Нилов Дмитрий Константинович
пользователь
кандидат химических наук с 2011 года
Количество цитирований статей в журналах по данным
Web of Science: 282,
Scopus: 166
IstinaResearcherID (IRID): 852963
Деятельность
-
Статьи в журналах
-
-
2022
Modeling the Structure of Human tRNA-Guanine Transglycosylase in Complex with 7-Methylguanine and Revealing the Factors that Determine the Enzyme Interaction with Inhibitors
-
Pushkarev Sergey V.,
Vinnik Valeriia A.,
Shapovalova Irina V.,
Švedas Vytas K.,
Nilov Dmitry K.
-
в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 87, № 5, с. 443-449
DOI
-
-
2022
The role of Tyr102 residue in the functioning of bacterial NAD+-dependent formate dehydrogenase of Pseudomonas sp. 101
-
Popinako A.V.,
Pometun A.A.,
Nilov D.K.,
Dibrova D.V.,
Khrustalev V.V.,
Khrustaleva T.A.,
Iurchenko T.S.,
Nikolaeva A.Yu,
Švedas V.K.,
Boyko K.M.,
Tishkov V.I.,
Popov V.O.
-
в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 616, с. 134-139
DOI
-
-
-
2022
Ингибиторное действие 7-метилгуанина и его метаболита 8-гидрокси-7-метилгуанина на поли(ADP-рибозо)полимеразу 1 человека
-
Кургина Т.А.,
Шрам С.И.,
Кутузов М.М.,
Абрамова Т.В.,
Щербакова Т.А.,
Мальцева Е.А.,
Поройков В.В.,
Лаврик О.И.,
Швядас В.К.,
Нилов Д.К.
-
в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 87, № 6, с. 792-801
DOI
-
-
-
-
2021
Bioinformatic analysis of the nicotinamide binding site in poly(ADP-ribose) polymerase family proteins
-
Manasaryan G.,
Suplatov D.,
Pushkarev S.,
Drobot V.,
Kuimov A.,
Švedas V.,
Nilov D.
-
в журнале Cancers, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 13, № 6
DOI
-
-
2021
Design, synthesis, and molecular docking study of new tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 (TDP1) inhibitors combining resin acids and adamantane moieties
-
Kovaleva K.,
Yarovaya O.,
Ponomarev K.,
Cheresiz S.,
Azimirad A.,
Chernyshova I.,
Zakharenko A.,
Konev V.,
Khlebnikova T.,
Mozhaytsev E.,
Suslov E.,
Nilov D.,
Švedas V.,
Pokrovsky A.,
Lavrik O.,
Salakhutdinov N.
-
в журнале Pharmaceuticals, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 14, № 5, с. 422-422
DOI
-
-
2021
Mechanisms of Nucleosome Reorganization by PARP1
-
Maluchenko Natalya V.,
Nilov Dmitry K.,
Pushkarev Sergey V.,
Kotova Elena Y.,
Gerasimova Nadezhda S.,
Kirpichnikov Mikhail P.,
Langelier Marie-France,
Pascal John M.,
Akhtar Md Sohail,
Feofanov Alexey V.,
Studitsky Vasily M.
-
в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 22, № 22
DOI
-
-
2020
Modeling of the enzyme-substrate complexes of human poly(ADP-ribose) polymerase 1
-
Nilov D.K.,
Pushkarev S.V.,
Gushchina I.V.,
Manasaryan G.A.,
Kirsanov K.I.,
Švedas V.K.
-
в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 85, с. 99-107
DOI
-
-
2020
Molecular mechanisms of PARP-1 inhibitor 7-methylguanine
-
Nilov D.,
Maluchenko N.,
Kurgina T.,
Pushkarev S.,
Lys A.,
Kutuzov M.,
Gerasimova N.,
Feofanov A.,
Švedas V.,
Lavrik O.,
Studitsky V.M.
-
в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 21, № 6, с. E2159-E2159
DOI
-
-
2020
Requirement for Serine-384 in Caspase-2 processing and activity
-
Zamaraev Alexey V.,
Volik Pavel I.,
Nilov Dmitry K.,
Turkina Maria V.,
Egorshina Aleksandra Yu,
Gorbunova Anna S.,
Iarovenko Svetlana Iu,
Zhivotovsky Boris,
Kopeina Gelina S.
