Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 3 февраля 2015 г.
Аннотация:Более 40% генов человека содержат в 5'-нетранслируемых областях (5'-НТО) короткие открытые рамки считывания (кОРС), уменьшающие эффективность трансляции основного белка, и, кроме того, экспрессируют хотя бы одну укороченную изоформу мРНК, не содержащую кОРС. Мы исследовали регуляцию трансляции мРНК гена SLAMF1. Данный ген кодирует мембранный белок CD150 – член CD2 суперсемейства, костимуляторный рецептор лимфоцитов, рецептор вируса кори и микробный сенсор макрофагов. Транскрипты гена SLAMF1 представлены как минимум двумя изоформами, отличающимися 5'_НТО. В длинной изоформе мРНК SLAMF1, содержащей в 5'-НТО четыре кОРС, стоп-кодон кОРС4 перекрывается с AUG-кодоном основной рамки, образуя потенциальный сайт терминации-реинициации UGAUG, а между стартами кОРС2 и кОРС3 находится последовательность, идентичная т.н. «мотиву 1» из последовательности TURBS. Эта последовательность присутствует в полицистронных РНК некоторых вирусов и необходима для реализации механизма сопряженной терминации-реинициации при их трансляции. В модельной клеточной системе репортерная мРНК на основе 5'-НТО короткой изоформы мРНК SLAMF1, не содержащей кОРС, транслируется в 5–6 раз эффективнее, чем мРНК с 5'-НТО длинной изоформы. Нуклеотидные замены, разрушающие старт-кодоны кОРС2-4, существенно повышают эффективность трансляции репортерной РНК, в то время как замена двух нуклеотидов в составе «мотива 1» TURBS снижает ее вдвое. Эти данные позволяют предположить, что TURBS-подобные элементы могут быть задействованы в регуляции трансляции некоторых клеточных мРНК, содержащих кОРС.