ИСТИНА

Glyakina A.V.

Соавторы: Галзитская О.В., Selivanova O., Surin A.K., Suvorina M., Балабаев Н.К., Гришин С.Ю., Dovidchenko N., Grigorashvili E., Machulin A.V., Гурин А.Н., Джус У.Ф., Калебина Т.С., Никулин А.Д. показать полностью..., Bogatyreva N., Marchenkov V.V., Mikhaylina A.O., Дерюшев Г., Лихачев И.В., Рекстина В.В., Рогачевский В.В., Фадеев Р.С., кобякова м.и., Deryusheva E., Garbuzynskiy S., Gorbunova E.Y., Kanev I.V., Karpov M., Lobanov M.Y., Matkarimov B.T., Mustaeva L., Panfilov A.V., Sadgyan A.S., Selivanova O., Shiliaev N.G., Sokolovskiy I.V., Sopova J.V., Strizhov N., TIN U.F., Ushakova N.I., Дерюшева Е.И., Донова М., Ефимова В.С., Исаева Л.В., Кочетов А.П., Кравченко С.В., Курпе С.Р., Лихачев И.А., Морозов В.Н., Немашкалова Е.Л., Никулин А.М., Новикова Л.А., Рубцов М.А., Садгян А.С., Слизень М.В., Ушакова Н.И.

