Современные био-онтологии: модель, инструмент или справочник?тезисы доклада

Работа с тезисами доклада


[1] Стриж И. Г. Современные био-онтологии: модель, инструмент или справочник? // Сборник тезисов докладов 16 Международной конференции Математика. Компьютер. Образование. — Пущино, 2009. — С. 291–291. Принципиальным отличием биологии XXI века является то, что практически любое современное исследование не только приводит к появлению многочисленных данных, но и требует привлечения новых технологий, способствующих решению проблемы хранения, обработки и интеграции получаемых данных, а также позволяющих исследователям вычленить необходимую им информацию. Помочь ученым призваны методы биоинформатики, а именно методы организации молекулярно-биологической информации, широко понимаемые компьютерные методы, методы вычислительной математики и статистики. Одним из подходов, применяемых для интеграции данных и знаний в биологии, является использование онтологий. Из основ философии известно, что онтология это наука о бытии - о природе вещей и взаимосвязях между ними. В контексте информационных технологий представления знаний, этим термином можно определить механизм или способ, используемый для описания некоторой области знаний, в частности базовых понятий этой области и связей между ними. Т.е. изначально онтологии были задуманы как некоторый инструмент для описания знаний. Важное условие при создании онтологий – они должны быть достаточно удобны и понимаемы и для людей, и для программных систем, поэтому часто говорят, что онтология является некоторой машиночитаемой моделью некоторой предметной области. Так как созданием онтологий для организации молекулярно-биологических данных ученые занялись относительно недавно, дебаты о том, что является отологией и как она должна быть правильно реализована продолжаются и по сей день. Проблема в том, что современные био-онтологии представляют собой огромный словарь терминов-концептов, формирующих описание определенной области знаний. Наиболее известной используемой био-онтологией сегодня является Генная Онтология. Она представляет собой совокупность трех огромных контролируемых словарей терминов, касающихся молекулярной функции, биологического процесса и клеточной структуры. Таким образом, современные био-онтологии представляют собой некий тезаурус – справочник терминов, по которым можно и нужно искать интересующие исследователей генные продукты. Это позволяет использовать уже существующие био-онтологии в качестве общедоступного учебного пособия.

Публикация в формате сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл скрыть