|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
RedChIP identifies noncoding RNAs associated with genomic sites occupied by Polycomb and CTCF proteinsстатья
Статья опубликована в высокорейтинговом журнале
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 4 марта 2022 г.
- Авторы: Gavrilov A.A., Sultanov R.I., Magnitov M.D., Galitsyna A.A., Dashinimaev E.B., Lieberman Aiden E., Razin S.V.
- Журнал: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
- Том: 119
- Номер: 1
- Год издания: 2022
- Издательство: National Academy of Sciences
- Местоположение издательства: United States
- Номер статьи: e2116222119
- DOI: 10.1073/pnas.2116222119
- Аннотация: Nuclear noncoding RNAs (ncRNAs) are key regulators of gene expression and chromatin organization. The progress in studying nuclear ncRNAs depends on the ability to identify the genome-wide spectrum of contacts of ncRNAs with chromatin. To address this question, a panel of RNA-DNA proximity ligation techniques has been developed. However, neither of these techniques examines proteins involved in RNA-chromatin interactions. Here, we introduce RedChIP, a technique combining RNA-DNA proximity ligation and chromatin immunoprecipitation for identifying RNA-chromatin interactions mediated by a particular protein. Using antibodies against architectural protein CTCF and the EZH2 subunit of the Polycomb repressive complex 2, we identify a spectrum of cis- and trans-acting ncRNAs enriched at Polycomb- and CTCF-binding sites in human cells, which may be involved in Polycomb-mediated gene repression and CTCF-dependent chromatin looping. By providing a protein-centric view of RNA-DNA interactions, RedChIP represents an important tool for studies of nuclear ncRNAs
- Добавил в систему: Разин Сергей Владимирович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | Gavrilov_PNAS.pdf | 1,1 МБ | 2 января 2022 [sergey.v.razin] |