic structure and its modification during all-trans → 13-cis photoisomerisation
(Стендовый)
Авторы:
Kudriavtsev A.V.
,
Novoseletsky V.N.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
,
Kirpichnikov M.P.
Biomembranes 2018. International conference. October 1-5, 2018, Dolgoprudny
, Московский физико-технический институт (гос. университет), Долгопрудный, Россия, 1-5 октября 2018
2018
Comparison of various substitution matrices for amino acid alignment and homology search of microbial rhodopsins
(Стендовый)
Авторы:
Novoseletsky V.N.
,
Kudriavtsev A.V.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
,
Kirpichnikov M.P.
Biomembranes 2018. International conference. October 1-5, 2018, Dolgoprudny
, Московский физико-технический институт (гос. университет), Долгопрудный, Россия, 1-5 октября 2018
2018
Structure of SMA 3000-stabilized lipodisks: a computer modelling study
(Стендовый)
Авторы:
Tarasov K.A.
,
Shaitan K.V.
,
Armeev G.A.
Biomembranes 2018. International conference. October 1-5, 2018, Dolgoprudny
, Московский физико-технический институт (гос. университет), Долгопрудный, Россия, 1-5 октября 2018
2018
SpFRET Microscopy Analysis of Distances Between DNA Linkers in Mononucleosomes.
(Стендовый)
Авторы:
Armeev G.
,
Lubitelev A.
,
Studitsky V.
,
Feofanov A.
,
Kirpichnikov M.
Microscopy and Microanalysis
, США, 5-9 августа 2018
2018
Mutual influence of linker histone H1 amino acid sequence and DNA nucleotide sequence on the linker histone H1 position in chromatosome
(Стендовый)
Авторы:
Горковец Т.К.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Армеев Г.А.
The 43th FEBS Congress
, Прага, Чехия, 7-12 июля 2018
2018
Single-particle FRET Microscopy of Structural Rearrangements in Nucleosomes Induced by Some Nuclear Proteins
(Приглашенный)
Авторы:
Kudryashova K.S.
,
Kotova E.Y.
,
Studitsky V.М.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Maluchenko N.V.
,
Valieva M.E.
,
Sultanov D.C.
,
Gerasimova N.S.
,
Chertkov O.V.
,
Armeev G.A.
,
Feofanov A.V.
,
Shaytan A.K.
5th International Congress on Microscopy & Spectroscopy ( INTERM 2018)
, Oludeniz, Турция, 24-30 апреля 2018
2018
Исследование расположения гистона H1 в хроматосоме методами молекулярного моделирования
(Стендовый)
Авторы:
Горковец Т.К.
,
Армеев Г.А.
Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2018»
, МГУ имени М.В. Ломоносова, Россия, 10-11 апреля 2018
2018
Effects of Histone Chaperones FACT and PARP1 on Nucleosome Structure and Transcription
(Приглашенный)
Авторы:
Sultanov D.C.
,
Valieva M.E.
,
Maluchenko N.V.
,
Kotova E.
,
Gerasimova N.S.
,
Shaytan A.K.
,
Hsieh F.K.
,
Kudryashova K.S.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Feofanov A.V.
,
Studitsky
,
Armeev G.A.
Cold Spring Harbor Laboratory international meeting on “THE PARP FAMILY & ADP-RIBOSYLATION”
, Cold Spring Harbor Laboratory, США, 3-6 апреля 2018
2017
nucleosome’s stability in volatile buffer
(Стендовый)
Авторы:
Valieva Maria E.
,
Gerasimova Nadezhda S.
,
Armeev Grigori A.
,
Maluchenko Natalia V.
,
Kudryashova Kseniya S.
,
Feofanov Alexey V.
,
Studitsky Vasily M.
,
Shaytan Alexey K.
"Biology at Advanced Laser Light Sources" workshop at European XFEL
, Гамбург, European XFEL, Германия, 30 ноября - 1 декабря 2017
2017
Паропроницаемые мембраны на основе полиэтилена
(Устный)
Авторы:
Трофимчук Е.С.
,
Дудник А.О.
,
Багров Д.В.
,
Армеев Г.А.
,
Рухля Е.Г.
,
Яминский И.В.
Третий междисциплинарный молодежный научный форум с международным участием «Новые материалы»
, Москва, Россия, 21-24 ноября 2017
2017
STRUCTURAL STUDIES OF CHROMATIN TRANSCRIPTION
(Пленарный)
Авторы:
Sokolova О.S.
,
Volokh О.I.
,
Studitsky V.М.
,
Armeev G.А.
,
Gerasimova N.S.
12th International Scientific Conference on Bioorganic Chemistry devoted to the Memory of Professor Ovchinnikov/Международная научная конференция "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды"
, Москва, Россия, 18-22 сентября 2017
2017
Integrative modeling methods for understanding nucleosome dynamics
(Стендовый)
Авторы:
Shaytan A.K.
,
Armeev G.A.
,
Gribkova A.K.
Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'17)
, Москва, Россия, 27-30 июля 2017
2017
Integrative modeling of protein-DNA complexes
(Стендовый)
Авторы:
Shaytan A.K.
,
Armeev G.A.
Российская международная конференция по криоэлектронной микроскопии RICCEM-2017
, Москва, МГУ имени М. В. Ломоносова, Россия, 5-8 июня 2017
2017
Large-Scale ATP-independent nucleosome unfolding by a histone chaperone FACT
(Стендовый)
Авторы:
Shaytan A.K.
,
Valieva M.E.
,
Armeev G.A.
,
Kudryashova K.S.
,
Gerasimova N.S.
,
Kulaeva O.I.
,
McCullough L.L.
,
Formosa T.
,
Studitsky V.M.
,
Feofanov A.V.
Chromatin and Epigenetics
, Гейдельберг, Германия, 3-6 мая 2017
2017
Оценка энергии ДНК-гистоновых взаимодействий в интермедиатах нуклеосом методом MM/PBSA
(Стендовый)
Авторы:
Грибкова Анна Кирилловна
,
Армеев Г.А.
XXIV Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов – 2017"
, МГУ имени М.В.Ломоносова, Россия, 20 апреля 2017
2017
Nucleosome dynamics, histone variants and DNA breaking by hydroxyl-radicals
(Стендовый)
Авторы:
Hua Xiao
,
Grigoriy Armeev
,
Shaytan Alexey K.
,
David Landsman
,
Panchenko Anna R.
,
Carl Wu
Keystone Symposia on Molecular and Cellular Biology "Genomic instability and DNA repair"
, Санта Фе, США, 2-7 апреля 2017
2019
Профиль процесса отворачивания ДНК от гистонового ядра нуклеосомы, рассчитанный методами молекулярного моделирования
(Устный)
Авторы:
Грибкова Анна Кирилловна
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
V International Scientific Conference of Young Researchers Devoted to the 94-th Anniversary of Azerbaijani National Leader Heydar Aliyev
, Баку, Азербайджан, 2 апреля 2017 - 19 апреля 2019
2017
Исследование энергетического профиля процесса отворачивания ДНК от гистонового ядра нуклеосомы
(Устный)
Авторы:
Грибкова А.К.
