Нанозимы «искусственная пероксидаза» для медицинской диагностики и терапииНИР

Nanozymes "artificial peroxidase" for medical diagnostics and therapy

Источник финансирования НИР

грант РНФ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 19 мая 2022 г.-31 декабря 2022 г. Нанозимы «искусственная пероксидаза» для медицинской диагностики и терапии
Результаты этапа: 1. Определение бимолекулярных констант скорости взаимодействия комплекса нанозима и восстанавливающего субстрата с пероксидом водорода для нанозимов различного размера с использованием подходов стационарной ферментативной кинетики. На предыдущей стадии проекта был установлен механизм действия нанозимов «искусственная пероксидаза», что позволило оценить бимолекулярные константы отдельных элементарных стадий. Было также показано, что активность каталитически синтезированных наночастиц берлинской лазури существенно зависит от их диаметра. Это обусловило необходимость выявить зависимость констант элементарных стадий от размера нанозимов. Скорость-лимитирующей является стадия окисления полученного комплекса нанозим-восстанавливающий субстрат пероксидом водорода, характеризующаяся константой k2. Зависимость последней от диаметра нанозима линеаризуется для разных восстанавливающих субстратов в билогарифмических координатах с тангенсом угла наклона, приблизительно равным 3.0. Это указывает на то, что пероксид водорода одинаково хорошо реагирует с активными центрами катализатора, расположенными во всем объеме наночастиц. Очевидно, восстанавливающие субстраты ввиду их размера не способны так же легко проникать в объем наночастиц. Соответствующая зависимость линеаризуется с тангенсом наклона приблизительно 2.5. Ввиду кубической зависимости скорость-лимитирующей константы от размера следует ожидать сверх-высоких значений бимолекулярных констант. Действительно, для нанозимов с диаметром около 300 нм значения k2 для случая низкопотенциального субстрата желтой кровяной соли достигают ~2·10^11 М-1с-1, для катехола ~2·10^10 М-1с-1. Полученные значения на 3-4 порядка величины превосходят константы для ферментов пероксидаз для стадии их взаимодействия с пероксидом водорода (наиболее быстрой стадии) и на 4-5 порядков – константы скорость-лимитирующей стадии действия фермента. Таким образом, для больших нанозимов бимолекулярные константы скорость-лимитирующих стадий на 4 – 5 порядков выше по сравнению с ферментом пероксидазой. 2. Применение подходов предстационарной кинетики ферментативных реакций для исследования механизма действия нанозимов. Успехи в исследовании стационарной кинетики восстановления пероксида водорода, катализируемого нанозимами «искусственная пероксидаза», полученные в результате выполнения основной части проекта, обусловили интерес к предстационарной кинетике, тем более что данный метод к нанозимам ранее никем не применялся. Поскольку регистрация скорости пероксидазной реакции возможна только на последней стадии, в начале было решено исследовать предстационарную кинетику восстановления берлинской лазури различными субстратами, то есть в отсутствии пероксида водорода. Как оказалось, даже в такой простейшей системе не представляется возможным оценивать константу скорости реакции по псевдопервому порядку, поскольку зависимость концентрации продукта от времени в полулогарифмических координатах не линеаризуется. По-видимому, это связано с влиянием обратной реакции, распада нанозим-субстратного комплекса, даже на миллисекундных временах. Соответственно было решено исследовать тангенс угла наклона в полулогарифмических координатах в начальный момент времени. Найденные значения констант оказались линейно зависящими от концентрации восстанавливающего субстрата. Это позволяет оценить кажущуюся бимолекулярную константу скорости делением константы скорости псевдопервого порядка на концентрацию восстанавливающего субстрата. Как оказалось, кажущаяся бимолекулярная константа уменьшается до трех порядков при увеличении формального редокс-потенциала субстрата в пределах 0.25 В. Такое поведение константы подтверждает, что активность субстратов в реакции восстановления пероксида водорода, катализируемой нанозимами «искусственная пероксидаза», существенно зависит от их восстанавливающей способности, то есть определяется термодинамикой восстановления каталитически синтезированной белинской лазури. 