Изучение механизмов трансляции вирусных и клеточных мРНК с применением интегрированного подходаНИР

An integrated approach to studying the mechanisms of viral and cellular mRNA translation

Источник финансирования НИР

грант РНФ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 15 мая 2023 г.-31 декабря 2023 г. Изучение механизмов трансляции вирусных и клеточных мРНК с применением интегрированного подхода, этап 1
Результаты этапа:
2 1 января 2024 г.-31 декабря 2024 г. Изучение механизмов трансляции вирусных и клеточных мРНК с применением интегрированного подхода, этап 2
Результаты этапа: За отчётный период с целью изучения молекулярных механизмов инициации, терминации и реинициации трансляции было проведено шесть CRISPR-скринингов на бицистронных конструкциях, кодирующих флуоресцентные белки, в том числе на стабильных линиях и (впервые) путём мРНК-трансфекции. Получены предварительные списки «хитов», выявлены гены – кандидаты для дальнейшего изучения. Разработана система для проведения CRISPR-скрининга, направленного на поиск генов, продукты которых вовлечены в молекулярные механизмы поглощения РНК при мРНК-трансфекции клеток, основанная на новом маркёре негативной селекции. Вместе с большим международным коллективом авторов разработаны «Минимальные требования к использованию бицистронных репортеров». На панели репортерных конструкций с IRES-элементами четырёх классических типов систематически проанализировано влияние тотальной замены уридина на m1-псевдоуридин (применяемой в современных мРНК-вакцинах) на активность IRES-элементов, сделан вывод о практически полной инактивации большинства IRES-элементов. Показано, что нокаут гена PA2G4 делает клетки НЕК293Т устойчивыми к заражению вирусом энцефаломиокардита (EMCV), а также очень сильно снижает эффективность трансляции, направляемой IRES-элементом EMCV. Наработаны в E.coli и выделены рекомбинантные белки архей, предположительно являющиеся факторами рибосомного рециклинга. В сотрудничестве с лабораторией А.Буздина (Сеченовский Университет) получены несколько нокаутных линий по генам SLC39A8 и SLC39A14 (на основе линий аденокрцином HCT-15 и HuTu80) и показано, что отсутствие генов изменяет устойчивость опухолевых клеток к некоторым химиотерапевтическим препаратам, что позволяет говорить о потенциале белков семейства SLC39A как мишеней для разработки новых противоопухолевых терапий. В сотрудничестве с лабораторией В.Гладышева (Гарвардская школа медицины) разработаны надёжные мультитканевые транскриптомные часы биологического возраста (tAge) для млекопитающих. Часы применены для анализа изменений биологического возраста клеток в процессах клеточного репрограммирования и эмбриогенеза.
3 1 января 2025 г.-31 декабря 2025 г. Изучение механизмов трансляции вирусных и клеточных мРНК с применением интегрированного подхода, этап 3
Результаты этапа:

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".