Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
Галзитская Оксана Валериановна
пользователь
доктор физико-математических наук с 2006 года
Институт белка РАН
Соавторы:
Selivanova O.
,
Финкельштейн А.В.
,
Surin A.K.
,
Glyakina A.V.
,
Lobanov M.Y.
,
Dovidchenko N.
,
Garbuzynskiy S.
,
Suvorina M.
,
Гришин С.Ю.
,
Bogatyreva N.
,
Grigorashvili E.
,
Балабаев Н.К.
,
Джус У.Ф.
показать полностью...
,
Никулин А.Д.
,
Machulin A.V.
,
Иванов Д.Н.
,
Ivankov D.N.
,
Гурин А.Н.
,
Калебина Т.С.
,
Лобанов М.Ю.
,
Фадеев Р.С.
,
Вихлянцев И.М.
,
Глякина А.В.
,
Лихачев И.В.
,
Сердюк И.Н.
,
Бобылев А.Г.
,
Дерюшев Г.
,
Дерюшева Е.И.
,
Тимченко A.A.
,
Якупова Э.И.
,
Marchenkov V.V.
,
Sokolovskiy I.V.
,
Gorbunova E.Y.
,
Higo J.
,
Mikhaylina A.O.
,
Nakamura H.
,
Skoogarev A.V.
,
Безсонов Е.Е.
,
Домнин П.А.
,
Кравченко С.В.
,
Мельник Б.С.
,
Пеньков Н.В.
,
Рекстина В.В.
,
Рогачевский В.В.
,
Селях И.О.
,
кобякова м.и.
,
Deryusheva E.
,
Higo J.
,
Kasakov A.S.
,
Kurpe S.R.
,
Marchenkov V.V.
,
Matkarimov B.T.
,
Molochkov N.V.
,
Mustaeva L.
,
Panfilov A.V.
,
Shiliaev N.G.
,
Slizen M.V.
,
БАЛОБАНОВ В.А.
,
Бадретдинов А.Я.
,
Гутин А.М.
,
Кулаев И.С.
,
Лихачев И.А.
,
Немашкалова Е.Л.
,
Новиков Г.Г.
,
Сабирзянова Т.А.
,
Семисотнов Г.В.
,
Тимченко М.А.
,
Уверский В.Н.
,
Andreasson J.
,
Badretdin A.J.
,
Badretdin A.J.
,
Barak I.
,
Bednarikova Z.
,
Bobylev L.
,
Brockerman J.
,
Caflisch A.
,
Chapman H.N.
,
Deryusheva E.
,
Fedechkin S.O.
,
Flückiger L.
,
Fong J.
,
Fong J.H.
,
Fontanillas E.
,
Furletova E.I.
,
Gabdoulkhakov A.G.
,
Galushko E.I.
,
Gellissen G.
,
Giewekemeyer K.
,
Girguis P.R.
,
Glukhov A.S.
,
Gorkovskii A.A.
,
Gorokhov V.V.
,
Groenning M.
,
Hourdez S.
,
Iakushun M.
,
Ikeda K.
,
Jollivet D.
,
Jung C.
,
Karpov M.
,
Kellermayer M.S.
,
Kihara H.
,
Kim Y.
,
Kitagawa H.
,
Kjeldsen F.
,
Korepanova E.A.
,
Kuroda M.
,
Lecompte O.
,
Leonova E.I.
,
Litus E.A.
,
Macedo-Ribeiro S.
,
Mary J.
,
Mitomo D.
,
Mártonfalvi Z.
,
Mühlig K.
,
Nielsen M.2.
,
Ono S.
,
Ourmazd A.
,
Pereyaslavets L.
,
Permyakov E.A.
,
Pinheiro F.
,
Reifsnyder D.C.
,
Reva B.A.
,
Sadgyan A.S.
,
Sadovnikova E.S.
,
Santockyte R.
,
Savitski M.2.
,
Schmatchenko V.
,
Selivanova O.
,
Serpell L.C.
,
Shaykhutdinova E.R.
,
Shoemaker B.
,
Shoemaker C.F.
,
Shtang O.M.
,
Shumeyko S.A.
,
Silenzi A.
,
Skrabana R.
,
Sokolik V.V.
,
Sokolik V.
,
Sopova J.V.
,
Strizhov N.
,
Sztuk-Dambietz J.
,
TIN U.F.
,
Tartaglia G.G.
,
Timneanu N.
,
Trebbin M.
,
Uetrecht C.
,
Ushakova N.I.
,
Uzdenski A.
,
Weinhausen B.
,
Xavier P.L.
,
Yurshenas D.A.
,
Ziaunys M.
,
Zubarev R.2.
,
Антал Т.К.
,
Бинги В.Н.
,
Бочкарева С.С.
,
Булычев А.А.
,
Ванин А.Ф.
,
Вершубский А.В.
,
Волгушева А.А.
,
Гиршович А.С.
,
Глушко Е.В.
,
Давлетшина Л.Н.
,
Донова М.В.
,
Дьяконова А.Н.
,
Елисеева И.А.
,
Ефимова В.С.
,
Ефремов Р.Г.
,
Зиганшин Р.Х.
,
Ильин В.А.
,
Исаева Л.В.
,
Коваленко И.Б.
,
Константинова А.В.
,
Кочетов А.П.
,
Красильников П.М.
,
Кренделева Т.Е.
,
Кудряшова И.Б.
,
Кузнецов М.Б.
,
Кузнецов С.Л.
,
Кукарских Г.П.
,
Курпе С.Р.
,
Курпе С.
,
Кутузов Н.П.
,
Леонова Э.И.
,
Ловягина Е.Р.
,
Лёбер Г.
,
Максимов Г.В.
,
Маторин Д.Н.
,
Матюшин М.А.
,
Мельник Т.М.
,
Немченко О.Ю.
,
Нечипуренко Ю.Д.
,
Никулин А.М.
,
Новикова Л.А.
,
Нокс П.П.
,
Плюснина Т.Ю.
,
Подлубная З.А.
,
Полежаев А.А.
,
Пятибратов М.Г.
,
Рева Б.А.
,
Ризниченко Г.Ю.
,
Рубцов М.А.
,
Рязанский С.С.
,
Садгян А.С.
,
Слизень М.В.
,
Сюткин А.С.
,
Сёмин Б.К.
,
Ушакова Н.И.
,
Хрущев С.С.
,
Юршенас Д.А.
269 статей
,
1 книга
,
6 докладов на конференциях
,
1 тезисы доклада
,
1 диссертация
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 2733, Scopus: 2904
IstinaResearcherID (IRID): 243978856
ResearcherID:
L-2664-2015
Деятельность
Статьи в журналах
2023
Nonspecific Amyloid Aggregation of Chicken Smooth-Muscle Titin
Bobylev A.G.
,
Yakupova E.I.
, Bobyleva L.G.,
Molochkov N.V.
,
Timchenko A.A.
,
Timchenko M.A.
,
Kihara H.
,
Nikulin A.D.
,
Gabdulkhakov A.G.
,
Melnik T.N.
,
Penkov N.V.
,
Lobanov M.Y.
,
Kazakov A.S.
,
Kellermayer M.
,
Mártonfalvi Z.
,
Galzitskaya O.V.
,
Vikhlyantsev I.M.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 2023, № 24, с. 1056
DOI
2023
The Strategies of Development of New Non-Toxic Inhibitors of Amyloid Formation
Galzitskaya O.V.
,
Grishin S.Y.
,
Glyakina A.V.
, Dovidchenko N.V.,
Konstantinova A.V.
, Kravchenko S.V.,
Surin A.K.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 24, № 4
DOI
2022
Amyloidogenic Peptides: New Class of Antimicrobial Peptides with the Novel Mechanism of Activity
Galzitskaya Oxana V.
,
Kurpe Stanislav R.
,
Panfilov Alexander V.
,
Glyakina Anna V.
,
Grishin Sergei Y.
, Kochetov Alexey P.,
Deryusheva Evgeniya I.
,
Machulin Andrey V.
,
Kravchenko Sergey V.
,
Domnin Pavel A.
,
Surin Alexey K.
, Azev Viacheslav N., Ermolaeva Svetlana A.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 23, № 10, с. 5463
DOI
2022
Extended disordered regions of ribosome-associated NAC proteins paralogs belong only to the germline in Drosophila melanogaster
Kogan Galina L., Mikhaleva Elena A., Olenkina Oxana M.,
Ryazansky Sergei S.
,
Galzitskaya Oxana V.
, Abramov Yuri A., Leinsoo Toomas A., Akulenko Natalia V., Lavrov Sergey A., Gvozdev Vladimir A.
в журнале
Scientific reports
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 12, № 1
DOI
2022
Influence of Chaperones on Amyloid Formation of Аβ Peptide
Galzitskaya O.V.
,
Selivanova O.M.
,
Dzhus U.F.
,
Marchenkov V.V.
,
Suvorina M.Yu
,
Surin A.K.
в журнале
Current Protein and Peptide Science
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 23, № 1, с. 44-51
DOI
2022
Influence of Chaperones on Amyloid Formation of Аβ Peptide
Galzitskaya O.V.
,
Selivanova O.M.
,
Dzhus U.F.
,
Marchenkov V.V.
,
Suvorina M.Yu
,
Surin A.K.
в журнале
Current Protein and Peptide Science
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 23, № 1, с. 44-51
DOI
2022
Is It Possible to Find an Antimicrobial Peptide That Passes the Membrane Bilayer with Minimal Force Resistance? An Attempt at a Predictive Approach by Molecular Dynamics Simulation
Likhachev Ilya V.
,
Balabaev Nikolay K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 23, № 11
DOI
2022
Multiple Antimicrobial Effects of Hybrid Peptides Synthesized Based on the Sequence of Ribosomal S1 Protein from Staphylococcus aureus
Kravchenko Sergey V.
,
Domnin Pavel A.
,
Grishin Sergei Y.
,
Panfilov Alexander V.
, Azev Viacheslav N., Mustaeva Leila G., Gorbunova Elena Y.,
Kobyakova Margarita I.
,
Surin Alexey K.
,
Glyakina Anna V.
,
Fadeev Roman S.
, Ermolaeva Svetlana A.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 23, № 1
DOI
2022
The Increased Amyloidogenicity of Spike RBD and pH-Dependent Binding to ACE2 May Contribute to the Transmissibility and Pathogenic Properties of SARS-CoV-2 Omicron as Suggested by In Silico Study
Aksenova AY, Likhachev IV,
Grishin SY
,
Galzitskaya OV
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 23, № 21
DOI
2021
Exploring Amyloidogenicity of Peptides From Ribosomal S1 Protein to Develop Novel AMPs
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Frontiers in Molecular Biosciences
, издательство
Frontiers Media S.A.
(Lausanne, Switzerland)
, том 8
DOI
2021
Identification of Amyloidogenic Regions in Pseudomonas aeruginosa Ribosomal S1 Protein
Grishin Sergei Y.
,
Dzhus Ulyana F.
,
Glukhov Anatoly S.
,
Selivanova Olga M.
,
Surin Alexey K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 22, № 14, с. 7291-7291
DOI
2021
Is It Possible to Create Antimicrobial Peptides Based on the Amyloidogenic Sequence of Ribosomal S1 Protein of P. aeruginosa?
Grishin Sergei Y.
,
Domnin Pavel A.
,
Kravchenko Sergey V.
, Azev Viacheslav N., Mustaeva Leila G., Gorbunova Elena Y.,
Kobyakova Margarita I.
,
Surin Alexey K.
, Makarova Maria A.,
Kurpe Stanislav R.
,
Fadeev Roman S.
, Vasilchenko Alexey S., Firstova Victoria V., Ermolaeva Svetlana A.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 22, № 18
DOI
2021
Is there an advantageous arrangement of aromatic residues in proteins?: Statistical analysis of aromatic interactions in globular proteins
Lobanov Mikhail Yu
,
Pereyaslavets Leonid B.
