|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Exhaustive conformational search for transition states: the case of catechol O-methyltransferase active siteстатья
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 8 августа 2017 г.
- Авторы: Medvedev Michael G., Panova Maria V., Chilov Ghermes G., Bushmarinov Ivan S., Novikov Fedor N., Stroganov Oleg V., Zeifman Alexey A., Svitanko Igor V.
- Журнал: Mendeleev Communications
- Том: 27
- Номер: 3
- Год издания: 2017
- Издательство: Elsevier BV
- Местоположение издательства: Netherlands
- Первая страница: 224
- DOI: 10.1016/j.mencom.2017.05.002
- Аннотация: In this article, we propose a combination of common quantum mechanics based transition state theory and exhaustive conformational search for modeling of difficult reactions with hundreds of competing transition states. We apply this approach to study all transition state conformations of the reaction taking place in the catechol O-methyltransferase (COMT) active site in the absence of a major part of the enzyme and compare our results to the recent QM/MM modeling of this reaction within the enzyme. The main points of our method are: (1) constraining of forming bonds upon conformers generation and (2) preliminary constrained optimization of located conformations to minima using a quantum mechanical method. Importantly, the same methodology is applicable to the quantum mechanical part in QM/MM calculations and can reduce demand of large sampling in difficult cases.
- Добавил в систему: Медведев Михаил Геннадьевич
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Акт экспертизы | Vozmozhnost_opublikovaniya_6.pdf | 619,5 КБ | 22 августа 2019 [Medvedev_MG] |