|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Alphacoronaviruses from bats captured in European Russia in 2015 and 2021 are closely related to those of Northern Europeстатья Исследовательская статья
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 10 июля 2024 г.
- Авторы: Korneenko E.V., Samoilov A.E., Chudinov I.K., Butenko I.O., Sonets I.V., Artyushin I.V., Yusefovich A.P., Kruskop S.V., Sinitsyn S.O., Klyuchnikova E.O., Gladkikh A.S., Dedkov V.G., Safonova M.V., Daszak P., Speranskaya A.S.
- Журнал: Frontiers in Ecology and Evolution
- Том: 12
- Год издания: 2024
- Издательство: Frontiers Media S.A.
- Местоположение издательства: Lausanne, Switzerland
- Первая страница: 1
- Последняя страница: 15
- Номер статьи: 1324605
- DOI: 10.3389/fevo.2024.1324605
- Аннотация: Летучие мыши считаются естественными резервуарами нескольких вирусов, включая коронавирусы (CoV), два рода которых, альфа- и бета-коронавирусы, заражают человека. Несмотря на широкомасштабный скрининг образцов летучих мышей на наличие новых вирусов, информация о разнообразии коронавирусов у летучих мышей, населяющих территорию России, остается скудной. Здесь мы проанализировали наличие и разнообразие альфакоронавирусов (Alpha-CoV) у летучих мышей европейской части России. Для исследования было взято 43 пробы помёта от рукокрылых 8 видов: P. nathusii, P. kuhlii, M. brandtii, M. daubentonii, N. noctula, V. murinus, M. dasycneme и P. auritus. Мы обнаружили фрагменты гена Alpha-CoV RdRp в 30% исследованных образцов у 75% отобранных видов. Филогенетический анализ RdRp показал, что большинство идентифицированных последовательностей Alpha-CoV относятся к кладам подрода Pedacovirus с небольшими кластерами никтоковирусов или миотаковирусов. Мы утверждаем, что близкородственные педаковирусы уже давно (с 2015 по 2021 гг.) циркулируют в обширном регионе от европейской части России до Северной Европы. Мы предполагаем, что близкородственные педаковирусы, собранные из общих территорий, представляют собой отдельный вид, который мы назвали коронавирусом NE-Alpha, хозяином которого являются летучие мыши рода Pipistrellus, населяющие регион от европейской части России до Северной Европы. Среди отобранных животных 4,6% были носителями двух альфа-коронавирусов, относящихся к разным подродам (педаковирус/миотаковирус или педаковирус/никтаковирус) одновременно. Мы подтвердили наличие двух разных подродов Alpha-CoV, родственных педаковирусу и никтаковирусу, у P. kuhlii, пойманного в 2021 году и содержавшегося в неволе, с помощью полногеномного секвенирования этих вирусов. Наличие двух или более коронавирусов у одного отдельного животного-хозяина является важной предпосылкой для возникновения рекомбинации. Мы также получили два полных генома Alpha-CoV из двух экземпляров P. nathusii, пойманных в 2015 году. Геномная организация BatCoV/MOW15-21 и BatCoV/MOW15-23 была аналогична таковой у других Alpha-CoV, но собранные геномы содержали длинную вставку в ген ORF1ab, которая не была описана у других Alpha-CoV, за исключением единственной последовательности P. nathusii, пойманного в Нидерландах. Мы предполагаем, что вставка кодирует ранее неописанный домен с неизвестной функцией, вероятно, относящийся к суперсемейству доменов SEA.
- Добавил в систему: Крускоп Сергей Вадимович