ИСТИНА

Антонов М.Ю.

Соавторы: Шайтан К.В., Левцова О.В., Попинако А.В., Молдогазиева Н.Т., Николаев И.Н., Терешкина К.Б., Кирпичников М.П., Соколова О.С., Шайтан А.К., Kazimirsky A.N., Науменкова Т.В., Николаев И.Н., Турлей Е.В. показать полностью..., Mordvintsev D.Y., Боздаганян М.Е., Виноградова И.К., Оршанский И.А., Чемерис А.С., Kitaev A.S., Utkin Y.N., Акимов М.П., Диброва Д.В., Ефремов Р.Г., Касимова М.А., Николаев И.Н., Новоселецкий В.Н., Орехов Ф.С., Терентьев А.А., Терешкин Э.В.

22 статьи, 1 книга, 3 доклада на конференциях, 3 тезисов докладов, 3 НИР, 2 свидетельства о регистрации прав на ПО, 1 диссертация

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 30, Scopus: 45

IstinaResearcherID (IRID): 3175457

Деятельность

• Статьи в журналах

  • 
    • 2018 Analysis of the interactions between GMF and Arp2/3 complex in two binding sites by molecular dynamics simulation
    • Popinako A., Antonov M., Dibrova D., Chemeris A., Sokolova O.S.
    • в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 496, № 2, с. 529-535 DOI
  • • 2018 Comparative analysis of serotonin 5-HT receptors from X-RAY, EM, MD
    • Popinako A.V., Antonov M.Yu, Sokolova O.S., Shaitan K.V.
    • в журнале Journal of Bioenergetics and Biomembranes, издательство Springer/Plenum Publishers (New York, USA), том 50, № 6 DOI
  • 
    • 2017 Analysis of the Interactions between Arp2/3 Complex and an Inhibitor Arpin by Molecular Dynamics Simulation
    • Popinako A.V., Antonov M.Yu, Chemeris A.S., Shaitan K.V., Sokolova O.S.
    • в журнале Biophysics, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 62, № 6, с. 885-891 DOI
  • 
    • 2014 Оценка профилей потенциала средней силы методом Umbrella sampling для трансмембранного переноса воды
    • Антонов М.Ю., Науменкова Т.В., Попинако А.В., Николаев И.Н., Шайтан К.В.
    • в журнале Математические заметки СВФУ, том 21, № 3, с. 96-106
  • 
    • 2012 Correlation between Biological Activity and Conformational Dynamics Properties of Tetra- and Pentapeptides Derived from Fetoplacental Proteins
    • Moldogazieva N.T., Terentiev A.A., Antonov M.Yu, Kazimirsky A.N., Shaitan K.V.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 77, № 5, с. 469-484
  • 
    • 2012 ВЛИЯНИЕ АМИНОКИCЛОТНОЙ ЗАМЕНЫ ПPО11-АЛА11 НА CТPУКТУPНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ CВОЙCТВА АНТИМИКPОБНОГО ПЕПТИДА БУФОPИНА-2
    • Науменкова Т.В., Антонов М.Ю., Николаев И.Н., Шайтан К.В.
    • в журнале Биофизика, издательство Наука (М.), том 57, № 6, с. 988-999
  • 
    • 2011 Influence of intramolecular interactions on conformational and dynamic properties of analogs of heptapeptide AFP(14-20)
    • Moldogazieva N.T., Shaitan K.V., Antonov M.Yu, Vinogradova I.K., Terentiev A.A.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 76, № 12, с. 1321-1336 DOI
  • 
    • 2011 Structural features of serotonin 5-HT3 receptors in native and modified forms
    • Popinako A., Antonov M., Shaitan K.
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 278, № S1, с. 127-127
  • 
    • 2011 ВЛИЯНИЕ ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ НА КОНФОРМАЦИОННО-ДИНАМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА АНАЛОГОВ ГЕПТАПЕПТИДА АФП14–20
    • Молдогазиева Н.Т., Шайтан К.В., Антонов М.Ю., Виноградова И.К., Терентьев А.А.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 76, № 12, с. 1640-1658
  • 
    • 2011 Метод молекулярной динамики в исследовании свойств биологических объектов
    • Шайтан К.В., Антонов М.Ю., Шайтан А.К., Новоселецкий В.Н., Боздаганян М.Е., Касимова М.А.
    • в журнале Наноструктуры. Математическая физика и моделирование, том 6, № 1/2, с. 61-75
  • 
    • 2011 Структурная и динамическая модель серотонинового 5-НТ3 рецептора человека. Сравнительный анализ структуры канальной части пентамерных лиганд-зависимых ионных каналов
    • Попинако А.В., Левцова О.В., Антонов М.Ю., Николаев И.Н., Шайтан К.В.
    • в журнале Биофизика, издательство Наука (М.), том 56, № 6, с. 1111-1116
  • 
    • 2009 Comparative study of molecular dynamics, diffusion, and permeability for ligands in biomembranes of different lipid composition
    • Levtsova O.V., Antonov M.Yu, Mordvintsev D.Yu, Utkin Yu N., Shaitan K.V., Kirpichnikov M.P.
    • в журнале Computational Biology and Chemistry, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom), том 33, с. 29-32
  • 
    • 2009 Steered molecular dynamics simulations of cobra cytotoxin interaction with zwitterionic lipid bilayer: no penetration of loop tips into membranes
    • Levtsova O.V., Antonov M.Yu, Mordvintsev D.Yu, Utkin Yu N., Shaitan K.V., Kirpichnikov M.P.
    • в журнале Computational Biology and Chemistry, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom), том 33, № 1, с. 29-32
  • 
    • 2009 Молекулярная динамика зервамицина II и его аналогов в воде и метаноле
    • Левцова О.В., Антонов М.Ю., Шайтан А.К., Оршанский И.А., Николаев И.Н., Шайтан К.В.
    • в журнале Биофизика, издательство Наука (М.), том 54, № 4, с. 616-621
  • 
    • 2008 Comparative study of molecular dynamics, diffusion, and permeability for ligands in biomembranes of different lipid composition
    • Shaitan K.V., Antonov M.Yu, Tourleigh Ye V., Levtsova O.V., Tereshkina K.B., Nikolaev I.N., Kirpichnikov M.P.
    • в журнале Biohemistry (Moscow) Supplement Series A: Membrane and Cell Biology, том 2, № 1, с. 73-81 DOI
  • • 2008 Conformational transitions in the nootropic peptide semacs (MEHFPGP) and its N-terminal modifications
    • Shaitan K.V., Tereshkina K.B., Kitaev A.S., Tereshkin E.B., Levtsova O.V., Antonov M.Yu, Akimov M.P., Nikolaev I.N.
    • в журнале Biophysics, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 53, № 2, с. 121-124
  • 
    • 2008 Молекулярная динамика олигопептидов 7. Сравнительное изучение взаимовлияния аминокислотных остатков в дипептидных структурах
    • Шайтан К.В., Левцова О.В., Терёшкина К.Б., Оршанский И.А., Антонов М.Ю., Акимов М.П., Николаев И.Н.
    • в журнале Биофизика, издательство Наука (М.), том 53, № 4, с. 550-555
  • 
    • 2008 Сравнительное изучение молекулярной динамики, диффузии и проницаемости по отношению к лигандам для биомембран с различным липидным составом
    • Шайтан К.В., Антонов М.Ю., Турлей Е.В., Левцова О.В., Терёшкина К.Б., Николаев И.Н., Кирпичников М.П.
    • в журнале Биологические мембраны, издательство Наука (М.), том 25, № 1, с. 75-83
  • 
    • 2007 Conformational dynamics of human alpha-fetoprotein-derived heptapeptide LDSYQCT analogs
    • Moldogazieva N.T., Terentiev A.A., Kazimirsky A.N., Antonov M.Yu, Shaitan K.V.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 72, № 5, с. 529-539 DOI
  • • 2007 Конформационная динамика аналогов гептапептида LDSYQCT – фрагмента альфа-фетопротеина человека
    • Молдогазиева Н.Т., Терентьев А.А., Казимирский А.Н., Антонов М.Ю., Шайтан К.В.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 72, № 5, с. 655-667

