Источник финансирования НИР
Этапы НИР
| # |
Сроки |
Название |
| 1 |
1 сентября 2012 г.-31 декабря 2012 г. |
Изучение механизмов межмолекулярного взаимодействия при образовании белок – белковых комплексов методами молекулярной и броуновской динамики. |
| Результаты этапа: ыло проведено моделирование взаимодействия макромолекул в растворе с использованием метода многочастичной броуновской динамики с учётом электростатических взаимодействий [Kovalenko et al., 2006]. Построенная модель рассматривает белковые молекулы как броуновские частицы, совершающие поступательное и вращательное движение в вязкой среде, при этом конформационные изменения не учитываются, а молекулы рассматриваются как твёрдые тела. Модель многочастичной броуновской динамики позволяет изучать влияние ионной силы, распределения зарядов на молекулах, рН и температуры на кинетические и структурные характеристики взаимодействия пар белков.
С помощью модели броуновской динамики были получены структуры предварительных комплексов «пластоцианин – цитохром f» в зависимости от расстояния контакта между ионами Cu…Fe и в зависимости от ионной силы раствора при различных способах описания формы молекул и значений заряд на атомах (по Хендерсону-Хассельбальху и CHARMM). Аналогичным образом были получены структуры диффузионно-столкновительного комплекса «циклиновая киназа – P16» при различной величине ионной силы раствора. |
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...).
После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем
выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".