,
Likhachev Ilya V.
,
Matkarimov Bakhyt T.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Computational and Structural Biotechnology Journal
, том 19, с. 5960-5968
DOI
2021
Mechanism of Amyloid Gel Formation by Several Short Amyloidogenic Peptides
Galzitskaya Oxana V.
,
Selivanova Olga M.
,
Gorbunova Elena Y.
, Mustaeva Leila G., Azev Viacheslav N.,
Surin Alexey K.
в журнале
Nanomaterials
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 11, № 11
DOI
2021
Myosin Binding Protein-C Forms Amyloid-Like Aggregates In Vitro
Bobyleva Liya G.
,
Shumeyko Sergey A.
,
Yakupova Elmira I.
,
Surin Alexey K.
,
Galzitskaya Oxana V.
,
Kihara Hiroshi
,
Timchenko Alexander A.
,
Timchenko Maria A.
,
Penkov Nikita V.
,
Nikulin Alexey D.
,
Suvorina Mariya Yu
,
Molochkov Nikolay V.
,
Lobanov Mikhail Yu
,
Fadeev Roman S.
,
Vikhlyantsev Ivan M.
,
Bobylev Alexander G.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 22, № 2, с. 731-731
DOI
2021
Search for Structural Basis of Interactions of Biogenic Amines with Human TAAR1 and TAAR6 Receptors
Glyakina Anna V.
, Pavlov Constantine D.,
Sopova Julia V.
, Gainetdinov Raul R., Leonova Elena I.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 23, № 1
DOI
2021
Sequence and evolutionary analysis of bacterial ribosomal S1 proteins
Deryusheva Evgeniya
,
Machulin Andrey
,
Matyunin Maxim
,
Galzitskaya Oxana
в журнале
Proteins
, том 89, № 9, с. 1111-1124
DOI
2021
Structural, Functional, and Evolutionary Characteristics of Proteins with Repeats
Deryusheva E.I.
,
Machulin A.V.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 55, № 5, с. 748-771
DOI
2021
Антибактериальные эффекты пептидов, синтезированных на основе последовательности рибосомного белка S1
Курпе С.Р.
,
Гришин С.Ю.
,
Глякина А.В.
,
Слизень М.В.
, Панфилов А.В.,
Кочетов А.П.
,
Сурин А.К.
,
Кобякова М.И.
,
Фадеев Р.С.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Биомедицинская химия
, том 67, № 3, с. 231-243
DOI
2020
Amyloidogenic Propensities of Ribosomal S1 Proteins: Bioinformatics Screening and Experimental Checking
Grishin Sergei Y.
,
Deryusheva Evgeniya I.
,
Machulin Andrey V.
,
Selivanova Olga M.
,
Glyakina Anna V.
, Gorbunova Elena Y., Mustaeva Leila G., Azev Vyacheslav N.,
Rekstina Valentina V.
,
Kalebina Tatyana S.
,
Surin Alexey K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 21, № 15, с. 5199-5199
DOI
2020
Antimicrobial and Amyloidogenic Activity of Peptides Synthesized on the Basis of the Ribosomal S1 Protein from Thermus Thermophilus
Kurpe Stanislav R.,
Grishin Sergei Yu
,
Surin Alexey K.
,
Selivanova Olga M.
,
Fadeev Roman S.
,
Dzhus Ylyana F.
, Gorbunova Elena Yu, Mustaeva Leila G., Azev Vyacheslav N.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 21, № 17, с. 6382-6382
DOI
2020
Antimicrobial and Amyloidogenic Activity of Peptides Synthesized on the Basis of the Ribosomal S1 Protein from Thermus Thermophilus
Kurpe Stanislav R., Grishin Sergei Yu,
Surin Alexey K.
,
Selivanova Olga M.
,
Fadeev Roman S.
,
Dzhus Ylyana F.
, Gorbunova Elena Yu, Mustaeva Leila G., Azev Vyacheslav N.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 21, № 17, с. 6382-6382
DOI
2020
Antimicrobial and Amyloidogenic Activity of Peptides. Can Antimicrobial Peptides Be Used against SARS-CoV-2?
Kurpe Stanislav R.,
Grishin Sergei Yu
,
Surin Alexey K.
, Panfilov Alexander V.,
Slizen Mikhail V.
, Chowdhury Saikat D.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 21, № 24, с. 9552-9552
DOI
2020
Aнтибактериальные эффекты пептидов, синтезированных на основе последовательности рибосомного белка S1 из Thermus Thermophilus. . 3(34):372-376. (2020)
Курпе СР
,
Гришин СЮ
,
Селиванова ОМ
,
Сурин АК
,
Галзитская ОВ
в журнале
Актуальная биотехнология
, том 3, № 34, с. 372-376
2020
Bioinformatics Analysis of Actin Molecules: Why Quantity Does Not Translate Into Quality?
Glyakina Anna V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Frontiers in genetics
, издательство
Frontiers Research Foundation.
(Lausanne, Switzerland)
, том 11
DOI
2020
Comparative Analysis of Aggregation of Thermus thermophilus Ribosomal Protein bS1 and Its Stable Fragment
Grishin S.Yu
,
Dzhus U.F.
,
Selivanova O.M.
,
Balobanov V.A.
,
Surin A.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 85, № 3, с. 344-354
DOI
2020
Comparative Analysis of Proteomes of a Number of Nosocomial Pathogens by KEGG Modules and KEGG Pathways
Slizen Mikhail V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 21, № 21
DOI
2020
Determination of amyloid core regions of insulin analogues fibrils
Surin Alexey K.
,
Grishin Sergei Yu
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Prion
, издательство
Landes Bioscience
(United States)
, том 14, № 1, с. 149-162
2020
Disordered Residues and Patterns in the Protein Data Bank
Lobanov Mikhail Yu
,
Likhachev Ilya V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Molecules
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 25, № 7
DOI
2020
How Quickly Do Proteins Fold and Unfold, and What Structural Parameters Correlate with These Values?
Glyakina Anna
,
Galzitskaya Oxana
в журнале
Biomolecules
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 10, № 2
DOI
2020
MIRRAGGE – Minimum Information Required for Reproducible AGGregation Experiments
Martins Pedro M., Navarro Susanna, Silva Alexandra, Pinto Maria F., Sárkány Zsuzsa, Figueiredo Francisco, Pereira Pedro José Barbosa,
Pinheiro Francisca
,
Bednarikova Zuzana
, Burdukiewicz Michał,
Galzitskaya Oxana V.
, Gazova Zuzana, Gomes Cláudio M., Pastore Annalisa,
Serpell Louise C.
,
Skrabana Rostislav
, Smirnovas Vytautas,
Ziaunys Mantas
, Otzen Daniel E., Ventura Salvador,
Macedo-Ribeiro Sandra
в журнале
Frontiers in Molecular Neuroscience
, издательство
Frontiers Research Foundation
(Switzerland)
, том 13
DOI
2020
Megahertz single-particle imaging at the European XFEL
Sobolev Egor, Zolotarev Sergei,
Giewekemeyer Klaus
, Bielecki Johan, Okamoto Kenta, Reddy Hemanth K.N.,
Andreasson Jakob
, Ayyer Kartik,
Barak Imrich
, Bari Sadia, Barty Anton, Bean Richard, Bobkov Sergey,
Chapman Henry N.
, Chojnowski Grzegorz, Daurer Benedikt J., Dörner Katerina, Ekeberg Tomas,
Flückiger Leonie
,
Galzitskaya Oxana
, Gelisio Luca, Hauf Steffen, Hogue Brenda G., Horke Daniel A., Hosseinizadeh Ahmad,
Ilyin Vyacheslav
,
Jung Chulho
, Kim Chan,
Kim Yoonhee
, Kirian Richard A., Kirkwood Henry, Kulyk Olena, Küpper Jochen, Letrun Romain, Loh N.Duane, Lorenzen Kristina, Messerschmidt Marc,
Mühlig Kerstin
,
Ourmazd Abbas
, Raab Natascha, Rode Andrei V., Rose Max, Round Adam, Sato Takushi, Schubert Robin, Schwander Peter, Sellberg Jonas A., Sikorski Marcin,
Silenzi Alessandro
, Song Changyong, Spence John C.H., Stern Stephan,
Sztuk-Dambietz Jolanta
, Teslyuk Anthon,
Timneanu Nicusor
,
Trebbin Martin
,
Uetrecht Charlotte
,
Weinhausen Britta
, Williams Garth J.,
Xavier P.Lourdu
, Xu Chen, Vartanyants Ivan A., Lamzin Victor S., Mancuso Adrian, Maia Filipe R.N.C
в журнале
Communications Physics
, издательство
Springer Nature
(Switzerland)
, том 3, № 1
DOI
2020
New Model for Stacking Monomers in Filamentous Actin from Skeletal Muscles of Oryctolagus cuniculus
Glyakina Anna V.
,
Surin Alexey K.
,
Grishin Sergei Yu
,
Selivanova Olga M.
,
Suvorina Mariya Yu
, Bobyleva Liya G., Vikhlyantsev Ivan M.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 21, № 21, с. 8319-8319
DOI
2020
Oligomers Are Promising Targets for Drug Development in the Treatment of Proteinopathies
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Frontiers in Molecular Neuroscience
, издательство
Frontiers Research Foundation
(Switzerland)
, том 12
DOI
2020
Structural and Functional Peculiarities of alpha-Crystallin
Selivanova Olga M.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Biology
, издательство
MDPI Publishing
(Basel, Switzerland, Switzerland)
, том 9, № 4
DOI
2020
Изменения структуры титина при его агрегации
Бобылёв А.Г.,
Якупова Э.И.
, Бобылёва Л.Г.,
Галзитская О.В.
,
Никулин А.Д.
, Шумейко С.А.,
Юршенас Д.А.
,
Вихлянцев И.М.
в журнале
Молекулярная биология
, том 54, № 4, с. 643-652
DOI
2020
Сравнительный анализ агрегации рибосомного белка bS1 и его стабильного фрагмента из Thermus thermophilus
Гришин С.Ю.
,
Джус У.Ф.
,
Селиванова О.М.
,
Балобанов В.А.
,
Сурин А.К.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 85, № 3, с. 399-411
DOI
2019
An Overlap between Splicing Sites in RNA and Homo-Repeats in Human Proteins
Galzitskaya O.V.
,
Novikov G.S.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 53, № 3, с. 524-528
DOI
2019
Identification of Amyloidogenic Regions in the Spine of Insulin Fibrils
Surin A.K.
,
Grishin S.Yu
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 84, № 1, с. 47-55
DOI
2019
Identification of amyloidogenic regions in S1 ribosomal proteins from Thermus thermophilus and Mycoplasma mobile
Galzitskaya O.V.
,
Grishin S.Y.
,
Dzhus U.F.
,
Selivanova O.M.
,
Glyakina A.V.
,
Deryusheva E.I.
,
Machulin A.V.
,
Suvorina M.Y.
,
Surin A.K.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 9, № S1, с. 264-264
DOI
2019
Ile351, Leu355 and Ile461 residues are essential for catalytic activity of bovine cytochrome P450scc (CYP11A1)
Glyakina AV
,
Strizhov NI
,
Karpov MV
,
Dovidchenko NV
,
Matkarimov BT
,
Isaeva LV
,
Efimova VS
,
Rubtsov MA
,
Novikova LA
,
Donova MV
,
Galzitskaya OV
в журнале
Steroids
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 143, с. 80-90
DOI
2019
Investigation of the Relationship between the S1 Domain and Its Molecular Functions Derived from Studies of the Tertiary Structure. Molecules
Deryusheva E.I.
,
Machulin A.V.
, Matyunin M.A.,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Molecules
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 24, № 20
DOI
2019
Is there codon usage bias for poly-Q stretches in the human proteome?