43 статьи, 5 докладов на конференциях

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 299, Scopus: 321

IstinaResearcherID (IRID): 2118588

Деятельность

• Статьи в журналах

  • 
    • 2022 Multiple Antimicrobial Effects of Hybrid Peptides Synthesized Based on the Sequence of Ribosomal S1 Protein from Staphylococcus aureus
    • Kravchenko Sergey V., Domnin Pavel A., Grishin Sergei Y., Panfilov Alexander V., Azev Viacheslav N., Mustaeva Leila G., Gorbunova Elena Y., Kobyakova Margarita I., Surin Alexey K., Glyakina Anna V., Fadeev Roman S., Ermolaeva Svetlana A., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 23, № 1 DOI
  • 
    • 2021 Search for Structural Basis of Interactions of Biogenic Amines with Human TAAR1 and TAAR6 Receptors
    • Glyakina Anna V., Pavlov Constantine D., Sopova Julia V., Gainetdinov Raul R., Leonova Elena I., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 23, № 1 DOI
  • • 2021 Антибактериальные эффекты пептидов, синтезированных на основе последовательности рибосомного белка S1
    • Курпе С.Р., Гришин С.Ю., Глякина А.В., Слизень М.В., Панфилов А.В., Кочетов А.П., Сурин А.К., Кобякова М.И., Фадеев Р.С., Галзитская О.В.
    • в журнале Биомедицинская химия, том 67, № 3, с. 231-243 DOI
  • 
    • 2020 Amyloidogenic Propensities of Ribosomal S1 Proteins: Bioinformatics Screening and Experimental Checking
    • Grishin Sergei Y., Deryusheva Evgeniya I., Machulin Andrey V., Selivanova Olga M., Glyakina Anna V., Gorbunova Elena Y., Mustaeva Leila G., Azev Vyacheslav N., Rekstina Valentina V., Kalebina Tatyana S., Surin Alexey K., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 21, № 15, с. 5199-5199 DOI
  • 
    • 2020 Bioinformatics Analysis of Actin Molecules: Why Quantity Does Not Translate Into Quality?
    • Glyakina Anna V., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале Frontiers in genetics, издательство Frontiers Research Foundation. (Lausanne, Switzerland), том 11 DOI
  • 
    • 2020 How Quickly Do Proteins Fold and Unfold, and What Structural Parameters Correlate with These Values?
    • Glyakina Anna, Galzitskaya Oxana
    • в журнале Biomolecules, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 10, № 2 DOI
  • 
    • 2020 New Model for Stacking Monomers in Filamentous Actin from Skeletal Muscles of Oryctolagus cuniculus
    • Glyakina Anna V., Surin Alexey K., Grishin Sergei Yu, Selivanova Olga M., Suvorina Mariya Yu, Bobyleva Liya G., Vikhlyantsev Ivan M., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 21, № 21, с. 8319-8319 DOI
  • • 2019 Identification of amyloidogenic regions in S1 ribosomal proteins from Thermus thermophilus and Mycoplasma mobile
    • Galzitskaya O.V., Grishin S.Y., Dzhus U.F., Selivanova O.M., Glyakina A.V., Deryusheva E.I., Machulin A.V., Suvorina M.Y., Surin A.K.
    • в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 9, № S1, с. 264-264 DOI
  • 
    • 2019 Ile351, Leu355 and Ile461 residues are essential for catalytic activity of bovine cytochrome P450scc (CYP11A1)
    • Glyakina AV, Strizhov NI, Karpov MV, Dovidchenko NV, Matkarimov BT, Isaeva LV, Efimova VS, Rubtsov MA, Novikova LA, Donova MV, Galzitskaya OV
    • в журнале Steroids, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 143, с. 80-90 DOI
  • 
    • 2018 Analysis of Insulin Analogs and the Strategy of Their Further Development
    • Selivanova O.M., Grishin S.Yu, Glyakina A.V., Sadgyan A.S., Ushakova N.I., Galzitskaya O.V.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 83, № S1, с. S146-S162 DOI
  • 
    • 2018 Comparative mechanical unfolding studies of spectrin domains R15, R16 and R17
    • Glyakina Anna V., Likhachev Ilya V., Balabaev Nikolay K., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале Journal of Structural Biology, издательство Academic Press (United States), том 201, № 2, с. 162-170 DOI
  • 
    • 2018 Search for Functional Flexible Regions in the G-protein Family: New Reading of the FoldUnfold Program
    • Deryusheva Eugenia, Machulin Andrey, Nemashkalova Ekaterina, Glyakina Anna, Galzitskaya Oxana
    • в журнале Protein and Peptide Letters, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 25, № 6, с. 589-598 DOI
  • 
    • 2018 Should the Treatment of Amyloidosis Be Personified? Molecular Mechanism of Amyloid Formation by Aβ Peptide and Its Fragments
    • Galzitskaya Oxana V., Surin Alexey K., Glyakina Anna V., Rogachevsky Vadim V., Selivanova Olga M.
    • в журнале Journal of Alzheimer's Disease Reports, издательство IOS Press (Amsterdam, Netherlands), том 2, № 1, с. 181-199 DOI
  • 
