Генетическая карта смородины красной ( Ribes rubrum L.), построенная с применением SSR и SNP ДНК-маркеровстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 4 августа 2021 г.
Аннотация:Данная работа направлена на составление первой в мире генетической карты смородины красной с применением микросателлитных и SNP ДНК-маркеров. Построенная генетическая карта включает восемь групп сцепления с уровнем LOD 10, в которые вошли 299 ДНК-маркеров, в том числе 12 микросателлитных и 287 SNP маркеров; общая длина всех групп сцепления составила 741 сМ, средняя – 93 сМ. В семи из восьми полученных групп сцепления картирован хотя бы один микросателлитный ДНК-маркер. Для большинства локализованных нами на карте красной смородины микросателлитных локусов позиции соотносятся с положением на группах сцепления смородины черной (локусы e3-B02, g1-A01, g1-L12 размещаются на одной группе сцепления № 5; локусы g2-J08, g2-B20, e1-O21, e1-O01 на полученной карте находятся каждый в отдельной группе сцепления 2, 3, 4, 6 соответственно), за исключением локусов, картированных у смородины черной на группе сцепления 1, которые в нашей работе не вошли ни в одну из составленных групп сцепления. Локус g2-J11 в наших исследованиях амплифицирует фрагменты в двух диапазонах, что позволяет предположить его дупликацию в геноме исследуемых образцов. Данный локус был картирован в двух группах сцепления смородины красной. Локализовано также два новых, ранее не картированных и не опубликованных микросателлитных локуса. В дальнейшем планируется провести локализацию хозяйственно полезных признаков в геноме смородины красной.