• Статьи в сборниках

  • • 2012 Использование параллельных вычислений для решения задач молекулярного моделирования. Глава 2
    • Антонов М.Ю., Шайтан А.К., Боздаганян М.Е., Орехов Ф.С., Шайтан К.В.
    • в сборнике ТРУДЫ МЕЖДУНАРОДНЫХ КОНФЕРЕНЦИЙ ПО МАТЕМАТИЧЕСКОМУ МОДЕЛИРОВАНИЮ, место издания ООО «ИЗДАТЕЛЬСТВО СФЕРА» Якутск, с. 263-278
  • 
    • 2009 Глава 14. Молекулярная динамика и диффузия в биомембранах с различным липидным составом
    • Шайтан К.В., Антонов М.Ю., Турлей Е.В., Левцова О.В., Терешкина К.Б., Николаев И.Н.
    • в сборнике “Методы компьютерного моделирования для исследования полимеров и биополимеров”. Отв. ред. Иванов В.А., Рабинович А.Л., Хохлов А.Р. 696 с, цв. вкл, место издания Книжный дом «ЛИБРОКОМ» Москва, с. 491-503

• Книги

  • • 2012 Молекулярное моделирование
    • Шайтан А.К., Николаев И.Н., Антонов М.Ю., Ефремов Р.Г., Шайтан К.В.
    • место издания Издательский дом СВФУ Якутск, ISBN 978-5-7513-1738-6, 64 с.