    • 2018 To Be Fibrils or To Be Nanofilms?: Oligomers Are Building Blocks for Fibril and Nanofilm Formation of Fragments of A$\upbeta$ Peptide
    • Selivanova Olga M., Surin Alexey K., Ryzhykau Yury L., Glyakina Anna V., Suvorina Mariya Yu, Kuklin Alexander I., Rogachevsky Vadim V., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале Langmuir, издательство American Chemical Society (United States), том 34, № 6, с. 2332-2343 DOI
  • • 2018 АНАЛИЗ АНАЛОГОВ ИНСУЛИНА И СТРАТЕГИЯ ИХ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ
    • Селиванова О.М., Гришин С.Ю., Глякина А.В., Садгян А.С., Ушакова Н.И., Галзиская О.В.
    • в журнале Успехи биологической химии, том 58, с. 313-346
  • • 2018 СТРУКТУРОНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ОСОБЕННОСТИ α-КРИСТАЛЛИНА
    • СЕЛИВАНОВА О.М., ГЛЯКИНА А.В., СУВОРИНА М.Ю., НИКУЛИН А.Д., СУРИН А.К., ГАЛЗИТСКАЯ О.В.
    • в журнале Актуальные вопросы биологической физики и химии, издательство Севастопольский государственный университет (Севастополь), том 3, № 3, с. 673-679
  • 
    • 2016 Dataset of the molecular dynamics simulations of bilayers consisting of short amyloidogenic peptide VDSWNVLVAG from Bgl2p–glucantransferase of S. cerevisiae cell wall
    • Glyakina Anna V., Balabaev Nikolai K., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале Data in Brief, издательство Elsevier Inc. (США), том 9, с. 597-601 DOI
  • 
    • 2016 One of the possible mechanisms of amyloid fibrils formation based on the sizes of primary and secondary folding nuclei of A beta 40 and A beta 42
    • Dovidchenko Nikita V., Glyakina Anna V., Selivanova Olga M., Grigorashvili Elizaveta I., Suvorina Mariya Yu, Dzhus Ulyana F., Mikhailina Alisa O., Shiliaev Nikita G., Marchenkov Victor V., Surin Alexey K., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале Journal of Structural Biology, издательство Academic Press (United States), том 194, № 3, с. 404-414 DOI
  • 
    • 2016 Structural model of amyloid fibrils for amyloidogenic peptide from Bgl2p–glucantransferase of S. cerevisiae cell wall and its modifying analog. New morphology of amyloid fibrils
    • Selivanova OM, Glyakina AV, Gorbunova EY, Mustaeva LG, Suvorina MY, Grigorashvili EI, Nikulin AD, Dovidchenko NV, Rekstina VV, Kalebina TS, Surin AK, Galzitskaya OV
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1864, № 11, с. 1489-1499 DOI
  • 
    • 2016 Structural model of amyloid fibrils for amyloidogenic peptide from Bgl2p–glucantransferase of S. cerevisiae cell wall and its modifying analog. New morphology of amyloid fibrils
    • Selivanova Olga M., Glyakina Anna V., Gorbunova Elena Yu, Mustaeva Leila G., Suvorina Mariya Yu, Grigorashvili Elizaveta I., Nikulin Alexey D., Dovidchenko Nikita V., Rekstina Valentina V., Kalebina Tatyana S., Surin Alexey K., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1864, № 11, с. 1489-1499 DOI
  • 
    • 2016 The Mechanism Underlying Amyloid Polymorphism is Opened for Alzheimer's Disease Amyloid-beta Peptide
    • Selivanova Olga M., Surin Alexey K., Marchenkov Victor V., Dzhus Ulyana F., Grigorashvili Elizaveta I., Suvorina Mariya Yu, Glyakina Anna V., Dovidchenko Nikita V., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале Journal of Alzheimer's Disease, издательство I O S press (Netherlands), том 54, № 2, с. 821-830 DOI
  • 
    • 2015 Determination of the size of the primary and secondary folding nuclei of Abeta40 and Abeta42 protofibrils from the concentration dependence of the rate and the lag-time of their formation
    • Galzitskaya O.V., Dovidchenko N.V., Glyakina A.V., Selivanova O.M., Grigorashvili E.I., Suvorina M.Y., Tin U., Mikhaylina A.O., Nikulin A.D., Surin A.K.
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 282, с. 20
  • 
    • 2015 Mechanical stability analysis of the protein L immunoglobulin-binding domain by full alanine screening using molecular dynamics simulations
    • Glyakina Anna V., Likhachev Ilya V., Balabaev Nikolay K., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале Biotechnology journal, издательство Wiley - VCH Verlag GmbH & CO. KGaA (Germany), том 10, № 3, с. 386-394 DOI
  • 
    • 2014 Folding of Right- and Left-Handed Three-Helix Proteins
    • Galzitskaya Oxana V., Pereyaslavets Leonid B., Glyakina Anna V.
    • в журнале Israel Journal of Chemistry, издательство Laser Pages Publishing Ltd. (Israel), том 54, № 8-9, с. 1126-1136 DOI
  • 
    • 2014 Right- and left-handed three-helix proteins: II. similarity and differences in mechanical unfolding of proteins
    • Glyakina A.V., Likhachev I.V., Balabaev N.K., Galzitskaya O.V.
    • в журнале Proteins: Structure, Function and Bioinformatics, издательство Wiley-Liss Inc (United States), том 82, № 1, с. 90-102 DOI
