Вопросы математического моделирования в биологии. Часть 2. Модели процессов взаимодействия белков в фотосинтетической мембране. Успехи современной биологиистатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 10 февраля 2021 г.
Аннотация:Вторая часть статьи посвящена агентным – многочастичным броуновским и молекулярно-динами-ческим моделям. В этих моделях на основе аппарата броуновского и молекулярного моделированияописываются движение и взаимодействие индивидуальных белков – переносчиков электронов(броуновские многочастичные модели) и индивидуальных атомов в молекулах – переносчикахэлектрона (молекулярная динамика). Прямые многочастичные модели в явном виде моделируютброуновскую диффузию подвижных белковых переносчиков и их электростатические взаимодей-ствия с мультиферментными комплексами как в растворе, так и в интерьере биомембраны. Анализэтих моделей раскрывает роль диффузии и электростатических факторов в регуляции электронноготранспорта, влияние геометрии реакционного объема, ионной силы и рН клеточной среды на ско-рость реакций транспорта электронов между белками-переносчиками. Совместное использованиеметодов кинетического и броуновского многочастичного моделирования позволяет изучать регуля-цию целостной системы электрон-транспортных процессов на субклеточном и молекулярном уров-не, механизмы переключения электронных потоков в клетках растений и водорослей, оцениватьоптимальные условия для получения клетками микроводорослей целевых продуктов, например во-дорода как альтернативного топлива. Перспективы различных методов математического моделиро-вания в изучении субклеточных систем обсуждаются в заключении. Материал статьи основан на ре-зультатах исследований, выполненных на кафедре биофизики биологического факультета МГУ им.М.В. Ломоносова.