|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
КОНФОРМАЦИИ ШАРНИРНОЙ ЦЕПИ КАК МОДЕЛЬ СВОРАЧИВАНИЯ БЕЛКАстатья
- Авторы: Вилкул Е.А., Иванов А.О., Тужилин А.А.
- Журнал: Наноструктуры. Математическая физика и моделирование
- Том: 13
- Номер: 2
- Год издания: 2015
- Первая страница: 25
- Последняя страница: 42
- Аннотация: В настоящей работе мы изучаем геометрию простейшей модели, которая могла бы быть применима к исследованию конформации белков. А именно, мы рассматриваем пространственную ломаную (которую можно представлять, например, как углеродно-азотный остов белка), фиксируем в ней длины ребер и углы между смежными ребрами, задаем потенциальное взаимодействие между ее вершинами и изучаем конфигурации такой ломаной, соответствующие локальным минимумам суммарного потенциала. При некоторых допущениях на характер взаимодействия эта задача полностью решается. При менее жестких ограничениях удается лишь проделать компьютерный эксперимент. Тем не менее, уже в рассмотренных случаях мы обнаружили ряд качественных явлений. Например, меняя потенциал так, чтобы его вид всегда оставался потенциальной ямой, мы наблюдали, как дискретные локальные минимумы включались в большие плоские области с очень маленькой вариацией значений: из-за наличия постоянного спонтанного движения атомов такие области также нужно относить к решениям. Кроме того, наши теоретические результаты и численные эксперименты позволили нам сформулировать гипотезу, оценивающую максимальное число строгих локальных минимумов суммарного потенциала, которое уже для 30 аминокислот оказалось астрономическим. Мы думаем, что такие оценки были бы полезны для осознания реальной ситуации в современной науке, изучающей конформации белков методами ядерно-магнитного резонанса и рентгено-структурного анализа.
- Добавил в систему: Иванов Александр Олегович