|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Остаток βV410 FOF1 АТФ-синтазы Escherichia coli участвует в LDAO-зависимой активации ферментатезисы доклада
- Авторы: Бруман С.М., Шугаева Т.Е., Лапашина А.С., Фенюк Б.А.
- Сборник: III Объединенный научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов. VII съезд биохимиков России. X Российский симпозиум "Белки и пептиды". VII съезд физиологов СНГ. Сочи, Дагомыс, 3–8 октября 2021. Научные труды
- Том: 2
- Тезисы
- Год издания: 2021
- Издательство: Общество с ограниченной ответственностью Издательство Перо
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 73
- Последняя страница: 74
- Аннотация: FoF1 АТФ-синтаза – фермент, катализирующий синтез АТФ из АДФ и неорганического фосфата с использованием энергии трансмембранной разности электрохимического потенциала протонов (Δμ̃H+). Фермент может работать в обратном направлении и выступать генератором Δμ̃H+, используя энергию гидролиза АТФ. Увеличение АТФазной активности может привести к растрате АТФ и гибели клеток. Чтобы этого не происходило, существуют механизмы регуляции АТФазной активности: у бактерий это неконкурентное АДФ-ингибирование, которое происходит при связывании MgАДФ в каталитическом сайте без фосфата, и ингибирование С-концевым доменом субъединицы ε, который может взаимодействовать с каталитическим ядром фермента и блокировать гидролиз АТФ. Часто для исследования этих механизмов используют вещества-активаторы, которые ослабляют указанные ингибиторные воздействия и стимулируют гидролиз АТФ. Одним из таких веществ является детергент LDAO. Известно, что он препятствует как АДФ-ингибированию, так и ε-ингибированию, однако точный механизм его действия на фермент до сих пор не ясен. Мы провели докинг LDAO в структуры АТФ-синтазы из четырех различных организмов и показали его возможные сайты связывания. Мы также смоделировали поведение LDAO в области каталитического сайта методами молекулярной динамики и выяснили, что LDAO может оказывать небольшой эффект на конформации фрагментов ɑ и β субъединиц (остатки ɑ370-373, β327-330) и влиять на конформацию “закрывающей” нуклеотид петли β405-416. Для проверки предсказаний мы исследовали АТФ-синтазу Escherichia coli с заменой βV410Q в упомянутой петле. Замена не оказала значимого эффекта на АТФазную активность фермента в большинстве исследованных условий. Однако в случае мутантного субкомплекса F1 стимулирующий эффект малых концентраций сульфита и LDAO на АТФазную активность был снижен по сравнению с диким типом. Мы предполагаем, что этот результат связан с изменением действия сульфита и LDAO на ε-ингибирование. Было также исследовано влияние обратной мутации βQ419V в аналогичной позиции АТФ-синтазы Bacillus subtilis на регуляцию активности фермента. Можно заключить, что исследованный остаток участвует во взаимодействии LDAO с ферментом, однако ключевой роли в нем не играет. Работа выполнена при поддержке Российского научного фонда (грант 20-14-00268).
- Добавил в систему: Лапашина Анна Сергеевна