|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Статистический анализ пространственных структур ДНК в интерфейсах комплексов гомеодомен-ДНКтезисы доклада
- Авторы: Полозов Р.В., Грохлина Т.И., Панченко Л.А., Иванов В.В.
- Сборник: Материалы XV Международой научной конференции "Актуальные вопросы биологической физики и химии". Севастополь 14-16 сентября 2020 г
- Тезисы
- Год издания: 2020
- Издательство: Севастопольский государственный университет
- Местоположение издательства: Севастополь
- Первая страница: 48
- Последняя страница: 48
- Аннотация: Специфические комплексы гомеодоменов с ДНК образуются при связывании белка с двуспиральной ДНК в B-форме (по широкому желобу) . Классификация комплексов белок-ДНК и их интерфейсов по физико-химическим, геометрическим параметрам связана с решением ряда задач вычислительного и статистического характера. Классификация должна дать сведения о взаимосвязи комплексов друг с другом, дать возможность проследить их эволюцию и дать основу для формулировок правил узнавания и построения моделей узнавания. Для решения задач классификации необходимо составить список надлежащих дескрипторов комплексов и их интерфейсов, провести многомерных статистический анализ данных из этого списка. Мы используем геометрические параметры локальной структуры ДНК в интерфейсах 75 комплексов гомеодомен-ДНК (PDB), параметры: Lu X.-J., Olson W.K. 3DNA: a software package. В данной работе представлены результаты анализа «диккерсоновых параметров» и дана их физико-химическая и структурная интерпретация.Specific complexes of homeodomains with DNA are formed when the protein binds to double-stranded DNA in the B-form (along the wide groove). The classification of protein-DNA complexes and their interfaces according to physicochemical and geometric parameters is associated with solving a number of computational and statistical problems. Classification should provide information on the relationship of complexes with each other, provide an opportunity to trace their evolution and provide a basis for the formulation of recognition rules and the construction of recognition models. To solve the classification problems, it is necessary to compile a list of appropriate descriptors of complexes and their interfaces, to conduct multivariate statistical analysis of the data from this list. We use the geometric parameters of the local DNA structure at the interfaces of 75 homeodomain-DNA (PDB) complexes, parameters: Lu X.-J., Olson W.K. 3DNA: a software package. This paper presents the results of the analysis of “Dickerson parameters” and gives their physicochemical and structural interpretation.
- Добавил в систему: Панченко Лариса Андреевна