Протеомный анализ мха Physcomitrella patens (Hedw.) B.S.Gстатья

Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 24 января 2020 г.

Работа с статьей


[1] Протеомный анализ мха physcomitrella patens (hedw.) b.s.g / А. Ю. Скрипников, Н. Б. Поляков, Е. В. Толчева и др. // Биохимия. — 2009. — Т. 74, № 5. — С. 593–606. Для построения референтной протеомной карты мха Physcomitrella patens, основанной на полной нуклеотидной последовательности генома, проведены двумерные электрофорезы белков, изолированных из протопластов, протонемы и гаметофоров мха. На гелях, обработанных серебром, разрешено в зависимости от фазы развития мха от 500 до 600 белковых пятен. Анализ пептидов, полученных в результате трипсинолиза белков, методом MALDITOFмассспектрометрии (пептидного отпечатка) позволил идентифицировать 212 индивидуальных белков. В целях расширения спектра изучаемых белков проведен одномерный гель-электрофорез белков экстракта в денатурирующих условиях с последующим анализом триптических пептидов методом LCESIMS/MS. С помощью предложенного метода определено еще 186 белков. Применительно к 398 белкам, идентифицированным двумя методами, проведена классификация в соответствии с системой кластеризации ортологичных генов. Установлено, что 16% белков участвуют в различных клеточных процессах и передаче сигнала, 26% – в процессах метаболизма, 7% – в процессинге и хранении генетической информации. В результате протеомного анализа с использованием флуоресцентных красителей,конъюгированных с белками в тотальных препаратах, обнаружены различия между двумя основными фазами жизненного цикла мха – протонемой и гаметофорами. Выявлены достоверные различия в белковом спектре протопластов, изолированных из протонемы, – они существенно отличаются по составу белков как от протонемы, так и от гаметофоров. КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: протеомика, 2Dэлектрофорез, MALDITOF, LCESIMS/MS, Physcomitrella patens, протопласты, DiGE.

Публикация в формате сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл скрыть