ИСТИНА

Нилов Дмитрий Константинович пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского, Отдел биокинетики, Лаборатория ферментативных модификаций физиологически активных соединений, старший научный сотрудник, с 2 июля 2007

кандидат химических наук с 2011 года

Соавторы: Швядас В.К., Лаврик О.И., Гущина И.В., Zakharenko A.L., Евтеев С.А., Поленова А.М., Попов В.О., Прохорова Е.А., Куликов А.В., Dyrkheeva N., Luzina O., Mikhailov S.N., Salakhutdinov N. показать полностью..., Shabalin I.G., Захаренко А.Л., Малюченко Н.В., Студитский В.М., Суханова М.В., Феофанов А.В., Халиуллин И.Г., Шаповалова И.В., Яшина К.И., Antonov M., Antoshina E., Chilov G.G., Filimonov A., Gerasimova N., Ilina E., Khodyreva S.N., Koval O., Kuprushkin M., Kurgina T., Kutuzov M.M., Lys A., Tararov V.I., Герасимова Н.С., Григоренко Б.Л., Захаренко А.И., Захарова О., Кирсанов К.И., Куликов А.В., Немухин А.В., Новиков Н., Попинако А.В., Тараров В.И., Хренова М.Г., Чилов Г.Г., Шабалин И.Г.

25 статей, 16 докладов на конференциях, 4 тезисов докладов, 12 НИР, 1 патент, 1 награда, 1 диссертация, 6 дипломных работ, 12 курсовых работ, 1 учебный курс

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 66, Scopus: 62

IstinaResearcherID (IRID): 852963

Деятельность стиль:  обычный | ГОСТ | plain | abbrv | acm | alpha | amsalpha | amsplain | apalike | ieeetr | siam

