Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 6 октября 2021 г.
Аннотация:Методом SSCP-анализа (single-strand conformation polymorphism) исследован полиморфизм семи генов (а)вирулентности возбудителя фитофтороза картофеля Phytophthora infestans: Avrl, Avr2, Avr2-like, Avr3a, Avr4, Avr-Smiral (Avr9) и ipiO (Avr-blbl) у 20 монозооспоровых линий P. infestans. При ПЦР-амплификации этих генов с последующим электрофоретическим разделением ампликонов в неденатурирующем полиакриаламидном геле образуются от двух до пяти хорошо воспроизводимых паттернов, которые содержат по несколько зон электрофоретической подвижности. ДНК этих зон была клонирована и секвенирована. Последовательности ДНК, представленные этими зонами, соответствуют известным вирулентным аллелям Avr-генов, однако, в случае ipiO найдены преимущественно авирулентные варианты гена. Каждый индивидуальный паттерн соответствует определенному варианту Avr-гена и может быть использован в качестве дескриптора для различения и идентификации штаммов P. infestans. В отличие от наиболее распространенного метода генотипирования штаммов P. infestans по SSR-локусам (single sequence repeat), SSCP-анализ выявляет полиморфизм, непосредственно связанный с вредоносностью штамма патогена.