|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Изучение белок-белковых взаимодействий методами молекулярного моделированиястатья Тезисы
- Авторы: Коваленко И.Б., Федоров В.А., Хрущев С.С., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
- Сборник: СБОРНИК НАУЧНЫХ ТРУДОВ VII СЪЕЗДА БИОФИЗИКОВ РОССИИ: в 2 томах
- Том: 1
- Год издания: 2023
- Место издания: Типография ФГБОУ ВО «КубГТУ» Краснодар, Россия Типография ФГБОУ ВО «КубГТУ» Краснодар
- Первая страница: 6
- Последняя страница: 7
- DOI: 10.26297/SbR6.2023.001
- Аннотация: В большинстве биологических систем белковые молекулы играют ключевую роль. С использованием методов рентгеноструктурного анализа и ядерного магнитного резонанса изучены пространственные структуры множества разных белков и их комплексов. Однако, до сих пор остается невыясненным в деталях, в какой степени электростатические и гидрофобные взаимодействия влияют на скорость образования комплексов белков на различных этапах сближения молекул.Образование белкового комплекса — это сложный многостадийный процесс, требующий учета множества факторов, таких как дальнодействующие электростатические взаимодействия между поверхностями белков, геометрическая и химическая комплементарность областей связывания, молекулярная подвижность в белок- белковом интерфейсе, гидрофобные взаимодействия. Нами разработан оригинальный подход, позволяющий, благодаря совместному использованию методов броуновской и молекулярной динамики, предсказать структуру образовавшегося комплекса и молекулярные механизмы, приведшие к его образованию. В данном подходе метод броуновской динамики используется для моделирования образования двумя белками столкновительного комплекса с учетом процессов диффузии и электростатических взаимодействий, а молекулярная динамика используется для моделирования трансформации предварительного комплекса в финальный с учетом подвижности атомов, конформационных изменений и молекул растворителя.Данный подход позволил нам выявить роль электростатических и гидрофобных взаимодействий в образовании комплекса белков пластоцианина и цитохрома f в цианобактериях, зеленых водорослях и высших растениях, и показать, что их роль в формировании комплекса меняется вместе с эволюционными изменения в белковых последовательностях.Работа выполнена при поддержке гранта Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых российских ученых - кандидатов наук МК-2931.2022.1.4.
- Добавил в систему: Федоров Владимир Андреевич
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | out1.pdf | 7,5 МБ | 11 декабря 2023 [Fedorov_VA] |