Структура сообщества архей в фотической зоне водной толщи Черного морястатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 6 мая 2016 г.
Аннотация:Проведен качественный и количественный анализ структуры сообщества архей в фотической зоне
водной толщи Черного моря. Методом ПЦР в реальном времени установлено, что численность архей на глубине 15 м составляет 2 × 104 кл/мл или 4.2% от общей микробной популяции. С использованием технологии секвенирования путем синтеза (метод Illumina/Solexa) ампликонов гена 16S рРНК впервые изучена структура сообщества архей подповерхностной водной толщи. Наиболее многочисленная группа архей была представлена филогенетическим кластером Marinе Group II, относящимся к филуму Euryarchaeota. Их численность в зоне исследуемого района составила 1.2–1.7 × 104 кл/мл. Вторым по численности (40% от свободноживущей популяции архей или 7.7 × 103 кл/мл) оказался филогенетический кластер Marine Group I, относящийся к филуму Thaumarchaeota. Среди последовательностей Marine Group I на основании высокого уровня сходства (выше 90%) были выявлены последовательности кластера 'Nitrosopumilus'. Также удалось детектировать группу архей, принадлежащих к кластеру некультивируемых микроорганизмов Deep-sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group 6 (DHVEG-6) филума Euryarchaeota. Последовательности гена 16S рРНК, отнесенные к данному кластеру, были выявлены только во фракции взвеси. Большая часть последовательностей DHVEG-6 на
основании высокого уровня гомологии (более 90%) была отнесена к кластеру 'Parvarchaeum'. Интересно, что, несмотря на заметный пик метана, наблюдаемый на глубине 15 м, детектировать последовательности метаногенов не удалось.