3. Заключительные исследования, посвященные синтезу сверхмалых нанозимов в обращенных мицеллах и исследованию их каталитической активности. В течение основного проекта были синтезированы сверхмалые нанозимы, диаметр которых (4-5 нм) практически совпадает с размером фермента пероксидазы. Установлено, что зависимость каталитической константы от диаметра наночастиц для сверхмалых наночастиц, каталитически синтезированных в системе обращенных мицелл, принадлежат той же зависимости, что и константы для традиционно синтезированных нанозимов. Таким образом, полученные сверхмалые наночастицы берлинской лазури можно отнести к семейству нанозимов «искусственная пероксидаза». Сверхмалые нанозимы ввиду их размеров, намного уступающих размерам каталитически синтезированных наночастиц берлинской лазури без использования темплатов, позволили дополнить размерные зависимости физико-химических свойств последних. Модификация электродов берлинской лазурью путем нанесения суспензии наночастиц впервые в истории модифицированных электродов позволила оценить долю материала, вовлеченную в электрохимическую реакцию. Эта доля существенно отличающаяся от 100%, оказалась зависящей от диаметра наночастиц. Как оказалось, доля электроактивной берлинской лазури в случае модификации сверхмалыми нанозимами (93%) прекрасно укладывается в полученную ранее зависимость. Таким образом, сверхмалые наночастицы, полученные методом темплатного каталитического синтеза берлинской лазури, позволяют проверять и дополнять размерные зависимости физико-химических свойств нанозимов «искусственная пероксидаза». По синтезу и каталитическим свойствам сверхмалых нанозимов подготовлена и опубликована статья в журнале Bioelectrochemistry (Q1; IF = 5.76). 4. Создание на основе наночастиц берлинской лазури твердоконтактных ионселективных амперометрических сенсоров на K+/Na+ для анализа биологических жидкостей. Ранее в рамках проекта нами был продемонстрирован принципиально новый подход к регистрации сигнала твердоконтактных ионселективных электродов. В продолжении проекта проточно-инжекционная амперометрия неэлектроактивных ионов (калия и натрия) применена к электродам на основе берлинской лазури в качестве твердого контакта. Установлено, что берлинская лазурь обладает собственной селективностью к ионам калия: отклик на ионы калия в 2.5 - 4 раза превышает таковой на ионы натрия. Как в кислой, так и в нейтральной (рН 6.0) средах максимальная величина отклика достигается при потенциале 0.1 В. Коэффициент чувствительности сенсоров на основе наночастиц в 6 раз выше, чем у сенсоров на основе плёнок. Коэффициент селективности (kNa/K) для сенсоров на основе пленок берлинской лазури лежит в диапазоне от 0.15 до 0.42, в то время как для сенсоров на основе наночастиц он варьируется от 0.31 до 0.54. Селективности к ионам натрия при использовании берлинской лазури в качестве твердого контакта удается добиться нанесением дополнительной натрий-селективной мембраны на основе ионофора-6 (Bis[(12-crown-4)methyl] dodecylmethylmalonate). В результате чувствительность сенсора к калию снижается на порядок, а к натрию практически не изменяется. Таким образом, электроды на основе наночастиц берлинской лазури и натрий-селективных мембран оказываются в 1.5 – 5 раз селективнее к ионам натрия. С другой стороны, применение калий-селективных мембран на основе валиномицина в качестве ионофора приводит к дальнейшему улучшению как чувствительности, так и селективности к ионам калия. Увеличение толщины ионоселективной мембраны ведет к повышению чувствительности сенсора. Напротив, более тонкие мембраны в нейтральной среде являются более селективными. Преимущество сенсоров на основе берлинской лазури и ионоселективной мембраны в проточно-инжекционной амперометрии состоит в том, что отклик на ионы калия практически не зависит от pH и состава внешнего раствора, что недостижимо в традиционной потенциометрии. Предложен одностадийный метод изготовления твердоконтактных ионоселективных электродов. При этом наночастицы берлинской лазури вносятся непосредственно в смесь для формирования ионоселективной мембраны. Для сенсоров на основе такой, композитной, мембраны чувствительность к ионам калия оказалась в 5 раз выше и не зависела от задаваемого потенциала. Таким образом, кроме технологического преимущества (одностадийного приготовления), полученные сенсоры характеризовались также улучшенными аналитическими характеристиками. 