Galzitskaya Oxana V.
,
Novikov Georgii S.
,
Dovidchenko Nikita V.
, Lobanov Mikhail Yu
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 17, № 01, с. 1950010
DOI
2019
New Mechanism of Amyloid Fibril Formation
Galzitskaya Oxana
в журнале
Current Protein and Peptide Science
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 20, № 6, с. 630-640
DOI
2019
Repeats in S1 Proteins: Flexibility and Tendency for Intrinsic Disorder
Machulin Andrey
,
Deryusheva Evgenia
,
Lobanov Mikhail
,
Galzitskaya Oxana
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 20, № 10
DOI
2019
The binding of monomeric amyloid β peptide to serum albumin is affected by major plasma unsaturated fatty acids
Litus E.A.
,
Kazakov A.S.
, Sokolov A.S.,
Nemashkalova E.L.
,
Galushko E.I.
,
Dzhus U.F.
,
Marchenkov V.V.
,
Galzitskaya O.V.
,
Permyakov E.A.
в журнале
Biochemical and Biophysical Research Communications
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 510, № 2, с. 248-253
2019
The number of domains in the ribosomal protein S1 as a hallmark of the phylogenetic grouping of bacteria
Machulin Andrey V.
,
Deryusheva Evgenia I.
,
Selivanova Olga M.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 14, № 8, с. e0221370
DOI
2019
ОПРЕДЕЛЕНИЕ АМИЛОИДОГЕННЫХ УЧАСТКОВ, ВХОДЯЩИХ В ОСТОВ ФИБРИЛЛ ИНСУЛИНА
Сурин А.К.
,
Гришин С.Ю.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 84, № 1, с. 128-137
DOI
2018
Analysis of Insulin Analogs and the Strategy of Their Further Development
Selivanova O.M.
,
Grishin S.Yu
,
Glyakina A.V.
,
Sadgyan A.S.
,
Ushakova N.I.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 83, № S1, с. S146-S162
DOI
2018
Anomalous Kinetics of Amyloidogenesis Suggest a Competition between Oligomers and Fibrils
Finkelstein A.V.
,
Dovidchenko N.V.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 52, № 1, с. 62-68
DOI
2018
Comparative mechanical unfolding studies of spectrin domains R15, R16 and R17
Glyakina Anna V.
,
Likhachev Ilya V.
,
Balabaev Nikolay K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Structural Biology
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 201, № 2, с. 162-170
DOI
2018
Molecular mechanism of amyloid formation by Ab peptide: review of own works
Selivanova O.M.
,
Rogachevsky V.V.
,
Syrin A.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Биомедицинская химия
, том 64, № 1, с. 94-109
DOI
2018
Proteome-scale understanding of relationship between homo-repeat enrichments and protein aggregation properties
Galzitskaya Oxana V.
,
Lobanov M.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 13, № 11, с. e0206941
DOI
2018
Search for Functional Flexible Regions in the G-protein Family: New Reading of the FoldUnfold Program
Deryusheva Eugenia
,
Machulin Andrey
,
Nemashkalova Ekaterina
,
Glyakina Anna
,
Galzitskaya Oxana
в журнале
Protein and Peptide Letters
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 25, № 6, с. 589-598
DOI
2018
Should the Treatment of Amyloidosis Be Personified? Molecular Mechanism of Amyloid Formation by Aβ Peptide and Its Fragments
Galzitskaya Oxana V.
,
Surin Alexey K.
,
Glyakina Anna V.
,
Rogachevsky Vadim V.
,
Selivanova Olga M.
в журнале
Journal of Alzheimer's Disease Reports
, издательство
IOS Press
(Amsterdam, Netherlands)
, том 2, № 1, с. 181-199
DOI
2018
Some questions remain unanswered for alpha-Crystallin
Selivanova Olga M.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Atlas of Science.( http://atlasofscience.org)
, № March 12
2018
Studies of the Process of Amyloid Formation by A$\upbeta$ Peptide
Galzitskaya O.V.
,
Galushko E.I.
,
Selivanova O.M.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 83, № S1, с. S62-S80
DOI
2018
To Be Fibrils or To Be Nanofilms?: Oligomers Are Building Blocks for Fibril and Nanofilm Formation of Fragments of A$\upbeta$ Peptide
Selivanova Olga M.
,
Surin Alexey K.
, Ryzhykau Yury L.,
Glyakina Anna V.
,
Suvorina Mariya Yu
, Kuklin Alexander I.,
Rogachevsky Vadim V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Langmuir
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 34, № 6, с. 2332-2343
DOI
2018
What is Responsible for Atypical Dependence of the Rate of Amyloid Formation on Protein Concentration: Fibril-Catalyzed Initiation of New Fibrils or Competition with Oligomers?
Finkelstein Alexei V.
,
Dovidchenko Nikita V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Physical Chemistry Letters
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 9, № 5, с. 1002-1006
DOI
2018
АНАЛИЗ АНАЛОГОВ ИНСУЛИНА И СТРАТЕГИЯ ИХ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ
Селиванова О.М.
,
Гришин С.Ю.
,
Глякина А.В.
,
Садгян А.С.
,
Ушакова Н.И.
,
Галзиская О.В.
в журнале
Успехи биологической химии
, том 58, с. 313-346
2018
АНОМАЛЬНАЯ КИНЕТИКА АМИЛОИДОГЕНЕЗА СВИДЕТЕЛЬСТВУЕТ О ТОМ, ЧТО ФИБРИЛЛЫ КОНКУРИРУЮТ С ОЛИГОМЕРАМИ?
Финкельштейн А.В.
,
Довидченко Н.В.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, № 1, с. 73-81
DOI
2018
СТРУКТУРОНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ОСОБЕННОСТИ α-КРИСТАЛЛИНА
СЕЛИВАНОВА О.М.
,
ГЛЯКИНА А.В.
,
СУВОРИНА М.Ю.
,
НИКУЛИН А.Д.
,
СУРИН А.К.
,
ГАЛЗИТСКАЯ О.В.
в журнале
Актуальные вопросы биологической физики и химии
, издательство
Севастопольский государственный университет
(Севастополь)
, том 3, № 3, с. 673-679
2018
ФУНКЦИОНАЛЬНО ЗНАЧИМЫЕ АМИНОКИСЛОТНЫЕ МОТИВЫ БЕЛКОВ ТЕПЛОВОГО ШОКА: СТРУКТУРНЫЙ И БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ HSP60/HSP10 ПЯТИ КЛАССОВ ХОРДОВЫХ
ТИХОМИРОВА Т.С.,
ГАЛЗИТСКАЯ О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 52, № 5, с. 879-897
DOI
2017
Amyloid properties of titin
Yakupova E.I.
,
Vikhlyantsev I.M.
,
Lobanov M.Y.
,
Galzitskaya O.V.
,
Bobylev A.G.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 82, № 13, с. 1675-1685
DOI
2017
Determination of regions involved in amyloid fibril formation for Aβ(1-40) peptide
Surin Alexey K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Atlas of Science.( http://atlasofscience.org)
, № May 30
2017
Determination of the size of folding nuclei of fibrils formed from Aβ(1-40) peptide
Dovidchenko Nikita V.
,
Selivanova Olga M.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Atlas of Science.( http://atlasofscience.org)
, № March 15
2017
Hepatic and Aortic Arch Expression and Serum Levels of Syndecan-1 in ApoE Mice
Leonova Elena I.
,
Sadovnikova Elena S.
,
Shaykhutdinova Elvira R.
,
Galzitskaya Oxana V.
, Murashev Arkady N., Solonin Alexandr S.
в журнале
The open biochemistry journal
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 11, № 1, с. 77-93
DOI
2017
New morphology of amyloid fibrils
Selivanova Olga M.
,
Surin Alexey K.
,
Kalebina Tatyana S.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Atlas of Science.( http://atlasofscience.org)
2017
Proteome evolution of deep-sea hydrothermal vent alvinellid polychaetes supports the ancestry of thermophily and subsequent adaptation to cold in some lineages
Fontanillas Eric
,
Galzitskaya Oxana V.
,
Lecompte Odile
,
Lobanov Mikhail Y.
, Tanguy Arnaud,
Mary Jean
,
Girguis Peter R.
,
Hourdez Stéphane
,
Jollivet Didier
в журнале
Genome biology and evolution
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 9, № 2, с. 279-296
DOI
2017
Rosetta Stone for Amyloid Fibrils: The Key Role of Ring-Like Oligomers in Amyloidogenesis
Galzitskaya Oxana V.
,
Selivanova Olga M.
в журнале
Journal of Alzheimer's Disease
, издательство
I O S press
(Netherlands)
, том 59, № 3, с. 785-795
DOI
2017
Taxonomic distribution, repeats, and functions of the S1 domain-containing proteins as members of the OB-fold family
Deryusheva Evgeniia I.
,
Machulin Andrey V.
,
Selivanova Olga M.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Proteins
, том 85, № 4, с. 602-613
DOI
2017
There and back again: Two views on the protein folding puzzle
Finkelstein A.V.
,
Badretdin A.J.
,
Galzitskaya O.V.
,
Ivankov D.N.
,
Bogatyreva N.S.
,
Garbuzynskiy S.O.
в журнале
Physics of Life Reviews
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 21, с. 56-71
DOI
2017
Unusual structure of aggregates formed by the fragment of Аβ(16-25) peptide
Selivanova Olga M.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Atlas of Science.( http://atlasofscience.org)
, № April 18
2017
α-CRYSTALLINS ARE SMALL HEAT SHOCK PROTEINS: FUNCTIONAL AND STRUCTURAL PROPERTIES
Tikhomirova T.S.,
Selivanova O.M.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 82, № 2, с. 106-121
DOI
2017
ИЗУЧЕНИЕ ПРОЦЕССА АМИЛОИДООБРАЗОВАНИЯ НА ПРИМЕРЕ ФРАГМЕНТОВ Аβ ПЕПТИДА (Аβ16-25, Аβ31-40, Аβ33-42). НОВАЯ МОДЕЛЬ ФОРМИРОВАНИЯ ФИБРИЛЛ
СЕЛИВАНОВА О.М.
,
ГЛЯКИНА А.В.
, ГОРБУНОВА Е.Ю., МУСТАЕВА Л.Г.,
СУВОРИНА М.Ю.
,
ГРИГОРАШВИЛИ Е.И.
,
НИКУЛИН А.Д.
,
СУРИН А.К.
,
ГАЛЗИТСКАЯ О.В.
в журнале
Актуальные вопросы биологической физики и химии
, издательство
Севастопольский государственный университет
(Севастополь)
, том 2, № 1, с. 259-263
2017
ОБ АМИЛОИДНЫХ СВОЙСТВАХ ТИТИНА
Якупова Э.И.
,
Вихлянцев И.М.
, Лобанов М.Ю.,
Галзитская О.В.
,
Бобылев А.Г.
в журнале
Успехи биологической химии
, том 57, с. 254-266
2017
Уровень экспрессии гена sdc1 в стенках дуги аорты и концентрация растворимого фрагмента синдекана-1 в сыворотке крови у АпоЕ-нокаутных мышей
Leonova E.I.
, Solonin A.S.,
Galzitskaya O.V.
, Shaykhutdinova E.R., Lobanov A.V., Murashev A.N.
в журнале
Патогенез
, том 15, № 1, с. 34-39
2016
DETERMINATION OF REGIONS INVOLVED IN AMYLOID FIBRIL FORMATION FOR Aβ(1-40) PEPTIDE
Surin A.K.
,
Grigorashvili E.I.
,
Suvorina M.Yu
,
Selivanova O.M.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 81, № 7, с. 762-769
DOI
2016
DETERMINATION OF SIZE OF FOLDING NUCLEI OF FIBRILS FORMED FROM RECOMBINANT Aβ(1-40) PEPTIDE
Grigorashvili
,
Selivanova O.M.
