Биоинформатический анализ структурных взаимосвязей в удаленных гомологах суперсемейства альфа-бета гидролазстатья

Статья опубликована в журнале из перечня ВАК

Работа с статьей


[1] Биоинформатический анализ структурных взаимосвязей в удаленных гомологах суперсемейства альфа-бета гидролаз / И. В. Шаповалова, Н. В. Панин, В. А. Тахавеев и др. // Современные проблемы науки и образования. — 2012. — № 6. Ферменты одного семейства, обладая общей каталитической стратегией, могут различаться по другим свойствами и разделяться на подсемейства по субстратной специфичности, стереоселективности, стабильности и т.д. Сравнительный биоинформатический анализ был применен для изучения таких позиций в структурах белков, специфическая изменчивость которых в рамках семейства позволяет предположить их ведущую роль в формировании функционального разнообразия. Такие специфические позиции подсемейства (СПП) консервативны только внутри подсемейств ферментов, но различаются между ними. Алгоритм поиска СПП в структурах белков на основе геномной и структурной информации был использован для биоинформатического анализа ферментов суперсемейства альфа-бета гидролаз, которые потеряли сходство по аминокислотным последовательностям в результате естественного отбора и эволюции от общего предка. Проведенное исследование показало высокую степень структурного сходства активных центров даже у удаленных гомологов и выявило закономерности распределения типов аминокислот у ферментов с различными каталитическими свойствами.

Публикация в формате сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл скрыть