5. Разработка биосенсоров для непрерывного мониторинга физиологических концентраций лактата в поте с дополнительной диффузионно-лимитирующей мембраной. Концентрация лактата в поте значительно выше, чем в крови: от 4 до 60 мМ в норме и до 60–100 мМ при интенсивных физических нагрузках. Таким образом, для анализа неразбавленного пота верхний предел обнаружения лактатных биосенсоров должен быть не менее 100 мМ. Можно предположить, что дополнительная полимерная мембрана, благодаря своему отрицательному заряду, ограничивает транспорт отрицательно заряженного субстрата (лактата) и тем самым влияет на динамический диапазон биосенсора. Действительно, при концентрации иономера в исходной смеси для формирования дополнительной мембраны 3.5 % и выше наблюдается резкое смещение диапазонов определяемых концентраций в сторону высоких содержаний лактата. Последнее, очевидно, связано с созданием диффузионных затруднений из-за применения дополнительной мембраны. С другой стороны, перевод действия сенсора в диффузионно-контролируемый режим должен вызвать повышение его операционной стабильности. Действительно, время полуинактивации разработанных лактатных биосенсоров повышается в десятки раз. Биосенсор с диффузионно-лимитирующей мембраной, содержащей 4 % иономера, представляется наиболее оптимальным по аналитическим характеристикам: широкий динамический диапазон (0.5–500 мМ), высокая чувствительность (0.11 ± 0.03 мА М-1 см-2) и увеличенное до нескольких десятков часов время полуинактивации (35 ± 1 ч). Линейный диапазон такого биосенсора простирается от 0.5 до 100 мМ лактата, что даже превышает диапазон физиологических концентраций лактата как в неразбавленном поте, так и в крови человека. Что касается операционной стабильности, биосенсор с дополнительной полимерной мембраной сохраняет на уровне 100% начального токового отклика в течение 5 ч в 20 мМ лактата. Кроме того, даже в растворе с экстремально высокой концентрацией лактата, 60 мМ, в течение первых 2 часов непрерывного мониторинга не наблюдается снижения токового отклика. Также была исследована стабильность разработанного биосенсора непосредственно в неразбавленном поте: стабильный токовый отклик наблюдается в течение 3 часов непрерывной работы в потоке пота, что достаточно для анализа пота даже во время длительных тренировок. По результатам данного и следующего разделов подготовлена и опубликована статья в журнале Analytical Chemistry (Q1; IF = 8.01). 6. Непрерывный мониторинг уровня лактата в поте проточным биосенсором с диффузионной мембраной в сочетании с параллельным периодическим контролем в крови в условиях гипоксии, вызванной тяжелой физической нагрузкой. Для неинвазивного мониторинга гипоксии разработанный лактатный биосенсор был интегрирован в проточный потосборник. Чувствительность биосенсоров в составе неинвазивного монитора всего на 10–15 % ниже, чем аналогичная величина, полученная в периодическом режиме при перемешивании. Разработанный монитор гипоксии прошел валидизацию с использованием альтернативного метода. Наблюдается корреляция между онлайн-показаниями монитора гипоксии и результатами проточно-инжекционного анализа: коэффициент корреляции Пирсона превышает 0.99. Апробацию проводили во время тренировки (приседания) здорового добровольца, использовали одновременно два монитора. Первый монитор помещали на поверхность кожи бедра (рабочая мышца), а второй – на поверхность кожи предплечья (нерабочая мышца). Независимо концентрацию лактата в поте контролировали в образцах, отобранных на выходе из монитора. Во время тренировки концентрация лактата в поте с работающей мышцы растет, а после окончания упражнений – довольно быстро снижается; динамика схожа с изменением концентрации лактата в крови. Напротив, лактат в поте с неработающей мышцы существенно не меняется во время тренировки. Это согласуется с ранее полученными нашей научной группой данными, что только концентрация лактата в поте, собранном с области над работающими мышцами, может наряду с уровнем лактата в крови выступать в качестве индикатора гипоксии в ходе изнурительной физической нагрузки. 