• Статьи в журналах

  • • 2019 7-Methylguanine Traps PARP-1 on Nucleosomes: spFRET Microscopy Study
    • Maluchenko Natalya, Nilov Dmitry, Feofanov Alexey, Lys Alexandra, Kutuzov Mikhail, Gerasimova Nadezhda, Studitsky Vasily
    • в журнале Microscopy and Microanalysis, издательство Cambridge University Press (United Kingdom), том 25, № S2, с. 1282-1283 DOI
  • 
    • 2019 Inhibitory Effect of New Semisynthetic Usnic Acid Derivatives on Human Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1
    • Dyrkheeva N., Luzina O., Filimonov A., Zakharova O., Ilina E., Zakharenko A., Kuprushkin M., Nilov D., Gushchina I., Švedas V., Salakhutdinov N., Lavrik O.
    • в журнале Planta Medica, издательство Georg Thieme Verlag (Germany), том 85, № 2, с. 103-111 DOI
  • 
    • 2018 2,5-Diketopiperazines: a new class of poly(ADP-ribose)polymerase Inhibitors
    • Nilov D.K., Yashina K.I., Gushchina I.V., Zakharenko A.L., Sukhanova M.V., Lavrik O.I., Švedas V.K.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 83, № 2, с. 152-158 DOI
  • • 2018 2,5-Дикетопиперазины: новый класс ингибиторов поли(ADP-рибозо)полимеразы
    • Нилов Д.К., Яшина К.И., Гущина И.В., Захаренко А.Л., Суханова М.В., Лаврик О.И., Швядас В.К.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 83, № 2, с. 251-258
  • 
    • 2018 7-Methylguanine: a natural DNA repair inhibitor and a promising anticancer compound
    • Nilov D., Kirsanov K., Antoshina E., Maluchenko N., Feofanov A., Kurgina T., Zakharenko A., Khodyreva S., Gerasimova N., Studitsky V., Lavrik O., Švedas V.
    • в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 8, № Supplement S1, с. 271-272 DOI
  • 
    • 2018 Selection of bifunctional tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors by molecular modeling
    • Gushchina I., Švedas V., Nilov D.
    • в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 8, № Supplement S1, с. 455-455 DOI
  • 
    • 2018 The utility of sulfonamide group in the design of bifunctional neuraminidase inhibitors
    • Evteev SA, Polenova AM, Nilov DK, Švedas VK
    • в журнале Journal of Bioenergetics and Biomembranes, издательство Springer/Plenum Publishers (New York, USA), с. 73 DOI
  • 
    • 2017 Structure modeling of human tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 and screening for its inhibitors
    • Gushchina I.V., Nilov D.K., Zakharenko A.L., Lavrik O.I., Švedas V.K.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 9, № 2, с. 59-66
  • • 2017 Моделирование структуры и скрининг ингибиторов тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы 1 человека
    • Гущина И.В., Нилов Д.К., Захаренко А.Л., Лаврик О.И., Швядас В.К.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 9, № 2, с. 62-69
  • • 2016 Identification of New Structural Fragments for the Design of Lactate Dehydrogenase A Inhibitors
    • Nilov D.K., Kulikov A.V., Prokhorova E.A., Švedas V.K.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 8, № 3, с. 118-122
  • 
    • 2016 Inhibition of Poly(ADP-Ribose)Polymerase by Nucleic Acid Metabolite 7-Methylguanine
    • Nilov D.K., Tararov V.I., Kulikov A.V., Zakharenko A.L., Gushchina I.V., Mikhailov S.N., Lavrik O.I., Švedas V.K.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 8, № 2, с. 108-115
  • 
    • 2016 Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors: usnic acid enamines enhance the cytotoxic effect of camptothecin
    • Zakharenko A., Luzina O., Koval O., Nilov D., Gushchina I., Dyrkheeva N., Švedas V., Salakhutdinov N., Lavrik O.
    • в журнале Journal of Natural Products, издательство American Chemical Society (United States), том 79, № 11, с. 2961-2967 DOI
  • • 2016 Идентификация новых структурных фрагментов для дизайна ингибиторов лактатдегидрогеназы А
