ИСТИНА

Основной задачей второго этапа выполнения данного проекта является расчет параметров взаимодействия системы хромофоров с белковым окружением. На основании проведенных, на предыдущем этапе квантово-химических расчетов волновых функций системы хромофоров и результатов молекулярно-механического моделирования белкового окружения возможно рассчитывать так называемые спектральные функции взаимодействия система-термостат, что позволяет учитывать диссипативную составляющую динамики. Проведение данных расчетов является необходимым условием неэмпирического моделирования диссипативной динамики, т.к. параметры модели не могут быть измерены экспериментально, а в работах в которых использовались подходы на основе схожих теорий (например теории Редфилда) спектральные функции были параметризованы с целью лучшего воспроизведения результата, что лишает их предсказательной силы. Другим важным фактом, который нужно учитывать является то, что допущения, на которых основана теория, являются умозрительными, и, несмотря на всю логичность их формулировок, могут быть применимы лишь в ограниченной области параметров. Поэтому следующим шагом после расчета спектральных функций была проверка используемых нами допущений в области параметров, соответствующей реальным процессам первичного переноса электрона в реакционных центрах фотосинтетических бактерий. Так ранее нами было показано, что Марковское приближение в таких реакциях не выполняется [1], а состояния термостата можно считать довольно стабильными[2]. В ходе выполнения проекта нами были рассчитаны параметры диссипативной динамики переноса электрона в реакционных центрах пурпурных бактерий и сделаны выводы применимости (или неприменимости) отдельных приближений теории. На основании данных результатов сформулированы уравнения для расчета динамики процессов переноса, которые будут использованы на третьем году выполнения проекта.