7. Создание систем для конденсации выдыхаемого воздуха в циклонном потоке. Оптимизация конструкции системы на основе параметров эффективности (в том числе скорости конденсации). Предложена конструкция ячейки для конденсации выдыхаемого воздуха, использующая геометрию циклонных сепараторов. Моделирование профилей воздушной среды, имитирующей упрощенный выдох человека, в такой ячейке в среде Solidworks, показало возникновение турбулентности. Кроме того, в угловых элементах поток сместили вбок от центральной оси поперечного сечения и предусмотрели ответвление для потенциального отбора слюны с обратным клапаном, сменный мундштук, а также крепление пластиковых микропробирок на выходе для сбора образца. Производительность разработанной ячейки варьируется от 2 до 5 микролитров отбираемого конденсата выдыхаемого воздуха (КВВ) в минуту. Проведено определение ключевых метаболитов – глюкозы и лактата – в образцах отобранного конденсата. Содержание лактата находится в промежутке от 40 до 250 мкМ, содержание глюкозы - от 5 до 200 мкМ. Правильность измерений концентрации лактата в биологических образцах была подтверждена методом ионной хроматографии. Предварительное сравнение образцов КВВ, отобранных различными методами показывает, что конденсат, отобранный с использованием переохлаждения (EcoScreen (Erich Jaeger GmbH, Германия), система на основе элементов Пельтье) содержит в десятки раз меньше ионов натрия (данные ИСП-МС) по сравнению с конденсатом, полученным при помощи предложенной ячейки. Это указывает на то, что отказ от стадии охлаждения позволяет уменьшить разбавление КВВ сконденсированными парами воды, содержащимися в выдохе в значительном количестве. 8. Разработка метода оценки антиоксидантной активности по каталитическому и некаталитическому поглощению пероксида водорода с использованием свободных и иммобилизованных нанозимов «искусственная пероксидаза». Антиоксидантную активность (АОА) образца характеризовали константой скорости реакции поглощения пероксида водорода (природного стабильного оксиданта) под действием антиоксидантов различной природы. Показано, что наночастицы берлинской лазури сами по себе не проявляют антиоксидантной активности. Действительно, ни оксидазная (восстановление кислорода), ни каталазная (диспропорционирование пероксида водорода) активности для каталитически синтезированных наночастиц берлинской лазури не отмечены. Кроме способности пищевых продуктов непосредственно восстанавливать пероксид водорода (так называемая, некаталитическая АОА), была изучена и каталитическая АОА. Действительно, наблюдалось значительное усиление антиоксидантной активности образцов соков при добавлении нанозимов, даже для образцов, собственная некаталитическая АОА которых ранее была за пределами чувствительности метода. При этом наблюдалась линейная зависимость констант скорости разложения пероксида водорода от концентрации добавленных наночастиц. Измеренная антиоксидантная активность не зависела от используемого сенсора, но зависела от исходной некаталитической антиоксидантной активности. Таким образом, в дополнении к предложенному ранее методу оценки АОА по разложению природного оксиданта, пероксида водорода, разработан каталитический метод, сущность которого заключается в катализе нанозимами восстановления Н2О2 пищевыми продуктами. Метод особенно ценен для продуктов, которые практически не проявляют некаталитического поглощения пероксида водорода. 9. Подготовка публикаций в высокорейтинговых журналах. В течение этапа подготовлено и опубликовано 2 статьи в журналах Bioelectrochemistry (Q1; IF = 5.76) и Analytical Chemistry (Q1; IF = 8.01), а также обзор в журнале Microchimica Acta (Q1; IF = 6.41). Получен патент на изобретение. 10. Участие в конференциях. На международных и Всероссийских конференциях сделано 2 пленарных, 4 устных и 3 стендовых доклада. 11. Участие в конкурсах научных работ молодых ученых и студентов. Основные исполнители проекта Комкова М.А., Дабосс Е.В. и Андреев Е.А. стали лауреатами премии Правительства Москвы молодым учёным. Член научного коллектива проекта Щербачева Е.В. награждена медалью РАН с премией для студентов высших учебных заведений России, а также стала победителем программы УМНИК 12. Защита курсовых и дипломных работ студентами химического факультета МГУ. Под руководством участников научного коллектива выполнены и защищены 2 дипломные работы по аналитической химии, а также 3 курсовые работы по аналитической химии и 2 курсовые работы по физической химии.
