ИСТИНА

Веб-сервер vsFilt является новым инструментом структурной фильтрации при компьютерном скрининге библиотек соединений с учетом особенностей механизма функционирования молекулярной мишени. Алгоритм vsFilt детектирует различные типы взаимодействий между тестируемой молекулой и белком-мишенью в смоделированном комплексе (водородные и галогенные связи, ионные взаимодействия, гидрофобные контакты, пи-стэкинг, катион-пи взаимодействия) и позволяет отбирать лекарствоподобные соединения, способные к наиболее эффективному и специфическому связыванию. vsFilt является пост-докинговым методом/этапом, который способен принципиально улучшить предсказательную силу компьютерного скрининга. - vsFilt доступен по адресу https://biokinet.belozersky.msu.ru/vsfilt (а также https://biokinet3.belozersky.msu.ru/vsfilt) - совместим с основными браузерами (Chrome, Firefox, Opera); - не требует регистрации; - обеспечивает конфиденциальность данных пользователя; - работает с молекулярными библиотеками, содержащими до 150 000 соединений; - результаты можно загрузить для локального использования, а также проанализировать в режиме онлайн с помощью встроенного 3D-визуализатора. В представленном докладе будут рассмотрены вопросы интеграции методов докинга, структурной фильтрации и молекулярной динамики, а также приведены примеры использования vsFilt для решения задач высокопроизводительного компьютерного скрининга (1 – разработка ингибиторов нейраминидазы вируса гриппа нового поколения, 2 – поиск противоопухолевых ингибиторов в ряду производных и миметиков природных соединений).