• Доклады на конференциях

  • • 2018 Comparative analysis of serotonin 5-HT receptors from X-RAY, EM, MD (Стендовый)
    • Авторы: Popinako A.V., Shaitan K.V., Sokolova O.S., Antonov M.Yu
    • Biomembranes 2018. International conference. October 1-5, 2018, Dolgoprudny, Московский физико-технический институт (гос. университет), Долгопрудный, Россия, 1-5 октября 2018
  • • 2014 Common Mechanisms of Selectivity in Eukaryotic Cation Channels (Стендовый)
    • Авторы: Popinako A.V., Antonov M.Yu, Sokolova O.S.
    • International Workshop "Biomembranes 2014". Dolgoprudny September 29 - October 3, Dolgoprudny, Moscow region, Россия, 2014
  • • 2014 Umbrella sampling analysis of transmembrane transport of water molecules (Стендовый)
    • Авторы: Antonov M.Yu, Naumenkova T.V., Popinako A.V., Shaitan K.V.
    • International Workshop “Structure and Functions of Biomembranes”, Dolgoprudny, 2014

• Тезисы докладов

  • • 2018 Comparative analysis of serotonin 5-HT receptors from X-RAY, EM, MD
    • Popinako A.V., Antonov M.Yu, Sokolova O.S., Shaitan K.V.
    • в сборнике Journal of Bioenergetics and Biomembranes, тезисы DOI
  • 
    • 2014 Umbrella sampling analysis of transmembrane transport of water molecules
    • Antonov M.Yu, Naumenkova T.V., Popinako A.V., Shaitan K.V.
    • в сборнике International Workshop “Structure and Functions of Biomembranes”, серия ISBN 978-5-7417-0506-3, место издания MIPT Dolgoprudny, тезисы, с. 72-73
  • • 2011 Молекулярное моделирование комплекса серотонинового 5-НТ3 рецептора с серотонином
    • Попинако А.В., Антонов М.Ю., Шайтан К.В.
    • в сборнике Сборник статей. Международная конференция «Рецепторы и внутриклеточная сигнализация», Пущино, Россия, 24-26 мая 2011, место издания Пущино, том 1, тезисы, с. 710-714

• НИРы

  • • 1 ноября 2010 - 15 ноября 2012 Разработка методов исследования структуры и функций потенциал-зависимых ионных каналов, включая кодируемые 18 хромосомой человека
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Кирпичников М.П. Участники НИР: Антонов М.Ю., Багров Д.В., Боздаганян М.Е., Браже А.Р., Волох О.И., Глухов Г.С., Ефремов Ю.М., Карлова М.Г., Касимова М.А., Левцова О.В., Малюченко Н.В., Маслакова А.А., Новоселецкий В.Н., Орехов Ф.С., Оршанский И.А., Печникова Е.В., Пищальникова А.В., Полевова С.В., Попинако А.В., Соколова О.С., Станишнева-Коновалова Т.Б., Трифонова Е.С., Шайтан А.К., Шайтан К.В.
  • • 1 февраля 2010 - 15 декабря 2012 Исследование динамики ассиметричных мембран со сложным липидным составов и их взаимодействия с биологически активными молекулами методами молекулярной динамики на разных уровнях детализации с использованием молекулярного гидрофобного потенциала
    • Биологический факультет
    • Руководитель: Левцова О.В. Участники НИР: Антонов М.Ю., Науменкова Т.В., Соколова О.С., озеров И.В.
  • • 18 ноября 2009 - 15 сентября 2011 Распределенные вычислительные системы для решения задач молекулярной биоинженерии
    • Биологический факультет МГУ имени М.В.Ломоносова
    • Руководитель: Шайтан К.В. Участники НИР: Антонов М.Ю., Балабаев Н.К., Боздаганян М.Е., Волох О.И., Касимова М.А., Левцова О.В., Новоселецкий В.Н., Орехов Ф.С., Оршанский И.А., Попинако А.В., Соколова О.С., Станишнева-Коновалова Т.Б., Турлей Е.В., Шайтан А.К.

• Свидетельства о регистрации прав на программное обеспечение

  • • 2006 PUMA-GUI программа для организации графического интерфейса для работы с программой PUMA-B (тип не указан)
    • Авторы: Антонов М.Ю., Балабаев Н.К., Шайтан К.В.
    • #2006613517 , 15 мая
  • • 2006 PUMA-B (ПУМА-Б) - программа для моделирования молекулярной динамики макромолекул и их комплексов в растворе// Свидетельство об официальной регистрации программ для ЭВМ (тип не указан)
    • Авторы: Антонов М.Ю., Балабаев Н.К., Шайтан К.В.
    • #2006613516 , 15 мая

• Диссертация

  • • 2008 СРАВНИТЕЛЬНОЕ ИЗУЧЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ И ПРОНИЦАЕМОСТИ МЕМБРАННЫХ СТРУКТУР
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.02 - Биофизика (биол. науки)
    • Автор: Антонов Михаил Юрьевич
    • Научный руководитель: Шайтан К.В., д.ф.-м.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете Д 501.001.96 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
    • Организация, в которой выполнялась работа: МГУ имени М.В. Ломоносова