,
Армеев Г.А.
Универсиада «Ломоносов»
, Москва, Россия, 1 февраля - 6 апреля 2017
2017
Chromatin structure and function investigation using integrative modeling approach
(Устный)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
Сотрудничество факультетов Московского университета и Рочестерского технологического института: направления и перспективы
, ЗБС МГУ имени С.Н. Скадовского, Россия, 10-16 января 2017
2016
Интеграция экспериментальных данных и вычислительных методов в исследовании хроматина.
(Устный)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
Первый Российский кристаллографический конгресс
, Москва, Россия, 21-26 ноября 2016
2016
Получение и исследование липодисков, содержащих комплекс сенсорного родопсина II с родственным белком-трансдьсером из Natronomonas pharaonis
(Устный)
Авторы:
Багров Д.В.
,
Воскобойникова Н.
,
Армеев Г.А.
,
Мосслеи В.
,
Глухов Г.С.
,
Исмагулова Т.
,
Мулкиджанян А.Я.
,
Кирпичников М.П.
,
Штайнхофф Х-Ю
,
Шайтан К.В.
Первый Российский кристаллографический конгресс
, Москва, Россия, 21-26 ноября 2016
2016
Dual active site in the endolytic transglycosilase gp144 of bacteriophage phiKZ
(Стендовый)
Авторы:
Chertkov O.V.
,
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
,
Klyachko N.L.
,
Miroshnikov K.A.
,
Legotsky S.A.
BACTERIOPHAGES: Theoretical and practical aspects of Their application in Medicine, Veterinary and Food. To the 100th Anniversary of the Discovery of Bacteriophages
, Москва, Россия, 13-15 октября 2016
2016
Chromatin Transcription: Epigenetics, Cancer & Aging
(Устный)
Авторы:
Valieva Maria E.
,
Gerasimova Nadezhda S.
,
Armeev Grigori A.
,
Kudryashova Kseniya S.
,
Nikitin Dmitry V.
,
Chertkov Oleg V.
,
Kulaeva Olga I.
,
Feofanov Alexey V.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Studitsky Vasily M.
,
Shaytan Alexey K.
II Международная научная конференция «Наука будущего»
, Казань, Россия, 20-23 сентября 2016
2016
Nucleosome Dynamics at Microsecond Timescale: DNA-Protein Interac- tions, Water-Mediated Interactions and Nucleosome Formation
(Стендовый)
Авторы:
Armeev Grigory A.
,
Alexander Goncearenco
,
Shaytan Alexey K.
,
David Landsman
,
Panchenko Anna R.
,
Zhurkin Victor B.
Biophysical Society 60th Annual Meeting
, Los Angeles, США, 27 февраля - 2 марта 2016
2016
Liquid sample delivery for XFEL: simulations of a protein solution nanodroplet evaporation
(Стендовый)
Авторы:
Armeev G.
,
Shaytan A.
,
Shaitan K.
European European x-ray free electron laser/XFEL Users’ Meeting 2016
, Hamburg, Германия, 27 января - 29 апреля 2016
2013
Atomistic computer simulations of nucleosomes and elongation complexes
(Устный)
Авторы:
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
19. International Symposium “Frontiers In Electronic Structure Theory and Multi Scale Modeling”, 21 – 22 October, 2013
, Moscow, Russia, Россия, 2013
2013
Исследование нуклеосом и элонгационных комплексов методами атомистического компьютерного моделирования
(Устный)
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
,
Блинов В.Н.
,
Севенюк А.А.
,
Студитский В.М.
VII Московский международный конгресс "Биотехнология: состояние и перспективы развития", 19-22 марта 2013
, Москва, Россия, 19-22 марта 2013
2012
ВОЗРАСТНЫЕ, ПОЛОВЫЕ И ВИДОВЫЕ ОСОБЕННОСТИ ПРОСТРАНСТВЕННОГО ОБУЧЕНИЯ АМФИБИЙ В ЛАБОРАТОРНЫХ УСЛОВИЯХ
Авторы:
Огурцов С.В.
,
Антипов В.А.
,
Армеев Г.А.
,
Вердиян Е.Е.
V Всероссийская конференция по поведению животных
, Москва, Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН, 20-23 ноября 2012г, Россия, 20-23 ноября 2012
2011
Age, gender and species specific differences in spatial orientation of the common toad (Bufo bufo L.) and the common grass frog (Rana temporaria L.) in a visual environment
Авторы:
Ogurtsov S.V.
,
Antipov V.A.
,
Armeev G.A.
,
Verdian E.E.
The 7th International Conference on Animal Navigation: Orientation & Navigation. Birds, Humans & Other Animals (Рэдинг, Великобритания, 2011 г.)
, Рэдинг, Великобритания, 6-9 апреля 2011
Тезисы докладов
2023
Изучение посттрансляционных модификаций гистонов методом молекулярного моделирования
Шаряфетдинова А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Князева А.С.
в сборнике
XXX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2023
, серия
30
, место издания
Ижевск
, тезисы
2023
Изучение посттрансляционных модификаций гистонов методом молекулярного моделирования
Шаряфетдинова А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Князева А.С.
в сборнике
Сборник тезисов XXXV ЗИМНЕЙ МОЛОДЁЖНОЙ НАУЧНОЙ ШКОЛЫ "ПЕРСПЕКТИВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И БИОТЕХНОЛОГИИ"
, место издания
Москва
, тезисы, с. 53-53
2023
Исследование пластичности димера гистонов Н2А-Н2В методом молекулярной динамики
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
XXX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2023
, тезисы
2023
Разработка подходов к моделированию скольжения ДНК в нуклеосоме методом полноатомной МД
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
VII СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ СБОРНИК ТРУДОВ
, место издания
Типография ФГБОУ ВО «КубГТУ» г. Краснодар г. Краснодар
, том 1, тезисы, с. 341-342
2023
Разработка программной библиотеки для расчета геометрических параметров ДНК на языке Python
Васильев В.А.
,
Армеев Г.А.
в сборнике
Сборник тезисов XXXV ЗИМНЕЙ МОЛОДЁЖНОЙ НАУЧНОЙ ШКОЛЫ "ПЕРСПЕКТИВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И БИОТЕХНОЛОГИИ"
, место издания
Москва
, тезисы, с. 2.2
2022
Histone tails conformation switching analyzed by all-atom MD simulations of nucleosomes
Kniazeva Anastasiia S.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Shaytan Alexey K.
в сборнике
Biophysical Society 66th Annual Meeting
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 121, тезисы, с. 361a
DOI
2022
Исследование скольжения ДНК в нуклеосоме методом молекулярного моделирования
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
XXIX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2022
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, том 29, тезисы
2021
15-microsecond molecular dynamics simulations of nucleosome show structural heterogeneity and plasticity
Armeev G.A.
,
Kniazeva A.S.
,
Komarova G.A.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Shaytan A.K.