,
Dovidchenko N.V.
,
Dzhus U.F.
,
Mikhailina A.O.
,
Suvorina M.Yu
,
Marchenkov V.V.
,
Surin A.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 81, № 5, с. 538-547
DOI
2016
Dataset of the molecular dynamics simulations of bilayers consisting of short amyloidogenic peptide VDSWNVLVAG from Bgl2p–glucantransferase of S. cerevisiae cell wall
Glyakina Anna V.
, Balabaev Nikolai K.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Data in Brief
, издательство
Elsevier Inc.
(США)
, том 9, с. 597-601
DOI
2016
Insulin and Lispro Insulin: What is Common and Different in their Behavior?
Selivanova Olga
,
Suvorina Mariya
,
Surin Alexey
,
Dovidchenko Nikita
,
Galzitskaya Oxana
в журнале
Current Protein and Peptide Science
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 18, № 1, с. 57-64
DOI
2016
Non-random distribution of homo-repeats: links with biological functions and human diseases
Lobanov Michail Yu
, Klus Petr, Sokolovsky Igor V.,
Tartaglia Gian Gaetano
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Scientific reports
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 6, № 1
DOI
2016
One of the mechanisms of amyloid fibrils formation based on the sizes of folding nuclei of Aβ40 and Aβ42
Dovidchenko NV
,
Selivanova OM
,
Galzitskaya OV
в журнале
Atlas of Science.( http://atlasofscience.org)
, № June 19
2016
One of the possible mechanisms of amyloid fibrils formation based on the sizes of primary and secondary folding nuclei of A beta 40 and A beta 42
Dovidchenko Nikita V.
,
Glyakina Anna V.
,
Selivanova Olga M.
,
Grigorashvili Elizaveta I.
,
Suvorina Mariya Yu
,
Dzhus Ulyana F.
,
Mikhailina Alisa O.
,
Shiliaev Nikita G.
,
Marchenkov Victor V.
,
Surin Alexey K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Structural Biology
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 194, № 3, с. 404-414
DOI
2016
PEPTIDE Aβ(16-25) FORMS NANOFILMS IN THE PROCESS OF ITS AGGREGATION
Selivanova O.M.
,
Gorbunova E.Yu
,
Mustaeva L.G.
,
Grigorashvili E.I.
,
Suvorina M.Yu
,
Surin A.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 81, № 7, с. 755-761
DOI
2016
Possible mechanisms of amyloid growth
Galzitskaya O.V.
, Leonova E.I.,
Dovidchenko N.V.
в журнале
Atlas of Science.( http://atlasofscience.org)
, № March 25
2016
Reversible and Irreversible Aggregation of Proteins from the FET Family: Influence of Repeats in Protein Chain on Its Aggregation Capacity
Galzitskaya OV
в журнале
Current Protein and Peptide Science
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 17, № 4, с. 319-331
2016
Search for conserved amino acid residues of the $\upalpha$-crystallin proteins of vertebrates
Shiliaev Nikita G.
,
Selivanova Olga M.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 14, № 02, с. 1641004
DOI
2016
Smooth muscle titin forms in vitro amyloid aggregates
Bobylev Alexandr G.
,
Galzitskaya Oxana V.
,
Fadeev Roman S.
, Bobyleva Liya G.,
Yurshenas Darya A.
, Molochkov Nikolay V.,
Dovidchenko Nikita V.
,
Selivanova Olga M.
,
Penkov Nikita V.
,
Podlubnaya Zoya A.
,
Vikhlyantsev Ivan M.
в журнале
Bioscience Reports
, издательство
Springer Nature
(Switzerland)
, том 36, № 3
DOI
2016
Structural model of amyloid fibrils for amyloidogenic peptide from Bgl2p–glucantransferase of S. cerevisiae cell wall and its modifying analog. New morphology of amyloid fibrils
Selivanova OM
,
Glyakina AV
,
Gorbunova EY
,
Mustaeva LG
,
Suvorina MY
,
Grigorashvili EI
,
Nikulin AD
,
Dovidchenko NV
,
Rekstina VV
,
Kalebina TS
, Surin AK,
Galzitskaya OV
в журнале
Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 1864, № 11, с. 1489-1499
DOI
2016
Structural model of amyloid fibrils for amyloidogenic peptide from Bgl2p–glucantransferase of S. cerevisiae cell wall and its modifying analog. New morphology of amyloid fibrils
Selivanova Olga M.
,
Glyakina Anna V.
, Gorbunova Elena Yu, Mustaeva Leila G.,
Suvorina Mariya Yu
,
Grigorashvili Elizaveta I.
,
Nikulin Alexey D.
,
Dovidchenko Nikita V.
, Rekstina Valentina V.,
Kalebina Tatyana S.
,
Surin Alexey K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 1864, № 11, с. 1489-1499
DOI
2016
The Mechanism Underlying Amyloid Polymorphism is Opened for Alzheimer's Disease Amyloid-beta Peptide
Selivanova Olga M.
,
Surin Alexey K.
,
Marchenkov Victor V.
,
Dzhus Ulyana F.
,
Grigorashvili Elizaveta I.
,
Suvorina Mariya Yu
,
Glyakina Anna V.
,
Dovidchenko Nikita V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Alzheimer's Disease
, издательство
I O S press
(Netherlands)
, том 54, № 2, с. 821-830
DOI
2016
To be folded, to be unfolded or to be aggregated?
Galzitskaya Oxana
в журнале
F1000Research
DOI
2016
X-ray diffraction and electron microscopy data for amyloid formation of Abeta40 and Abeta42
Selivanova Olga M.
,
Grigorashvili Elizaveta I.
,
Suvorina Mariya Yu
,
Dzhus Ulyana F.
,
Nikulin Alexey D.
, Marchenkov Victor V.,
Surin Alexey K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Data in Brief
, издательство
Elsevier Inc.
(США)
, том 8, с. 108-113
DOI
2016
НЕОБЫЧНАЯ СТРУКТУРА АГРЕГАТОВ, ОБРАЗОВАННЫХ ФРАГМЕНТОМ Аβ16-25 ПЕПТИДА, И ПЕРСПЕКТИВЫ ЕГО ИСПОЛЬЗОВАНИЯ В БИОТЕХНОЛОГИИ
СЕЛИВАНОВА О.М.
, ГОРБУНОВА Е.Ю., МУСТАЕВА Л.Г.,
ГРИГОРАШВИЛИ Е.И.
,
СУВОРИНА М.Ю.
,
НИКУЛИН А.Д.
,
СУРИН А.К.
,
ГАЛЗИТСКАЯ О.В.
в журнале
Актуальные вопросы биологической физики и химии
, издательство
Севастопольский государственный университет
(Севастополь)
, том 1, № 1, с. 229-232
2016
НЕОБЫЧНАЯ СТРУКТУРА АГРЕГАТОВ, ОБРАЗОВАННЫХ ФРАГМЕНТОМ Аβ16-25 ПЕПТИДА, И ПЕРСПЕКТИВЫ ЕГО ИСПОЛЬЗОВАНИЯ В БИОТЕХНОЛОГИИ
СЕЛИВАНОВА О.М.
, ГОРБУНОВА Е.Ю., МУСТАЕВА Л.Г.,
ГРИГОРАШВИЛИ Е.И.
,
СУВОРИНА М.Ю.
,
НИКУЛИН А.Д.
,
СУРИН А.К.
,
ГАЛЗИТСКАЯ О.В.
в журнале
Актуальные вопросы биологической физики и химии
, издательство
Севастопольский государственный университет
(Севастополь)
, том 1, № 1, с. 229-232
2015
Determination of the size of folding nuclei of protofibrils from the concentration dependence of the rate and lag-time of their formation
Galzitskaya OV
,
Dovidchenko NV
,
Selivanova OM
,
Suvorina MY
,
Surin AK
,
Finkelstein AV
в журнале
Biomol Struct Dyn
, № 33, с. Suppl 1:112
DOI
2015
Determination of the size of the primary and secondary folding nuclei of Abeta40 and Abeta42 protofibrils from the concentration dependence of the rate and the lag-time of their formation
Galzitskaya O.V.
,
Dovidchenko N.V.
,
Glyakina A.V.
,
Selivanova O.M.
,
Grigorashvili E.I.
,
Suvorina M.Y.
,
Tin U.
,
Mikhaylina A.O.
,
Nikulin A.D.
,
Surin A.K.
в журнале
FEBS Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 282, с. 20
2015
FoldNucleus: web server for the prediction of RNA and protein folding nuclei from their 3D structures
Pereyaslavets LB, Sokolovsky IV,
Galzitskaya OV
в журнале
Bioinformatics
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 31, № 20, с. 3374-3376
DOI
2015
How Common Is Disorder?: Occurrence of Disordered Residues in Four Domains of Life
Lobanov Mikhail
,
Galzitskaya Oxana
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 16, № 8, с. 19490-19507
DOI
2015
Influence of homo-repeats on functions and aggregation propensities of protein chains
Galzitskaya Oxana V.
,
Lobanov Mikhail
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 33, № sup1, с. 111-112
DOI
2015
Investigation of polymorphism of A beta-peptide amyloids from different firms
Suvorina M.Y.
,
Selivanova O.M.
,
Grigorashvili E.I.
,
Nikulin A.D.
,
Surin A.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
FEBS Journal
, издательство
Blackwell Publishing Inc.
(United Kingdom)
, том 282, с. 180
2015
Is it possible reversible and irreversible aggregation of proteins?
Galzitskaya O.V.
в журнале
Atlas of Science.( http://atlasofscience.org)
, № December 23
2015
Mechanical stability analysis of the protein L immunoglobulin-binding domain by full alanine screening using molecular dynamics simulations
Glyakina Anna V.
,
Likhachev Ilya V.
, Balabaev Nikolay K.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Biotechnology journal
, издательство
Wiley - VCH Verlag GmbH & CO. KGaA
(Germany)
, том 10, № 3, с. 386-394
DOI
2015
Phyloproteomic Analysis of 11780 Six-Residue-Long Motifs Occurrences
Galzitskaya O.V.
,
Lobanov M.Yu
в журнале
BioMed Research International
, том 2015
DOI
2015
Possible mechanisms of amyloid formation: determination of the size of folding nuclei of protofibrils from the concentration dependence of the rate and lag-time of their formation
Galzitskaya O.V.
,
Dovidchenko N.V.
,
Selivanova O.M.
,
Suvorina M.Y.
,
Surin A.K.
,
Finkelstein A.V.
в журнале
Amino Acids
, издательство
Springer Verlag
(Germany)
, том 47, № 8, с. 1650-1650
2015
Repeats are one of the main characteristics of RNA-binding proteins with prion-like domains
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Molecular BioSystems
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 11, № 8, с. 2210-2218
DOI
2015
Studies of Polymorphism of Amyloid-β 42 Peptide from Different Suppliers
Suvorina Mariya Yu
,
Selivanova Olga M.
,
Grigorashvili Elizaveta I.
,
Nikulin Alexey D.
, Marchenkov Victor V.,
Surin Alexey K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Alzheimer's Disease
, издательство
I O S press
(Netherlands)
, том 47, № 3, с. 583-593
DOI
2015
The role of syndecan-2 in amyloid plaque formation
Leonova E.I.,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 49, № 1, с. 77-85
DOI
2015
Theoretical Search for RNA Folding Nuclei
Pereyaslavets Leonid,
Galzitskaya Oxana
в журнале
Entropy
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 17, № 12, с. 7827-7847
DOI
2015
What is necessary to be prion-like domain?
Galzitskaya O.V.
в журнале
Atlas of Science.( http://atlasofscience.org)
, № December 5
2015
Включение важнейших многочастичных взаимодействий в силовое поле АМБЕР и применение обновленного поля к молекулярно-динамическим расчетам
Балабаев Н.К.,
Гарбузинский С.А.