    • Нилов Д.К., Куликов А.В., Прохорова Е.А., Швядас В.К.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 8, № 3, с. 129-133
  • • 2016 Ингибирование поли(ADP-рибозо)полимеразы метаболитом нуклеиновых кислот 7-метилгуанином
    • Нилов Д.К., Тараров В.И., Куликов А.В., Захаренко А.Л., Гущина И.В., Михайлов С.Н., Лаврик О.И., Швядас В.К.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 8, № 2, с. 120-128
  • 
    • 2015 Molecular modeling of formate dehydrogenase modified forms: what modifications can block the substrate channel?
    • Popinako A., Antonov M., Nilov D., Švedas V., Popov V.
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 282, № Supplement S1, с. 387-387 DOI
  • 
    • 2015 Search for Human Lactate Dehydrogenase A Inhibitors Using Structure-Based Modeling
    • Nilov DK, Prokhorova EA, Švedas VK
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 7, № 2, с. 57-63
  • • 2015 Поиск ингибиторов лактатдегидрогеназы A человека с использованием компьютерного моделирования
    • Нилов Д.К., Прохорова Е.А., Швядас В.К.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 7, № 2, с. 62-68
  • 
    • 2014 Catalytic Cycle of Penicillin Acylase from Escherichia coli: QM/MM Modeling of Chemical Transformations in the Enzyme Active Site upon Penicillin G Hydrolysis Bella
    • Grigorenko Bella L., Khrenova Maria G., Nilov Dmitry K., Nemukhin Alexander V., Švedas Vytas K.
    • в журнале ACS catalysis, издательство American Chemical Society (United States), том 4, с. 2521-2529 DOI
  • 
    • 2012 Construction of a Full-Atomic Mechanistic Model of Human Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease APE1 for Virtual Screening of Novel Inhibitors
    • Khaliullin I.G., Nilov D.K., Shapovalova I.V., Svedas V.K.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 4, № 2, с. 80-86
  • 
    • 2012 Molecular modeling of formate dehydrogenase: the formation of the Michaelis complex
    • Nilov Dmitry K., Shabalin Ivan G., Popov Vladimir O., Švedas Vytas K.
    • в журнале Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Adenine Press (United States), том 30, № 2, с. 170-179 DOI
  • • 2012 Построение механистической полноатомной модели апуриновой/апиримидиновой эндонуклеазы человека APE1 для виртуального скрининга новых ингибиторов
    • Халиуллин И.Г., Нилов Д.К., Шаповалова И.В., Швядас В.К.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 4, № 2, с. 83-89
  • 
    • 2011 Improved procedure of the search for poly(ADP-Ribose) polymerase-1 potential inhibitors with the use of the molecular docking approach
    • Zakharenko A.L., Sukhanova M.V., Khodyreva S.N., Novikov F.N., Stroylov V.S., Nilov D.K., Chilov G.G., Svedas V.K., Lavrik O.I.
    • в журнале Molecular Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 45, № 3, с. 517-521
  • 
    • 2011 Investigation of Formate Transport through the Substrate Channel of Formate Dehydrogenase by Steered Molecular Dynamics Simulations
    • Nilov D.K., Shabalin I.G., Popov V.O., Svedas V.K.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 76, № 2, с. 172-174
  • • 2011 Изучение транспорта формиата через субстратный канал формиатдегидрогеназы при помощи управляемой молекулярной динамики
    • Нилов Д.К., Шабалин И.Г., Попов В.О., Швядас В.К.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 76, № 2, с. 211-213
  • 
    • 2011 Усовершенствованная процедура поиска потенциальных ингибиторов поли(АДФ-рибозо)-полимеразы-1 с использованием молекулярного докинга
    • Захаренко А.Л., Суханова М.В., Ходырева С.Н., Новиков Ф.Н., Стройлов В.С., Нилов Д.К., Чилов Г.Г., Швядас В.К., Лаврик О.И.
    • в журнале Молекулярная биология, том 45, № 3, с. 565-569

