ИСТИНА

Для митохондриальных геномов 24 видов мхов с помощью новой разработанной программы NPG-explorer (NPGe) построен нуклеотидный пангеномом – совокупность блоков последовательностей, представляющих из себя выравнивания ортологичных фрагментов геномов. При построении митохондриального пангенома мхов использован порог по степени сходства равный 65% консервативных позиций внутри ортологичного блока и минимальная длина блока равная 50 п.н. В результате выявлено 232 стабильных блока, которые составляют в среднем 45% от длины митохондриального генома. В объединенном выравнивании стабильных блоков 82% позиций консервативны. Филогенетическое дерево, построенного программой NPGe, хорошо соответствует другим филогенетическим реконструкциям. Программой NPGe идентифицировано 30 блоков с повторами длиной не менее 50 п.н. Максимальная длина блока с повторами равна 140 п.н. Дупликации в митохондриальных геномах мхов редки. В среднем, на геном приходится около 500 п.н. в крупных дупликациях. Определена суммарная длина вставок и делеций в каждом геноме. Процессы потери и приобретения участков ДНК в митохондриальных геномах мхов достаточно активны, и такие перестройки, очевидно, могут быть использованы как дополнительные маркеры при реконструкции филогении.