,
Галзитская О.В.
,
Глякина А.В.
, Маткаримов Б.Т.,
Финкельштейн А.В.
в журнале
Математическая биология и биоинформатика
, том 10, № 2, с. 427-435
DOI
2014
Activation of Neuronal Defense Mechanisms in Response to Pathogenic Factors Triggering Induction of Amyloidosis in Alzheimer\textquotesingles Disease
Maltsev Alexander V.,
Santockyte Rasa
, Bystryak Simon,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Alzheimer's Disease
, издательство
I O S press
(Netherlands)
, том 40, № 1, с. 19-32
DOI
2014
Cell communication using intrinsically disordered proteins: what can syndecans say?
Leonova Elena I.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 33, № 5, с. 1037-1050
DOI
2014
Folding of Right- and Left-Handed Three-Helix Proteins
Galzitskaya Oxana V.
, Pereyaslavets Leonid B.,
Glyakina Anna V.
в журнале
Israel Journal of Chemistry
, издательство
Laser Pages Publishing Ltd.
(Israel)
, том 54, № 8-9, с. 1126-1136
DOI
2014
HRaP: database of occurrence of HomoRepeats and patterns in proteomes
Lobanov Mikhail Yu
,
Sokolovskiy Igor V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 42, № D1, с. D273-D278
DOI
2014
How to determine the size of folding nuclei of protofibrils from the concentration dependence of the rate and lag-time of aggregation. II. Experimental application for insulin and LysPro insulin: aggregation morphology, kinetics, and sizes of nuclei
Selivanova OM
,
Suvorina MY
,
Dovidchenko NV
,
Eliseeva IA
, Surin AK,
Finkelstein AV
,
Schmatchenko VV
,
Galzitskaya OV
в журнале
Journal of Physical Chemistry B
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 118, № 5, с. 1198-1206
DOI
2014
How to determine the size of folding nuclei of protofibrils from the concentration dependence of the rate and lag-time of aggregation. I. Modeling the amyloid protofibril formation
Dovidchenko NV
,
Finkelstein AV
,
Galzitskaya OV
в журнале
Journal of Physical Chemistry B
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 118, № 5, с. 1189-1197
DOI
2014
Mechanisms of amyloid fibril formation
Dovidchenko N.V.
, Leonova E.I.,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 79, № 13, с. 1515-1527
DOI
2014
Right- and left-handed three-helix proteins: II. similarity and differences in mechanical unfolding of proteins
Glyakina A.V.
,
Likhachev I.V.
,
Balabaev N.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics
, издательство
Wiley-Liss Inc
(United States)
, том 82, № 1, с. 90-102
DOI
2014
What handedness and angles between helices has the studied three-helical protein domain?
Pereyaslavets L.B.,
Glyakina A.V.
,
Dovidchenko N.V.
,
Sokolovskiy I.V.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Bioinformatics
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 31, № 6, с. 963-965
DOI
2013
A novel web server predicts amino acid residue protection against hydrogen–deuterium exchange
Lobanov Mikhail Yu
,
Suvorina Masha Yu
,
Dovidchenko Nikita V.
,
Sokolovskiy Igor V.
,
Surin Alexey K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Bioinformatics
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 29, № 11, с. 1375-1381
DOI
2013
Amyloidogenic peptides of yeast cell wall glucantransferase Bgl2p as a model for the investigation of its pH-dependent fibril formation
Bezsonov EE
,
Groenning M.
,
Galzitskaya OV
,
Gorkovskii AA
,
Semisotnov GV
,
Selyakh IO
,
Ziganshin RH
,
Rekstina VV
,
Kudryashova IB
,
Kuznetsov SA
,
Kulaev IS
,
Kalebina TS
в журнале
Prion
, издательство
Landes Bioscience
(United States)
, том 7, № 2, с. 175-184
DOI
2013
An N-terminal, 830 residues intrinsically disordered region of the cytoskeleton-regulatory protein supervillin contains Myosin II- and F-actin-binding sites
Fedechkin Stanislav O.
,
Brockerman Jacob
, Luna Elizabeth J.,
Lobanov Michail Yu
,
Galzitskaya Oxana V.
, Smirnov Serge L.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 31, № 10, с. 1150-1159
DOI
2013
Comparative characteristics of the structure and function for syndecan-1 from animal organisms
Leonova E.I.,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Молекулярная биология
, том 47, № 3, с. 505-512
2013
Experimental and Theoretical Studies of Mechanical Unfolding of Different Proteins
Glyakina A.V.
,
Balabaev N.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 78, № 11, с. 1216-1227
2013
Haloarcula marismortui archaellin genes as ecoparalogs
Syutkin Alexey S.
,
Pyatibratov Mikhail G.
,
Galzitskaya Oxana V.
, Rodríguez-Valera Francisco, Fedorov Oleg V.
в журнале
Extremophiles
, издательство
Springer Verlag
(Germany)
, том 18, № 2, с. 341-349
DOI
2013
Intensive Protein Synthesis in Neurons and Phosphorylation of Beta Amyloid Precursor Protein and Tau Protein are Triggering Factors of Neuronal Amyloidosis and Alzheimer’s Disease
Maltsev A.V.,
Dovidchenko N.V.
, Uteshev V.K.,
Sokolik V.V.
,
Shtang O.M.
, Yakushin M.A., Sokolova N.M.,
Surin A.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry, Supplemental Series B
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 7, № 4, с. 278-293
2013
Intensive Protein Synthesis in Neurons and Phosphorylation of Beta Amyloid Precursor Protein and Tau Protein are Triggering Factorsof Neuronal Amyloidosis and Alzheimer’s Disease
Mal'tsev AV,
Davidchenko NV
, Uteshev VK,
Sokolik VV
, Shtang OM,
Iakushun MA
, Sokolova NM,
Suprin AK
,
Galzitskaia OV
в журнале
Biomeditsinskaia khimiia
, издательство
Rossiiskaya Akademiya Meditsinskikh Nauk
(Russian Federation)
, том 59, № 2, с. 144-170
2013
IsUnstruct: prediction of the residue status to be ordered or disordered in the protein chain by a method based on the Ising model
Lobanov Michail Yu
,
Sokolovskiy Igor V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 31, № 10, с. 1034-1043
DOI
2013
Right- and left-handed three-helix proteins. I. Experimental and simulation analysis of differences in folding and structure
Glyakina Anna V.
, Pereyaslavets Leonid B.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Proteins
, том 81, № 9, с. 1527-1541
DOI
2013
Stability and rigidity/flexibility—Two sides of the same coin?
Mamonova Tatyana B.,
Glyakina Anna V.
,
Galzitskaya Oxana V.
, Kurnikova Maria G.
в журнале
Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 1834, № 5, с. 854-866
DOI
2013
Structure and functions of syndecans in vertebrates
Leonova E.I.,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 78, № 10, с. 1071-1085
DOI
2013
Исследование механических свойств C-кадгерина методом молекулярной динамики
Лихачев И.В.
,
Галзитская О.В.
,
Балабаев Н.К.
в журнале
Компьютерные исследования и моделирование
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, том 5, № 4, с. 727-735
2012
Comparison of experimental and theoretical data on hydrogen-deuterium exchange for ten globular proteins
Suvorina M.Yu
,
Surin A.K.
,
Dovidchenko N.V.
,
Lobanov M.Yu
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 77, № 6, с. 616-623
DOI
2012
Formation of RNA spatial structures
Leonova E.I., Baranov M.V.,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 46, № 1, с. 34-46
DOI
2012
Nucleation-based prediction of the protein folding rate and its correlation with the folding nucleus size
Galzitskaya Oxana V.
,
Glyakina Anna V.
в журнале
Proteins
, том 80, № 12, с. 2711-2727
DOI
2012
Occurrence of disordered patterns and homorepeats in eukaryotic and bacterial proteomes
Lobanov M.Yu
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Molecular BioSystems
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 8, № 1, с. 327-337
DOI
2012
Occurrence of six-amino-acid motifs in three eukaryotic proteomes
Lobanov M.Yu
,
Bogatyreva N.S.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 46, № 1, с. 168-173
DOI
2012
Structural polymorphism and possible pathways of amyloid fibril formation on the example of insulin protein
Selivanova O.M.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 77, № 11, с. 1237-1247
DOI
2011
Accessible Surfaces of Beta Proteins Increase with Increasing Protein Molecular Mass More Rapidly than Those of Other Proteins
Glyakina Anna V.
,
Bogatyreva Natalya S.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 6, № 12, с. e28464
DOI
2011
Bacterial proteins fold faster than eukaryotic proteins with simple folding kinetics
Galzitskaya O.V.
,
Bogatyreva N.S.
,
Glyakina A.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 76, № 2, с. 225-235
DOI
2011
Cunning simplicity of a stoichiometry driven protein folding thesis
Galzitskaya OV
, Lobanov MY,
Finkelstein AV
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 28, № 4, с. 595-598
2011
Cunning simplicity of a stoichiometry driven protein folding thesis
Galzitskaya O.V.
,
Lobanov M.Yu
,
Finkelstein A.V.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 28, № 4, с. 595-598
2011
Disordered Patterns in Clustered Protein Data Bank and in Eukaryotic and Bacterial Proteomes
Lobanov Michail Yu
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 6, № 11, с. e27142
DOI
2011
Modeling of amyloid fibril formation
Dovidchenko N.V.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 76, № 3, с. 366-373
2011
Prediction of folding nuclei for tRNA molecules
Pereyaslavets L.B., Baranov M.V., Leonova E.I.,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 76, № 2, с. 236-244
2011
Regions which are Responsible for Swapping are also Responsible for Folding and Misfolding
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
The open biochemistry journal
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 5, с. 27-36
DOI
2011
Role of amyloid beta-peptide in neurodegenerative diseases
Maltsev A.V., S Bystryak,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Ageing Research Reviews
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 10, № 4, с. 440-452
2011
The Ising model for prediction of disordered residues from protein sequence alone
Lobanov Michail Yu
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Physical Biology
, издательство
IOP Publishing
([Bristol, UK], England)
, том 8, № 3, с. 035004
DOI
2010
A comparative analysis of folding pathways of thermophilic and mesophilic proteins by Monte Carlo simulations
Glyakina A.V.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 8, № 3, с. 395-411
2010
Estimation of protein folding rate from Monte Carlo simulations and entropy capacity. , 11 (7), 523-537, (2010)
Galzitskaya O.V.
в журнале
Current Protein and Peptide Science
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 11, № 7, с. 523-537
2010
Flexibility and mobility in Mesophilic and thermophilic homologous proteins from Molecular Dynamics and FoldUnfold Method
Mamonova T.B.,
Glyakina A.V.
, Kurnikova M.G.,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 8, № 3, с. 377-394
2010
Formation and participation of nano-amyloids in pathogenesis of alzheimer’s disease and other amyloidogenic diseases
Maltsev A.V.,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry, Supplemental Series B
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 56, № 6, с. 624-638
2010
Influence of Conformational Entropy on the Protein Folding Rate
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Entropy
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 12, № 4, с. 961-982
DOI
2010
Influence of organization of native protein structure on its folding: Modeling of the folding of $\upalpha$-helical proteins
Glyakina A.V.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 75, № 8, с. 995-1005
DOI
2010
Library of Disordered Patterns in 3D Protein Structures
Lobanov Michail Yu
,
Furletova Eugeniya I.
,
Bogatyreva Natalya S.
