|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных |
||
Гликополимеры клеточных стенок бактерий порядка Actinomycetales: структурное разнообразие, таксономические и экологические аспектыНИР
- Руководитель НИР: Тульская Е.М.
- Участники НИР: Барышникова Л.М., Дмитренок А.С., Евтушенко Л.И., Потехина Н.В., Сенченкова С.Н., Стрешинская Г.М., Шашков А.С.
- Подразделение: Кафедра микробиологии
- Срок исполнения: 1 января 2013 г. - 31 декабря 2015 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 13-04-00447а
- Номер ЦИТИС: 01201355788
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Общая биология и экология
- ПН России: Науки о жизни
-
Рубрики ГРНТИ:
- 34.27.15 Систематика и номенклатура микроорганизмов
-
Ключевые слова:
ямр-спектроскопия, клеточная стенка, актиномицеты, гликополимеры, таксономия
-
Описание:
Целью настоящего межлабораторного проекта является изучение гликополимеров клеточных стенок, ковалентно связанных с пептидогликаном и расположенных в поверхностных слоях клетки, у представителей порядка Actinomycetales (актиномицетов) класса Actinobacteria – обширной группы микроорганизмов, выделяющихся среди других прокариот размерами (до 10 млн п.о.) и организацией генома, сложностью морфологических форм, способностью синтезировать биологически активные соединения, а также к деструкции высокотоксичных соединений, загрязняющих окружающую среду. Предполагается использование недеструктивных методов (высокоразрешающая ЯМР-спектроскопия, масс-спектрометрия) для установления структур гликополимеров клеточных стенок актинобактерий, что позволяет выявить не только фосфат-содержащие, но и полимеры другой природы, включая минорные, которые играют важную роль в жизнедеятельности микробной клетки. Внимание будет сфокусировано на исследовании клеточных стенок представителей родов некоторых семейств (Promicromonosporaceae, Geodermatophilaceae, Micrococcaceae, Microbacteriaceae,Micromonosporaceae) актинобактерий, не исследованных в этом отношении.
-
Основные результаты:
Изучены 36 штаммов актинобактерий из коллекции ВКМ, принадлежащие различным родам из 8 семейств. Семейство Micromonosporineae Род Actinoplanes: A. lobatus Ас-676Т; A. auranticolor Ас-648 Т; A. regularis Ас-650 Т; A. caeruleus Ас-1257Т; A. digitatis Ас-649Т; A. cyaneus Ас-1095T; Семейство Streptomyceteceae Род Streptomyces: S. albus Ас-35T; S. albus ssp. pathocidicus Ас-598Т; S. coelicolor Ас-738T; а также штаммы из коллекции львовского университета S. albus J-1074, S. albus R1-100, S. coelicolor A3(2), S. coelicolor М145В и три штамма с нокаутом генов (sco4879, sco4881, sco4880) Семейство Brevibacteriaceae Род Brevibacterium- B. aurantiacum ВKM Ac-2111Т Семейство Micrococcaceae Род Arthrobacter: A. protophormiae Ac-2104T; A. crystallopoietes Ac-1107 T; Arthrobacter sp. Ac-2549, Arthrobacter sp. Ac-2550; Arthrobacter sp. Ac-1098, Arthrobacter histidinolovorans Ac-1978T Семейство Nocardiopsaceae Род Nocardiopsis: N. synnemataformans Ac-2518T, N. halotolerans Ac-2519Т, N. composta Ac-2520, N. composta Ac-2521T и N. metallicus Ac-2522T Семейство Promicromonosporaceae Род Promicromonospora: P. citrea Ac-665T и Promicromonospora sp. Ac-1028 Семейство Geodermatophilaceae Род Geodermatophilus: G. obscurus subsp. obscurus Ac-658T Семейство Microbacteriaceae Род Rathayibacter: R. tritici Ac-1603T, R. festucae Ac-1390T, R. caricis Ac-1799T, Rathayibacter sp. Ac-2596, Rathayibacter sp. Ac-2121; В клеточных стенках определены сахара и полиолы. Химическими, ЯМР-спектроскопическими и масс-спектрометрическими методами установлены структуры и состав полимеров клеточных стенок исследованных штаммов. Выявлено 23 новые, не описанные ранее, структуры гликополимеров, относящихся к различным классам (тейхоевые, тейхуроновые, тейхулозоновые кислоты, гликозил-1-фосфатные полимеры, полисахариды). Полученные результаты свидетельствуют о природном разнообразии структур биополимеров, а также большом биосинтетическом потенциале микроорганизмов. Полученные данные о наборе и структуре гликополимеров свидетельствуют об их видоспецифичности и могут быть полезны в усовершенствовании таксономии актинобактерий.