• Доклады на конференциях

  • • 2019 Identification of new sulfonated inhibitors of human lactate dehydrogenase A through virtual screening and structural filtration (Стендовый)
    • Авторы: Polenova A.M., Gushchina I.V., Švedas V.K., Nilov D.K.
    • Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'19), Biological Faculty of Moscow State University, Россия, 27-30 июля 2019
  • • 2019 Searching for inhibitors against the open conformation of human lactate dehydrogenase A (Стендовый)
    • Авторы: Smolkina EV, Nilov DK
    • Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'19), Biological Faculty of Moscow State University, Россия, 27-30 июля 2019
  • • 2019 Rational design of novel tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors as promising antitumor agents (Стендовый)
    • Авторы: Nilov D.K., Švedas V.K., Gushchina I.V.
    • 4-ая Российская конференция по медицинской химии (МедХим-2019) с международным участием Екатеринбург, 9-14.06.2019, Екатеринбург, Россия, 10-14 июня 2019
  • • 2018 The utility of sulfonamide group in the design of bifunctional neuraminidase inhibitors (Стендовый)
    • Авторы: Evteev S.A., Polenova A.M., Nilov D.K., Švedas V.K.
    • Biomembranes 2018, Долгопрудный, Россия, 1-5 октября 2018
  • • 2018 Рациональный дизайн сульфозамещённых противоопухолевых ингибиторов (Устный)
    • Авторы: Евтеев С.А., Поленова А.М., Гущина И.В., Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • IV Междисциплинарный симпозиум по медицинской, органической, биологической химии и фармацевтике МОБИ-ХимФарма2018, Новый Свет, Крым, Россия, 23-26 сентября 2018
  • • 2018 First selective inhibitors of transketolase from Mycobacterium tuberculosis targeted towards both the pyrophosphate binding site and an adjacent hydrophobic site (Стендовый)
    • Авторы: Nilov D., Gushchina I., Shcherbakova T., Meshalkina L., Švedas V.
    • Chemical Biology 2018, Хайдельберг, Германия, 29 августа - 1 сентября 2018
  • • 2018 7-Methylguanine: a natural DNA repair inhibitor and a promising anticancer compound (Стендовый)
    • Авторы: Antoshina E., Maluchenko N., Nilov D., Kirsanov K., Feofanov A., Kurgina T., Zakharenko A., Khodyreva S., Gerasimova N., Studitsky V., Lavrik O., Švedas V.
    • The 43th FEBS Congress, Прага, Чехия, 7-12 июля 2018
  • • 2018 Selection of bifunctional tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors by molecular modeling (Стендовый)
    • Авторы: Gushchina I., Švedas V., Nilov D.
    • The 43th FEBS Congress, Прага, Чехия, 7-12 июля 2018
  • • 2018 Sulfonamide-based linkers provide opportunities for the design of bifunctional inhibitors of influenza virus neuraminidase (Стендовый)
    • Авторы: Evteev S.A., Švedas V.K., Nilov D.K.
    • 25th International Student Congress Of (bio)Medical Sciences (ISCOMS 2018), Groningen, Нидерланды, 4-8 июня 2018
  • • 2018 ПОИСК СЕЛЕКТИВНЫХ ИНГИБИТОРОВ ФЕРМЕНТОВ ПАТОГЕНОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ БИОИНФОРМАТИКИ И МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ (Устный)
    • Авторы: Швядас В.К., Суплатов Д.А., Нилов Д.К., Балдин С.М., Гущина И.В., Щербакова Т.А., Шмальгаузен Е.В.
    • Международный Форум "Биотехнология: состояние и перспективы развития. Науки о жизни" (BIOTECH WORLD 2018), Москва, Гостиный двор, Ильинка, 4, Россия, 23-25 мая 2018
  • • 2017 Prospects for the use of sulfonates in medicinal chemistry (Устный)
    • Авторы: Nilov D.K., Evteev S.A., Polenova A.M.
    • 3rd Russian Conference on Medicinal Chemistry/3-я Российская конференция по медицинской химии, Казань, Россия, 28 сентября - 3 ноября 2017
  • • 2017 How we do modulate functional properties of enzymes (Устный)
    • Авторы: Švedas V., Gushchina I., Meshalkina L., Nilov D., Shmalhauzen E., Suplatov D.
    • Biocatalysis-2017: Fundamentals & applications. June 25-30, 2017, Moscow Region, Russian Federation., Истра, Россия, 25-30 июля 2017
  • • 2017 Identifying new inhibitors of DNA repair enzymes (Устный)
    • Авторы: Švedas V.K., Gushchina I.V., Nilov D.K.
    • Biocatalysis-2017: Fundamentals & applications. June 25-30, 2017, Moscow Region, Russian Federation., Истра, Россия, 25-30 июля 2017
  • • 2016 In silico screening for sulfonate-based inhibitors against promising anticancer targets (Устный)
    • Авторы: Nilov D.K., Gushchina I.V., Svedas V.K.
    • Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/BGRS-2016, Новосибирск, Россия, 29 августа - 2 сентября 2016
  • • 2015 Molecular model of tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 for a structure-based screening for its inhibitors (Стендовый)
    • Авторы: Nilov D.K., Gushchina I.V., Zakharenko A.L., Lavrik O.I., Švedas V.K.
    • Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'15), Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, Россия, 16-19 июля 2015
  • • 2015 Molecular modeling of formate dehydrogenase modified forms: what modifications can block the substrate channel? (Стендовый)
    • Авторы: Popinako A., Antonov M., Nilov D., Švedas V., Popov V.
    • The 40th FEBS Congress, Берлин, Германия, 4-9 июля 2015