2 1 января 2023 г.-31 декабря 2023 г. Нанозимы «искусственная пероксидаза» для медицинской диагностики и терапии
Результаты этапа: 1. Бимолекулярные константы скорости как функции размера нанозимов. На предыдущей стадии проекта был установлен механизм действия нанозимов «искусственная пероксидаза». Скорость-лимитирующей является стадия окисления комплекса нанозим-восстанавливающий субстрат пероксидом водорода (константа k2). Зависимость последней от диаметра нанозима линеаризуется в билогарифмических координатах с тангенсом угла наклона ~3.0. Таким образом, пероксид водорода одинаково хорошо реагирует с активными центрами, расположенными во всем объеме наночастиц. Такая зависимость для восстанавливающих субстратов (с ограниченной способностью проникать внутрь наночастиц) имеет тангенс наклона ~2.5. Для нанозимов с диаметром ~300 нм k2 для желтой кровяной соли достигает ~2·10^11 М-1с-1, для катехола ~2·10^10 М-1с-1. Эти значения на 3-4 порядка величины выше констант взаимодействия ферментов пероксидаз с Н2О2 и на 4-5 порядков выше констант скорость-лимитирующей стадии действия фермента. 2. Применение подходов предстационарной кинетики ферментативных реакций для исследования механизма действия нанозимов. Предстационарная кинетика для изучения катализа нанозимами ранее не применялась. Значения констант скорости псевдопервого порядка, найденные из наклона зависимости концентрации продукта от времени в начальный момент, линейно зависят от концентрации восстанавливающего субстрата. Кажущаяся бимолекулярная константа, найденная из их отношения, уменьшается до трех порядков при увеличении формального редокс-потенциала субстрата в пределах 0.25 В. Такое поведение константы подтверждает, что активность субстратов в катализе нанозимами «искусственная пероксидаза» существенно зависит от их восстанавливающей способности. 3. Заключительные исследования, посвященные синтезу сверхмалых нанозимов в обращенных мицеллах и их активности. В течение основного проекта были синтезированы сверхмалые нанозимы, диаметр которых (4-5 нм) практически совпадает с размером фермента пероксидазы. Модификация электродов берлинской лазурью путем нанесения суспензии наночастиц впервые позволила оценить долю электроактивного материала модифицированных электродов. Как оказалось, доля электроактивной берлинской лазури в случае модификации сверхмалыми нанозимами (93%) прекрасно укладывается на полученную ранее зависимость. Таким образом, сверхмалые наночастицы, полученные методом темплатного каталитического синтеза берлинской лазури, позволяют проверять и дополнять размерные зависимости физико-химических свойств нанозимов «искусственная пероксидаза». По синтезу и каталитическим свойствам сверхмалых нанозимов подготовлена и опубликована статья в журнале Bioelectrochemistry (Q1; IF = 5.76). 4. Создание твердоконтактных ионселективных амперометрических сенсоров на K+/Na+. Ранее в рамках проекта нами была предложена проточно-инжекционная амперометрия как альтернатива потенциометрии для твердоконтактных ионселективных электродов. Берлинская лазурь обладает селективностью к ионам калия, отклик на них в 2.5 - 4 раза выше, чем на ионы натрия. Селективности к ионам натрия (kNa/K = 1.5 - 5) удается добиться нанесением дополнительной натрий-селективной мембраны на основе ионофора-6, понижающей чувствительность к ионам калия на порядок. С другой стороны, калий-селективные мембраны на основе валиномицина приводят к улучшению как чувствительности, так и селективности к ионам калия. Преимущество проточно-инжекционной амперометрии с наночастицами берлинской лазури в качестве твердого контакта, недостижимое в потенциометрии, это независимость отклика от pH. Предложен одностадийный метод изготовления сенсоров, при котором наночастицы берлинской лазури вносятся непосредственно в смесь для формирования ионоселективной мембраны. Для сенсоров на основе такой, композитной, мембраны чувствительность к ионам калия оказалась в 5 раз выше и не зависела от задаваемого потенциала. 