ИСТИНА

Djebali S.

Соавторы: Первушин Д.Д., Davis C.A., Dobin A., Gingeras T.R., Breschi A., Graveley B., Guigo R., Guigó R., Lagarde J., Sloan C., Adams L., Alexander R., Alver B. показать полностью..., Amrhein H., Antoshechkin I., Ardlie K., Auerbach R., Bansal M., Bates D., Beal K., Beer M.A., Bell K., Bender М., Bickel P., Blobel G., Boeck M., Boley N., Booth B., Boyle A., Brenner S., Brown J., Bussotti G., Byron R., Calvo M., Canfield T., Cao X., Cayting P., Celniker S., Chang C.F., Cheng C., Cheng Y., Cherbas L., Cherbas P., Cline M., Davis R.C., De Bruijn M., DeLuca, DeSalvo G., Denas O., Dermitzakis E.T., Di_C D.A., Diegel M., Disteche C., Dogan N., Drenkow J., Drenkow J., Duff M., Dunn D.R., Edsall L., Eichler E., Erickson D., Euskirchen G., Ewing B., Fang G., Fastuca M., Fastuca M., Feingold E., Feingold E., Ferreira P., Fisher-Aylor K., Flicek P., Frankish A., GTEx C., Gao G., Garrido-Martín D., Gerstein M., Getz G., Gilbert D., Gillis J., Giste E., Goldmann J., Good P., Good P., Gosh S., Groudine M., Hammonds A., Hansen R., Hardison R., Harmanci A., Harrow J., Haugen E., Herrero J.L., Hillier L., Hoskins R., Howald C., Hu M.L., Huang T.H., Hubbard T., Humbert R., Huynh C., Irizarry R., Jain D., Jansen C., Jesse G., Jha S.W., Johnson R., Josefowicz S., Kahveci T., Kasper D., Kaufman, Kawli T., Keller C., Kellis M., Kent W., Kirilusha A., Kirkup V., Kitchen R., Kuan S., Kundaje A., Kutyavin T., Lacerda d.B., Ladewig E., Lai E., Lappalainen T., Learned K., Lee D., Leng M.J., Levasseur D., Li S., Lian J., Lin S., Lin Y., Love M., Lowdon R., Lu, Ma Z., MacCoss M., Malladi V., Marinov G., Mason C., May G., McCleary D., McWhirter R., Melé M., Merrihew G., Mishra T., Monlong J., Morrissey C., Mortazavi A., Mortazavi A., Murad R., Neph S., Neri F., Niarchou A., Notredame C., Oliver B., Olson S., Olsson S., Orkin S., Papayannopoulou T., Park P.K., Pazin M., Pazin M., Pei B., Perrimon N., Pham K.L., Pignatelli M., Pope B., Prieto P., Ramalho S.M., Rasmussen M., Reh T., Reinke V., Ren B., Reverter F., Reymond A., Robinson G., Rosenbloom K., Rozowsky J., Rudensky A.Y., Ryba T., Rynes E., Sammeth M., Samstein R., Sandstrom R., Saunders G., Scavelli A., Schlesinger F., See L.C., Segrè A., Selleri L., Sethi A., Shen Y., Sisu C., Skoultchi A., Slack F., Snyder M., Stamatoyannopoulos J., Stoiber M., Strasbourger P., Sullivan T., Tanzer A., Tanzer A., Taylor J., Teng M., Thompson O., Thurman R., Treuting P., Trout D., Vierstra J., Vlasova A., Vong S., Wan K., Wang G., Wang H., Wang S., Wang T.C., Waterston R., Watkins K., Wei X., Weiss M., Weissman S., Wen C.K., Wen J., Wilken M., Williams D., Wold B., Wright P., Wucher V., Xue C., Yan K., Yang L., Ye Z., Yip K., Young T., Yue F., Zaleski C., Zaleski C., Zhan L., Zhang Y., Zheng H., Zhong S., Zhou X.Y., Сабо П., Шафер М.А.

