A Complex Distribution of Elongation Family GTPases EF1A and EFL in Basal Alveolate Lineagesстатья

Статья опубликована в высокорейтинговом журнале

Информация о цитировании статьи получена из Scopus, Web of Science
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 30 апреля 2017 г.

Работа с статьей

Прикрепленные файлы


Имя Описание Имя файла Размер Добавлен
1. Полный текст PDF EF1A-EFL-GBE-2014.pdf 1,5 МБ 24 октября 2014 [VV_Aleoshin]
2. Supplementary Data EF1A-EFL-GBE-2014-suppl.pdf 561,7 КБ 24 октября 2014 [VV_Aleoshin]

[1] A complex distribution of elongation family gtpases ef1a and efl in basal alveolate lineages / K. V. Mikhailov, J. Janouškovec, D. V. Tikhonenkov et al. // Genome biology and evolution. — 2014. — Vol. 6, no. 9. — P. 2361–2367. Translation elongation factor-1 alpha (EF1A) and the related GTPase EF-like (EFL) are two proteins with a complex mutually exclusive distribution across the tree of eukaryotes. Recent surveys revealed that the distribution of the two GTPases in even closely related taxa is frequently at odds with their phylogenetic relationships. Here, we investigate the distribution of EF1A and EFL in the alveolate supergroup. Alveolates comprise three major lineages: ciliates and apicomplexans encode EF1A, whereas dinoflagellates encode EFL. We searched transcriptome databases for seven early-diverging alveolate taxa that do not belong to any of these groups: colpodellids, chromerids, and colponemids. Current data suggest all seven are expected to encode EF1A, but we find three genera encode EFL: Colpodella, Voromonas, and the photosynthetic Chromera. Comparing this distribution with the phylogeny of alveolates suggests that EF1A and EFL evolution in alveolates cannot be explained by a simple horizontal gene transfer event or lineage sorting. [ DOI ]

Публикация в формате сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл скрыть