-
в журнале Cell death & disease, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 11, № 10
DOI
-
-
-
-
2019
7-Methylguanine Traps PARP-1 on Nucleosomes: spFRET Microscopy Study
-
Maluchenko Natalya,
Nilov Dmitry,
Feofanov Alexey,
Lys Alexandra,
Kutuzov Mikhail,
Gerasimova Nadezhda,
Studitsky Vasily
-
в журнале Microscopy and Microanalysis, издательство Cambridge University Press (United Kingdom), том 25, № S2, с. 1282-1283
DOI
-
-
2019
Inhibitory Effect of New Semisynthetic Usnic Acid Derivatives on Human Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1
-
Dyrkheeva N.,
Luzina O.,
Filimonov A.,
Zakharova O.,
Ilina E.,
Zakharenko A.,
Kuprushkin M.,
Nilov D.,
Gushchina I.,
Švedas V.,
Salakhutdinov N.,
Lavrik O.
-
в журнале Planta Medica, издательство Georg Thieme Verlag (Germany), том 85, № 2, с. 103-111
DOI
-
-
-
2019
Ингибитор 7-метилгуанин: подавление репарации ДНК, противоопухолевые и токсикологические свойства
-
Нилов Д.К.,
Кирсанов К.И.,
Фетисов Т.И.,
Кургина Т.А.,
Кутузов М.М.,
Малюченко Н.В.,
Герасимова Н.С.,
Швядас В.К.
-
в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 2, с. 243-243
-
-
-
2018
2,5-Diketopiperazines: a new class of poly(ADP-ribose)polymerase Inhibitors
-
Nilov D.K.,
Yashina K.I.,
Gushchina I.V.,
Zakharenko A.L.,
Sukhanova M.V.,
Lavrik O.I.,
Švedas V.K.
-
в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 83, № 2, с. 152-158
DOI
-
-
2018
2,5-Дикетопиперазины: новый класс ингибиторов поли(ADP-рибозо)полимеразы
-
Нилов Д.К.,
Яшина К.И.,
Гущина И.В.,
Захаренко А.Л.,
Суханова М.В.,
Лаврик О.И.,
Швядас В.К.
-
в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 83, № 2, с. 251-258
-
-
2018
7-Methylguanine: a natural DNA repair inhibitor and a promising anticancer compound
-
Nilov D.,
Kirsanov K.,
Antoshina E.,
Maluchenko N.,
Feofanov A.,
Kurgina T.,
Zakharenko A.,
Khodyreva S.,
Gerasimova N.,
Studitsky V.,
Lavrik O.,
Švedas V.
-
в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 8, № Supplement S1, с. 271-272
DOI
-
-
-
-
-
-
-
2016
Inhibition of Poly(ADP-Ribose)Polymerase by Nucleic Acid Metabolite 7-Methylguanine
-
Nilov D.K.,
Tararov V.I.,
Kulikov A.V.,
Zakharenko A.L.,
Gushchina I.V.,
Mikhailov S.N.,
Lavrik O.I.,
Švedas V.K.
-
в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 8, № 2, с. 108-115
-
-
2016
Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors: usnic acid enamines enhance the cytotoxic effect of camptothecin
-
Zakharenko A.,
Luzina O.,
Koval O.,
Nilov D.,
Gushchina I.,
Dyrkheeva N.,
Švedas V.,
Salakhutdinov N.,
Lavrik O.
-
в журнале Journal of Natural Products, издательство American Chemical Society (United States), том 79, № 11, с. 2961-2967
DOI
-
-
-
2016
Ингибирование поли(ADP-рибозо)полимеразы метаболитом нуклеиновых кислот 7-метилгуанином
-
Нилов Д.К.,
Тараров В.И.,
Куликов А.В.,
Захаренко А.Л.,
Гущина И.В.,
Михайлов С.Н.,
Лаврик О.И.,
Швядас В.К.
-
в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 8, № 2, с. 120-128
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2011
Improved procedure of the search for poly(ADP-Ribose) polymerase-1 potential inhibitors with the use of the molecular docking approach
-
Zakharenko A.L.,
Sukhanova M.V.,
Khodyreva S.N.,
Novikov F.N.,
Stroylov V.S.,
Nilov D.K.,
Chilov G.G.,
Svedas V.K.,
Lavrik O.I.
