Модель смеси распределения Парето с гауссовским шумом и её применение для выделения сигнала на биочипе при исследованиях генома эукариотов

Степанов, В.С.

Автор: Степанов В.С.
Сборник: Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования, образование
Серия: Труды Первой международной научно-практической конференции "Исследование, разработка и применение высоких технологий в промышленности"
Том: 1
Тезисы
Год издания: 2005
Место издания: Санкт-Петербургский государственный политехнический университет Санкт-Петербург
Первая страница: 60
Последняя страница: 61
Аннотация: При воздействии внешних факторов (химических и др.) на клетку, в 1-ю очередь включаются гены, хранящиеся в нуклеотидах её ДНК. После экспрессии нужных клетке генов, запускается синтез белков, нужных ей для адаптации к внешним воздействиям. При исследованиях генома клеток- эукариотов (дрожжей, мышей и проч.) уровень экспрессии генов нередко измеряется с использованием "биочипов" (например, GeneChip производства Affymetrix). Но здесь, из-за использования явления флюоресценции, сигнал получается непрерывным. Кроме того,возникают дополнительные помехи, или "шум". Это имеет место для генов, что активируются редко, поэтому полезный сигнал для них на биочипе слаб и близок по яркости свечения к уровню шума. Выявление и фильтрация шума здесь актуальны для решения ряда задач молекулярной биологии и генетики. В работе предложено описывать сигнал снимаемый с биочипа моделью смеси гауссовского шума и полезного сигнала с непрерывным распределением Парето , заданном на конечном отрезке числовой оси. Неизвестные параметры модели смеси (мат.ождание, дисперсия шума, удельный вес шума в смеси и два параметра закона Парето) находятся в работе численной максимизацией логарифма функции правдоподобия ЕМ-алгоритмом. Сделано исследование на модельных данных.
Добавил в систему: Степанов Владимир Сергеевич

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных

Прикрепленные файлы