, Roytberg Michail A.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
PLoS Computational Biology
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 6, № 10, с. e1000958
DOI
2010
Statistical analysis and prediction of disordered residues in protein structures
Lobanov M.Yu
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Mathematical Biology and Bioinformatics
, том 5, № 2, с. 124-137
2010
Statistical analysis of unstructured amino acid residues in protein structures
Lobanov M.Yu
,
Garbuzynskiy S.O.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 75, № 2, с. 192-200
DOI
2010
Two-, Three-, and Four-State Events Occur in the Mechanical Unfolding of Small Protein L Using Molecular Dynamics Simulations
Glyakina A.V.
,
Balabaev N.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Protein and Peptide Letters
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 17, с. 92-103
2010
ЗАВИСИТ ЛИ СКОРОСТЬ СВОРАЧИВАНИЯ БЕЛКОВЫХ МОЛЕКУЛ ОТ ЧИСЛА СТАДИЙ СВОРАЧИВАНИЯ? МОДЕЛИРОВАНИЕ СВОРАЧИВАНИЯ БЕЛКОВ С ФЕРРЕДОКСИНОВОЙ УКЛАДКОЙ БЕЛКОВОЙ ЦЕПИ
Галзитская О.В.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 75, № 6, с. 807-818
2010
Исследование механических свойств иммуноглобулинсвязывающих доменов белков L и G методом молекулярной динамики
Глякина А.В.
,
Галзитская О.В.
,
Балабаев Н.К.
в журнале
Компьютерные исследования и моделирование
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, том 2, № 1, с. 73-81
2009
ComSin: database of protein structures in bound (complex) and unbound (single) states in relation to their intrinsic disorder
Lobanov Michail Yu
,
Shoemaker Benjamin A.
,
Garbuzynskiy Sergiy O.
,
Fong Jessica H.
, Panchenko Anna R.,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 38, № suppl_1, с. D283-D287
DOI
2009
Comparison of transition states obtained upon modeling of unfolding of immunoglobulin-binding domains of proteins L and G caused by external action with transition states obtained in the absence of force probed by experiments
Glyakina A.V.
,
Balabaev N.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 74, № 3, с. 316-328
2009
Coupling between Properties of the Protein Shape and the Rate of Protein Folding
Ivankov Dmitry N.
,
Bogatyreva Natalya S.
,
Lobanov Michail Yu
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 4, № 8, с. e6476
DOI
2009
FoldAmyloid: a method of prediction of amyloidogenic regions from protein sequence
Garbuzynskiy S.O.
,
Lobanov M.Yu
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Bioinformatics
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 26, № 3, с. 326-332
DOI
2009
Influence of flexible loops on the rate of protein folding
Galzitskaya O.V.
в журнале
Current Topics in Peptide and Protein Research
, издательство
Research Trends
(India)
, том 9, с. 71-82
2009
Intrinsic disorder in proteins and their complexes: a large-scale view
Fong J.
,
Shoemaker B.
,
Garbuzynskiy S.O.
,
Lobanov M.Yu
,
Galzitskaya O.V.
, Panchenko A.
в журнале
PLoS Computational Biology
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 5, № 3
2009
Mechanical unfolding of proteins L and G with constant force: Similarities and differences
Glyakina A.V.
,
Balabaev N.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Journal of Chemical Physics
, издательство
AIP Publishing
(United States)
, том 131, № 045102, с. 1-10
2009
Multiple Unfolding Intermediates Obtained by Molecular Dynamic Simulations under Stretching for Immunoglobulin-Binding Domain of Protein G
Glyakina A.V.
,
Balabaev N.K.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
The open biochemistry journal
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 3, с. 66-77
2009
Prediction of amino acid residues protected from hydrogen-deuterium exchange in a protein chain
Dovidchenko N.V.
,
Lobanov M.Yu
,
Garbuzynskiy S.O.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 74, № 8, с. 888-897
DOI
2009
Одни и те же или разные аминокислотные остатки ответственны за правильное и неправильное сворачивание белков?
Галзитская О.В.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 74, № 2, с. 229-337
2009
Сравнение переходных состояний для иммуноглобулинсвязывающих доменов белков L и G, полученных при моделировании разворачивания под действием внешних сил и в экспериментах под действием денатуранта
Глякина А.В.
,
Балабаев Н.К.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Биохимия
, издательство
ИКЦ «Академкнига»
(Москва)
, том 74, № 3, с. 316-328
2008
AMYLOID-LIKE PROPERTIES OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE CELL WALL GLUCANTRANSFERASE BGL2P: PREDICTION AND EXPERIMENTAL EVIDENCES
Kalebina T.S.
,
Plotnikova T.A.
, Gorkovskii A.A.,
Selyakh I.O.
,
Galzitskaya O.V.
,
Bezsonov E.E.
,
Gellissen G.
,
Kulaev I.S.
в журнале
Prion
, издательство
Landes Bioscience
(United States)
, том 2, № 2, с. 91-96
2008
Compactness determines protein folding type
Galzitskaya O.V.
,
Bogatyreva N.S.
,
Ivankov D.N.
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 6, № 4, с. 667-680
DOI
2008
Phylogenetic Analysis of the Loops in Elongation Factors EF1A: Stronger Support for the Grouping of Animal and Fung
Galzitskaya O.V.
,
Deryusheva E.I.
,
Serdyuk I.N.
в журнале
Journal of Computer Science and System Biology
, издательство
Hilaris
(Brussels, Belgium)
, том 1, № 1, с. 73-80
DOI
2008
Prediction of loop regions in protein sequence
Dovidchenko Nikita V.
,
Bogatyreva Natalya S.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 6, № 05, с. 1035-1047
DOI
2008
Prediction of loop regions in protein sequence
Dovidchenko Nikita V.
,
Bogatyreva Natalya S.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 6, № 05, с. 1035-1047
DOI
2008
Prediction of status residue to be protected or not protected from hydrogen exchange using amino acid sequence only
Dovidchenko N.V.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
The open biochemistry journal
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 2, с. 77-80
2008
Search for folding initiation sites from amino acid sequence
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 6, № 04, с. 681-691
DOI
2008
To be folded or to be unfolded?
Garbuzynskiy Sergiy O.
,
Lobanov Michail Yu
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Protein Science
, издательство
Cold Spring Harbor Laboratory Press
(United States)
, том 13, № 11, с. 2871-2877
DOI
2008
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИНАМИКА РАЗВОРАЧИВАНИЯ БЕЛКОВЫХ ГЛОБУЛ ПОД ДЕЙСТВИЕМ ВНЕШНИХ СИЛ
Глякина А.В.
,
Галзитская О.В.
,
Балабаев Н.К.
в журнале
Вестник Тверского государственного университета. Серия: Химия
, № 6, с. 100-119
2008
Предсказание коротких петель в белках с внутренней неупорядоченностью
Дерюшева Е.И.
,
Галзитская О.В.
,
Сердюк И.Н.
в журнале
Молекулярная биология
, том 42, № 6, с. 1067-1078
2008
Радиус инерции - индикатор компактности белковых структур
Лобанов М.Ю.
,
Богатырева Н.С.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 42, № 4, с. 701-706
2008
Связь формы белка со скоростью его сворачивания и разворачивания
Богатырева Н.С.
,
Иванков Д.Н.
,
Лобанов М.Ю.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Математическая биология и биоинформатика
, том 3, № 2, с. 69-78
2007
Backbone Carbonyl Group Basicities Are Related to Gas-Phase Fragmentation of Peptides and Protein Folding
Savitski Mikhail\hspace0 25emM
,
Kjeldsen Frank
,
Nielsen Michael\hspace0 25emL
,
Garbuzynskiy Sergiy\hspace0 25emO
,
Galzitskaya Oxana\hspace0 25emV
,
Surin Alexey\hspace0 25emK
,
Zubarev Roman\hspace0 25emA
в журнале
Angewandte Chemie - International Edition
, издательство
John Wiley & Sons Ltd.
(United Kingdom)
, том 46, № 9, с. 1481-1484
DOI
2007
Different packing of external residues can explain differences in the thermostability of proteins from thermophilic and mesophilic organisms
Glyakina Anna V.
,
Garbuzynskiy Sergiy O.
,
Lobanov Michail Yu
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Bioinformatics
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 23, № 17, с. 2231-2238
DOI
2007
Expected packing density allows predicting both amyloidogenic and disordered regions in protein chain
Galzitskaya O.V.
,
Garbuzynskiy S.O.
,
Lobanov M.Yu
в журнале
Journal of Physics Condensed Matter
, издательство
IOP Publishing
([Bristol, UK], England)
, том 19, № 28
2007
More compact protein globules exhibit slower folding rates
Galzitskaya Oxana V.
,
Reifsnyder Danielle C.
,
Bogatyreva Natalya S.
,
Ivankov Dmitry N.
,
Garbuzynskiy Sergiy O.
в журнале
Proteins
, том 70, № 2, с. 329-332
DOI
2007
Prediction of Number and Position of Domain Boundaries in Multi-Domain Proteins by Use of Amino Acid Sequence Alone
Dovidchenko Nikita
,
Lobanov Michail Yu
,
Galzitskaya Oxana
в журнале
Current Protein and Peptide Science
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 8, № 2, с. 189-195
DOI
2007
Understanding the Folding Rates and Folding Nuclei of Globular Proteins
Finkelstein Alexei
,
Ivankov Dmitry
,
Garbuzynskiy Sergiy
,
Galzitskaya Oxana
в журнале
Current Protein and Peptide Science
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 8, № 6, с. 521-536
DOI
2007
Неструктурированные области в элонгационных факторах EF1A трех надцарств живого мира
Сердюк И.Н.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 41, № 6, с. 1042-1055
2007
Поиск структурных факторов, ответственных за стабильность белков из термофильных организмов
Глякина А.В.
,
Лобанов М.Ю.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 41, № 4, с. 681-687
2006
Entropy capacity determines protein folding
Galzitskaya Oxana V.
,
Garbuzynskiy Sergiy O.
в журнале
Proteins
, том 63, № 1, с. 144-154
DOI
2006
FoldUnfold: web server for the prediction of disordered regions in protein chain
Galzitskaya O.V.
,
Garbuzynskiy S.O.
,
Lobanov M.Yu
в журнале
Bioinformatics
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 22, № 23, с. 2948-2949
DOI
2006
Is it possible to predict amyloidogenic regions from sequence alone?
Galzitskaya O.V.
,
Garbuzynskiy S.O.
,
Lobanov M.Yu
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 4, № 2, с. 373-378
2006
Prediction of Amyloidogenic and Disordered Regions in Protein Chains
Galzitskaya Oxana V.
,
Garbuzynskiy Sergiy O.
,
Lobanov Michail Yurievich
в журнале
PLoS Computational Biology
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 2, № 12, с. e177
DOI
2006
Trend of amino acid composition of proteins of different taxa
Bogatyreva Natalya S.
,
Finkelstein Alexei V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
, издательство
Imperial College Press
(United Kingdom)
, том 4, № 2, с. 597-608
DOI
2006
Идентификация бета-агрегационных сайтов в белковой цепи
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 40, № 6, с. 931-936
2006
Оптимальное соотношение между средней конформационной энтропией и средней энергией взаимодействия между остатками для быстрого сворачивания белков
Галзитская О.В.
,
Гарбузинский С.А.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 51, № 4, с. 622-632
2006
Поиск амилоидогенных участков белковой цепи
Галзитская О.В.
,
Гарбузинский С.А.
,
Лобанов М.Ю.
в журнале
Молекулярная биология
, том 40, № 5, с. 910-918
2006
Предсказание границ доменов на основе статистики встречаемости аминокислотных остатков
Галзитская О.В.
,
Довидченко Н.В.
,
Лобанов М.Ю.
,
Гарбузинский С.А.
в журнале
Молекулярная биология
, том 40, № 1, с. 111-121
2006
Предсказание нативно-развернутых участков белковой цепи
Галзитская О.В.
,
Гарбузинский С.А.
,
Лобанов М.Ю.
