Algorithms for reconstruction of chromosomal structuresстатья

Статья опубликована в высокорейтинговом журнале

Информация о цитировании статьи получена из Scopus, Web of Science
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 15 декабря 2016 г.

Работа с статьей


[1] Algorithms for reconstruction of chromosomal structures / V. A. Lyubetsky, R. A. Gershgorin, A. V. Seliverstov, K. Y. Gorbunov // BMC Bioinformatics. — 2016. — Vol. 17, no. 40. — P. 23. One of the main aims of phylogenomics is the reconstruction of objects defined in the leaves along the whole phylogenetic tree to minimize the specified functional, which may also include the phylogenetic tree generation. Such objects can include nucleotide and amino acid sequences, chromosomal structures, etc. The structures can have any set of linear and circular chromosomes, variable gene composition and include any number of paralogs, as well as any weights of individual evolutionary operations to transform a chromosome structure. Many heuristic algorithms were proposed for this purpose, but there are just a few exact algorithms with low (linear, cubic or similar) polynomial computational complexity among them to our knowledge. The algorithms naturally start from the calculation of both the distance between two structures and the shortest sequence of operations transforming one structure into another. Such calculation per se is an NP-hard problem. [ DOI ]

Публикация в формате сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл скрыть