5. Биосенсоры для непрерывного мониторинга лактата в поте на основе дополнительной диффузионно-лимитирующей мембраны. Ввиду необходимости детектировать высокие концентрации лактата (содержание в поте от 4 мМ до 60 мМ в норме и до 60 мМ – 100 мМ при интенсивных физических нагрузках) биосенсор покрывался дополнительной отрицательно заряженной мембраной. Биосенсор с диффузионно-лимитирующей мембраной, содержащей 4 % перфторсульфонированного иономера, наиболее оптимален по аналитическим характеристикам: широкий диапазон (0.5 мМ – 500 мМ), достаточная чувствительность (0.11 ± 0.03 мА М-1 см-2) и высокая операционная стабильность (~100% начального отклика в течение 5 часов в 20 мМ лактата или 3 часа в потоке пота). Линейный диапазон такого биосенсора от 0.5 мМ до 100 мМ лактата перекрывает диапазон физиологических концентраций лактата как в поте, так и в крови человека. По результатам данного и следующего разделов опубликована статья в наиболее престижном аналитическом журнале: Analytical Chemistry (Q1; IF = 8.01). 6. Непрерывный мониторинг лактата в поте биосенсором с диффузионной мембраной в условиях гипоксии. Для неинвазивного мониторинга гипоксии разработанный лактатный биосенсор был интегрирован в проточный потосборник. Правильность работы монитора подтверждена независимым методом: коэффициент корреляции Пирсона >0.99. Один монитор помещали на поверхность кожи бедра (рабочая мышца), другой –предплечья (нерабочая мышца). Во время тренировки (приседания) здорового добровольца концентрация лактата в поте с работающей мышцы растет, а после окончания упражнений – довольно быстро снижается; динамика схожа с изменением концентрации лактата в крови. Напротив, содержание лактата в поте с неработающей мышцы существенно не меняется во время тренировки. Следовательно, содержание лактата в поте может служить индикатором гипоксии в ходе интенсивной физической нагрузки. 7. Создание систем для конденсации выдыхаемого воздуха в циклонном потоке. Предложена конструкция ячейки для конденсации выдыхаемого воздуха, использующая геометрию циклонных сепараторов. Содержание лактата в отбираемом конденсате находится в промежутке от 0.04 мМ до 0.25 мМ, содержание глюкозы - от 0.005 мМ до 0.2 мМ. Предварительное сравнение показывает, что конденсат, отобранный с использованием переохлаждения, содержит в десятки раз меньше ионов натрия (данные ИСП-МС) по сравнению с конденсатом, полученным при помощи предложенной ячейки. 8. Оценка антиоксидантной активности по каталитическому и некаталитическому поглощению пероксида водорода. Антиоксидантную активность (АОА) характеризовали константой скорости поглощения Н2О2. Показано, что наночастицы берлинской лазури не проявляют АОА. Кроме способности пищевых продуктов непосредственно восстанавливать Н2О2 (некаталитическая АОА), изучена и каталитическая АОА. В присутствии нанозимов АОА появляется даже для образцов, собственная некаталитическая АОА которых не регистрировалась. Каталитическая антиоксидантная активность не зависит от используемого сенсора, но зависит от исходной некаталитической антиоксидантной активности. 9. Подготовка публикаций в высокорейтинговых журналах. В течение этапа подготовлено и опубликованы статьи в журналах Bioelectrochemistry (Q1; IF = 5.76) и Analytical Chemistry (Q1; IF = 8.01). Получен патент на изобретение. Обзор в журнале Microchimica Acta (Q1; IF = 6.41) под заголовком «Берлинская лазурь: от наилучшего электрокатализатора до нанозимов, побеждающих природный фермент» резюмирует основные достижения проекта до настоящего времени. 10. Участие в конференциях. На международных и Всероссийских конференциях сделано 2 пленарных, 4 устных и 3 стендовых доклада. 11. Участие в конкурсах научных работ молодых ученых и студентов. Комкова М.А., Дабосс Е.В. и Андреев Е.А. стали лауреатами премии Правительства Москвы. Щербачева Е.В. награждена медалью РАН, а также стала победителем программы УМНИК. 12. Защита курсовых и дипломных работ студентами химического факультета МГУ. Под руководством участников проекта выполнены и защищены 2 дипломные и 5 курсовых работ.

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".