в журнале
Молекулярная биология
, том 40, № 2, с. 341-348
2005
Comparison of X-ray and NMR structures: Is there a systematic difference in residue contacts between X-ray- and NMR-resolved protein structures?
Garbuzynskiy Sergiy O.
,
Melnik Bogdan S.
, Lobanov Michail Yu,
Finkelstein Alexei V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics
, издательство
Wiley-Liss Inc
(United States)
, том 60, № 1, с. 139-147
DOI
2005
On prediction of folding nuclei in globular proteins
Garbuzynskiy S.A.
,
Finkelstein A.V.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 39, № 6, с. 1032-1041
2005
Theoretical study of protein folding: outlining folding nuclei and estimation of protein folding rates
Galzitskaya O.V.
,
Garbuzynskiy S.O.
,
Finkelstein A.V.
в журнале
Journal of Physics Condensed Matter
, издательство
IOP Publishing
([Bristol, UK], England)
, том 17, № 18, с. S1539-S1551
DOI
2005
К вопросу о предсказании ядер сворачивания в глобулярных белках
Гарбузинский С.А.
,
Финкельштейн А.В.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 39, № 6, с. 1032-1041
2005
Предсказание скоростей и ядер сворачивания глобулярных белков на основе теории их самоорганизации
Финкельштейн А.В.
,
Иванков Д.Н.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Успехи биологической химии
, том 45, с. 3-36
2005
Различия между белковыми структурами, определяемыми с помощью рентгеноструктурного анализа и ядерного магнитного резонанса
Мельник Б.С.
,
Гарбузинский С.А.
,
Лобанов М.Ю.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 39, № 1, с. 129-138
2004
General dynamic properties of A beta(12-36) amyloid peptide involved in Alzheimer's disease from unfolding simulation
Suzuki S.,
Galzitskaya O.V.
,
Mitomo D.
,
Higo J.
в журнале
Journal of Biochemistry
, издательство
Nihon Seikagakkai/Japanese Biochemical Society
(Japan)
, том 136, № 5, с. 583-594
DOI
2004
Outlining Folding Nuclei in Globular Proteins
Garbuzynskiy Sergiy O.
,
Finkelstein Alexei V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Journal of Molecular Biology
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 336, № 2, с. 509-525
DOI
2004
Physics of protein folding
Finkelstein A.V.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Physics of Life Reviews
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 1, № 1, с. 23-56
DOI
2004
Взаимодействие шаперона GroEL с ранними кинетическими промежуточными состояниями ренатурирующих белков ингибирует формирование их нативной структуры
Соколовский И В Марченков В.В, Котова Н.В.,
Галзитская О.В.
, Бочкарева Е.С.,
Гиршович А.С.
,
Семисотнов Г.В.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 49, № 6, с. 987-994
2003
Chain length is the main determinant of the folding rate for proteins with three-state folding kinetics
Galzitskaya Oxana V.
,
Garbuzynskiy Sergiy O.
,
Ivankov Dmitry N.
,
Finkelstein Alexei V.
в журнале
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics
, издательство
Wiley-Liss Inc
(United States)
, том 51, № 2, с. 162-166
DOI
2003
Prediction of protein domain boundaries from sequence alone
Galzitskaya O.V.
,
Melnik B.S.
в журнале
Protein Science
, издательство
Cold Spring Harbor Laboratory Press
(United States)
, том 12, № 4, с. 696-701
DOI
2003
beta-hairpins, alpha-helices, and the intermediates among the secondary structures in the energy landscape of a peptide from a distal beta-Hairpin of SH3 domain
Ikeda Kazuyoshi
,
Galzitskaya Oxana V.
,
Nakamura Haruki
,
Higo Junichi
в журнале
Journal of Computational Chemistry
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 24, № 3, с. 310-318
DOI
2002
α-helix and β-hairpin folding from experiment, analytical theory and molecular dynamics simulations
Galzitskaya Oxana
,
Higo Junichi
,
Finkelstein Alexei
в журнале
Current Protein and Peptide Science
, издательство
Bentham Science Publishers
(Netherlands)
, том 3, № 2, с. 191-200
DOI
2002
Сворачивание бета-шпилек
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 36, № 5, с. 755-760
2002
Чувствительность пути сворачивания к деталям аминокислотной последовательности
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 36, № 3, с. 386-390
2001
Energy landscape of a beta-hairpin peptide in explicit water studied by multicanonical molecular dynamics
Higo Jucichi
,
Galzitskaya Oxana V.
,
Ono Satoshi
,
Nakamura Haruki
в журнале
Chemical Physics Letters
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 337, № 1-3, с. 169-175
DOI
2001
Folding nuclei in proteins
Galzitskaya Oxana V.
,
Ivankov Dmitry N.
,
Finkelstein Alexei V.
в журнале
FEBS Letters
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 489, № 2-3, с. 113-118
DOI
2001
Nucleation and folding rates in proteins
Galzitskaya O.V.
,
Ivankov D.N.
,
Finkelstein A.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 35, № 4, с. 605-613
DOI
2001
Нуклеация и скорость сворачивания в белках
Галзитская О.В.
,
Иванков Д.Н.
,
Финкельштейн А.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 35, № 4, с. 708-717
2000
Optimal region of average side-chain entropy for fast protein folding
Galzitskaya O.V.
,
Surin A.K.
, Nakamura H.
в журнале
Protein Science
, издательство
Cold Spring Harbor Laboratory Press
(United States)
, том 9, № 3, с. 580-586
2000
beta-hairpin folds by molecular dynamics simulations
Galzitskaya Oxana V.
,
Higo Junichi
,
Kuroda Masataka
,
Nakamura Haruki
в журнале
Chemical Physics Letters
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 326, № 5-6, с. 421-429
DOI
1999
A theoretical search for folding/unfolding nuclei in three-dimensional protein structures
Galzitskaya O.V.
,
Finkelstein A.V.
в журнале
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
, издательство
National Academy of Sciences
(United States)
, том 96, № 20, с. 11299-11304
DOI
1999
Search for folding nuclei in the 3D protein structures
Skoogarev A.V.
,
Galzitskaya O.V.
,
Finkelstein A.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 33, № 6, с. 897-907
1999
Solution conformation of phakellistatin 8 investigated by molecular dynamics simulations
Galzitskaya Oxana
,
Caflisch Amedeo
в журнале
Journal of Molecular Graphics and Modelling
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 17, № 1, с. 19-27
DOI
1999
Влияние избыточного фосфорилирования на структурные свойства белка тау
Уверский В.Н.
,
Галзитская О.В.
, Винтер С., Киттлер Л.,
Лёбер Г.
в журнале
Цитология
, издательство
Наука
(СПб.)
, том 41, № 6, с. 540-549
1999
Поиск ядер сворачивания в пространственных структурах белков
Скугарев А.В.,
Галзитская О.В.
,
Финкельштейн А.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 33, № 6, с. 1016-1026
1998
Folding rate dependence on the chain length for RNA-like heteropolymers
Galzitskaya Oxana V.
,
Finkelstein Alexei V.
в журнале
Folding & design
, издательство
Current Biology
(London, England)
, том 3, № 2, с. 69-78
DOI
1998
Hyperphosphorylation induces structural modification of tau-protein
Uversky Vladimir N.
, Winter Stefan,
Galzitskaya Oxana V.
, Kittler Leonhard, Lober Gunter
в журнале
FEBS Letters
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 439, № 1-2, с. 21-25
DOI
1998
Roughness of the globular protein surface
Timchenko A.A.
,
Galzitskaya O.V.
,
Serdyuk I.N.
в журнале
JINR Rapid Communications
, том 4, № 90, с. 59-63
1997
Geometrical factor and physical reasons for its influence on the kinetic and thermodynamic properties of RNA-like heteropolymers
Galzitskaya Oxana V.
в журнале
Folding & design
, издательство
Current Biology
(London, England)
, том 2, № 3, с. 193-201
DOI
1997
Roughness of the globular protein surface: analysis of high resolution X-ray data
Timchenko A.A.
,
Galzitskaya O.V.
,
Serdyuk I.N.
в журнале
Proteins
, том 28, № 2, с. 194-201
1997
Theoretical study of the dependence of the folding rate on chain length for RNA-like heteropolymers
Galzitskaya O.V.
,
Finkelstein A.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 31, № 3, с. 399-408
1997
Влияние энергии дальних контактов на время поиска нативной структуры для РНК-подобных гетерополимеров
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 31, № 3, с. 488-491
1997
О природе шероховатости поверхности белковых глобул
Сердюк И.Н.
,
Галзитская О.В.
,
Тимченко А.А.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 42, № 6, с. 1197-1207
1997
Теоретическое исследование зависимости скорости сворачивания РНК-подобных гетерополимеров от длины цепи
Галзитская О.В.
,
Финкельштейн А.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 31, № 3, с. 478-487
1996
Computer simulation of secondary structure folding of random and ‘‘edited’’ RNA chains
Galzitskaya Oxana V.
,
Finkelstein Alexei V.
в журнале
Journal of Chemical Physics
, издательство
AIP Publishing
(United States)
, том 105, № 1, с. 319-325
DOI
1996
Folding rate and native structure stability in "random" and "edited" chains
Finkelstein A.V.
,
Galzitskaya O.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 30, № 1, с. 91-96
1996
Скорость сворачивания и стабильность нативной структуры в “случайных” и “отредактированных” цепях
Финкельштейн А.В.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 30, № 1, с. 145-155
1995
Folding of chains with random and edited sequences: similarities and differences
Galzitskaya Oxana V.
,
Finkelstein Alexei V.
в журнале
Protein Engineering, Design and Selection
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 8, № 9, с. 883-892
DOI
1995
Самоорганизация белковой цепи ускоряется с повышением стабильности ее нативной структуры. Численный эксперимент
Галзитская О.В.
,
Финкельштейн А.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 29, № 2, с. 317-325
1994
Protein chain can achieve the energy minimum without exhaustive sorting of all its conformations: computer modelling and phenomenological theory
Galzitskaya O.V.
,
Reva B.A.
,
Finkelstein A.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 28, с. 877-884
1994
Self-organisation of protein chain accelerates upon stabilisation of its native conformation. Numerical experiment
Galzitskaya O.V.
,
Finkelstein A.V.
в журнале
Molecular Biology
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 29, с. 181-186
1994
Достижение белковой цепью энергетического минимума не требует полного перебора конформаций: компьютерный эксперимент и феноменологическая теория
Галзитская О.В.
,
Рева Б.А.
,
Финкельштейн А.В.
в журнале
Молекулярная биология
, том 28, № 6, с. 1412-1427
1993
Переход спираль-клубок в простейшей модели больших природных РНК. II. Учет неспецифических взаимодействий
Гутин А.М.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 38, № 1, с. 93-98
1993
Переход спираль-клубок в простейшей модели больших природных РНК: I. Учет только нативных спиралей
Гутин А.М.
,
Галзитская О.В.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 38, № 1, с. 84-92
Статьи в сборниках
2021
Determination of the Most Stable Packing of Peptides From Ribosomal S1 Protein, Protein Bgl2p and Abeta peptide in beta-layers during Molecular Dynamics Simulations
Glyakina A.V.
,
Balabaev N.K.
,
Galzitskaya O.V.
в сборнике
Computer Simulations of Aggregation of Proteins and Peptides
, серия
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
, место издания
Springer
, том 2340, с. 221-233
DOI
2020
Elastic and Non-elastic Properties of Cadherin Ectodomain: Comparison with Mechanical System
Likhachev I.V.
,
Balabaev N.K.
,
Galzitskaya O.V.
в сборнике
International Conference on Computer Science, Engineering and Education Applications ICCSEEA 2019: Advances in Computer Science for Engineering and Education II
, серия
Advances in Intelligent Systems and Computing
, с. 555-566
2020
Investigation of Fibrillation by Amyloidogenic Regions of the Ribosomal S1 Proteins
Deryusheva E.I.