-
в журнале Molecular Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 45, № 3, с. 517-521
-
-
-
-
2011
Усовершенствованная процедура поиска потенциальных ингибиторов поли(АДФ-рибозо)-полимеразы-1 с использованием молекулярного докинга
-
Захаренко А.Л.,
Суханова М.В.,
Ходырева С.Н.,
Новиков Ф.Н.,
Стройлов В.С.,
Нилов Д.К.,
Чилов Г.Г.,
Швядас В.К.,
Лаврик О.И.
-
в журнале Молекулярная биология, том 45, № 3, с. 565-569
-
Доклады на конференциях
-
-
-
-
-
2021
vsFilt: a new tool for structural filtration and virtual screening
(Стендовый)
-
Авторы:
Nilov D.K.,
Gushchina I.V.,
Suplatov D.A.,
Švedas V.K.
-
Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB), Москва, Россия, 30 июля - 2 августа 2021, Skolkovo Insitute of Science and Technology, Moscow, Россия, 30 июля - 2 августа 2021
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2019
Ингибитор 7-метилгуанин: подавление репарации ДНК, противоопухолевые и токсикологические свойства
(Стендовый)
-
Авторы:
Нилов Д.К.,
Кирсанов К.И.,
Фетисов Т.И.,
Кургина Т.А.,
Кутузов М.М.,
Малюченко Н.В.,
Герасимова Н.С.,
Швядас В.К.
-
II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды», Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
-
-
-
-
-
-
-
-
2018
Рациональный дизайн сульфозамещённых противоопухолевых ингибиторов
(Устный)
-
Авторы:
Евтеев С.А.,
Поленова А.М.,
Гущина И.В.,
Нилов Д.К.,
Швядас В.К.
-
IV Междисциплинарный симпозиум по медицинской, органической, биологической химии и фармацевтике МОБИ-ХимФарма2018, Новый Свет, Крым, Россия, 23-26 сентября 2018
-
-
-
2018
7-Methylguanine: a natural DNA repair inhibitor and a promising anticancer compound
(Стендовый)
-
Авторы:
Antoshina E.,
Maluchenko N.,
Nilov D.,
Kirsanov K.,
Feofanov A.,
Kurgina T.,
Zakharenko A.,
Khodyreva S.,
Gerasimova N.,
Studitsky V.,
Lavrik O.,
Švedas V.
-
The 43th FEBS Congress, Прага, Чехия, 7-12 июля 2018
-
-
-
-
2018
ПОИСК СЕЛЕКТИВНЫХ ИНГИБИТОРОВ ФЕРМЕНТОВ ПАТОГЕНОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ БИОИНФОРМАТИКИ И МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ
(Устный)
-
Авторы:
Швядас В.К.,
Суплатов Д.А.,
Нилов Д.К.,
Балдин С.М.,
Гущина И.В.,
Щербакова Т.А.,
Шмальгаузен Е.В.
-
Международный Форум "Биотехнология: состояние и перспективы развития. Науки о жизни" (BIOTECH WORLD 2018), Москва, Гостиный двор, Ильинка, 4, Россия, 23-25 мая 2018
-
-
-
2017
How we do modulate functional properties of enzymes
(Устный)
-
Авторы:
Švedas V.,
Gushchina I.,
Meshalkina L.,
Nilov D.,
Shmalhauzen E.,
Suplatov D.
-
Biocatalysis-2017: Fundamentals & applications. June 25-30, 2017, Moscow Region, Russian Federation., Истра, Россия, 25-30 июля 2017
-
-
-
-
-
Тезисы докладов
-
-
-
-
2020
ИНГИБИТОРЫ ПОЛИ-АДФ-РИБОЗО-ПОЛИМЕРАЗЫ-1 И ИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С НУКЛЕОСОМАМИ
-
Малюченко Н.В.,
Нилов Д.К.,
Кошкина Д.О.,
Лыс А.А.,
Студитский В.М.,
Феофанов А.В.
-
в сборнике Сборник тезисов докладов Шестой Междисциплинарной конференции «Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии», серия МОБИ-ХимФарма, издательство Общество с ограниченной ответственностью Издательство Перо (Москва), том 1, тезисы, с. 68-68
-
-
2019
Ингибитор 7-метилгуанин: подавление репарации ДНК, противоопухолевые и токсикологические свойства
-
Нилов Д.К.,
Кирсанов К.И.,
Фетисов Т.И.,
Кургина Т.А.,
Кутузов М.М.,
Малюченко Н.В.,
Герасимова Н.С.,
Швядас В.К.
