|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Особенности разнообразия гаплотипов Д-петли мтДНК нерки Oncorhynchus nerka Walbaumстатья
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 10 октября 2019 г.
- Авторы: Пономарева Е.В., Хрусталева А.М., Пономарева М.В., Волков А.А., Шубина Е.А.
- Журнал: Генетика и разведение животных
- Номер: 2
- Год издания: 2018
- Издательство: Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский институт генетики и разведения сельскохозяйственных животных Российской академии сельскохозяйственных наук
- Местоположение издательства: Санкт-Петербург, Пушкин
- Первая страница: 45
- Последняя страница: 50
- DOI: 10.31043/2410-2733-2018-2-45-50
- Аннотация: В работе проанализированы гаплотипы полной последовательности Д-петли мтДНК у 60 особей нерки (Oncorhynchus nerka Walbaum) из материковой (р. Анадырь, р. Пахача, оз. Азабачье, р.Камчатка, р.Воровская) и островной части (острова Итуруп, Парамушир, Шумшу) ареала. После множественного выравнивания полученных последовательностей исследован участок мтДНК длиной 1025 п.н., включающийполную последовательность Д-петли, GC–содержание этого фрагмента составляло 39.8%. Было выявлено 4 полиморфных сайта (0.3% от всех сайтов), из них информативных 4, все замены транзиции, и выявлено 4 индела. Только одна замена наблюдается в участке Д-петли до поли-Т повтора, остальные вариабельные сайты расположены во второй половине исследуемого фрагмента мтДНК. Для нерки характерно низкое разнообразие гаплотипов Д-петли: всего было выявлено 4 гаплотипа по заменам и 7 гаплотипов с учетом инделов. Были выявлены две гаплогруппы, отличающиеся по трем заменам. Выделено два наиболее распространенных гаплотипа А и В, отличающихся на 3 замены. Гаплотипы А и В присутствуютв обеих группах популяций, еще 2 гаплотипа обнаружены среди материковых популяций. На Курильскихостровах присутствуют только А и В гаплотипы. С учетом инделов гаплотипы А и В отличаютсяна 3 замены и 2 индела, и выделяется гаплотип, обнаруженный только у рыб Курильских островов. С учетом инделов индекс разнообразия гаплотипов (Hd) увеличивается до 0.75, индекс разнообразия гаплотипов в материковых популяциях выше, чем в популяциях Курильских островов.Таким образом, Д-петля митохондриальной ДНК нерки обладает структурными особенностями: большинствовариабельных сайтов расположено в участке от поли-Т повтора, и при низком гаплотипическомразнообразии присутствует большое количество инделов. При этом в структуре современного генетическогоразнообразия нерки прослеживается снижение численности и фрагментации ареала в течениепозднего плейстоцена.
- Добавил в систему: Пономарева Мария Валериановна