в сборнике
International Journal of Biomedicine
, серия
Issue Suppl_1
, место издания
International Medical Research and Development Corporation
, том 11, тезисы, с. 19-20
DOI
2020
Динамические особенности нуклеосом с каноническим гистоном Н2А и его вариантной формой Н2А.Z. 27 международная конференция Математика, компьютер
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
XXVII Международная конференция "Математика. Компьютер. Образование" (МКО-2020)
, серия
МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, том 27, тезисы, с. 47-47
2020
Сравнительная динамика канонических нуклеосом и нуклеосом с вариантной формой гистона Н2А. II межвузовская студенческая конференция Студенческий биохимический форум
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
II межвузовская студенческая конференция Студенческий биохимический форум - 2020
, тезисы
2019
Abstract P-47: Recognition of single particle’s diffraction images generated in x-ray free electron laser experiments
Lozhnikov Mikhail A.
,
Kobelkov Georgiy M.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Kudriavtsev Aleksandr V.
,
Novoseletsky Valery N.
,
Shaytan Alexey K.
,
Shaitan Konstantin V.
в сборнике
International Journal of Biomedicine
, серия
S1
, место издания
International Medical Research and Development Corporation Нью Йорк
, том 9, тезисы, с. 38-38
DOI
2019
Оценка изменения свободной энергии депротонирования аминокислот , участвующих в переносе протона , в ходе фотоцикла бактериородопсина
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
Математика, компьютер образование
, место издания
АНО "Ижевский институт компьютерных исследований" Ижевск
, тезисы, с. 37-37
2019
Создание молекулярных моделей нуклеосом и их комплексов по разнородным экспериментальным данным
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
Математика, компьютер образование
, место издания
АНО "Ижевский институт компьютерных исследований" Ижевск
, тезисы, с. 30-30
2018
Single-particle FRET Microscopy of Structural Rearrangements in Nucleosomes Induced by Some Nuclear Proteins
Feofanov V.
,
Maluchenko N.V.
,
Valieva M.E.
,
Sultanov D.C.
,
Gerasimova N.S.
,
Chertkov O.V.
,
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
,
Kudryashova K.S.
,
Kotova E.Y.
,
Studitsky V.М.
,
Kirpichnikov M.P.
в сборнике
Book of abstracts of 5th International Congress on Microscopy & Spectroscopy (INTERM 2018)
, место издания
Turkey
, тезисы, с. 55
2018
Исследование процесса переноса протона в ходе фотоцикла бактериородопсина
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
в сборнике
"I межвузовская студенческая конференция Студенческий биохимический форум - 2018"
, тезисы, с. 12-13
2018
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПЛАСТИЧНОСТИ ДИМЕРОВГИСТОНОВ H3-H4
Поспелова Ю.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
26 международная конференция " Математика, компьютер, образование"
, серия
26
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, тезисы, с. 56
2018
РЕДАКТИРОВАНИЕ ПАРАМЕТРОВ СИЛОВЫХ ПОЛЕЙ И ТОПОЛОГИЙМОЛЕКУЛ ДЛЯ ПРОГРАММЫ GROMACS
Андреева Е.А.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
26 международная конференция " Математика, компьютер, образование"
, серия
26
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, тезисы, с. 29
2018
СОЗДАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНЫХ МОДЕЛЕЙ НУКЛЕОСОМ И ИХ КОМПЛЕКСОВПО РАЗНОРОДНЫМ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫМ ДАННЫМ
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
26 международная конференция " Математика, компьютер, образование"
, серия
26
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, тезисы, с. 30
2017
INTEGRATIVE MODELING METHODS FOR UNDERSTANDING NUCLEOSOME DYNAMICS. 2017. С. 178
Armeev G.
,
Gribkova A.
,
Shaytan A.
в сборнике
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB-2017
, место издания
Moscow
, тезисы, с. 178
2017
INTEGRATIVE MODELING OF PROTEIN-DNA COMPLEXES
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
в сборнике
Сборник трудов международной конференции по криоэлектронной микроскопии
, тезисы, с. 11-11
2017
Паропроницаемые мембраны на основе полиэтилена
Трофимчук Е.С.
,
Дудник А.О.
,
Багров Д.В.
,
Армеев Г.А.
,
Рухля Е.Г.
,
Яминский И.В.
в сборнике
Сборник материалов "Третий междисциплинарный молодежный научный форум с международным участием "Новые материалы" Москва 21-24 ноября 2017
, место издания
М: ООО "Буки Веди" Москва
, тезисы, с. 866-869
2017
Профиль процесса отворачивания ДНК от гистонового ядра нуклеосомы, рассчитанный методами молекулярного моделирования
Грибкова Анна Кирилловна
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
V International Scientific Conference of Young Researchers Devoted to the 94-th Anniversary of Azerbaijani National Leader Heydar Aliyev
, место издания
Baku
, тезисы
2017
Структурные исследования процессов транскрипции хроматина
Sokolova О.S.
,
Volokh О.I.
,
Gerasimova N.S.
,
Armeev G.А.
, Shaytan А.К.,
Studitsky V.М.
в сборнике
Acta Naturae, Международная научная конференция по биоорганической химии "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" и VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды"
, серия
СПЕЦВЫПУСК
, место издания
ИБХ РАН Перо Москва
, тезисы, с. 95
2016
Preparation and investigation of lipodisq nanoparticles containing sensory rhodopsin ii and its cognate transducer from Natronomonas pharaonis
Bagrov D.V.
,
Voskoboynikova N.
,
Armeev G.A.
,
Mosslehy W.
,
Gluhov G.S.
,
Ismagulova T.T.
,
Mulkidjanian A.Y.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Steinhoff H.J.
,
Shaitan K.V.
в сборнике
Сборник тезсов Первого российского кристаллографического конгресса
, место издания
НП-Принт Москва
, тезисы, с. 226
2016
О возможности определения структуры белков в экспериментах на рентгеновских лазерах на свободных электронах в режиме нестационарного рассеяния
Синицын Д.О.
,
Лунин В.Ю.
,
Грум-Гржимайло А.Н.
,
Грызлова Е.В.
,
Лунина Н.Л.
,
Петрова Т.Е.
,
Терешкина К.Б.
,
Степанов А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Крупянский Ю.Ф.
в сборнике
Первый Российский кристаллографический конгресс "От конвергенции наук к природоподобным технологиям" 21 - 26 ноября 2016 г., Москва, Россия, Сборник тезисов
, тезисы, с. 221-221
2013
Atomistic computer simulations of nucleosomes and elongation complexes
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
в сборнике
Frontiers In Electronic Structure Theory And Multi Scale Modeling
, место издания
Moscow, MS&S
, тезисы, с. 49-978
2013
Исследование нуклеосом и элонгационных комплексов методами атомистического компьютерного моделирования», VII Московский международный конгресс, Биотехнология: состояние и перспективы развития, 19-22 марта 2013, материалы конгресса
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
,
Блинов В.Н.
