Restructuring higher taxonomy using broad-scale phylogenomics: The living Ophiuroideaстатья

Статья опубликована в высокорейтинговом журнале

Информация о цитировании статьи получена из Scopus, Web of Science
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 11 апреля 2017 г.

Работа с статьей

Прикрепленные файлы


Имя Описание Имя файла Размер Добавлен

[1] Restructuring higher taxonomy using broad-scale phylogenomics: The living ophiuroidea / T. D. O'Hara, A. F. Hugall, B. Thuy et al. // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2017. — Vol. 107. — P. 415–430. Abstract: The power and throughput of next-generation sequencing is instigating a major transformation in our understanding of evolution and classification of life on our planet. The new trees of life are robust and comprehensive. Here we provide a landmark phylogeny of the living ophiuroids and use it as the basis for a major revision of the higher classification of this class of marine invertebrates. We used an exon-capture system to generate a 1484 exon (273 kbp) data-matrix from DNA extracted from ethanol-preserved museum samples. We successfully obtained an average of 92% of our target sequence from 576 species spread across the known taxonomic diversity. The topology of the major lineages was robust to taxon sampling, exon-sampling, models and methods. However, estimates of node age were much less precise, varying by about a quarter of mean age. We used a combination of phylogenetic distinctiveness and temporal-banding to guide our revision of the family-level classification. Empirically, we determined that limiting family crown age to 110 ± 10 Ma (mid Cretaceous) selected phylogenetically distinct nodes while minimising disruption to the existing taxonomy. The resulting scheme of 32 families and six orders considerably expands the number of higher taxa. The families are generally longitudinally widespread across the world’s oceans, although 17 are largely confined to temperate and equatorial latitudes and six to relatively shallow water (less than 1000 m depth). Дополнительная аннотация: На основании данных сканирующей электронной микроскопии А.В. Мартыновым недавно была предложена группа, объединяющая ветвисторуких офиур (например голова горгоны, Gorgonocephalus) с внешне очень отличными настоящими офиурами семейства Ophiuridae (Martynov, 2010). В рамках традиционной классификации подобная группа никогда не предлагалась. Спустя четыре года существование этой удивительной с точки зрения классических зоологических учебников группы было подтверждено молекулярными данными (O'Hara et al., 2014). Новое исследование сделало возможным объединить морфологические данные, полученные А.В. Мартыновым, и результаты молекулярно-филогенетического анализа по большому числу генов в рамках единой работы, посвященной фундаментальному пересмотру систематики класса Ophiuroidea (O’Hara, Hugall, Thuy, Stöhr, Martynov, 2016). Сведения о микроструктурных морфологических признаках, использованные в этой работе были получены на основе исследования коллекции офиур Зоологического музея МГУ. Предложенная ранее по морфологии группа впервые получила в данной публикации специальное название – Euryophiurida в ранге надотряда. Данное исследование представляет собой редкий случай в современной биологии, когда пересмотр классификации групп высокого ранга был инициирован морфологическими, а не молекулярными данными. [ DOI ]

Публикация в формате сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл скрыть