Анализ модельной структуры сайта связывания антител против 2,4-дихлорофеноксиуксусной кислотыстатья

Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science

Информация о цитировании статьи получена из Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 26 сентября 2019 г.

Работа с статьей

Прикрепленные файлы


Имя Описание Имя файла Размер Добавлен
1. Полный текст pbmc20034903238_Koliasnikov2003.pdf 353,8 КБ 7 мая 2015 [olkol]

[1] Колясников О. В., Григоренко В. Г., Егоров А. М. Анализ модельной структуры сайта связывания антител против 2,4-дихлорофеноксиуксусной кислоты // Биомедицинская химия. — 2003. — Т. 49, № 3. — С. 238–249. По данным об аминокислотной последовательности методом гомологии построены пространственные структуры для трех антител, специфичных к пестициду 2,4-дихлоро-феноксиуксусной кислоте (2,4-D). Во всех случаях была получена сходная структура сайта связывания. Наиболее важным остатком во взаимодействии с 2,4-D является тирозин, служащий "стенкой" сайта связывания и предположительно образующий pi-стекинг взаимодействие с ароматическим ядром лиганда. Другие стенки полости образованы гидрофобными остатками. На входе в полость в 2-х из 3-х структур находятся остатки глутаминовой кислоты. На базе результатов докинга 2,4-D и его аналогов качественно объяснены данные по кросс-реактивности. По результатам моделирования предлагается замена глутаминовой кислоты H50 на входе в сайт связывания на серин или лизин для устранения электростатического отталкивания с лигандом и предположительного улучшения его связывания. Соответствующие мутации были проверены виртуальным мутагенезом на модельной структуре.

Публикация в формате сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл скрыть