, Севенюк А.А.,
Студитский В.М.«
в сборнике
VII Московский международный конгресс, "Биотехнология: состояние и перспективы развития Москва, 19-22 марта 2013 г. Материалы Конгресса
, место издания
ЗАО «Экспо-биохим-технологии», РХТУ им. Д.И.Менделеева г.Москва
, том 1, тезисы, с. 251-251
2013
Исследование структуры и конформационной подвижности нуклеосом методом молекулярной динамики
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
Материалы Международного молодежного научного форума «Ломоносов-2013»
, издательство
ООО "МАКС Пресс"
(Москва)
, тезисы, с. 23-23
редакторы
Андреев А.И.
,
Андриянов Андрей Владимирович
,
Антипов Евгений Александрович
,
Чистякова М.В.
2012
ВОЗРАСТНЫЕ, ПОЛОВЫЕ И ВИДОВЫЕ ОСОБЕННОСТИ ПРОСТРАНСТВЕННОГО ОБУЧЕНИЯ АМФИБИЙ В ЛАБОРАТОРНЫХ УСЛОВИЯХ
Огурцов С.В.
,
Антипов В.А.
,
Армеев Г.А.
,
Вердиян Е.Е.
в сборнике
V Всероссийская конференция по поведению животных. Сборник тезисов
, место издания
Товарищество научных изданий КМК Москва
, тезисы, с. 134-134
НИРы
6 мая 2022 - 31 декабря 2023
Анализ разнообразия и поиск новых функционально значимых семейств гистоновых белков в животных, растениях, грибах, археях и вирусах
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан А.К.
Ответственный исполнитель:
Сингх-Пальчевская Л.Р.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Грибкова А.К.
,
Князева А.С.
10 января 2022 - 30 ноября 2023
Развитие технологий геномного редактирования для решения инновационных задач промышленных и пищевых биотехнологий
Кафедра синтетической биологии
Руководитель:
Страховская М.Г.
Ответственные исполнители:
Армеев Г.А.
,
Глухов Г.С.
,
Кочиева Е.З.
,
Машко С.В.
,
Попов В.О.
,
Шайтан А.К.
9 ноября 2021 - 30 декабря 2021
Научно-исследовательская работа по изучению структуры вирусоподобных частиц методом просвечивающей электронной микроскопии
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Соколова О.С.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Зайцев П.А.
,
Карлова М.Г.
,
Моисеенко А.В.
,
Трифонова Т.С.
29 сентября 2021 - 31 декабря 2023
Новые системы и уровни редактирования геномов: от нуклеотидной последовательности к пространственной организации (биологический факультет)
Биологический факультет
Руководители:
Разин С.В.
,
Студитский В.М.
Ответственный исполнитель:
Каменский П.А.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Афонин Д.А.
,
Багров Д.В.
,
Балева М.В.
,
Волох О.И.
,
Вьюшков В.С.
,
Галдина Г.В.
,
Герасимов Е.С.
,
Герасимова Н.С.
,
Гилязова А.В.
,
Глухов Г.С.
,
Грибкова А.К.
,
Жаркова И.И.
,
Замалутдинова С.В.
,
Карлова М.Г.
,
Карпова О.И.
,
Кирпичников М.П.
,
Князева А.С.
,
Кожевникова Д.Д.
,
Коровина А.Н.
,
Кравчук Е.В.
,
Левицкий С.А.
,
Ломов Н.А.
,
Любителев А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Мамаева Н.Ю.
,
Маслакова А.А.
,
Петрова Е.В.
,
Пиунова У.Е.
,
Разин С.В.
,
Рамонова А.А.
,
Рубцов М.А.
,
Сивкина А.Л.
,
Соколова О.С.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Студитский В.М.
,
Ульянов С.В.
,
Феофанов А.В.
,
Чичерин И.В.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Штомпель А.С.
2 августа 2021 - 30 июня 2023
Структурная динамика нуклеосом и их взаимодействий: поиск подходов для диагностики и лечения онкологических заболеваний
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан А.К.
Ответственные исполнители:
Армеев Г.А.
,
Грибкова А.К.
,
Князева А.С.
Участники НИР:
Багров Д.В.
,
Косарим Н.А.
,
Моторин Н.А.
,
Новиков Р.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Сингх-Пальчевская Л.Р.
22 июля 2021 - 30 июня 2023
Моделирование влияния активных процессов на структуру и динамику хроматина
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Армеев Г.А.
1 января 2021 - 31 декабря 2026
Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственные исполнители:
Лобакова Е.С.
,
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Айдналиева Н.В.
,
Алескерова Л.Э.
,
Алипкина С.И.
,
Аргентова В.В.
,
Армеев Г.А.
,
Архипова А.Ю.
,
Ахаев Д.Н.
,
Багров Д.В.
,
Барский Е.Л.
,
Баулина О.И.
,
Боздаганян М.Е.
,
Бонарцев А.П.
,
Бондаренко Е.А.
,
Буракова О.В.
,
Васильева С.Г.
,
Вахрушева А.В.
,
Волох О.И.
,
Гапизов С.Ш.
,
Герасимова Н.С.
,
Гераськина О.В.
,
Глухов Г.С.
,
Горелова О.А.
,
Грибкова А.К.
,
Дольникова Г.А.
,
Жаркова И.И.
,
Зайцев П.А.
,
Зайцева А.А.
,
Карлова М.Г.
,
Качер Ю.Г.
,
Князева А.С.
,
Коровина А.Н.
,
Кошкина Д.О.
,
Кудрявцев А.В.
,
Кудряцев А.В.
,
Кудряшова К.С.
,
Лукьянов А.А.
,
Любителев А.В.
,
Люкманова Е.Н.
,
Малинина Д.К.
,
Малюченко Н.В.
,
Мариловцева Е.В.
,
Налобин Д.С.
,
Никишин И.И.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Орехов Ф.С.
,
Орлов Н.А.
,
Панченко Л.А.
,
Петушкова Ю.А.
,
Петушкова Ю.П.
,
Рамонова А.А.
,
Саванина Я.В.
,
Саулина А.А.
,
Селях И.О.
,
Семенова Л.Р.
,
Сивкина А.Л.
,
Сингх-Пальчевская Л.Р.
,
Соколова А.И.
,
Соколова О.С.
,
Соловченко А.Е.
,
Соловченко О.В.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Студитский В.М.
,
Суханова Ю.А.
,
Трифонова Е.С.
,
Утешинская Л.В.
,
Федоренко Т.А.
,
Феофанов А.В.
,
Чеканов К.А.
,
Чивкунова О.Б.
,
Шайтан А.К.
,
Шапиро Т.Н.
,
Шибзухова К.А.
,
Шиловский Г.А.
,
Щербаков П.Н.
,
Яголович А.В.
12 декабря 2019 - 25 октября 2021
Универсальный биосенсор целевых последовательностей нуклиновых кислот на основе dCas9 белков
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан А.К.
Ответственные исполнители:
Глухов Г.С.
,
Грибкова А.К.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Зайцев П.А.
,
Качер Ю.Г.
,
Новиков Р.В.
2 декабря 2019 - 1 декабря 2021
Интегративное моделирование укладки нуклеосом в хроматине на основе данных Micro-C
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан А.К.
Ответственный исполнитель:
Армеев Г.А.