  • 
    • 2014 What handedness and angles between helices has the studied three-helical protein domain?
    • Pereyaslavets L.B., Glyakina A.V., Dovidchenko N.V., Sokolovskiy I.V., Galzitskaya O.V.
    • в журнале Bioinformatics, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 31, № 6, с. 963-965 DOI
  • 
    • 2013 Experimental and Theoretical Studies of Mechanical Unfolding of Different Proteins
    • Glyakina A.V., Balabaev N.K., Galzitskaya O.V.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 78, № 11, с. 1216-1227
  • 
    • 2013 Right- and left-handed three-helix proteins. I. Experimental and simulation analysis of differences in folding and structure
    • Glyakina Anna V., Pereyaslavets Leonid B., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале Proteins, том 81, № 9, с. 1527-1541 DOI
  • 
    • 2013 Stability and rigidity/flexibility—Two sides of the same coin?
    • Mamonova Tatyana B., Glyakina Anna V., Galzitskaya Oxana V., Kurnikova Maria G.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1834, № 5, с. 854-866 DOI
  • 
    • 2012 Computer simulation of gas-phase neutralization of electrospray generated protein macroions
    • Kanev I.V., Balabaev N.K., Glyakina A.V., Morozov V.N.
    • в журнале Journal of Physical Chemistry B, издательство American Chemical Society (United States), том 116, с. 5872-5881
  • 
    • 2012 Nucleation-based prediction of the protein folding rate and its correlation with the folding nucleus size
    • Galzitskaya Oxana V., Glyakina Anna V.
    • в журнале Proteins, том 80, № 12, с. 2711-2727 DOI
  • 
    • 2011 Accessible Surfaces of Beta Proteins Increase with Increasing Protein Molecular Mass More Rapidly than Those of Other Proteins
    • Glyakina Anna V., Bogatyreva Natalya S., Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале PLoS ONE, издательство Public Library of Science (United States), том 6, № 12, с. e28464 DOI
  • 
    • 2011 Bacterial proteins fold faster than eukaryotic proteins with simple folding kinetics
    • Galzitskaya O.V., Bogatyreva N.S., Glyakina A.V.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 76, № 2, с. 225-235 DOI
  • 
    • 2010 A comparative analysis of folding pathways of thermophilic and mesophilic proteins by Monte Carlo simulations
    • Glyakina A.V., Galzitskaya O.V.
    • в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 8, № 3, с. 395-411
  • 
    • 2010 Flexibility and mobility in Mesophilic and thermophilic homologous proteins from Molecular Dynamics and FoldUnfold Method
    • Mamonova T.B., Glyakina A.V., Kurnikova M.G., Galzitskaya O.V.
    • в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 8, № 3, с. 377-394
  • 
    • 2010 Influence of organization of native protein structure on its folding: Modeling of the folding of $\upalpha$-helical proteins
    • Glyakina A.V., Galzitskaya O.V.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 75, № 8, с. 995-1005 DOI
  • 
    • 2010 Two-, Three-, and Four-State Events Occur in the Mechanical Unfolding of Small Protein L Using Molecular Dynamics Simulations
    • Glyakina A.V., Balabaev N.K., Galzitskaya O.V.
    • в журнале Protein and Peptide Letters, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 17, с. 92-103
  • 
    • 2009 Comparison of transition states obtained upon modeling of unfolding of immunoglobulin-binding domains of proteins L and G caused by external action with transition states obtained in the absence of force probed by experiments
    • Glyakina A.V., Balabaev N.K., Galzitskaya O.V.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 74, № 3, с. 316-328
  • 
    • 2009 Mechanical unfolding of proteins L and G with constant force: Similarities and differences
    • Glyakina A.V., Balabaev N.K., Galzitskaya O.V.
    • в журнале Journal of Chemical Physics, издательство AIP Publishing (United States), том 131, № 045102, с. 1-10
  • 
    • 2009 Multiple Unfolding Intermediates Obtained by Molecular Dynamic Simulations under Stretching for Immunoglobulin-Binding Domain of Protein G
    • Glyakina A.V., Balabaev N.K., Galzitskaya O.V.
    • в журнале The open biochemistry journal, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 3, с. 66-77
  • 
    • 2007 Different packing of external residues can explain differences in the thermostability of proteins from thermophilic and mesophilic organisms
    • Glyakina Anna V., Garbuzynskiy Sergiy O., Lobanov Michail Yu, Galzitskaya Oxana V.
    • в журнале Bioinformatics, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 23, № 17, с. 2231-2238 DOI