-
в сборнике ACTA NATURAE, серия СПЕЦВЫПУСК Научные Труды II Объединенного научного форума (VI Съезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России, IX Российский симпозиум "Белки и пептиды"), место издания Перо Москва, том 2, тезисы, с. 243-243
-
-
-
-
2018
Рациональный дизайн сульфозамещённых противоопухолевых ингибиторов
-
Евтеев С.А.,
Поленова А.М.,
Гущина И.В.,
Нилов Д.К.,
Швядас В.К.
-
в сборнике Сборник тезисов докладов Четвёртого Междисциплинарного Симпозиума по Медицинской, Органической и Биологической Химии и Фармацевтике, серия МОБИ-ХимФарма, издательство Общество с ограниченной ответственностью Издательство Перо (Москва), том 1, тезисы, с. 25
-
редактор
Кудрявцев Константин Викторович
-
-
НИРы
-
-
17 марта 2021 - 31 декабря 2024
Разработка и реализация принципов суперкомпьютерного кодизайна для развития сквозных цифровых технологий и создания высокопроизводительных вычислительных платформ для предсказательного моделирования и применения искусственного интеллекта: от микромира, до живых организмов и Земной системы
-
4.08.Лаборатория параллельных информационных технологий
-
Руководитель:
Швядас В.К.
Ответственные исполнители:
Антонов А.С.,
Кирилин Е.М.
Участники НИР:
Балдин С.М.,
Бычкова В.И.,
Воеводин В.В.,
Волков Е.В.,
Дебольский А.В.,
Добров Б.В.,
Дробот В.В.,
Кирилин Е.М.,
Коннов С.И.,
Копылов К.Е.,
Лукашевич Н.В.,
Лыкосов В.Н.,
Медведев А.И.,
Молокоедов В.С.,
Мортиков Е.В.,
Нилов Д.К.,
Попов С.М.,
Пушкарев С.В.,
Рубцова Ю.В.,
Серов В.А.,
Сидоров И.Ю.,
Смирнов А.В.,
Смирнов В.А.,
Степаненко В.М.,
Стефанов К.С.,
Тихомиров М.М.,
Чернышев Д.И.,
Чернышев Р.В.,
Чухарев Ф.С.,
Шайхисламов Д.И.,
Шоков В.Н.
-
-
-
1 января 2020 - 31 декабря 2023
Методы структурирования трудноформализуемых предметных областей на основе автоматизированного формирования больших графов знаний и онтологий по разнородным потокам текстовых данных
-
4.04.Лаборатория анализа информационных ресурсов
-
Руководитель:
Добров Б.В.
Ответственный исполнитель:
Лукашевич Н.В.
Участники НИР:
Артемова Е.Л.,
Архипенко К.В.,
Балдин С.М.,
Батура Т.В.,
Болдырев И.А.,
Браславский П.И.,
Быстрицкий Д.К.,
Быстрицкий Н.Д.,
Волков Е.В.,
Дробот В.В.,
Иванов В.В.,
Кирилин Е.М.,
Коннов С.И.,
Копылов К.Е.,
Кремнева М.Д.,
Майоров В.Д.,
Макаров-Землянский Н.В.,
Мячина А.В.,
Нилов Д.К.,
Пушкарев С.В.,
Рубцова Ю.В.,
Сидоров А.В.,
Смирнов В.А.,
Тихомиров М.М.,
Тутубалина Е.В.,
Чернышев Д.И.,
Чухарев Ф.С.,
Швядас В.К.,
Шелманов А.О.,
Штернов С.В.
-
-
-
1 января 2019 - 31 декабря 2024
Поиск регуляторов биологических процессов, воздействующих на белки, ферменты, полиферментные комплексы и рецепторные системы
-
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
-
Руководитель:
Швядас В.К.
Ответственный исполнитель:
Муронец В.И.