Участники НИР:
Грибкова А.К.
,
Князева А.С.
,
Комарова Г.А.
,
Поспелова Ю.
,
Сингх-Пальчевская Л.Р.
,
Тимохин Г.С.
7 ноября 2019 - 30 сентября 2020
Развитие крупной уникальной научной установки "Трехмерная электронная микроскопия и спектроскопия" МГУ имени М.В.Ломоносова
Биологический факультет
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственные исполнители:
Полевова С.В.
,
Рамонова А.А.
,
Соколова О.С.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Архипова А.Ю.
,
Багров Д.В.
,
Волох О.И.
,
Карлова М.Г.
,
Моисеенко А.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Рамонова А.А.
,
Соколов Д.Д.
,
Соловченко А.Е.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Темерева Е.Н.
,
Шайтан К.В.
1 марта 2019 - 31 декабря 2022
Эпигенетические механизмы биологических процессов и их роль в патогенезе онкологических заболеваний
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственные исполнители:
Феофанов А.В.
,
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Герасимова Н.С.
,
Гераськина О.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Соколова О.С.
,
Студитский В.М.
,
Шайтан А.К.
10 октября 2018 - 10 октября 2021
Моделирование структуры и динамики хроматина в соответствии с данными Hi-C для одиночных клеток.
Кафедра физики полимеров и кристаллов
Руководитель:
Чертович А.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Гаврилов А.А.
,
Кос П.И.
,
Петров А.И.
,
Тамм М.В.
,
Шайтан А.К.
8 августа 2018 - 30 июня 2021
Структурная динамика нуклеосом и их взаимодействий: поиск подходов для диагностики и лечения онкологических заболеваний.
Биологический факультет
Руководитель:
Шайтан А.К.
Ответственные исполнители:
Армеев Г.А.
,
Новоселецкий В.Н.
Участники НИР:
Андреева Е.А.
,
Басс М.В.
,
Глухов Г.С.
,
Грибкова А.К.
,
Князева А.С.
,
Комарова Г.А.
,
Новиков Р.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Поспелова Ю.
,
Сингх-Пальчевская Л.Р.
,
Суханова Ю.А.
,
Тарасов К.А.
31 июля 2018 - 8 февраля 2022
Моделирование структурных и динамических экспериментов с биомакромолекулярными объектами с использованием рентгеновских лазеров
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан К.В.
Ответственный исполнитель:
Шайтан А.К.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Вылегжанин Ф.Е.
,
Кобельков Г.М.
,
Кудрявцев А.В.
,
Ложников М.А.
,
Новоселецкий В.Н.
15 февраля 2018 - 15 июля 2021
Механизмы формирования и функциональные свойства липопротеиновых дисков, стабилизированных амфифильными альтернирующими сополимерами, содержащими звенья малеиновой кислоты
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан К.В.
Ответственный исполнитель:
Шайтан А.К.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Боздаганян М.Е.
,
Глухов Г.С.
,
Карлова М.Г.
,
Орехов Ф.С.
,
Соколова О.С.
,
Тарасов К.А.
15 ноября 2017 - 4 декабря 2019
Разработка научных и технологических основ получения и исследования физико-химических свойств биополимерного материала для создания внутрикостных имплантов с биополимерным покрытием на основе сверхупругих титановых сплавов.
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан К.В.
Ответственные исполнители:
Багров Д.В.
,
Бонарцев А.П.
,
Мойсенович М.М.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Архипова А.Ю.
,
Воинова В.В.
,
Рамонова А.А.
,
Шайтан А.К.
26 октября 2017 - 28 февраля 2021
Структурная динамика ретиналь-содержащих белков
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственный исполнитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Кудрявцев А.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Островский М.А.
,
Фельдман Т.Б.
,
Шайтан А.К.
,
Эрендженова А.А.
11 августа 2017 - 27 ноября 2020
Механизм взаимодействия PARP-1 с хроматином
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Феофанов А.В.
Ответственный исполнитель:
Малюченко Н.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Валиева М.Е.
,
Герасимова Н.С.
,
Гераськина О.В.
,
Иванова М.А.
,
Коровина А.Н.
,
Кошкина Д.О.
,
Любителев А.В.
,
Никитин Д.В.
,
Саулина А.А.
,
Чертков О.В.
,
Шайтан А.К.
2 мая 2017 - 31 декабря 2018
Эпигенетические механизмы и регуляция транскрипции: структурно-функциональный анализ и разработка новых методов исследования
Биологический факультет
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственный исполнитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Алескерова Л.Э.
,
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Волох О.И.
,
Герасимова Н.С.
,
Ефременко А.В.
,
Иванова М.А.
,
Иванова М.А.
,
Карлова М.Г.
,
Киташов А.В.
,
Любителев А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Никитин Д.В.
,
Сивкина А.Л.
,
Соколова О.С.
,
Студитский В.М.
,
Феофанов А.В.
,
Чертков О.В.
,
Шайтан А.К.
1 января 2016 - 31 декабря 2020
Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Участники НИР:
Айдналиева Н.В.
,
Алескерова Л.Э.
,
Аргентова В.В.
,
Армеев Г.А.
,
Архипова А.Ю.
,
Асланян Р.Р.
,
Ахаев Д.Н.
,
Багров Д.В.
,
Барский Е.Л.
,
Баулина О.И.
,
Боздаганян М.Е.
,
Бонарцев А.П.
,
Бондаренко Е.А.
,
Буракова О.В.
,
Валиева М.Е.
,
Васильева С.Г.
,
Вахрушева А.В.
,
Волох О.И.
,
Волынцева А.Д.
,
Герасимова Н.С.
,
Гераськина О.В.
,
Глухов А.И.
,
Глухов Г.С.
,
Гончаренко А.В.
,
Гончарук М.В.
,
Гончарук С.А.
,
Гордеев С.А.
,
Горелова О.А.
,
Долгих Д.А.
,
Дольникова Г.А.
,
Жаркова И.И.
,
Зайцева А.А.
,
Иванова М.А.
,
Карлова М.Г.
,
Коровина А.Н.
,
Кошкина Д.О.
,
Кузьменков А.И.
,
Лобакова Е.С.
,
Лукьянов А.А.
,
Любителев А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Мариловцева Е.В.
,
Мойсенович А.М.
,
Мойсенович М.М.
,
Налобин Д.С.
,
Никитин Д.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Орехов Ф.С.
,
Орлова А.А.
,
Панченко Л.А.
,
Петушкова Ю.А.
,
Петушкова Ю.П.
,
Попова С.С.
,
Пугачева Т.Т.
,
Рамонова А.А.
,
Саванина Я.В.
,
Савилова З.Д.
,
Селях И.О.
,
Семенова Л.Р.
,
Сивкина А.Л.
,
Соколова О.С.
,
Соловченко А.Е.
,
Соловченко О.В.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Студитский В.М.
,
Суханова Ю.А.
,
Тамбиев А.Х.
,
Трифонова Е.С.
,
Утешинская Л.В.
,
Федоренко Т.А.
,
Феофанов А.В.
,
Чеканов К.А.
