Аннотация:В процессе транскрипции происходят запрограммированные в ДНК остановки
синтеза РНК – транскрипционные паузы, которые выполняют регуляторные фун-
кции. Важной разновидностью транскрипционных пауз в клетках бактерий явля-
ются сигма-зависимые паузы, при которых сигма-субъединица РНК-полимеразы
(РНКП) опознаёт промотор-подобные участки в транскрибируемой ДНК. До сих
пор о такой способности было известно только для главной сигма-субъединицы
Escherichia coli – сигма70. Однако, в клетках E. coli присутствует ещё 5 альтерна-
тивных сигма-субъединиц, родственных сигма70-субъединице. Способны ли они
вызывать такие паузы, не известно. Целью данной работы является выявление и
исследование свойств пауз, вызванных альтернативными сигма-субъединицами.
Нами установлено, что сигма38-субъединица, ответственная за транскрипцию
генов в стационарной фазе роста и в стрессовых условиях, способна с высокой
эффективностью вызывать паузу в модельных элонгационных комплексах, содер-
жащих последовательность -10 элемента промотора. Показано, что при мутациях
в -10-подобном элементе пауза исчезает. Изучены особенности структуры элонга-
ционного комплекса при связывании сигма38-субъединицы. Установлено, что сиг-
ма38-зависимая пауза ослабляется в присутствии факторов GreA и GreB, которые
активируют расщепление РНК в активном центре РНКП. Это указывает на то, что
в состоянии паузы комплекс смещается назад по матрице ДНК, что приводит к ос-
тановке транскрипции. Дальнейшей задачей работы является изучение возможной
роли сигма38-зависимых пауз в регуляции транскрипции генов, а также анализ
формирования пауз с участием других альтернативных сигма-субъединиц.