хроматин как бионаносистемаНИР

Источник финансирования НИР

госбюджет, раздел 0110 (для тем по госзаданию)

Этапы НИР

# Сроки Название
4 1 января 2014 г.-31 декабря 2014 г. хроматин как бионаносистема
Результаты этапа: С использованием техники 4 C продемонстрировано, что CpG островки, в том числе и те из них, которые не содержат промоторов, предпочтительно взаимодействуют друг с другом. Для ряда якорей, поставленных на различные CpG островки в границах хромосомы 14 кур, наблюдали сходные спектры пространственных контактов, которые существенно отличались от спектров контактов якорей фиксированных в удаленных от CpG островков областях. Для якорей, расположеннных внутри CpG островков, была прослежена положительная корреляция между контактами с удаленными геномными областями и присутствием в этих областях сайтов связывания для транскрипционных факторов SP1 и CTCF. В целом, полученные результаты позволяют заключить, что кластеризация CpG островков играет важную роль в сегрегации активного и неактивного хроматиновых компартментов внутри клеточного ядра Отработаны условия получения гипотонических ядер эритроидных клеток, в которых происходит видимая дезинтеграция ряда внутриядерных компартментов (ядрышек, телец Кахаля и PML телец). Отработаны условия восстановления этих компартментов посредством добавления агента, повышающего уровень макромолекулярного скопления (полиэтиленгликоль) при сохранении гипотонической среды. С использованием техники 3С проанализированы профили взаимодействия удаленных регуляторных элементов, входящих в состав активаторного комплекса домена бета-глобиновых генов в нормальных ядрах, гипотонических ядрах и гипотонических ядрах в присутствии полиэтиленгликоля. Продемонстрировано, что гипотоническая обработка ядер, приводящая к увеличению их объема и дезинтеграции внутренних компартментов, приводит также к утрате взаимодействий между удаленными элементами активаторного комплекса домена бета-глобиновых генов. Эти взаимодействия восстанавливаются одновременно с восстановлением внутриядерных компартментов при добавлении к суспензии ядер полиэтиленгликоля, которых повышает уровень макромолекулярного скопления. На основании данных результатов сделано заключение о том, что процесс самоорганизации хроматиновых структур в условиях макромолекулярного скопления играет важную роль в позиционировании регуляторных элементов генома, обеспечивающим возможность их взаимодействия. Соответственно, данные результаты свидетельствуют об отсутствии в ядре жесткой скелетной структуры (ядерного матрикса), являющейся платформой для сборки различных компартментов и макромолекулярных комплексов. Одновременно, представляется наиболее вероятным, что роль динамичесой платформы для организации внутриядерных процессов играет сам по себе упакованный геном, пространственная организация которого поддерживается в том числе и силами, возникающими в условиях макромолекулярного скопления. Новая модель, увязывающая пространственную организацию генома с функциональной компартментализацией клеточного ядра, представлена в ряде публикаций по проекту, список которых приводится ниже.
5 1 января 2015 г.-31 декабря 2015 г. хроматин как бионаносистема
Результаты этапа:

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".