,
Чемерис А.С.
,
Чертков О.В.
,
Чивкунова О.Б.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Шебанова А.С.
,
Шибзухова К.А.
,
Щербаков П.Н.
,
Яголович А.В.
,
герасимова н.с.
24 декабря 2015 - 31 декабря 2017
Создание научно-методического задела для изучения структуры локально-упорядоченных биологических объектов
Биологический факультет
Руководитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Бонарцев А.П.
,
Долгих Д.А.
,
Донцова О.А.
,
Кирпичников М.П.
,
Люкманова Е.Н.
,
Мойсенович М.М.
,
Некрасова О.В.
,
Островский М.А.
,
Родина Е.В.
19 октября 2015 - 31 декабря 2017
Структура и функции калиевых потенциалзависимых каналов и их мутантных форм, ответственных за развитие хронических сердечных и неврологических заболеваний
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Соколова О.С.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Волынцева А.Д.
,
Глухов Г.С.
,
Карлова М.Г.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Трифонова Е.С.
,
Чемерис А.С.
,
Шайтан К.В.
23 марта 2015 - 31 декабря 2015
Изучение структуры липидных нанодисков как перспективных объектов для спектроскопии двойного электрон-электронного резонанса и экспериментов с единичными молекулами
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Ефремов Ю.М.
,
Некрасова О.В.
,
Новоселецкий В.Н.
1 января 2015 - 31 декабря 2018
Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем
Ректорат
Руководитель:
Садовничий В.А.
Ответственный исполнитель:
Каменский П.А.
Участники НИР:
Cоина В.С.
,
Абрамов С.М.
,
Аверина О.А.
,
Агеева Л.В.
,
Адельянов А.М.
,
Азовский А.И.
,
Акопян Ж.А.
,
Аксенова А.А.
,
Аксенова В.А.
,
Аксянов Е.А.
,
Аласания К.Ю.
,
Александров В.В.
,
Александрова А.В.
,
Александрушкина Н.И.
,
Александрушкина Н.А.
,
Алексеевский А.В.
,
Аляутдинов А.Р.
,
Алёшин В.В.
,
Андреева Т.В.
,
Антал Т.К.
,
Антонова И.И.
,
Антоновская А.А.
,
Антохина О.Г.
,
Арифулин Е.А.
,
Армеев Г.А.
,
Артюшин И.В.
,
Арушанян И.О.
,
Ахметжанова А.А.
,
Ашапкин В.В.
,
Бабенко В.А.
,
Бакеева Л.Е.
,
Балацкий А.В.
,
Банникова А.А.
,
Баринова Н.Н.
,
Баулина О.И.
,
Бацевич В.А.
,
Бедарева И.В.
,
Белевич Т.А.
,
Беме И.Р.
,
Бенедиктов А.А.
,
Березина Н.Я.
,
Биланенко Е.Н.
,
Бисерова Н.М.
,
Благовещенская Е.Ю.
,
Боброва В.К.
,
Бондарева Э.А.
,
Бондаренко Г.Н.
,
Борисанова А.О.
,
Брагина Е.Е.
,
Брызгалина Е.В.
,
Бубнова Е.Н.
,
Бугров Д.И.
,
Бушуев А.В.
,
Бызов Б.А.
,
Бычков А.Ю.
,
Бычкова Е.Ю.
,
Вайпан Д.В.
,
Вайс В.Б.
,
Вальехо-Роман К.М.
,
Вангели И.М.
,
Ванюшин Б.Ф.
,
Варлыгина Т.И.
,
Вархотов Т.А.
,
Васильев А.Н.
,
Васильева Е.Д.
,
Васильева С.Г.
,
Вилкул Е.А.
,
Виноградова Е.Н.
,
Виноградская М.И.
,
Владыченская И.П.
,
Водопьянов С.С.
,
Волкова О.А.
,
Волкова О.С.
,
Волцит О.В.
,
Воробьева Е.А.
,
Воронина Е.Ю.
,
Воронко О.В.
,
Ворцепнева Е.В.
,
Высоких М.Ю.
,
Гавриленко С.М.
,
Галинская Т.В.
,
Галкин И.И.
,
Галоян Э.А.
,
Ганчарова О.С.
,
Гаранина А.С.
,
Георгиев А.А.
,
Герасимов Е.С.
,
Глаголева Е.С.
,
Глушакова А.М.
,
Гмошинский В.И.
,
Гоголева С.С.
,
Година Е.З.
,
Головин А.В.
,
Гололобова М.А.
,
Гомыранов И.А.
,
Горелова О.А.
,
Горшкова Е.А.
,
Горюнов Д.В.
,
Гофман Д.К.
,
Григорьев Ф.В.
,
Григорьева А.А.
,
Григорьева О.А.
,
Грицышин В.А.
,
Груздева М.А.
,
Грум-Гржимайло О.А.
,
Гусев Ф.Е.
,
Данилович И.Л.
,
Дегтярева Г.В.
,
Диброва Д.В.
,
Добров Б.В.
,
Добровольская Т.Г.
,
Дроздова О.Ю.
,
Дуброва М.С.
,
Дудов С.В.
,
Дудова К.В.
,
Дыйканов Д.Т.
,
Дьяков М.Ю.
,
Евтеев А.А.
,
Ежова О.В.
,
Екимова И.А.
,
Еланский С.Н.
,
Елумеева Т.Г.
,
Емельянова Л.Г.
,
Еремичев Р.Ю.
,
Ерохина М.В.
,
Ефименко А.Ю.
,
Ефимов С.В.
,
Жадан А.Э.
,
Жирков И.А.
,
Зайцева А.А.
,
Захаров К.В.
,
Землемерова Е.Д.
,
Зернов А.С.
,
Зубкова Е.Н.
,
Иваненко В.Н.
,
Иваницкая О.Н.
,
Иваницкий В.В.
,
Иванов А.О.
,
Иванова А.Е.
,
Игнатов М.С.
,
Игнатова Е.А.
,
Ильина И.Ю.
,
Ильинская О.П.
,
Калякин М.В.
,
Камалов А.А.
,
Карапетян М.К.
,
Касумян А.О.
,
Каткова Е.В.
,
Качалкин А.В.
,
Квятковский А.Л.
,
Квятковский А.Я.
,
Керимов А.Б.
,
Климович П.С.
,
Климчук О.И.
,
Клёнова А.В.
,
Кнорре Д.А.
,
Князева А.А.
,
Кобельков Г.М.
,
Кобельков С.Г.
,
Кокаева Л.Ю.
,
Колбасов Г.А.
,
Колбасова Г.Д.
,
Колесниченко К.А.
,
Кондакова О.А.
,
Коновалова О.П.
,
Конюхов И.В.
,
Копылов-Гуськов Ю.О.
,
Королев Д.Е.
,
Королева А.Т.
,
Корсуновская О.С.
,
Коршунова Г.А.
,
Коршунова Т.А.
,
Кочкин Д.В.
,
Кошелева Н.В.
,
Крайнов В.Н.
,
Крамина Т.Е.
,
Кремнёв С.В.
,
Криницына А.А.