6 статей, 1 доклад на конференции

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 1650, Scopus: 1594

IstinaResearcherID (IRID): 11486363

Деятельность

• Статьи в журналах

  • 
    • 2020 A limited set of transcriptional programs define major cell types
    • Breschi Alessandra, Muñoz-Aguirre Manuel, Wucher Valentin, Davis Carrie A., Garrido-Martín Diego, Djebali Sarah, Gillis Jesse, Pervouchine Dmitri D., Vlasova Anna, Dobin Alexander, Zaleski Chris, Drenkow Jorg, Danyko Cassidy, Scavelli Alexandra, Reverter Ferran, Snyder Michael P., Gingeras Thomas R., Guigó Roderic
    • в журнале Genome Research, издательство Cold Spring Harbor Laboratory Press (United States), том 30, № 7, с. 1047-1059 DOI
  • 
    • 2016 A benchmark for RNA-seq quantification pipelines
    • Teng M., Love MI, Davis CA, Djebali S., Dobin A., Graveley BR, Li S., Mason CE, Olson S., Pervouchine D., Sloan CA, Wei X., Zhan L., Irizarry RA
    • в журнале Genome Biology, издательство BioMed Central (London), том 17, № 1, с. 74 DOI
  • 
    • 2016 Gene-specific patterns of expression variation across organs and species
    • Breschi A., Djebali S., Gillis J., Pervouchine DD, Dobin A., Davis CA, Gingeras TR, Guigo R.
    • в журнале Genome Biology, издательство BioMed Central (London), том 17, № 1, с. 151 DOI
  • 
    • 2015 Human genomics. The human transcriptome across tissues and individuals
    • Melé M., Ferreira PG, Reverter F., DeLuca DS, Monlong J., Sammeth M., Young TR, Goldmann JM, Pervouchine DD, Sullivan TJ, Johnson R., Segrè AV, Djebali S., Niarchou A., GTEx Consortium, Wright FA, Lappalainen T., Calvo M., Getz G., Dermitzakis ET, Ardlie KG, Guigó R.
    • в журнале Science, издательство American Association for the Advancement of Science (United States), том 348, № 6235, с. 660-5 DOI
  • 
    • 2014 A comparative encyclopedia of DNA elements in the mouse genome" Nature
    • Yue F., Cheng Y., Breschi A., Vierstra J., Wu W., Ryba T., Sandstrom R., Ma Z., Davis C., Pope BD, Shen Y., Pervouchine DD, Djebali S., Thurman RE, Kaul R., Rynes E., Kirilusha A., Marinov GK, Williams BA, Trout D., Amrhein H., Fisher-Aylor K., Antoshechkin I., DeSalvo G., See LH, Fastuca M., Drenkow J., Zaleski C., Dobin A., Prieto P., Lagarde J., Bussotti G., Tanzer A., Denas O., Li K., Bender MA, Zhang M., Byron R., Groudine MT, McCleary D., Pham L., Ye Z., Kuan S., Edsall L., Wu YC, Rasmussen MD, Bansal MS, Kellis M., Keller CA, Morrissey CS, Mishra T., Jain D., Dogan N., Harris RS, Cayting P., Kawli T., Boyle AP, Euskirchen G., Kundaje A., Lin S., Lin Y., Jansen C., Malladi VS, Cline MS, Erickson DT, Kirkup VM, Learned K., Sloan CA, Rosenbloom KR, Lacerda de_Sousa B., Beal K., Pignatelli M., Flicek P., Lian J., Kahveci T., Lee D., Kent WJ, Ramalho Santos M., Herrero J., Notredame C., Johnson A., Vong S., Lee K., Bates D., Neri F., Diegel M., Canfield T., Sabo PJ, Wilken MS, Reh TA, Giste E., Shafer A., Kutyavin T., Haugen E., Dunn D.Reynolds AP, Neph S., Humbert R., Hansen RS, De Bruijn M., Selleri L., Rudensky A., Josefowicz S., Samstein R., Eichler EE, Orkin SH, Levasseur D., Papayannopoulou T., Chang KH, Skoultchi A., Gosh S., Disteche C., Treuting P., Wang Y., Weiss MJ, Blobel GA, Cao X., Zhong S., Wang T., Good PJ, Lowdon RF, Adams LB, Zhou XQ, Pazin MJ, Feingold EA, Wold B., Taylor J., Mortazavi A., Weissman SM, Stamatoyannopoulos JA, Snyder MP, Guigo R., Gingeras TR, Gilbert DM, Hardison RC, Beer MA, Ren B.
    • в журнале Nature, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 515, № 7527, с. 355-64 DOI
  • 
    • 2014 Comparative analysis of the transcriptome across distant species" Nature
    • Gerstein MB, Rozowsky J., Yan KK, Wang D., Cheng C., Brown JB, Davis CA, Hillier L., Sisu C., Li JJ, Pei B., Harmanci AO, Duff MO, Djebali S., Alexander RP, Alver BH, Auerbach R., Bell K., Bickel PJ, Boeck ME, Boley NP, Booth BW, Cherbas L., Cherbas P., Di_C Dobin A., Drenkow J., Ewing B., Fang G., Fastuca M., Feingold EA, Frankish A., Gao G., Good PJ, Guigó R., Hammonds A., Harrow J., Hoskins RA, Howald C., Hu L., Huang H., Hubbard TJ, Huynh C., Jha S., Kasper D., Kato M., Kaufman TC, Kitchen RR, Ladewig E., Lagarde J., Lai E., Leng J., Lu Z., MacCoss M., May G., McWhirter R., Merrihew G., Miller DM, Mortazavi A., Murad R., Oliver B., Olson S., Park PJ, Pazin MJ, Perrimon N., Pervouchine D., Reinke V., Reymond A., Robinson G., Samsonova A., Saunders GI, Schlesinger F., Sethi A., Slack FJ, Spencer WC, Stoiber MH, Strasbourger P., Tanzer A., Thompson OA, Wan KH, Wang G., Wang H., Watkins KL, Wen J., Wen K., Xue C., Yang L., Yip K., Zaleski C., Zhang Y., Zheng H., Brenner SE, Graveley BR, Celniker SE, Gingeras TR, Waterston R.
    • в журнале Nature, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 512, № 7515, с. 445-8 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2015 Reconstructing the transcriptional profile of a tissue from the transcriptional profiles of primary cells (Стендовый)
    • Авторы: Pervouchine DD, Breschi A., Djebali S., Gingeras TR, Dobin A., Lagarde J., Guigó R., Davis CA
    • Cold Spring Harbor annual ENCODE meeting, Cold Spring HArbor, США, 7-11 марта 2015