• Тезисы докладов

  • • 2018 Sulfonamide-based linkers provide opportunities for the design of bifunctional inhibitors of influenza virus neuraminidase
    • Evteev S.A., Švedas V.K., Nilov D.K.
    • в сборнике Book of Abstracts ISCOMS 2018, место издания Groningen, the Netherlands, тезисы, с. 567-567
  • • 2018 The utility of sulfonamide group in the design of bifunctional neuraminidase inhibitors
    • Evteev S.A., Polenova A.M., Nilov D.K., Švedas V.K.
    • в сборнике BIOMEMBRANES 2018. Book of Abstracts, место издания MIPT Dolgoprudny, тезисы, с. 206
  • • 2018 Рациональный дизайн сульфозамещённых противоопухолевых ингибиторов
    • Евтеев С.А., Поленова А.М., Гущина И.В., Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • в сборнике Сборник тезисов докладов Четвёртого Междисциплинарного Симпозиума по Медицинской, Органической и Биологической Химии и Фармацевтике, место издания "Перо" Москва, тезисы, с. 25
  • • 2017 Prospects for the use of sulfonates in medicinal chemistry
    • Evteev S.A., Polenova A.M., Nilov D.K.
    • в сборнике 3rd Russian Conference on Medicinal Chemistry. Abstract book, место издания Kazan, тезисы, с. 31