,
Крупицкий А.В.
,
Крускоп С.В.
,
Кручинин П.А.
,
Кручинина А.П.
,
Кузищин К.В.
,
Кузнецов А.Г.
,
Кулебякин К.Ю.
,
Кулебякина М.А.
,
Куприянова Е.В.
,
Кураков А.В.
,
Кутов Д.К.
,
Кутуева Л.И.
,
Кутузова И.А.
,
Кушунина М.А.
,
Лазарев Е.Н.
,
Лапашина А.С.
,
Лапыгина Е.В.
,
Лебедев В.С.
,
Левик Л.Ю.
,
Лемак С.С.
,
Леонтьева О.А.
,
Лисенкова А.А.
,
Лисовский А.А.
,
Лобакова Е.С.
,
Логачёва М.Д.
,
Лопатина Ю.В.
,
Лубнина Н.В.
,
Лукашевич Н.В.
,
Лукьянов А.А.
,
Лысак Л.В.
,
Лысков Д.Ф.
,
Мазей Ю.А.
,
Макарова Н.Е.
,
Максимова И.А.
,
Малахов В.В.
,
Малютина А.М.
,
Манахов А.Д.
,
Манских В.Н.
,
Манучарова Н.А.
,
Маркина М.М.
,
Маркова О.В.
,
Марова-Кляйнбуб И.М.
,
Мартынов А.В.
,
Марфенина О.Е.
,
Маслакова А.А.
,
Мелихова Е.В.
,
Мельникова М.Н.
,
Милютина И.А.
,
Михайлов К.В.
,
Михайлов К.Г.
,
Морковин А.А.
,
Москаленко В.Н.
,
Мохова Е.Н.
,
Мулкиджанян А.Я.
,
Мунтян М.С.
,
Мурашев В.В.
,
Мурашев И.А.
,
Нагаев Б.Э.
,
Назаров П.А.
,
Назаров Р.А.
,
Нанова О.Г.
,
Недоспасов С.А.
,
Неретин Н.Ю.
,
Неретина Т.В.
,
Нестеренко А.М.
,
Нетрусов А.И.
,
Никитин М.А.
,
Николаева О.В.
,
Нилова М.В.
,
Нимирицкий П.П.
,
Новаковский Г.Э.
,
Новаковский Г.Э.
,
Новоселецкая Е.С.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Носов А.М.
,
Оболенская Е.В.
,
Овченков Е.А.
,
Огурцов С.В.
,
Озеров А.Л.
,
Озрина Р.Д.
,
Олейникова О.В.
,
Олейникова О.В.
,
Онипченко В.Г.
,
Онищенко Г.Е.
,
Орлов Д.С.
,
Орловский И.В.
,
Павлинов И.Я.
,
Павлов Д.С.
,
Павлов С.Д.
,
Павлова Н.С.
,
Панина О.Б.
,
Панютина А.А.
,
Парфёнова Е.В.
,
Пенин А.А.
,
Перехватов В.В.
,
Петракова О.С.
,
Петров Н.Б.
,
Петров П.Н.
,
Петушкова Ю.А.
,
Пивоваров Е.А.
,
Плетюшкина О.Ю.
,
Плеханова О.С.
,
Погосян С.И.
,
Поздняков Л.А.
,
Полевова С.В.
,
Полилов А.А.
,
Поляков М.П.
,
Полянская Л.М.
,
Попеленский Ф.Ю.
,
Попкова Е.Г.
,
Попов В.С.
,
Попова Е.Н.
,
Попова С.С.
,
Поярков Н.А.
,
Просвиров А.С.
,
Птушенко В.В.
,
Пугачева Т.Т.
,
Рамонова А.А.
,
Распопова А.А.
,
Ревина Д.Б.
,
Редькин Я.А.
,
Решетников Р.В.
,
Римская-Корсакова Н.Н.
,
Рогаев Е.И.
,
Романов А.А.
,
Романова Е.С.
,
Романова Е.С.
,
Рубина К.А.
,
Румянцев В.Ю.
,
Русин Л.Ю.
,
Русинов И.С.
,
Рыжов А.Л.
,
Рысенкова К.Д.
,
Савилова З.Д.
,
Савицкая М.А.
,
Савицкий В.Ю.
,
Савкин И.А.
,
Савченко А.С.
,
Самигуллин Т.Х.
,
Самойлов К.Ю.
,
Самоходская Л.М.
,
Самсонов Т.Е.
,
Северова Е.Э.
,
Селях И.О.
,
Семенова А.В.
,
Семенова Л.Р.
,
Семенова М.Л.
,
Семин В.Н.
,
Семина Е.В.
,
Сенченков Е.П.
,
Сенчукова А.Л.
,
Серегин А.П.
,
Сидоренко Г.Ю.
,
Симоненко Е.Ю.
,
Симонян Р.А.
,
Синев А.Ю.
,
Скулачев В.П.
,
Скулачев К.В.
,
Слободкина Е.А.
,
Смирнова Е.А.
,
Соловченко А.Е.
,
Соловьева Е.Н.
,
Сорокин М.И.
,
Сото Э.
,
Спасская Н.Н.
,
Сперанская А.С.
,
Спирин С.А.
,
Стамбольский Д.В.
,
Старостина Е.Е.
,
Степанов А.Л.
,
Сулимов А.В.
,
Сулимов В.Б.
,
Сумбатян Н.В.
,
Суханова Е.С.
,
Сухоруков А.П.
,
Сысоева В.Ю.
,
Тарнопольская М.Е.
,
Тащилова А.С.
,
Твердислов В.А.
,
Темерева Е.Н.
,
Терентьева Е.И.
,
Терехова В.А.
,
Тимошенко В.Ю.
,
Титова М.В.
,
Тихонов В.В.
,
Тишечкин Д.Ю.
,
Токарчук А.В.
,
Томкович П.С.
,
Троицкий А.В.
,
Тужилин А.А.
,
Тузов К.А.
,
Федоров А.В.
,
Федоров В.В.
,
Федорова А.В.
,
Федосеева (Бандолина) Е.В.
,
Федосов В.Э.
,
Фенюк Б.А.
,
Фетисова Е.К.
,
Флегонтов П.Н.
,
Фырнин Д.М.
,
Хайлова Л.С.
,
Храмова Ю.В.
,
Цетлин А.Б.
,
Чеканов К.А.
,
Челомбитько М.А.
,
Черепанов Д.А.
,
Чернов И.Ю.
,
Черняк Б.В.
,
Чертополохов В.А.
,
Чертопруд Е.С.
,
Чесунов А.В.
,
Чивкунова О.Б.
,
Чотчаева Ф.Р.
,
Чубатова Н.В.
,
Чудаев Д.А.
,
Чурикова О.А.
,
Шагиева Г.С.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Шалаева Д.Н.
,
Шаранова Н.Э.
,
Шаталкин А.И.
,
Шаталова Н.Н.
,
Шафеи Р.А.
,
Шахпаронов В.В.
,
Шведчикова Н.К.
,
Шестаков А.И.
,
Шилов Е.С.