,
Machulin A.V.
,
Selivanova O.M.
,
Grishin S.Yu
,
Glyakina A.V.
,
Surin A.K.
,
Galzitskaya O.V.
в сборнике
Proceedings of the International Conference "Mathematical Biology and Bioinformatics"
, место издания
IMPB RAS - Branch of KIAM RAS Pushchino
, том 8, с. e13
DOI
2018
Two Views on the Protein Folding Puzzle
Finkelstein Alexei V.
,
Galzitskaya Oxana V.
,
Garbuzynskiy Sergiy O.
,
Badretdin Azat J.
,
Ivankov Dmitry N.
,
Bogatyreva Natalya S.
в сборнике
Trends in Biomathematics: Modeling, Optimization and Computational Problems
, место издания
Springer, Cham
, с. 391-412
DOI
2017
Туда и обратно: Два аспекта проблемы сворачивания белка
Финкельштейн А.В.
,
Бадретдинов А.Я.
,
Галзитская О.В.
,
Иванков Д.Н.
,
Богатырева Н.С.
,
Гарбузинский С.А.
в сборнике
Физико-химические механизмы и регуляция процессов трансформации энергии в биологических структурах
, серия
Междисциплинарные вопросы биологии, математики, физики, химии и медицины
, место издания
АНО "Ижевский Институт Компьютерных Исследований" Москва-Ижевск
, с. 74-101
2016
Influence of Repeats in the Protein Chain on its Aggregation Capacity for ALS-Associated Proteins
Galzitskaya Oxana V.
в сборнике
Update on Amyotrophic Lateral Sclerosis
, место издания
InTech
, с. 101-120
DOI
2016
Kinetics of amyloid formation by different proteins and peptides: polymorphism and sizes of folding nuclei of fibrils
Galzitskaya Oxana V.
,
Dovidchenko Nikita V.
,
Selivanova Olga M.
в сборнике
Exploring New Findings on Amyloidosis
, с. 143-163
2015
Computational Approaches to Identification of Aggregation Sites and the Mechanism of Amyloid Growth
Dovidchenko Nikita V.
,
Galzitskaya Oxana V.
в сборнике
Advances in Medicine and Biology
, место издания
Nova Science Publishers New York
, том 87, с. 213-239
DOI
2015
Determination of the Size of the Primary and Secondary Folding Nuclei of Protofibrils from the Concentration Dependence of the Rate and the Lag-Time of Their Formation
Finkelstein Alexey V.
,
Dovidchenko Nikita V.
,
Selivanova Olga M.
,
Suvorina Maria Yu
,
Surin Alexey K.
,
Galzitskaya Oxana V.
в сборнике
Physical Biology of Proteins and Peptides
, место издания
Springer International Publishing Cham
, с. 47-66
DOI
2015
Role of Syndecans in Lipid Metabolism and Human Diseases
Leonova Elena I.,
Galzitskaya Oxana V.
в сборнике
Advances in Medicine and Biology
, место издания
Nova Science Publishers New York
, том 87, с. 241-258
DOI
2014
Understanding the Folding Rates and Folding Nuclei of Globular Proteins
Finkelstein A.V.
,
Ivankov D.N.
,
Garbuzynskiy S.O.
,
Galzitskaya O.V.
в сборнике
Frontiers in Protein and Peptide Sciences
, место издания
BENTHAM SCIENCE PUBLISHERS
, том 1, с. 91-138
DOI
2011
Misfolded Species Involved Regions Which Are Involved in an Early Folding Nucleus
Galzitskaya O.V.
в сборнике
Protein Structure. Editor: Lauren M. Haggerty
, издательство
Nova Science Publishers, Inc.
(United States)
, с. 1-30
2011
Modelling of Protein Folding and Prediction of Rate based on Nucleation Mechanism
Galzitskaya O.V.
в сборнике
Protein Folding. Editor: Eric C. Walters
, издательство
Nova Science Publishers, Inc.
(United States)
, с. 151-185
2009
COMPARISON OF Phi-VALUES AND FOLDING TIME PREDICTIONS BY USING MONTE-CARLO AND DYNAMIC PROGRAMMING APPROACHES
Galzitskaya O.V.
,
Garbuzynskiy S.O.
в сборнике
Computational Biology: New Research
, с. 277-314
2008
Do amyloidogenic regions intersect with folding nuclei of native structure?
Galzitskaya O.V.
в сборнике
Proceedings from Computational biophysics to system biology (CBSB08)
, серия
From Computational Biophysics to Systems Biology
, место издания
Julich Germany
, том 8, с. 219-221
2008
Folding and aggregation features of proteins
Galzitskaya O.V.
,
Garbuzynskiy S.O.
в сборнике
Protein Misfolding
, издательство
Nova Science Publishers, Inc.
(United States)
, с. 99-112
2008
Protein structure and its folding rate
Finkelstein A.V.
,
Ivankov D.N.
,
Garbuzynskiy S.O.
,
Galzitskaya O.V.
в сборнике
Mathematical Modelling of Biosystems (Applied Optimization, 102)
, место издания
Springer
, с. 273-301
2001
The State of Art in Steps of Protein Folding
Galzitskaya O.V.
,
Ivankov D.N.
,
Finkelstein A.V.
в сборнике
Summer School "The prediction and mechanism of protein folding: from topology to intermediate states"
, место издания
Institute d'etudes scientifiques de Cargese
, с. 8-19
2000
Folding nuclei in 3D protein structures
Galzitskaya O.V.
,
Skoogarev A.V.
,
Ivankov D.N.
,
Finkelstein A.V.
в сборнике
Proceedings of the Pacific Symposium on Biocomputong
, серия
Pacific Symposium on Biocomputing
, том 5, с. 128-139
1999
Folding nuclei in 3D protein structures
Galzitskaya O.V.
,
Skoogarev A.V.
,
Ivankov D.N.
,
Finkelstein A.V.
в сборнике
Pacific Symposium on Biocomputing 2000
, место издания
Singapore
, с. 131-142
Книги
2017
Физико-химические механизмы и регуляция процессов трансформации энергии в биологических структурах (Под редакцией Г.Ю.Ризниченко, А.Б.Рубина)
Кузнецов А.С.,
Ефремов Р.Г.
,
Нокс П.П.
,
Горохов В.В.
, Твердислов В.А.,
Финкельштейн А.В.
,
Бадретдинов А.Я.
,
Галзитская О.В.
, Иванков Д.Н.,
Богатырева Н.С.
,
Гарбузинский С.А.
,
Нечипуренко Ю.Д.
,
Давлетшина Л.Н.
,
Ловягина Е.Р.
,
Сёмин Б.К.
, Антонов В.Ф.,
Корепанова Е.А.
,
Немченко О.Ю.
,
Булычев А.А.
,
Маторин Д.Н.
,
Ванин А.Ф.
,
Максимов Г.В.
,
Бочкарева С.С.
,
Кутузов Н.П.
,
Узденский А.Б.
,
Красильников П.М.
,
Кренделева Т.Е.
,
Антал Т.К.
,
Кукарских Г.П.
,
Волгушева А.А.
,
Вершубский А.В.
, Тихонов А.Н.,
Ризниченко Г.Ю.
,
Плюснина Т.Ю.
,
Дьяконова А.Н.
,
Коваленко И.Б.
,
Хрущев С.С.
,
Бинги В.Н.
,
Полежаев А.А.
,
Кузнецов М.Б.
место издания
Москва-Ижевск: Институт компьютерных исследований
, ISBN 978-5-4344-0420-4, 522 с.
Доклады на конференциях
2020
Изучение фибриллообразования амилоидогенных участков рибосомных белков S1
(Устный)
Авторы:
Дерюшева Е.И.
,
Мачулин А.В.
,
Селиванова О.М.
,
Гришин С.Ю.
,
Глякина А.В.
,
Сурин А.К.
,
Галзитская О.В.
VIII Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 12-19 октября 2020 г., Пущино, Россия
, Пущино, Россия, 12-19 октября 2020
2020
АМИЛОИДОГЕННЫЕ И АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫЕ ЭФФЕКТЫ ПЕПТИДОВ, СИНТЕЗИРОВАННЫХ НА ОСНОВЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ БЕЛКА BS1 ИЗ THERMUS THERMOPHILUS
(Устный)
Авторы:
Курпе С.Р.
,
Гришин С.Ю.
,
Джус У.Ф.
,
Селиванова О.М.
,
Глякина А.В.
,
Сурин А.К.
,
Галзитская О.В.
24-я Международная Пущинская школа-конференция молодых учёных "Биология - наука XXI века"
, Пущино, Россия, 5-7 октября 2020
2019
Определение амилоидогенных участков рибосомного белка S1 (60 кДа) и его фрагмента S1 (49 кДа) из Thermus thermophilus с помощью ВЭЖХ-МС анализа
(Устный)
Авторы:
Гришин С.Ю.
,
Сурин А.К.
,
Джус У.Ф.
,
Глякина А.В.
,
Суворина М.Ю.
,
Селиванова О.М.
,
Галзитская О.В.
Девятый съезд ВМСО, VIII ВСЕРОССИЙСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ С МЕЖДУНАРОДНЫМ УЧАСТИЕМ «Масс-спектрометрия и ее прикладные проблемы»
, Москва, Россия, 14-18 октября 2019
2019
Identification of amyloidogenic regions in S1 ribosomal proteins from Thermus thermophilus and Mycoplasma mobile
(Стендовый)
Авторы:
Galzitskaya O.
,
Grishin S.
,
Dzhus U.
,
Selivanova O.
,
Glyakina A.
,
Deryusheva E.
,
Machulin A.
,
Suvorina M.
,
Surin A.
44th Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS)
, Краков, Польша, 6-11 июля 2019
2019
АМИЛОИДОГЕННЫЕ УЧАСТКИ, ВОВЛЕЧЕННЫЕ В ФОРМИРОВАНИЕ ФИБРИЛЛ ИНСУЛИНА, ЛИЗПРО И ГЛАРГИНА
(Стендовый)
Авторы:
Гришин С.Ю.
,
Сурин А.К.
,
Галзитская О.В.
XXXI Зимняя молодёжная научная школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии»
, г. Москва, Россия, 11-14 февраля 2019
2018
ФИБРИЛЛОГЕНЕЗ АНАЛОГОВ ИНСУЛИНА ЧЕЛОВЕКА
(Устный)
Авторы:
Гришин С.Ю.
,
Селиванова О.М.
,
Суворина М.Ю.
,
Сурин А.К.
,
Галзитская О.В.
22-ая Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых "БИОЛОГИЯ-НАУКА XXI ВЕКА
, г. Пущино, Московская область, Россия, 23-27 апреля 2018
Тезисы докладов
2009
Bgl2p- Amyloid-like fibril forming protein from Saccharomyces cerevisiae yeast cell wall
Gorkovskii A.A.,
Plotnikova T.A.
,
Selyakh I.O.
,
Galzitskaya O.V.
,
Bezsonov E.E.
,
Kalebina T.S.
в сборнике
Book of Abstracts International conference 27th ISSY: Pasteur`s legacy – Yeast for Health and Biotechnologies
, место издания
Paris, France
, тезисы, с. 164-164
Руководство диссертациями
2013
Влияние структурных свойств глобулярных белков на их механическую стабильность и термостабильность
Кандидатская диссертация по специальности 03.01.02 - Биофизика (биол. науки)
Автор:
Глякина Анна Владимировна
Научные руководители:
Балабаев Николай Кириллович
, к.ф.-м.н., доц.,
Галзитская Оксана Валериановна
, д.ф.-м.н.
Защищена в совете
Д 501.001.96
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
Ведущая организация:
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической физики им. Н.Н. Семенова Российской академии наук
Оппоненты:
Шайтан Константин Вольдемарович
,
Сивожелезов Виктор Семенович