|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
ВЗАИМОСВЯЗЬ ДНРНК – PART1 И МИКРОРНК ПРИ РАКЕ ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫтезисы доклада
- Авторы: Тимофеева С.В., Филиппова С.Ю., Мезенцев С.С., Новикова И.А., Кит О.И.
- Сборник: III международная конференция ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ТЕХНОЛОГИИ В ТРАНСЛЯЦИОННОЙ БИОМЕДИЦИНЕ 3–5 июня 2025 г. г. Томск
- Тезисы
- Год издания: 2025
- Место издания: Сибирский Государственный Медицинский Университет
- Первая страница: 52
- Последняя страница: 52
- Аннотация: Введение. Рак предстательной железы является одной из наиболее распространенныхформ рака среди мужчин, и его патогенез связан с комплексным взаимодействиемгенетических и эпигенетических факторов. В последние годы внимание исследователейпривлекли длинные некодирующие РНК (днРНК) [1], которые играют важную роль врегуляции экспрессии генов. Одной из таких молекул является днРНК–PART1, которая,согласно предварительным данным, может влиять на регуляцию микроРНК.Целью нашего исследования был биоинформатический поиск взаимодействия днРНК–PART1 и микроРНК при раке предстательной железы.Материалы и методы. Для анализа использовали данные из открытых баз данных TheCancer Genome Atlas (TCGA) и Gene Expression Omnibus (GEO). Комплексный поисквзаимодействия днРНК–PART1 и микроРНК при раке предстательной железы был проведен спомощью алгоритма LncRRIsearch. LncRRIsearch включает в себя множество анализовлокальных взаимодействий оснований, предсказанных Riblast для каждой днРНК. Основнымкритериеми, используемым для определения наиболее вероятных взаимодействий междумРНК и днРНК, является минимальная свободная энергия (KCAL/MOL). Далеепроанализировали взаимодействия днРНК с транскриптом PART1 (ENSG00000152931),используя базу данных LNCRNASNP2-HUMAN, и определили связанные с ними микроРНКпри RPM>=1 (т.е. микроРНК с высокой экспрессий).Результаты. Для транскрипта PART1 (ENSG00000152931) идентифицировали дведнРНК, которые продемонстрировали наибольшую вероятность взаимодействия: RPGR(ENSG00000156313), SNX8 (ENSG00000106266) и MLYCD (ENSG00000103150). Далеепровели поиск микроРНК с высокой экспрессией в регионах выше упомянутых днРНК иустановили, что при условии RPM>=1, RPGR связан с 51 микроРНК, SNX8 – с 42 микроРНК,MLYCD – с 73 микроРНК, и в то же время PART1 взаимодействует с 124 микроРНК.Заключение. Получены данные для функциональных карт, которые могут быть полезныдля поиска биомаркеров для ранней диагностики рака предстательной железы.Ключевые слова. Рак предстательной железы, длинные некодирующие РНК,микроРНК, днРНК– PART1.1. Timofeeva, S. V. Polymorphism rs2383207 of CDKN2B-AS and Susceptibility toAtherosclerosis: A Mini Review / S. V. Timofeeva, T. A. Sherchkova, T. P. Shkurat // Non-CodingRNA. – 2022. – Vol. 8, No. 6. – DOI 10.3390/ncrna8060078. – EDN XHCKSZ.
- Добавил в систему: Тимофеева Софья Владимировна