,
Шиловский Г.А.
,
Шнырева А.В.
,
Штратникова В.Ю.
,
Шубина Е.А.
,
Шуленина Н.Э.
,
Щелкунов М.И.
,
Щербаков П.Н.
,
Эльдаров Ч.М.
,
Юрцева О.В.
,
Яворская М.И.
,
Яковенко С.А.
,
Якушев А.В.
,
Якушев А.Г.
,
Яровая Е.Б.
6 июня 2012 - 11 июля 2013
Исследование и разработка алгоритмов и методов построения трехмерных атомистических моделей молекул белков и их комплексов на основе анализа карт электронной плотности низкого разрешения, молекулярного моделирования и баз данных по пространственной структуре гомологов
Биологический факультет
Руководитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Балабаев Н.К.
,
Боздаганян М.Е.
,
Давлетов И.Д.
,
Кирпичников М.П.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Сивожелезов В.С.
,
Соколова О.С.
,
Турченков Д.А.
,
Шайтан А.К.
,
Шуров Д.Л.
1 января 2012 - 31 декабря 2013
Суперкомпьютерное моделирование структуры и динамики нуклеосом
Биологический факультет
Руководитель:
Шайтан А.К.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Блинов В.Н.
1 декабря 2010 - 31 декабря 2012
Эукариотическое транскрибирование: механизмы генетических и эпигенетических процессов и разработка регуляторов для биоинженерии
Биологический факультет
Руководитель:
Студитский В.М.
Участники НИР:
Аргентова В.В.
,
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Волох О.И.
,
Герасимова Н.С.
,
Глухов Г.С.
,
Демиденко А.В.
,
Ефременко А.В.
,
Ефремов Ю.М.
,
Иванова М.А.
,
Киташов А.В.
,
Кудряшова К.С.
,
Кулаева О.И.
,
Малюченко Н.В.
,
Маслакова А.А.
,
Никитин Д.В.
,
Орловский И.В.
,
Печникова Е.В.
,
Роскошная А.С.
,
Рубцов М.А.
,
Соколова О.С.
,
Феофанов А.В.
,
Чертков О.В.
,
Шайтан А.К.
Свидетельства о регистрации прав на программное обеспечение
2018
Программа для определения структуры биомакромолекулярных комплексов методами интегративного моделирования с использованием карт электронной плотности низкого разрешения (SOFT)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Волынцева А.Д.
,
Соколова О.С.
,
Новоселецкий В.Н.
#2018612587, 20 февраля
2013
Программный комплекс реконструкции пространственной структуры белков и комплексов на основе карт электронной плотности низкого разрешения. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ (тип не указан)
Авторы:
Шуров Д.Л.
,
Армеев Г.А.
,
Турченков Д.А.
,
Блинов В.Н.
,
Кирпичников М.П.
,
Шайтан К.В.
#2013616706, 17 июля
Участие в программных комитетах конференций
12-23 апреля 2021
XXVIII Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов 2021"
Член программного комитета
МГУ им. М.В. Ломоносова, Москва, Россия
Диссертация
2018
Определение структуры нуклеосом и их комплексов с белками хроматина методами молекулярного моделирования
Кандидатская диссертация по специальности 03.01.09 - Математическая биология, биоинформатика (физ.-мат. науки)
Автор:
Армеев Григорий Алексеевич
, к.ф.-м.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
Научные руководители:
Шайтан Константин Вольдемарович
, д.ф.-м.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова,
Шайтан Алексей Константинович
, д.ф.-м.н., проф. РАН, член-корр. РАН, МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
МГУ.015.5(03.02)
МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
Организация, в которой выполнялась работа:
МГУ имени М.В. Ломоносова
Оппоненты:
Ефремов Роман Гербертович
,
Головин Андрей Викторович
,
Балабаев Николай Кириллович
Руководство дипломными работами
2021
Оценка эффективности ферстеровского резонансного переноса энергии методами молекулярного моделирования
Научный руководитель:
Армеев Г.А.
Автор: Кристовский Н.В. (Бакалавр)
2021
Молекулярные механизмы динамики канонических и H2A.Z-нуклеосом
Научные руководители:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Автор: Князева А.С. (Магистр)
2021
Дизайн биосенсора нуклеиновых кислот на основе двух dCas9 белков
Научные руководители:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Автор: Новиков Р.В. (Бакалавр)
2019
Исследование функционально-значимых конформационных изменений в белковых молекулах методами термодинамического интегрирования и метадинамики
Научные руководители:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Автор: Князева А.С. (Бакалавр)
2017
Исследование энергетического профиля процесса отворачивания ДНК от гистонового кора нуклеосомы
Научные руководители:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Автор: Грибкова Анна Кирилловна (Бакалавр)
2016
Анализ и предсказание профилей гидроксильного расщепления днк для изучения нуклеосом и их комплексов
Научные руководители:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Автор: Ефимова Дарья Андреевна (Бакалавр)
Авторство учебных курсов
2021
Программирование для биологов
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
,
Князева А.С.
,
Грибкова А.К.
,
Сингх-Пальчевская Л.
2021
Python для биологов
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
2020
Прикладное программирование на языке Python
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
2018
Введение в биоинформатику
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Коротков Е.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Герасимов Е.С.
,
Армеев Г.А.
Преподавание учебных курсов
5 октября 2020 - 30 декабря 2020
Прикладное программирование на языке Python
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
,
Кафедра биоинженерии
обязательная, базовой части, семинары, 54 часов
21 февраля 2019 - 28 февраля 2019
Практическая биология
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
обязательная, базовой части, практические занятия, 12 часов
Выступление в СМИ
22 апреля 2021 г.
Суперкомпьютер помог учёным МГУ разобраться с дыханием и скольжением ДНК
(Научная Россия)
Авторы (участники):
Князева Анастасия Сергеевна
,
Шайтан Алексей Константинович
,
Армеев Григорий Алексеевич
,
Кирпичников Михаил Петрович
,
Воеводин Владимир Валентинович
22 апреля 2021 г.
Суперкомпьютер помог учёным разобраться с дыханием и скольжением ДНК
(Русская Планета)
Авторы (участники):
Князева Анастасия Сергеевна
,
Шайтан Алексей Константинович
,
Армеев Григорий Алексеевич
,
Кирпичников Михаил Петрович
,
Воеводин Владимир Валентинович
22 апреля 2021 г.
Ученые МГУ разбираются в логике “чтения” молекулярными механизмами “текста” из нуклеотидов
(Научно-информационный портал ПОИСК)
Авторы (участники):
Князева Анастасия Сергеевна
,
Шайтан Алексей Константинович
,
Армеев Григорий Алексеевич
,
Кирпичников Михаил Петрович
,
Воеводин Владимир Валентинович
22 апреля 2021 г.
Ученые проследили за движением нитей ДНК внутри ядра клеток
(ТАСС, Наука)
Авторы (участники):
Князева Анастасия Сергеевна
,
Шайтан Алексей Константинович
,
Армеев Григорий Алексеевич
,
Кирпичников Михаил Петрович
,
Воеводин Владимир Валентинович