- Добавил в систему: Тульская Елена Михайловна
Источник финансирования НИР
| грант РФФИ |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 4 апреля 2013 г.-31 декабря 2013 г. | Гликополимеры клеточных стенок бактерий порядка Actinomycetales: структурное разнообразие, таксономические и экологические аспекты |
| Результаты этапа: В одиннадцати штаммах актинобактерий, не изученных ранее в этом отношении, определены сахара, полиолы и гликополимеры клеточных стенок. Полученные результаты позволят усовершенствовать систематику актинобактерий. Исследованы штаммы рода Actinoplanes: A. lobatus ВКМ Ас-676Т; A. auranticolor ВКМ Ас-648 Т; A. regularis ВКМ Ас-650 Т; A. caeruleus ВКМ Ас-1257Т; представители рода Streptomyces: S. albus ВКМ Ас-35T; а также штаммы из коллекции львовского университета S. albus J-1074, S. albus R-1-100 и, кроме того, S. coelicolor A3(2) и три штамма с нокаутом генов (sco4879, sco4881, sco4880), предположительно ответственных за биосинтез Kdn-гликополимеров клеточной стенки. Данные о новых структурах гликополимеров пополнили базу данных по ЯМР спектрам углеводсодержащих природных биополимеров. Определены сахара, полиолы, химическими и ЯМР-спектроскопическими методами установлены структуры полимеров клеточных стенок (КС) в пятнадцати штаммах актинобактерий, не изученных ранее в этом отношении. Исследованы штаммы родов: Actinoplanes - A. digitatis ВКМ Ас-649Т; Streptomyces - S. coelicolor М145В (восстановленный), S. coelicolor ВКМ Ас-738T и S.albus ssp. pathacidicus ВКМ Ас-598Т; Brevibacterium- B. aurantiacum ВKM Ac-2111Т; Arthrobacter- A. protophormiae ВКМ Ac-2104T и A. crystallopoietes BKM Ac-1107 T; Nocardiopsis - , N. synnemataformans ВКМ Ac-2518T, N. halotolerans ВКМ Ac-2519Т, N. composta ВКМ Ac-2520, N. composta ВКМ Ac-2521T и N. metallicus ВКМ Ac-2522T; Promicromonospora – P. citrea Ac-665T и P. citrea Ac-1028; Geodermatophilus – G. obscurus subsp. obscurus Ac-658T. Полученные результаты позволят усовершенствовать систематику актинобактерий. | ||
| 2 | 4 апреля 2014 г.-31 декабря 2014 г. | Гликополимеры клеточных стенок бактерий порядка Actinomycetales: структурное разнообразие, таксономические и экологические аспекты |
| Результаты этапа: В одиннадцати штаммах актинобактерий, не изученных ранее в этом отношении, определены сахара, полиолы и гликополимеры клеточных стенок. Полученные результаты позволят усовершенствовать систематику актинобактерий. Исследованы штаммы рода Actinoplanes: A. lobatus ВКМ Ас-676Т; A. auranticolor ВКМ Ас-648 Т; A. regularis ВКМ Ас-650 Т; A. caeruleus ВКМ Ас-1257Т; представители рода Streptomyces: S. albus ВКМ Ас-35T; а также штаммы из коллекции львовского университета S. albus J-1074, S. albus R-1-100 и, кроме того, S. coelicolor A3(2) и три штамма с нокаутом генов (sco4879, sco4881, sco4880), предположительно ответственных за биосинтез Kdn-гликополимеров клеточной стенки. Данные о новых структурах гликополимеров пополнили базу данных по ЯМР спектрам углеводсодержащих природных биополимеров. Определены сахара, полиолы, химическими и ЯМР-спектроскопическими методами установлены структуры полимеров клеточных стенок (КС) в пятнадцати штаммах актинобактерий, не изученных ранее в этом отношении. Исследованы штаммы родов: Actinoplanes - A. digitatis ВКМ Ас-649Т; Streptomyces - S. coelicolor М145В (восстановленный), S. coelicolor ВКМ Ас-738T и S.albus ssp. pathacidicus ВКМ Ас-598Т; Brevibacterium- B. aurantiacum ВKM Ac-2111Т; Arthrobacter- A. protophormiae ВКМ Ac-2104T и A. crystallopoietes BKM Ac-1107 T; Nocardiopsis - , N. synnemataformans ВКМ Ac-2518T, N. halotolerans ВКМ Ac-2519Т, N. composta ВКМ Ac-2520, N. composta ВКМ Ac-2521T и N. metallicus ВКМ Ac-2522T; Promicromonospora – P. citrea Ac-665T и P. citrea Ac-1028; Geodermatophilus – G. obscurus subsp. obscurus Ac-658T. Полученные результаты позволят усовершенствовать систематику актинобактерий. | ||
| 3 | 1 января 2015 г.-31 декабря 2015 г. | Гликополимеры клеточных стенок бактерий порядка Actinomycetales: структурное разнообразие, таксономические и экологические аспекты |
| Результаты этапа: | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".