|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Неканонические механизмы 5’-конец-зависимой инициации трансляции у эукариотНИР
- Руководитель НИР: Дмитриев С.Е.
- Участники НИР: Андреев Д.Е., Бочкаева З.В., Оловников И.А., Симонова Л.В., Теренин И.М.
- Подразделение: Лаборатория регуляции синтеза белка
- Срок исполнения: 1 января 2007 г. - 31 декабря 2009 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 07-04-01120
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Структура и функции биологических макромолекул и макромолекулярных комплексов. Биокатализ.
- ПН России: Науки о жизни
-
Рубрики ГРНТИ:
- 34.15.17 Макромолекулярные ассоциации и проблемы узнавания в молекулярной биологии
- 34.15.25 Молекулярная биология гена
- 34.15.31 Молекулярная биология вирусов
-
Ключевые слова:
кеп-зависимая инициация, tpl, ретротранспозон l1, eif2a, hi95, инициация трансляции, hsp70, инициирующие факторы, эукариотические мрнк
-
Описание:
Отечественный грант РФФИ №07-04-01120 «Неканонические механизмы 5’-конец-зависимой инициации трансляции у эукариот» (1.01.2007 - 31.12.2009; Руководитель проекта – Дмитриев С.Е.)
-
Основные результаты:
Проект нацелен на изучение некоторых необычных случаев 5’-конец-зависимой инициации трансляции эукариотических мРНК, а также на объяснение нескольких аспектов механизма выбора инициаторного кодона, которые плохо укладываются в рамки существующей классической модели. В ходе выполнения проекта мы смогли наглядно продемонстрировать несостоятельность очень распространённой теории о том, будто слабая зависимость от 5’-кепа, которая наблюдается у некоторых клеточных мРНК, определяется наличием в их 5’-нетранслируемых областях (5’-НТО) участков внутреннего связывания рибосомы (IRES-элементов). Применив разработанные нами подходы для адекватной оценки эффективности трансляции таких мРНК in vitro (в экстрактах культивируемых клеток) и in vivo (в живых клетках, трансфицированных искусственными транскриптами), мы показали, что хотя кеп-зависимость мРНК с разными лидерами может отличаться в десятки раз, она не связана со способностью направлять трансляцию второго цистрона в бицистронной мРНК (классическое определение IRES-элемента). Более того, вопреки общепринятому мнению, не прослеживается и связи кеп-зависимости с общей структурированностью лидера. Эти важные наблюдения были опубликованы нами в этом году в журнале «Nucleic Acids Research» и послужили отправной точкой для второго направления исследований по проекту. Это второе направление было связано с попыткой разобраться, какие же элементы в 5’-НТО ответственны за низкую кеп-зависимость мРНК, не содержащих IRES-элементы. В качестве модели был взят длинный GC-богатый лидер мРНК про-апоптотического фактора Apaf-1 человека, который в норме имел самую низкую кеп-зависимость из всех изученных нами. Мы обнаружили, что в условиях стресса (при индукции апоптоза в культивируемых клетках) этот лидер и вовсе перестаёт зависеть от кепа, однако строгая зависимость от 5’-конца по-прежнему сохраняется. Делеционный анализ позволил выявить в лидере Apaf-1 две области, которые могут быть ответственны за явление низкой кеп-зависимости (5’-концевую и внутреннюю), в одной из которых (внутренней) нам удалось связать эту детерминанту с определённой структурой в РНК.
- Добавил в систему: Дмитриев Сергей Евгеньевич
Источник финансирования НИР
| грант РФФИ |
| грант РФФИ |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 1 января 2007 г.-31 декабря 2009 г. | Неканонические механизмы 5’-конец-зависимой инициации трансляции у эукариот |
| Результаты этапа: Проект нацелен на изучение некоторых необычных случаев 5’-конец-зависимой инициации трансляции эукариотических мРНК, а также на объяснение нескольких аспектов механизма выбора инициаторного кодона, которые плохо укладываются в рамки существующей классической модели. В ходе выполнения проекта мы смогли наглядно продемонстрировать несостоятельность очень распространённой теории о том, будто слабая зависимость от 5’-кепа, которая наблюдается у некоторых клеточных мРНК, определяется наличием в их 5’-нетранслируемых областях (5’-НТО) участков внутреннего связывания рибосомы (IRES-элементов). Применив разработанные нами подходы для адекватной оценки эффективности трансляции таких мРНК in vitro (в экстрактах культивируемых клеток) и in vivo (в живых клетках, трансфицированных искусственными транскриптами), мы показали, что хотя кеп-зависимость мРНК с разными лидерами может отличаться в десятки раз, она не связана со способностью направлять трансляцию второго цистрона в бицистронной мРНК (классическое определение IRES-элемента). Более того, вопреки общепринятому мнению, не прослеживается и связи кеп-зависимости с общей структурированностью лидера. Эти важные наблюдения были опубликованы нами в этом году в журнале «Nucleic Acids Research» и послужили отправной точкой для второго направления исследований по проекту. Это второе направление было связано с попыткой разобраться, какие же элементы в 5’-НТО ответственны за низкую кеп-зависимость мРНК, не содержащих IRES-элементы. В качестве модели был взят длинный GC-богатый лидер мРНК про-апоптотического фактора Apaf-1 человека, который в норме имел самую низкую кеп-зависимость из всех изученных нами. Мы обнаружили, что в условиях стресса (при индукции апоптоза в культивируемых клетках) этот лидер и вовсе перестаёт зависеть от кепа, однако строгая зависимость от 5’-конца по-прежнему сохраняется. Делеционный анализ позволил выявить в лидере Apaf-1 две области, которые могут быть ответственны за явление низкой кеп-зависимости (5’-концевую и внутреннюю), в одной из которых (внутренней) нам удалось связать эту детерминанту с определённой структурой в РНК. | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".