Участники НИР:
Астахова А.А.,
Балдин С.М.,
Баринова К.В.,
Буник-Фаренвальд В.И.,
Вирясов М.Б.,
Вирясова Г.М.,
Голенкина Е.А.,
Гуранда Д.Ф.,
Дарбинян Т.Г.,
Дробот В.В.,
Калмыков П.В.,
Кирилин Е.М.,
Кочетов Г.А.,
Курочкина Л.П.,
Магретова Н.Н.,
Мельникова А.К.,
Мичурина В.Н.,
Никулин М.В.,
Нилов Д.К.,
Орлов В.Н.,
Панин Н.В.,
Пирожкова Е.Б.,
Позднякова Н.В.,
Поздышев Д.В.,
Севостьянова И.А.,
Семенюк П.И.,
Сергеева М.Г.,
Соловьев В.В.,
Соловьева О.Н.,
Стройлова Ю.Ю.,
Судьина Г.Ф.,
Суплатов Д.А.,
Успенская Т.В.,
Чистяков Д.В.,
Шарапова Я.А.,
Шмальгаузен Е.В.,
Щербакова Т.А.
-
-
-
-
-
-
-
12 ноября 2014 - 1 июля 2015
Разработка комплекса образовательных модулей для подготовки исследователей в области создания инновационных лекарственных препаратов
-
Факультет биоинженерии и биоинформатики
-
Руководитель:
Фенюк Б.А.
Участники НИР:
Богатырева М.Х.,
Головин А.В.,
Зиновкина Л.А.,
Каленикова Е.И.,
Калинина Н.И.,
Миронов А.А.,
Нилов Д.К.,
Северин Ф.Ф.,
Скулачев В.П.,
Ставровская Е.Д.,
Суплатов Д.А.,
Швядас В.К.
-
-
-
-
1 января 2014 - 31 декабря 2018
Центр биомедицинских исследований, Компонент по инфекционным заболеваниям
-
Отдел биокинетики
-
Руководитель:
Швядас В.К.
Участники НИР:
Балдин С.М.,
Кирилин Е.М.,
Мисюра Н.М.,
Муронец В.И.,
Никулин М.В.,
Нилов Д.К.,
Панин Н.В.,
Суплатов Д.А.,
Успенская Т.В.,
Халиуллин И.Г.,
Шаповалова И.В.,
Щербакова Т.А.
-
-
1 января 2013 - 31 декабря 2018
Управление биологическими процессами путем воздействия низкомолекулярными регуляторами на ферменты, полиферментные комплексы, рецепторные системы и другие супрамолекулярные структуры
-
Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
-
Руководитель:
Швядас В.К.
Участники НИР:
Астахова А.А.,
Балдин С.М.,
Буник-Фаренвальд В.И.,
Вирясова Г.М.,
Голенкина Е.А.,
Гуранда Д.Ф.,
Дарбинян Т.Г.,
Дробот В.В.,
Загряжская А.Н.,
Кирилин Е.М.,
Ливенский А.Д.,
Никулин М.В.,
Нилов Д.К.,
Панин Н.В.,
Пирожкова Е.Б.,
Сергеева М.Г.,
Судьина Г.Ф.,
Суплатов Д.А.,
Успенская Т.В.,
Чистяков Д.В.,
Щербакова Т.А.
-
-
7 августа 2012 - 31 декабря 2013
Поиск соединений, изменяющих амилоидогенную трансформацию белков, вызывающих нейродегенеративные заболевания, с помощью методов молекулярного моделирования и экспериментальных подходов
-
Отдел биохимии животной клетки
-
Руководитель:
Стройлова Ю.Ю.
Участники НИР:
Иванов И.А.,
Куравский М.Л.,
Мараховская А.С.,
Моисеева Е.В.,
Нилов Д.К.,
Прохорова Е.А.,
Халиуллин И.Г.,
Яшина К.И.
-
Патенты
-
Награды и премии
-
Членство в научных обществах
-
Руководство диссертациями
-
-
2021
Разработка сульфозамещенных ингибиторов транскетолазы и тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы 1 с использованием методов биоинформатики и молекулярного моделирования
- Кандидатская диссертация по специальности 03.01.08 - Биоинженерия (биол. науки)
- Автор:
Гущина Ирина Владимировна
-
Научные руководители:
Швядас В.К., д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова,
Нилов Д.К., к.х.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
-
Защищена в совете
МГУ.03.04
МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
-
Организация, в которой выполнялась работа:
НИИФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ
-
Оппоненты:
Щербинин Дмитрий Сергеевич,
Ходырева Светлана Николаевна,
Шайтан Константин Вольдемарович
- Объявление о защите
-
Диссертация
-
Руководство дипломными работами
-
Руководство курсовыми работами
-
Авторство учебных курсов