|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Эволюция коротких тандемных повторов (STR) рыб семейства карповые (Cyprinidae)статья Тезисы
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
- Авторы: Орлов М.А., Тихонов А.Ю.
- Журнал: Acta Naturae (русскоязычная версия)
- Том: 1
- Год издания: 2019
- Издательство: Парк-медиа
- Местоположение издательства: М.
- Первая страница: 34
- Последняя страница: 34
- Аннотация: Короткие тандемные повторы (short sequence repeats, SSR) представляют собой участки ДНК длиной в несколько нуклео-тидов, которые повторяются непосредственно друг за другом от нескольких до десятков и более раз. Длина SSR в находящихся под давлением селекционного отбора генов может быстро изменяться, а также коррелировать с выраженностью кодируемого признака [1]. Более того, способность SSR к экспансиям и сокращениям связана с изменением скорости мутационного про-цесса ДНК [2]. Для корюшки (Gasterosteus aculeatus) установлено, что подвергающиеся активным эволюционным преобразо-ваниям гены обогащены протяженными TG-повторами [2]. Нами рассмотрены полные наборы SSR 29 рыб семейства карповых (Cyprinidae), полученных главным образом из базы данных FishMicrosat [3]. Cyprinidae интересны в связи со сложной картиной полиплоидности, образованием межвидовых и межродовых гибридов и хромосомными перестройками [4]. Для наборов SSR проведен статистический анализ размеров и нуклеотидной последовательности. Несколько геномов включают заметно выде-ляющиеся по протяженности SSR. Далее для каждого набора повторов рассчитана представленность олигонуклеотидов (ди-, три-и тетра-), для которых проведен иерархический кластерный анализ. Полученные в результате два кластера хорошо согла-суются с тем, разводятся ли соответствующие виды в неволе. При визуализации первичной структуры соответствующих им SSR выявлено, что включающий большинство культивируемых рыб кластер отличает большее количество TG-(CA-)богатых последовательностей его обеднении AG-(TC-)динуклеотидами. Таким образом, разведение представителей Cyprinidae в не-воле оказалось связанным с преобладанием пар TG. Кластеризация частоты встречаемости олигонуклеотидов в наборах SSR успешно выделила две группы–дикие/разводимые рыбы. Описанное может быть связана с активным искусственным отбором, направленным на важные для разведения в неволе признаки.
- Добавил в систему: Орлов Михаил Анатольевич