|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Оптимизационная модель апоптоза: определение кинетических константстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК- Авторы: Синцов А.В., Якобовский М.В., Кауфманн С.Г., Ханин М.А.
- Журнал: Математическое моделирование
- Том: 19
- Номер: 3
- Год издания: 2007
- Издательство: Российская академия наук
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 59
- Последняя страница: 73
- Аннотация: Апоптозом называют особый механизм уничтожения опасных для организма клеток, который обусловлен действием внутриклеточной системы белков (прокаспаз и др.) Эти белки в норме находятся в пассивном состоянии и не влияют на жизненные процессы в клетке. Однако, после индукции апоптоза прокаспазы активируются (превращаются в каспазы) и разрушают белки, входящие в состав клетки. Апоптоз вызывают различные стимулы, к которым относятся молекулы, активирующие специальные мембранные “рецепторы смерти”, белок, называемый гранзимом B, проникающий в клетку через мембрану, и др. Гранзим B не только активирует каспазы, но и обладает способностью непосредственно, без участия каспаз, разрушать внутриклеточные белки (апоптотические мишени). Основная цель работы заключается в исследовании методом математического моделирования динамики активации каспаз и разрушения мишеней апоптоза, при индукции этого процесса гранзимом B. В частности, исследовано влияние концентрации гранзима B на динамику активации каспаз. Наибольшие трудности, возникшие при решении сформулированной задачи, связаны с отсутствием полного набора количественных данных, определяющих кинетические константы биохимических реакций, участвующих в системе апоптоза. Поэтому был предложен оптимизационный метод определения величин кинетических констант биохимических реакций, участвующих в апоптозе. Основу метода составляет поиск условного минимума потребления белков системой апоптоза. В результате применения этого метода была определена совокупность кинетических констант апоптоза, индуцированного гранзимом B. Были установлены следующие особенности динамики апоптоза: увеличение продолжительности лаг фазы при снижении концентрации гранзима B, слабая зависимость максимальной концентрации каспаз от концентрации гранзима B. Результаты моделирования приводят к новому взгляду на динамику активации каспаз и разрушения мишеней, а также позволяют исследовать возможность применения гранзима B при лечении опухолей.
- Добавил в систему: Якобовский Михаил Владимирович