• НИРы

  • • 1 января 2019 - 31 декабря 2022 Поиск регуляторов биологических процессов, воздействующих на белки, ферменты, полиферментные комплексы и рецепторные системы
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Астахова А.А., Балдин С.М., Баринова К.В., Буник В.И., Вирясова Г.М., Голенкина Е.А., Гуранда Д.Ф., Дарбинян Т.Г., Дробот В.В., Кирилин Е.М., Кочетов Г.А., Курочкина Л.П., Мичурина В.Н., Муронец В.И., Никулин М.В., Нилов Д.К., Орлов В.Н., Панин Н.В., Пирожкова Е.Б., Позднякова Н.В., Семенюк П.И., Сергеева М.Г., Соловьева О.Н., Стройлова Ю.Ю., Судьина Г.Ф., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Чистяков Д.В., Шмальгаузен Е.В., Щербакова Т.А.
  • • 12 апреля 2018 - 15 декабря 2019 Изучение особенностей структурной организации центров связывания в ферментах патогенов и разработка новых антибиотиков для лечения заболеваний нижних дыхательных путей с использованием системных подходов биоинформатики и молекулярного моделирования
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Ответственные исполнители: Нилов Д.К., Суплатов Д.А., Щербакова Т.А. Участники НИР: Балдин С.М., Гущина И.В., Дробот В.В., Кирилин Е.М., Шарапова Я.А., Шмальгаузен Е.В.
  • • 26 октября 2017 - 26 октября 2020 Механизмы узнавания повреждений ДНК в хроматине белками семейства PARP
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Герасимова Н.С. Участники НИР: Гущина И.В., Кудряшова К.С., Малюченко Н.В., Никитин Д.В., Нилов Д.К., Султанов Д.Ч., Чертков О.В.
  • • 10 апреля 2017 - 31 декабря 2019 Конструирование и испытание ингибиторов ферментов метаболизма ДНК и гликолиза в опухолевых клетках
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Нилов Д.К. Участники НИР: Гущина И.В., Евтеев С.А., Кирсанов К.И., Лесовая Е.А., Поленова А.М., Успенская Т.В.
  • • 14 марта 2016 - 25 декабря 2017 Исследование механизмов взаимодействия новых ингибиторов репарации ДНК с белковыми мишенями и оптимизация их структуры
    • Отдел биокинетики
    • Руководитель: Нилов Д.К. Участники НИР: Гущина И.В., Евтеев С.А., Куликов А.В.
  • • 26 мая 2015 - 15 декабря 2017 Изучение особенностей структурной организации центров связывания в ферментах патогенов и разработка новых антибиотиков для лечения заболеваний нижних дыхательных путей с использованием системных подходов биоинформатики и молекулярного моделирования
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Балдин С.М., Кирилин Е.М., Мешалкина Л.Е., Нилов Д.К., Семенюк П.И., Суплатов Д.А., Шарапова Я.А., Шмальгаузен Е.В., Щербакова Т.А.
  • • 12 ноября 2014 - 1 июля 2015 Разработка комплекса образовательных модулей для подготовки исследователей в области создания инновационных лекарственных препаратов
    • Факультет биоинженерии и биоинформатики
    • Руководитель: Фенюк Б.А. Участники НИР: Богатырева М.Х., Головин А.В., Зиновкина Л.А., Каленикова Е.И., Калинина Н.И., Миронов А.А., Нилов Д.К., Северин Ф.Ф., Скулачев В.П., Ставровская Е.Д., Суплатов Д.А., Швядас В.К.
  • • 25 сентября 2014 - 31 декабря 2015 Разработка ингибиторов ферментов репарации ДНК в качестве прототипов лекарственных препаратов для социально значимых заболеваний
    • Отдел биокинетики
    • Руководитель: Швядас В.К. Участник НИР: Нилов Д.К.
  • • 20 февраля 2014 - 31 декабря 2016 Поиск ингибиторов изоформы А лактатдегидрогеназы в опухолевых клетках с помощью методов молекулярного моделирования и экспериментальных подходов
    • Отдел биокинетики
    • Руководитель: Нилов Д.К. Участники НИР: Гущина И.В., Куликов А.В., Прохорова Е.А., Успенская Т.В., Шарапова Я.А.
  • • 1 января 2014 - 31 декабря 2018 Центр биомедицинских исследований, Компонент по инфекционным заболеваниям
    • Отдел биокинетики
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Балдин С.М., Кирилин Е.М., Мисюра Н.М., Муронец В.И., Никулин М.В., Нилов Д.К., Панин Н.В., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Халиуллин И.Г., Шаповалова И.В., Щербакова Т.А.
  • • 1 января 2013 - 31 декабря 2018 Управление биологическими процессами путем воздействия низкомолекулярными регуляторами на ферменты, полиферментные комплексы, рецепторные системы и другие супрамолекулярные структуры
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Швядас В.К. Участники НИР: Астахова А.А., Балдин С.М., Буник В.И., Вирясова Г.М., Голенкина Е.А., Гуранда Д.Ф., Дарбинян Т.Г., Дробот В.В., Загряжская А.Н., Кирилин Е.М., Ливенский А.Д., Никулин М.В., Нилов Д.К., Панин Н.В., Пирожкова Е.Б., Сергеева М.Г., Судьина Г.Ф., Суплатов Д.А., Успенская Т.В., Чистяков Д.В., Щербакова Т.А.
  • • 7 августа 2012 - 31 декабря 2013 Поиск соединений, изменяющих амилоидогенную трансформацию белков, вызывающих нейродегенеративные заболевания, с помощью методов молекулярного моделирования и экспериментальных подходов
    • Отдел биохимии животной клетки
    • Руководитель: Стройлова Ю.Ю. Участники НИР: Иванов И.А., Куравский М.Л., Мараховская А.С., Моисеева Е.В., Нилов Д.К., Прохорова Е.А., Халиуллин И.Г., Яшина К.И.

• Патенты

  • • 2014 Средство для ингибирования фермента поли(АДФ-рибозо)полимеразы.
    • Авторы: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • #RU 2522915 , 20 июля

• Награды и премии

  • • 2015 Стипендия Московского государственного университета им. М.В.Ломоносова для молодых преподавателей и научных сотрудников, добившихся значительных результатов в педагогической и научно-исследовательской деятельности
    • Лауреат: Нилов Д.К.
    • Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Россия

• Диссертация

  • • 2011 Молекулярное моделирование взаимодействия фермента с субстратами и ингибиторами на примере формиатдегидрогеназы и поли(ADP-рибозо)-полимеразы
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.04 - Биохимия (хим. науки)
    • Автор: Нилов Дмитрий Константинович, к.х.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Научный руководитель: Швядас В.К., д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете Д 501.001.59 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет

• Руководство дипломными работами

  • • 2019 Разработка сульфозамещенных ингибиторов лактатдегидрогеназы А человека с применением методов компьютерного скрининга
    • Научные руководители: Швядас В.К., Нилов Д.К.
    • Автор: Поленова А.М. (Специалист)
  • • 2019 Исследование возможности конструирования бифункциональных ингибиторов нейраминидазы вируса гриппа
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Евтеев С.А. (Специалист)
  • • 2015 Поиск новых ингибиторов нейраминидазы вируса гриппа и характеристика участков их связывания
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Шарапова Я.А. (Специалист)
  • • 2015 Поиск ингибиторов ферментов репарации ДНК с использованием методов молекулярного моделирования
    • Научные руководители: Швядас В.К., Нилов Д.К.
    • Автор: Гущина И.В. (Специалист)
  • • 2013 Разработка новых ингибиторов поли(АДФ-рибозо)-полимеразы человека с использованием компьютерного скрининга
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Яшина К.И. (Специалист)
  • • 2011 Модификация силового поля Amber для исследования структуры и свойств пенициллинацилазы
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Гурьянова Н.Н. (Специалист)

• Руководство курсовыми работами

  • • 2019 Создание модели фермент-субстратного комплекса поли(АДФ-рибозо)полимеразы 1 человека
    • Научный руководитель: Нилов Д.К.
    • Автор: Пушкарев Сергей Владимирович (Специалист)
  • • 2017 Компьютерный поиск линкеров для конструирования бифункциональных ингибиторов нейраминидазы вируса гриппа
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Евтеев С.А. (Специалист)
  • • 2017 Компьютерный поиск конкурентных ингибиторов лактатдегидрогеназы А человека в ряду сульфонатов
    • Научный руководитель: Нилов Д.К.
    • Автор: Поленова А.М. (Специалист)
  • • 2014 Разработка алгоритма структурной фильтрации для компьютерного скрининга ингибиторов
    • Научный руководитель: Нилов Д.К.
    • Автор: Гущина И.В. (Специалист)
  • • 2014 Новый участок связывания ингибиторов нейраминидазы вируса гриппа
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Шарапова Я.А. (Специалист)
  • • 2014 Компьютерный и экспериментальный поиск ингибиторов изоформы М лактатдегидрогеназы человека
    • Научный руководитель: Нилов Д.К.
    • Автор: Прохорова Е.А. (Специалист)
  • • 2013 Построение полноатомной модели эндонуклеазы вируса гриппа и виртуальный скрининг ее ингибиторов
    • Научный руководитель: Нилов Д.К.
    • Автор: Прохорова Е.А. (Специалист)
  • • 2013 Построение полноатомной модели гемагглютинина вируса гриппа и скрининг его потенциальных ингибиторов
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Гущина И.В. (Специалист)
  • • 2013 Компьютерный поиск новых потенциальных ингибиторов нейраминидазы вируса гриппа
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Шарапова Я.А. (Специалист)
  • • 2012 Построение полноатомных моделей поли(ADP-рибозо)-полимеразы человека для виртуального скрининга новых ингибиторов
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Яшина К.И. (Специалист)
  • • 2012 Моделирование структуры ацилфермента в каталитическом механизме пенициллинацилазы
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Гущина И.В., Шарапова Я.А. (Специалист)
  • • 2010 Изучение связывания субстрата пенициллинацилазой методом управляемой молекулярной динамики
    • Научные руководители: Нилов Д.К., Швядас В.К.
    • Автор: Гурьянова Н.Н. (Специалист)

• Авторство учебных курсов

  • • 2014 Механизмы ферментативных реакций
    • Авторы: Швядас В.К., Буник В.И., Суплатов Д.А., Нилов Д.К., Халиуллин И.Г.