AlphaFold в арсенале современного медицинского химика

Иваненков, Я.А.; Евтеев, С.А.; Малышев, А.С.; Терентьев, В.А.; Безруков, Д.С.; Ерещенко, А.В.; Корженевская, А.А.; Загрибельный, Б.А.; Шегай, П.В.; Каприн, А.Д.

Авторы: Иваненков Я.А., Евтеев С.А., Малышев А.С., Терентьев В.А., Безруков Д.С., Ерещенко А.В., Корженевская А.А., Загрибельный Б.А., Шегай П.В., Каприн А.Д.
Журнал: Успехи химии
Том: 93
Номер: 3
Год издания: 2024
Издательство: АНО «Успехи химии»
Местоположение издательства: Москва
Номер статьи: RCR5107
DOI: 10.59761/rcr5107
Аннотация: Создание новых малых лекарственных молекул — важная и сложная междисциплинарная проблема. На ранних этапах ее решения используют методыхемоинформатики и биоинформатики, что позволяет сократить затраты на поиск соединения-лидера. В арсенале медицинского химика методы моделирования стыковки и молекулярнойдинамики занимают особое место, так как позволяют прогнозировать возможный механизм связывания потенциального лиганда с белковой мишенью. Однако для моделирования стыковки необходимо располагать пространственной структурой изучаемой мишени. В настоящее время доступны базы данных трехмерных структур, но многие белковые молекулы еще не описаны, поэтому возникает потребность в моделировании их строения. Разработано несколько компьютерных подходов, позволяющих решать эту задачу. Алгоритм AlphaFold, работающий на базе методов машинного обучения, рассматривается научным сообществом в качестве наиболее эффективного для прогнозирования трехмерных структур молекул белков. Однако границы его применения в области медицинской химии, в частности для виртуальногоскрининга, остаются неясными. В данном обзоре кратко описаны методы, позволяющие прогнозировать трехмерные структуры белков, а также рассмотрены примеры использования алгоритма AlphaFold с целью разработки и рационального отбора потенциальных лигандов на стадию биологического тестирования. Особое внимание уделено публикациям, в которых приведены результаты экспериментальной валидации подхода. На основании проведенного анализа сформулированы основные проблемы в обозначенной области и возможные пути их решения.
Добавил в систему: Безруков Дмитрий Сергеевич

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных

AlphaFold в арсенале современного медицинского химикастатья

Прикрепленные файлы