Аннотация:Рукокрылые являются резервуаром большого количества вирусов, включая коронавирусы. Мониторинг коронавирусов в летучих мышах является актуальной задачей. Цель данного исследования: поиск новых вирусов семейств Coronaviridae, носителями которых являются летучие мыши, обитающие на территории Европейской части России. Для поиска вирусов использовали фекалии летучих мышей, пойманных в Москве, Московской области (Солнечногорск, Видное, Троицк, Мытищи), Калуге, Ростове-на-Дону, Йошкар-Оле в 2021 году. Была использована методика выявления вирусов с помощью амплификации фрагментов геномов вирусов (участка RdRp, кодирующего репликазу), с последующим проведением высокопроизводительного секвенирования этих фрагментов на платформе Illumina (MiSeq, USA).