• Статьи в сборниках

  • • 2021 Determination of the Most Stable Packing of Peptides From Ribosomal S1 Protein, Protein Bgl2p and Abeta peptide in beta-layers during Molecular Dynamics Simulations
    • Glyakina A.V., Balabaev N.K., Galzitskaya O.V.
    • в сборнике Computer Simulations of Aggregation of Proteins and Peptides, серия Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), место издания Springer, том 2340, с. 221-233 DOI
  • • 2020 Investigation of Fibrillation by Amyloidogenic Regions of the Ribosomal S1 Proteins
    • Deryusheva E.I., Machulin A.V., Selivanova O.M., Grishin S.Yu, Glyakina A.V., Surin A.K., Galzitskaya O.V.
    • в сборнике Proceedings of the International Conference "Mathematical Biology and Bioinformatics", место издания IMPB RAS - Branch of KIAM RAS Pushchino, том 8, с. e13 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2020 Структурно функциональная характеристика семейства рибосомных белков S1 (Стендовый)
    • Авторы: Гришин С.Ю., Глякина А.В., Курпе С.Р., Матюнин М.А., Мачулин А.В., Дерюшева Е.И.
    • Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2020», Москва, Россия, 10-27 ноября 2020
  • • 2020 Изучение фибриллообразования амилоидогенных участков рибосомных белков S1 (Устный)
    • Авторы: Дерюшева Е.И., Мачулин А.В., Селиванова О.М., Гришин С.Ю., Глякина А.В., Сурин А.К., Галзитская О.В.
    • VIII Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 12-19 октября 2020 г., Пущино, Россия, Пущино, Россия, 12-19 октября 2020
  • • 2020 АМИЛОИДОГЕННЫЕ И АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫЕ ЭФФЕКТЫ ПЕПТИДОВ, СИНТЕЗИРОВАННЫХ НА ОСНОВЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ БЕЛКА BS1 ИЗ THERMUS THERMOPHILUS (Устный)
    • Авторы: Курпе С.Р., Гришин С.Ю., Джус У.Ф., Селиванова О.М., Глякина А.В., Сурин А.К., Галзитская О.В.
    • 24-я Международная Пущинская школа-конференция молодых учёных "Биология - наука XXI века", Пущино, Россия, 5-7 октября 2020
  • • 2019 Определение амилоидогенных участков рибосомного белка S1 (60 кДа) и его фрагмента S1 (49 кДа) из Thermus thermophilus с помощью ВЭЖХ-МС анализа (Устный)
    • Авторы: Гришин С.Ю., Сурин А.К., Джус У.Ф., Глякина А.В., Суворина М.Ю., Селиванова О.М., Галзитская О.В.
    • Девятый съезд ВМСО, VIII ВСЕРОССИЙСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ С МЕЖДУНАРОДНЫМ УЧАСТИЕМ «Масс-спектрометрия и ее прикладные проблемы», Москва, Россия, 14-18 октября 2019
  • • 2019 Identification of amyloidogenic regions in S1 ribosomal proteins from Thermus thermophilus and Mycoplasma mobile (Стендовый)
    • Авторы: Galzitskaya O., Grishin S., Dzhus U., Selivanova O., Glyakina A., Deryusheva E., Machulin A., Suvorina M., Surin A.
    • 44th Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS), Краков, Польша, 6-11 июля 2019